Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04483 LG1 62297510 62301441 PREDICTED: zinc finger protein 4-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 62297578 5_prime_UTR_variant
G/A 62297591 5_prime_UTR_variant
T/A 62297910 intron_variant
C/T 62297917 intron_variant
A/G 62298230 intron_variant
G/C 62298252 intron_variant
G/T 62298426 intron_variant
A/T 62298731 intron_variant
A/G 62299063 intron_variant
G/A 62299064 intron_variant
A/T 62299217 intron_variant
T/A 62299874 intron_variant
T/C 62300138 intron_variant
T/A 62300599 synonymous_variant p.Thr40Thr
G/A 62300653 synonymous_variant p.Leu58Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04483.1
MMTPNLNLEAENHSEGSSQVASNVSLHEASYDLTKGSTTTSSCLTKDETDPGSVTLDLTLNFNSSDSELKGSSDASSEVGAEPPASASATPRVFSCNYCRRKFYSSQALGGHQNAHKRERTMAKRALRMGMFTERYTSLASLPLHGSPFRSLGLEAHSAMHQRHVSSSMRTPDMRAAARFERNHFGSLVFMEDDDVGLFWPGSFRQVDQGAGVTEGHVQSSNPSLVPIVPPPPQASASPDLTLKL*


CDS Sequence:
>Vu_04483.1
ATGATGACTCCAAACTTGAACTTGGAAGCTGAAAATCATTCAGAAGGAAGTAGCCAGGTGGCATCCAATGTCTCCTTGCATGAAGCATCTTATGATCTTACAAAGGGCAGCACCACCACTTCCTCCTGTCTGACAAAGGATGAAACTGATCCAGGTTCTGTTACCCTTGACTTGACACTCAACTTCAATTCCAGTGATAGTGAGTTGAAAGGTTCTAGTGATGCTAGCAGTGAAGTGGGAGCTGAACCTCCTGCTTCAGCATCAGCAACTCCCAGGGTTTTTTCTTGTAACTACTGCAGGAGGAAGTTCTATAGTTCGCAGGCATTAGGAGGCCATCAAAATGCTCACAAAAGGGAGAGGACAATGGCTAAGCGTGCATTGAGAATGGGAATGTTCACTGAGAGGTACACAAGTTTGGCATCTCTACCTCTTCATGGTTCACCTTTTAGGTCTCTTGGTCTTGAAGCTCATTCTGCAATGCACCAAAGACACGTCTCATCCTCAATGAGAACTCCTGATATGAGAGCCGCTGCAAGATTTGAAAGAAACCATTTTGGATCACTGGTTTTCATGGAAGATGATGATGTTGGATTGTTTTGGCCTGGAAGTTTCAGACAGGTAGACCAAGGAGCTGGTGTTACTGAAGGACATGTTCAAAGCTCAAATCCCAGTCTTGTTCCAATAGTGCCTCCTCCACCACAAGCTTCTGCTTCTCCGGATCTCACATTGAAGCTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_04483::LG1:62295510-62297510(+)
