Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04502 LG1 62669776 62671544 PREDICTED: receptor-like protein kinase FERONIA
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 62670896 missense_variant p.Lys78Met
T/A 62671180 5_prime_UTR_variant
C/T 62671181 5_prime_UTR_variant
T/G 62671186 5_prime_UTR_variant
C/T 62671191 5_prime_UTR_variant
A/T 62671194 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 62671245 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04502.1
MRIPLIASLVAASLLLLSFVIGFIIFRCVRRVNSDRDSNSESSSTRCREFSLAEIRAATSNFEERLIVGRGGFGNVYKGHIDRSHKPVAIKRLKPGSDQGAHEFQTEIKMLSRFRHEHLVSLIGYCNDGREMILVYDFMARGTLRDHLYGSGEVLSWKRRLKICLEAARGLEFLHAGVGRQSVIHRDVKSTNILLDENWVAKVSDFGLSKVGSNASHVTTDVKGSVGYLDPEYYMSLWLTHKSDVYSFGVILLEALCGRAPIVSRVEKDQECLVAWVKRCFDDGNVHETVDPVLKGSIRSKCLNKFVEIALSCLNDHGKDRPLMRDVVKGLEYALNLQCRLAQGEREIGLTEMERHGEFDEKFASSSSKATTTCSEEEQALVHVMFSDLGNQRPR*


CDS Sequence:
>Vu_04502.1
ATGAGAATTCCACTAATAGCCTCTCTTGTGGCTGCGTCGTTGTTGCTATTGTCGTTCGTCATCGGATTCATAATCTTCCGATGCGTAAGAAGAGTTAACTCCGACAGAGATAGCAACTCGGAGTCTTCAAGCACGCGCTGCCGCGAGTTTTCTCTGGCGGAGATAAGAGCAGCCACCAGCAACTTCGAAGAGCGTTTAATCGTGGGCAGAGGAGGGTTCGGGAACGTGTACAAGGGGCACATCGACAGGAGTCACAAGCCCGTGGCCATCAAGCGGCTCAAACCGGGTTCGGACCAGGGCGCACACGAGTTCCAAACCGAGATCAAGATGCTCTCACGATTCCGCCACGAGCACTTGGTTTCCCTCATTGGGTACTGCAACGACGGTAGAGAAATGATACTCGTCTATGATTTCATGGCGCGTGGGACCCTCCGCGACCACTTGTACGGCTCAGGCGAGGTGCTGTCGTGGAAGCGGCGACTGAAGATCTGCCTGGAGGCCGCACGTGGGCTTGAGTTCCTCCACGCAGGCGTGGGCCGGCAGAGCGTAATCCACCGTGACGTGAAGAGCACAAACATCCTGCTGGACGAGAATTGGGTGGCGAAGGTGTCGGATTTCGGGTTGTCAAAGGTGGGATCGAACGCGTCGCACGTGACAACAGACGTTAAGGGTAGTGTGGGATACTTGGATCCTGAGTACTATATGAGTCTTTGGTTGACTCATAAATCCGACGTCTACTCCTTTGGCGTGATTTTGCTTGAGGCATTGTGTGGGAGAGCACCTATAGTGAGCAGGGTGGAGAAGGATCAAGAGTGTTTGGTGGCGTGGGTGAAGCGGTGTTTTGACGATGGGAATGTTCATGAGACGGTGGATCCGGTTTTGAAAGGTAGCATACGCTCCAAGTGTTTGAATAAGTTCGTGGAGATTGCTCTGAGTTGTTTGAATGATCATGGCAAGGACCGGCCTCTGATGAGAGACGTGGTGAAGGGGTTGGAGTATGCGTTGAATTTGCAATGCCGCTTGGCGCAAGGTGAACGGGAAATTGGCTTGACAGAAATGGAGCGTCATGGCGAATTTGACGAAAAATTTGCTTCTTCCAGTAGTAAAGCTACGACGACATGCAGTGAGGAGGAGCAAGCTTTGGTGCATGTCATGTTCTCTGACCTTGGAAATCAAAGGCCACGGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_04502::LG1:62671544-62673544(-)
