Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04480 LG1 62236417 62239582 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 62236540 missense_variant p.Phe42Ile
G/C 62237202 missense_variant p.Gln262His
A/T 62237277 intron_variant
T/A 62237284 intron_variant
C/G 62237355 intron_variant
G/C 62237357 intron_variant
G/C 62237379 intron_variant
A/T 62237460 intron_variant
T/G 62237473 intron_variant
T/C 62237478 intron_variant
G/C 62237482 intron_variant
A/T 62238322 missense_variant p.Thr334Ser
T/A 62238328 missense_variant p.Phe336Ile
T/A 62238490 intron_variant
A/T 62238491 intron_variant
G/A 62238613 intron_variant
T/C 62238632 intron_variant
T/C 62238859 missense_variant p.Trp445Arg
A/T 62238888 synonymous_variant p.Ser454Ser
C/T 62239002 synonymous_variant p.Asn492Asn
G/A 62239326 stop_gained p.Trp600*
G/T 62239339 missense_variant p.Gly605Cys
C/T 62239342 stop_gained p.Gln606*
G/T 62239480 missense_variant p.Gly652Cys
T/C 62239506 synonymous_variant p.Tyr660Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04480.1
MDKVNIKKEQRHGIDHLYRRPTLPSFLIFSAFSMANVPVSFFFLASMFLVLVASISSQEENKHEECSKPFSCGLTSIYYPFWGGSRPSYCASNHKFKLNCEDNQNSTLQLGSQTFQVLHFDPVQYTVKIVRTGIVYDNCSSSAVTNNSVDSNLFRYLNVRNITIYYGCPYSLISNSTRSFQCKEDGNKSAFYGDPATGKVQDCDGARIEVQVAQELDPDRGIQGLNKALSEGFEIHLISEAQVQCLKCVSTNGTCGANNESQFSCFCPNGSEGLDCSNSDKWNWQRKLVIGVAAAVISGIVFSLGFYIYYGRLKKKNRLREVTPSVIYNSKGISHSSSLEDYEKGSKYIGVHFFTYSELEEATNFFNPDRELGDGGFGKVYFGKLQDGRLVAVKRMYENSLKRVEQFVNEVEILTGLHHQNLVSLYGCTPRHSRELLLVYEYIPNGTVADHLHGQRAKPGTLPWHIRMNIAIETANALVYLHASDIIHRDVKTNNILLDNHFSVKVADFGLSRPFPIHATHVSTAPQGTPGYVDPEYHEYYQLTDKSDVYSFGVVLIELISSMHAVDISRRRHEINLSNMAIKKIQSGALHEIVDPTLGFGSDFKVRKMISAVAELAFQCLQSSKDVRPTMAEVLDRLEDIRSDGKYKSRHEVLDISEDDIAFLKNEPPPPSPDSNFQTVRSIVN*


CDS Sequence:
>Vu_04480.1
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Promoter Sequence:
>Vu_04480::LG1:62234417-62236417(+)
TTTGGTTTTGAATCCAACATGTATTAGTTCTGAAATGCATTTGAGTTACACTTTAGAATGTAGTTTTAGATATGAAATATATTCCGGATTATATAATAAAAAATACATTTGAGAACAATACATTTTATATTATCGAGAATTATTTTGTTTTGAAATACATTTCAAATTTTTGATTTGAAATCATATTTTGAACTGCACAGTCTAAAACATATTTTAGAACCAATATGAGAACGTGTAATCCAAAATATATTTCAAAACCAAATACATTTTAAATCTTTCAGTCTGAAAGAAATTTTGAATTTCACAATTGAACAGGTATTTGATTTTGAAATGCATTTGAGACAGTAAAATCCAAAATGTATTCCAAAAACATTAATGTTTTGCATACCAATACACTGATTCCGTTCGCTCCGCCCCCAACCCGAAATCGAAAAAAATAATGCGGATTAACCTCTTCATTTCACTAAAGCTATCGGGGTTCAAGAAGAAAACATGAGAGAACTCATTTACTCATATTATATAATAGTCATTTAGATTTCATTTTAAGCGTGATTGTCCACTAAATTAACATAATAAGAGGTATAATAACTTGAGTAAAAATAAGTTATTTTAAATTTTTTATTCCATTTCTCTTTTATTTTGATCTTTTAGGATTATTGTTACCCAATGGATCAAAATGATTGACTCTTTAAAAATGTATCACATAAGTTAATTATCAAATATGACAAATAGAATTCTATATAGATATAAGAGCAAAATTCAATTTAGTTCATTAGATACAAATTGACTTAAGTAGAAATTTAATTTGTTGCAAATGATTTAATTTAATCTGTTAGTTGATTCCATTTACATTATAATTATTTTACATATCATTGTTTATTTGTTTTATAAAAAAATGATATGAATAAAAATTAATTATATAAAATTAATAAGATAAAATATAATATTTATTATAGACCCAGTTAAAACATGAATCAATAGAGTAAAAATAAACATAATTGAACTTGAATTCCTTTAATGAATTCAACTTTTAATTTACGTGTTGTTCATTTGATTTGTGAATCAAGTTTGACAAGTGAATCATCAAATCGAGTTTTAAACTATGTTACTGGTGGTTTGGTTCATTCCTTTTCTAAAGCTAATGAGTTCTTCGTTTTGCAGACATCCTACTGTAACTGTCCATTTCTAATATATTTATTCCTTGACTTTGTCAAACCAAGCACACAATCATGTGTCATTTTATATCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAGATATGTCTTGTCAGCCCATTCCAGCATGTTAAAGACTAATATTATAATAAAGTGTCAAACTTCAGAAAATAATACTTAAAACATTGGTATTCAAGACCCCACCATTTCCTTAATTTGAAAAGTCAATATCTGATAAAACTATTTAGATCAACGTCAAGTAATCACATGTGTGATTCAATGCTTCAGACAGAGCTTTGAAATATTTGCATACTTGTTGAAATATGTGAATTTTGGTGTGATTGCAGATAAAACACACCATATAATATGATGGAGCGTTTCTTGATATGATATAACAAAACTTGAAATCAAGCTTTCGGGGTATGAACATCACATATTCAAAACTTGAAAAATCTAATTAAACTATATATTTTTTATTATAATCTCAAATATGGTCGCGAAGTGTGATCATCATAACGGTATATTAATAAAAAAATATCAATATATTTTTATTGATGAATATTTTATAAACTTTTGTTGTATATCAACCCATGGTATTCAAAATTTGAAAAAAATAATTGTACTCGTGTCTTGTAATAGCTGTTGAGGTGGCGAGGTGGAAGGTTCATAAGACCAAGATTGGAACAAGAAACGCAAATATCGTCCAATTCAGCAGCTATTGAAAATTCAGAAGGTCAA


Gene Sequence:
>Vu_04480(+)
ATGGATAAAGTGAATATTAAAAAGGAACAACGTCATGGCATTGATCACTTATATCGTAGACCTACCCTTCCTTCATTTCTCATTTTCTCTGCTTTTTCTATGGCTAATGTTCCAGTGAGCTTCTTCTTCCTTGCATCAATGTTCTTGGTCTTGGTGGCATCAATCAGTTCCCAAGAAGAGAACAAACACGAAGAGTGTAGCAAGCCATTCAGCTGCGGACTAACGTCCATCTACTACCCTTTCTGGGGAGGGAGCAGACCCAGTTATTGTGCTAGCAACCACAAATTCAAGCTCAACTGTGAGGATAATCAAAACTCCACCCTTCAACTTGGCTCACAAACTTTTCAAGTTCTTCACTTTGATCCAGTTCAGTACACCGTGAAAATCGTTCGAACAGGCATTGTCTATGATAATTGCTCTTCCTCGGCCGTAACCAACAACTCCGTGGATTCAAATCTCTTTCGATACTTGAATGTTAGGAACATCACCATCTACTATGGTTGTCCCTATTCCCTGATTTCAAACAGCACACGCTCTTTTCAATGCAAGGAAGATGGTAACAAGAGTGCTTTCTATGGGGACCCTGCAACTGGGAAAGTCCAAGACTGTGATGGAGCTAGGATTGAAGTGCAAGTAGCACAGGAACTTGACCCTGATCGGGGAATTCAAGGACTCAACAAAGCCTTGAGTGAAGGGTTTGAAATACATCTTATTTCAGAGGCACAAGTTCAGTGCTTAAAATGCGTTTCAACTAATGGAACATGTGGGGCTAATAATGAGTCTCAGTTTTCATGCTTTTGCCCCAATGGAAGTGAAGGTTTAGATTGCTCTAATAGTATGTCTTCTTTCACTTCTCTTCTATTCTCTTCATTCAATGTGTCCTTCATGCACATATACATATGGATTTCAACTTTTGATAATAGATTTATTTTGTTTGCCTGTTGAAATCTGTAGAAATGGCTGTTTAGAAATCTGTAGAACTAGGAACCTAGTAAAAAATAAACCATTGACCAAGTCAGAGAACAATTTTGTTGTAGCTAATTAGATAAAAATATTTCTGGTGTTGAAAGATGTTACAGGAACCTATGTTAGGATTTAGGTGGCTGATGAATCTTTTAGGTGGCTGATGAATCTTCAAAGTTGTTGACTCTTTTTTGTGGGTTGGTGGCAAACAATTTGTTGCTTCTAGTTTAGGAGGCTTCACAGAAATCCTCCTCTTATTTCTTCAGAATTTTCTGTGACACGGAATAATATGATTAGGTTGTGTTTGGACATTTATTTTTTCACGTGTTTATTTTGTCTTAGTGGTGTTAATTTGGTGCTCACAAAGTATTGCCAAAGTGATGTTACATCTTCTGAATTTTTCAATAATGGTCTAATCATAAATTACATTCTTTGATGTGGTTGTGTTCTTTTCTCCCTCTCCATCTAAATCCAGATTTTATAGTGCAATTCTATGTGAAACTATTTTGGTCTGTTGACTTTGACGATATGTTGCTTATCATTCTCTTTTTATGTAGTTTACTCATTACCTAACTCATAAAAAATTAGATATTTTTCTTCTATATCCTCCTTGAATTTTCATGATTTTCCACAAACTGTTCTCACTCCTGTTTGTCTTCTATGTGGACTGTCTCAGGCGATAAATGGAACTGGCAAAGGAAGCTGGTTATAGGTAATATATATCCCATTATCCTTGGAAGAGAATTCACAATGTTGTATAATATTTCATTAATACAGTTATACTAACCGAAAATTTGAATGATTGTTGGTAGGTGTTGCTGCTGCAGTGATAAGTGGAATTGTATTTAGCCTTGGCTTTTACATCTATTATGGTCGTCTAAAGAAGAAGAATCGTCTCCGTGAAGTAACACCTTCTGTAATATATAATTCTAAAGGAATCTCACATAGTTCTTCTTTAGAAGATTATGAGAAGGGAAGTAAATACATTGGAGTCCACTTCTTCACCTATAGTGAACTTGAAGAGGCCACAAACTTCTTTAATCCAGACAGAGAACTAGGAGACGGAGGATTTGGAAAAGTGTATTTTGGTAAAACCAATCACCTTTCTCATAATTATTCACTAATTATCAATTTTGTACCTGAGACATTCACAGTTTATGTTGTTCTTAGTGACAAGCAATATTAGAATCTAACACTGAAAGGAACTTAGTTTCTTCTATAAAACTGTGTATAGAAAGTTTAGAATGGGAGATATATTGATTTGAATTGTGATATATTGATTTGTTGTGTAGGGAAACTTCAGGATGGACGATTAGTTGCAGTGAAGAGAATGTACGAGAACAGTTTGAAAAGAGTTGAGCAATTCGTGAATGAAGTGGAGATCTTAACTGGCCTACACCACCAGAACCTTGTGTCTCTATATGGATGCACTCCTCGCCACAGTAGAGAACTTCTGCTGGTGTACGAATACATTCCAAATGGAACCGTGGCTGATCATCTTCATGGTCAAAGAGCAAAACCTGGCACACTCCCTTGGCACATCAGAATGAACATTGCCATTGAAACTGCAAATGCATTGGTATATCTCCACGCTTCTGATATCATCCACAGAGACGTAAAAACCAACAACATTCTCCTTGACAACCACTTCAGTGTCAAAGTAGCAGATTTTGGCCTCTCACGTCCCTTCCCAATCCATGCCACACACGTTTCCACTGCCCCACAGGGAACTCCTGGTTATGTGGATCCAGAGTATCACGAGTACTACCAGCTCACTGATAAGAGTGATGTTTACAGCTTCGGGGTGGTGCTGATCGAGCTCATATCTTCTATGCATGCGGTTGATATCTCAAGGCGTAGACATGAGATCAACTTGTCCAACATGGCCATCAAGAAGATCCAAAGTGGTGCGTTGCATGAGATTGTGGATCCAACTCTTGGGTTTGGGTCAGATTTCAAGGTCAGGAAAATGATCAGTGCAGTGGCTGAGTTGGCGTTTCAGTGCTTGCAGAGTTCCAAAGATGTGAGGCCTACTATGGCAGAAGTGTTGGATAGACTTGAGGATATAAGAAGTGATGGGAAGTATAAGAGCAGGCATGAGGTGCTTGATATATCAGAAGATGATATTGCTTTCCTCAAGAATGAACCTCCTCCTCCTTCACCTGATTCAAATTTTCAAACTGTACGTAGTATAGTTAACTAG