CTAAAGCCTAATGTTTATATATATAATTAAAATATGTTAATTTTTGTACAAATTTGGAAATTTTCTTCAATTATTTGGACTTGGGTCTAGAAAACGATTCCATTGAGGTATATGGGCTCGATTTTTTGACAACCAAGGCCAGTCCCTTTTTTAGATAAAATATTTAAATAAAAAGAGAGGATATTTTGATATTTCTTTCAACTTTTTATCCATGAGTCTAGAAAAATGGAAGTCATAAAGGTATATGGCATCGGTTCTTTATCAACCAAGGTCAAATCCTCTTTCTTAAATAAAGTATTTAAATAAATAATGAGACTTTTGAAAAATTTTGAAAATTTTGGTACACATCGCTCTACAATAACCAAAGTCATATGTGTATATAGCCTCAATTATTTGAAAATTAAAACTAAATCTCCTCTCTTAGATTAAATAATTATAAAGTAGATATTTTGAAAAATTTTGAAAGATAATTATCAACTAAATCTCCTTTCTTAGAGCATATTGGTCATGTTGGGTTGGTTTGGGAAGAGGCTAGGTTTGTCTGGGTCAGTTCCTAATCAAGATGGGCGAGGTTAGGTCAGGTTGAGGTTAAGTAGGTAGGTTAGGTTGGACATTAGTCAAGGTAAGGTCTCGATCAAGCCAAAGTTGATAGGGTCCATAACATGTTGAGTTGAATCGAGTCCATGTTGGACCAAGTTGAGTTAGACCCATGTTAGGTCGAGTCAAGTCAAACAACTAGTAGATCAAATCAAGTTAGGTTTACCTTGGATTAAGTCAAGTTAAGTGCATCTCAAACTTATTTGAGGGCTAAATGGAGTTAAACGCACCTCGACCCGAGTTAGGTAAGAACACATTAGGCTAAGCGAAGTTTGACTCACGTTGAGTTGAACCAATTCAAACTCAGTTTAAAGTTAATTTAAAATATTAATGATTCGATTTGTAATTTAAAATATTTTAAGGAAAAATTAATTTTAAAATATTTGTGGAGGTTAATTGAATTTTTATTGTGGAGAGTCTTGACCCTGATTCACTTTATATGAGCATTTTATAAGTTGAGTGTTTTTTAAGTCCTTAGTGTTGTAATGAAAAGAGACTTGTTTTAAGATTGATTAAGGTTGGGTCATAGACGAAATAAATCGAATTAAAAATTCTAAATTTAACACTAATAAGACATGATTCAAACTCATATAAGGAATTCACTTCACCTCTAACTCAAAATCTAGATGTATGAATCTTCTCTTTATACGTGGTTAAAGTTTCTGGTCTTCTCTCACTCTCGCTGAATTCCTGCCAAGTGACCATATTATTTCTAAACGAAGGAATCCTTAATATCATGATGTCTTATCTTTGAGTTAACTTAGTATTGCAAGGAAAAACGATAATAGGGTCATCTCCAATATGTTATAGTTTTATAAACAATTAAAACAGTGATAATGATAAGTGTGGAAGTGTTTTAGTGGGAAGAGGAAAGAGAAAGAAAGAGCAAAATGCAATGTGCAGGTTGGAAAAGATGGGGAAGTTATGGGAGTCCATATGAATGAATATGACAAAGGTGGCTGGGTCAATCAATGGTAAAGAAAAATATCCTCTATAGTTGAAGCAGATAATAATAGAAAATGTGTATCACTTAAAGACATAAAGCTAACGTTAAATATGGAACAGAAGGGACCACTATCTTTTGTAGTGGACGCAAAACGACCATTAAGGAAATTCTATTTTATTTGAATTATAAACAAAAAAACTGATGCATATTTATTATTTATGCTCTAGCACAGTTAGTGGGACCATGATGAGAATTTATGAAGATAAAACATAGCTAAAATTATTAGCCACATTTTGATTTTATTAGTTGTTTCACGTTTTGTGCAGCAGCATGCGTCCGGTTGAGTTGAGTAGATAGCTAGCTAGCTGGTGGGTCTTGGCAGGTAAAGTAGTGATTGCTTTTCTTGTCTATGATGTTTGGTCATTTTTAACATCTCACACAGACAGACAGAAAGACA


Gene Sequence:
>Vu_04483(+)