TTGATTGTTCAACAACATTTAACCTACCCGCGAAAGGATGACCGACCAAAGTCTCTGCTAATTCATGGTTGTGATAGCCGCACATAAGCTTTAACACCCAACCATCTCCTTTAGGTTTACCCCTCAACCTAAACGAACACTCACATTTTCTTGTGCCAGAGAAACTAGGTTGAACATCTGGCTTATACTTCCTATACTTCCCGCTTCTTTCACAGCCTAACAAAATAAATGTCTTTCTACCAGCTTCACCAGTTGCTGTGTCAGATCTTATAATGACGACAACAAATCCAAGATCAAATGCAATCTTTCGAACCCATTCAATTAAATTGGCGCGTGTTGGGAATATTTGATCAGTGGAAAATTGATCTGTGTAATCACCCTCACCCACTTCTTTTAAAAAAATAAGAAAACTCCGATATAAAATCAGAATTTATTTCAGAATCCAAATATGGATACTTATCCATCTGATATAATTAAATATGACCTACAATAAATATTACAATTTAAAATTTTATTAAATTACAAATAAAAAATTCAAAAACACTTTTAAAATTAAAATGAAACTATAAAGAAGTTCTTTAACCTAATGTTAATGAAAACTTATATTTTTAGAACTACAAATTATGCCCTGAACTAGATAGAGTATCTTTCTATCGTAAGTGAACCTTAAGTTGCTGGATAAGGCAAGATAATAATATTGAGTTGTTGGATAAGGCAAGAGAATAATATTGAGTCAAGATAATAATATTGAGTTGTTGGATAAAGCAAGAGAATAATATTGAGTCTAGTGGGATCTTAACTTTCATATTCATCTTTTCAACATAAAAATCAACTAACCTAAATATGATTAAAGAGGTTTTTCCAATTCATTCTTTGACTAATAATACACTGCCTAATGACTAAGCATAATTCATGAACAAGAAATTTAAAATAAAAAATCATAACATAAAACAAGAAATTTAAAATAAAAAATAATAGCATAAGACAAAAAACATGAAAGAAAAAAAGCATGCACGAAATAAAGAAAAAAAAAGGGTGCACATATAAGAAACACACTTCAAAGTGCGGCCACTAAAAAATAAAAAACACACTTCGAAGTGCGGCCACTAGTTTCCGCAACTCGAAGTGCGGTTAGGAGATTCTGCGACTCCAATGACGTACCTGTCTTCTTCCTCTCGCCGAAGAATGCCACAGTACCACCAGATCTCCCAAAGAATGCCACAGCACCACCAGATCTCCCAGCACACCCAGCACTACCAGGGAATGATAACCACCAACTCAATACAGTAAAGGAATGAAAAAAAATAACAAAAACAGTAAACAAAATGCTTGCTATGCTACAGTGAAAACGAAGAAGACGGCTGCACCTTAGGGTTTATACCCAAAACAAATTTTAGTTGTTGGCAGTTACGAAAATGGTTGGTGGTTAAGAAACATTAATTCATTAATTAAGTTTTGACTTTTTATTAAATGAAGGGTAAAAAAGGTAAAATTGGGGGTGGAGGATGAAGGCAGTGAGGTGTAGGAAGAAAGACTCTTATATTAATATTGGGAAATATTCACAAACTATTTGTCACTTGCCCAAATCATCAAATCAACGATACTGATACAATGTTTCTGTGAAGGACTAATGCTTTTAGAGAAAAACATGATTAATGCAGCAAGTGGAGACACTTTAATGGATAAAACAAATGTAAGTGGAGACACTTTAAGGGATAAAACACATGTAGTTGCTCAGGTCTTAATTTCCAACATGACAAAGAATTCTCAACAATTCAACCGTTCTCGGATGTCTGTCAGGTAGGTTCATGTAATTCACTTCTTATTGTCATTGTTTTATTCATTTAATCAACAATACATTTAAGTTTAGAAAAATATACTTTTTAACATACATAAAATTTTTGATATTATTTTTATTTTTTTTAAAAATATAAAGCTTACTCCATGAATGTAAAAGTGTATAGATCATATGTAATGTGGGTCTATCATTTTTCAGTTGT


Gene Sequence:
>Vu_04502(-)
GAAAGGGAAGTACTTCCAAAAAGCAATGTCAAGTGACACTCCAATCTTCTTCCTCTTTATTTCTACCCTTCTTCACACCCCGGTTTCCGTCGTCACTAGTCTCTTTTCTCCCTCAAAGTTAACCCCACTCTCCTGAGTAACTTCAACGCTTCACTCCTCCACAAAAGAATACTACATAAACGTGGAACCCAAACGAAACTTAAACATTCACACCAAGCAGCACCACTCATCCCAAAGCTTACGCATTCAGCAATGGCATCGAAGCCATGTCATGCCAACTGATCTCGATCAAGCCCTCACCAAGGATACAAGTGAAAGCACCACTTTGAAGCCAGAGCACAGAATCAAGATTGGAGGTAACAAGATTTCCAAACCCTCACCCTCTTACCTCACCCAAACCATCAAACCCAACAAGCATGAGAATTCCACTAATAGCCTCTCTTGTGGCTGCGTCGTTGTTGCTATTGTCGTTCGTCATCGGATTCATAATCTTCCGATGCGTAAGAAGAGTTAACTCCGACAGAGATAGCAACTCGGAGTCTTCAAGCACGCGCTGCCGCGAGTTTTCTCTGGCGGAGATAAGAGCAGCCACCAGCAACTTCGAAGAGCGTTTAATCGTGGGCAGAGGAGGGTTCGGGAACGTGTACAAGGGGCACATCGACAGGAGTCACAAGCCCGTGGCCATCAAGCGGCTCAAACCGGGTTCGGACCAGGGCGCACACGAGTTCCAAACCGAGATCAAGATGCTCTCACGATTCCGCCACGAGCACTTGGTTTCCCTCATTGGGTACTGCAACGACGGTAGAGAAATGATACTCGTCTATGATTTCATGGCGCGTGGGACCCTCCGCGACCACTTGTACGGCTCAGGCGAGGTGCTGTCGTGGAAGCGGCGACTGAAGATCTGCCTGGAGGCCGCACGTGGGCTTGAGTTCCTCCACGCAGGCGTGGGCCGGCAGAGCGTAATCCACCGTGACGTGAAGAGCACAAACATCCTGCTGGACGAGAATTGGGTGGCGAAGGTGTCGGATTTCGGGTTGTCAAAGGTGGGATCGAACGCGTCGCACGTGACAACAGACGTTAAGGGTAGTGTGGGATACTTGGATCCTGAGTACTATATGAGTCTTTGGTTGACTCATAAATCCGACGTCTACTCCTTTGGCGTGATTTTGCTTGAGGCATTGTGTGGGAGAGCACCTATAGTGAGCAGGGTGGAGAAGGATCAAGAGTGTTTGGTGGCGTGGGTGAAGCGGTGTTTTGACGATGGGAATGTTCATGAGACGGTGGATCCGGTTTTGAAAGGTAGCATACGCTCCAAGTGTTTGAATAAGTTCGTGGAGATTGCTCTGAGTTGTTTGAATGATCATGGCAAGGACCGGCCTCTGATGAGAGACGTGGTGAAGGGGTTGGAGTATGCGTTGAATTTGCAATGCCGCTTGGCGCAAGGTGAACGGGAAATTGGCTTGACAGAAATGGAGCGTCATGGCGAATTTGACGAAAAATTTGCTTCTTCCAGTAGTAAAGCTACGACGACATGCAGTGAGGAGGAGCAAGCTTTGGTGCATGTCATGTTCTCTGACCTTGGAAATCAAAGGCCACGGTAATTAATGTAATCAAACTCTGCTAATGTCCATCTTGTATATCACGGAGAAATACTAACTAGTGGGTTAATGTATGGATTTACTGGCAAATTTTAGATGTTCCTGAACCATAATTTCTAGTTAATGTTTACATAACACTAGTATTAATAAACGTTTTTATTGAGATCC