AGACACAGACACGTTCACACTAACTGATAATTAGCCCTCATCAGTTAAAGTTAAGCAGTGGCAAAATACAACCTCAAATTCGACAAAAGACGTGGTTCATGTCTTCATGTTATCTGACTTTCCTCCATCACCTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTTGCTTTCCCATAACATAACTCTTTTTCTTTCTCTCTTTTTCTCTGTCTGTGATCTTATCTATCTCTCCTTTTAATTATTCACTCACCCCTTTACACTGCTTGATGCTAAAAAACATGGTACCCTCTATTGTTGGTTGTTGCTGATACTCCTCATACTCACAACTAGGTGCCTAGCAACAGCATGTGAGGGAAGGAGCCTGCAGATTTATCGTACTGTACTATGGTTTGTTATGTAAGTTCCTCTTTTTCACCCATCTCATCACTGAAAAAAGATTTGTTTTTCGTTATGCACTTTCTTCCAATTCCTCCCTTCATTTTAACCCATTCTTCTGCTGCCTTTTTTATTTCCTTCTTCATTCTCTTTCTTTTGTTTCACTTTTTCTTTGATTGCTCTACTGCTTCTCTCATTTTGTGTTTTTGGAGTCTCATGATGGTCCACTTTGGCTTGCAAGAAATGAAAATTTTTTATGCTAATGTTGAGGGTTTTGTGTCTGGTTTATGTGATAATCTGAAACCGTTTCTGTAATGGGTAATTACAATTTTGTCAGTTTACTAAGAAAAGAAAAGGTTATACCTACCAGTTGAGTATCAAAATTTAGATCTATGTTCTTAAGTTCAAGCGGAAGCATCAGATTTTATGAGAATAATTTCTCTTTTCTTGTATTCTACTGTTTATGAGAATAATTCCAACTGTTTTTCGTCTTCTTTTCTCCTATAACCTTTCGAGATGATAATTACCTGTTCGATTTCCATGTTTTAGGACTGCTTTTGGGTGGTTAATTAGTTGATTAGACATATTGGAATTATCTGGCTAATCTCTGGAGTTAATTTACTTCCATGAAAGCATGGAATTAGATTTCTCATGTTTATGTTAATAACCTCTTGAGTGTTCTGTTAAACCTATCTGATTTAAATAATACATTTTTGCAACTCCACCAAATTTTCTGACATGACCCTTTTCATCTCAGTATATTTGAAAATACCATTGGCTTTTGCCAGCAAATAAAGGATTAATAGCTGTAAAATTTGGCATGGCAAGGACCTAGTAGACTCATGATTGGAGGACAATTCCACAATTTACTATTGATGGGAAGAACAGTTATAGGTCACAACAACCGACAATATATAATGCTACTTTTATACTTTTGCTTAAATTAGTGCATCGTAGAATCACTTATTTTCTGCTTAAATTAGCATCAATGAGGGAAAACTTGAGTGGGAATCTACAGTGTCTTGAAAAAAGGGAATGAACCGTGCTATGACCAACTAAATAGCCACCGAGGTTGTCTTATTCTAGTATTTTACTCAATAAAATGTGCTAAACATCATGAGACGAACTAGATTCTACTAAGTAAAAGAAAATATATGAAATACATAACATAGTAATGCTCATTTAAGTACCATCAAGGGATAAGGAACATAAGGTACATTTTGCACCAAGTCTCCTGTCATATGGAACCAAACCACAAGGTACATTTTGTATTTAAGTCTTCTTTTGTATCCAACGTATGTTTCCATTGTTGTACGAAATGAATAAATAAAAAGATGACAAAAAAAAAGTTTATTTCCATTTAACTATTTTTCTTGGGTGATTATCTTGCATTAGAACATATTCATCCGAAAACTTTTTTGCTAAATTGTTGTTATGAAAAGCTTAAAAGATATGAAAGAAGAAAGTCACTCTGATTCTTCATATGTCCTTCAATTTGCATACTTTTCTTAAATTGTCTAGCTATGGATGCATCAGCTAACACTTGAGTTCACTTAAGGAGGCTGTTTTTAAGGGGAAGGACCAAATTTTGTTTGTTGTAACTTGAGTCACAATTCCTTGGTAGATAGATTACTTTTAATATGACTGTTTGAATGTCAAATCCTCTTTGATGAAACAAAAGATAACTTTGTTTAAGCAAAGCATAATTGTACCCTTTCCCGAGCAATTCAGGTGAGTAAATTATATTCATGGTTCTGGTTGTGGATCAAAATTATTTTTTAAGAATTCAGTGGAAAGTGCTATACATTGGTTTTCCATAAAGAATTATGCCGCATCCATGATAATTGGCTTGTAAGAAATCACTGGTTAACATTTATATGTACTCTCTTCATCTTGGTCATAATGGAGAAACATACTTAGGTTTGTCCCCTGGGAATTCGAAGGGACTGTTTGAGAAACTGCATAACTGACATTAAAAAATGTATTGGTAGGAATGTTTTGTGGTTTGAATTTCTATCCTCTTCGGCATTATTCACTTTAGGTCTCTATGAAGAAAGACAAAAATAGGCATTTTAGGCAACAAGAAAATTTGGTAACTTTTTTTTTTTGTTAGGAGATATTTTGTTCAAAGTGGCACTACTGTAAATGAACTGTTACATGTGATGTGAACTGTGTTTTCTATTGATGAAATTCATGTGCCAACTTTTACTTTTGCGGTATTGCTGTCTATATTTGAGCAATGATAACACTCTGTCTCTGTTAGCAGCACTTAAATGATATTTTTATTTTAGTGCTGAGATAAAAACAATAGAAACCATGAAGTTGCCTATGTGTAAGACCATACAGTTGATGCGAGACGAGATATATTATATGATTGGATTGGTAGGGTTTGCTCTACTTCGATTCCATATTATTGCCACTTTATGTTAATGCCAGAATGTATCTTCCATTTTGCAAACACAAACAAAACTCCGAACTTTACATAGCATATAATGTGTTTGATAAAAATGCAGGCAATGGTATCATGGTAAGCTGAGTAACGGATTTGTTCCACCCAAGTGCCTTCTGGGAAAAAAGTGAACTCTTAACAGGGCCATACAACATGATGACTCCAAACTTGAACTTGGAAGCTGAAAATCATTCAGAAGGAAGTAGCCAGGTGGCATCCAATGTCTCCTTGCATGAAGCATCTTATGATCTTACAAAGGGCAGCACCACCACTTCCTCCTGTCTGACAAAGGATGAAACTGATCCAGGTTCTGTTACCCTTGACTTGACACTCAACTTCAATTCCAGTGATAGTGAGTTGAAAGGTTCTAGTGATGCTAGCAGTGAAGTGGGAGCTGAACCTCCTGCTTCAGCATCAGCAACTCCCAGGGTTTTTTCTTGTAACTACTGCAGGAGGAAGTTCTATAGTTCGCAGGCATTAGGAGGCCATCAAAATGCTCACAAAAGGGAGAGGACAATGGCTAAGCGTGCATTGAGAATGGGAATGTTCACTGAGAGGTACACAAGTTTGGCATCTCTACCTCTTCATGGTTCACCTTTTAGGTCTCTTGGTCTTGAAGCTCATTCTGCAATGCACCAAAGACACGTCTCATCCTCAATGAGAACTCCTGATATGAGAGCCGCTGCAAGATTTGAAAGAAACCATTTTGGATCACTGGTTTTCATGGAAGATGATGATGTTGGATTGTTTTGGCCTGGAAGTTTCAGACAGGTAGACCAAGGAGCTGGTGTTACTGAAGGACATGTTCAAAGCTCAAATCCCAGTCTTGTTCCAATAGTGCCTCCTCCACCACAAGCTTCTGCTTCTCCGGATCTCACATTGAAGCTTTGAGTTGACCTCAGAAGGATACATACACAAACAAAGGCCTCACAGAGTAATAAATAAGTGGCTAAGAAGTGAATCATCCATTGCATTATAATTACATTTCTCAACCATTACTTTGAGGGGTTAGTTATCAGAGTTTTATATATATGTGTATGTACCACTTCTCTTAAAGATGTTTTAATATTTGATTCTCTTCCGAAGTGAAATTATTAATTAATAGGCGTGCACTG