Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04475 LG1 62143537 62148208 PREDICTED: putative receptor-like protein kinase At4g00960 isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   nucleus, plasma membrane
Molecular Function   enables   ATP binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, ATP binding
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 62143556 missense_variant p.Lys7Arg
G/A 62143723 splice_region_variant&intron_variant
A/G 62143878 intron_variant
A/T 62143879 intron_variant
G/A 62143884 intron_variant
C/T 62143888 intron_variant
A/T 62143893 intron_variant
C/G 62143947 intron_variant
C/T 62143953 intron_variant
G/A 62143975 intron_variant
G/A 62144412 intron_variant
C/T 62144800 intron_variant
T/C 62144811 intron_variant
A/T 62144832 intron_variant
C/T 62145175 intron_variant
C/G 62145178 intron_variant
C/T 62145544 intron_variant
T/A 62145753 intron_variant
G/A 62145762 intron_variant
G/C 62145801 intron_variant
G/T 62146014 intron_variant
C/T 62146156 intron_variant
G/T 62146275 intron_variant
T/C 62146285 intron_variant
T/A 62146525 intron_variant
T/A,* 62146763 intron_variant
T/C 62146836 intron_variant
G/C 62146888 intron_variant
G/A 62146937 intron_variant
T/C 62146954 intron_variant
G/A 62146974 intron_variant
G/A 62147262 intron_variant
A/T 62147632 intron_variant
C/A 62147640 intron_variant
G/A 62148138 missense_variant p.Ser304Asn
T/G 62148139 missense_variant p.Ser304Arg
A/C 62148169 missense_variant p.Glu314Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04475.1
MDRDKDKSHTHSFFRSFVKHFKFGSSKEGSDEADIQKMAAQEQKIFAYETLASVTKNFSDIHKLGEGESQKREKLDWKRRLGIITGVAKGLLYLHEDSHNCIIHRDIKASNILLDDKWTPKIADFGMARLFPEDQTQVNTRVAGTNGYMAPEYVMHGNLSVKADVFSYGVLVLELITGQRNSSFNLDVDAQSMLDWAYKMYKKGKSLEIVEPTLAGTMVGEEVAMCIQMGLLCTQGDPQLRPTMRRVVVMLSRKPGQMQEPTRPGVPGSRYRRPRRHSALSSTLGTSGASDSHTSDSSNYTTVTTSATGTSSATVESDPKGKRPMREG*


CDS Sequence:
>Vu_04475.1
ATGGACAGGGACAAGGACAAGTCTCACACTCACAGTTTTTTTCGCAGTTTCGTTAAACACTTCAAATTCGGTTCCAGTAAAGAGGGAAGCGATGAAGCTGACATACAGAAAATGGCTGCGCAAGAGCAGAAGATTTTTGCCTACGAAACCTTGGCTTCTGTCACCAAGAATTTTAGTGATATTCACAAGCTAGGCGAGGGAGAATCACAAAAGAGAGAGAAGCTGGATTGGAAACGTAGGTTGGGCATAATCACAGGCGTGGCAAAGGGTTTACTTTATCTGCACGAAGACTCACACAATTGCATCATCCATCGCGACATCAAGGCCAGTAATATCTTGCTTGATGACAAATGGACGCCCAAGATTGCAGATTTTGGCATGGCTCGTCTCTTCCCCGAAGATCAGACCCAAGTCAACACACGTGTGGCTGGAACCAATGGATACATGGCTCCAGAATATGTTATGCATGGAAATCTATCGGTGAAGGCAGATGTATTTAGTTATGGAGTTTTGGTATTGGAATTGATCACCGGCCAAAGAAACTCCTCTTTCAATTTGGACGTGGACGCCCAGAGCATGCTTGATTGGGCATACAAGATGTACAAGAAAGGGAAGAGCTTAGAAATTGTGGAACCGACGTTGGCAGGTACAATGGTAGGTGAAGAGGTAGCGATGTGCATTCAGATGGGTTTGTTATGCACTCAAGGTGATCCACAGCTACGTCCCACGATGAGGCGTGTGGTGGTGATGCTGTCAAGGAAACCAGGCCAGATGCAAGAACCAACCAGACCAGGGGTGCCTGGTTCTAGATACAGAAGACCTCGAAGACACTCTGCATTGTCTTCCACATTGGGTACCTCAGGTGCCTCCGATTCACACACTTCTGATTCAAGTAATTATACGACTGTTACTACTAGTGCCACTGGGACCAGCTCTGCCACTGTTGAATCAGACCCCAAGGGTAAACGTCCAATGAGGGAGGGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_04475::LG1:62141537-62143537(+)
CTATAATTATTCTTTTTTTTTTCTAATAACATTTTCAGATTTGGAGTTTTTTATAACTTTGTTGCAATATTTCTTAATTGGATGCGTAGAATTAAATAAACAAATGGTTTTTTTTTTGTCTTTTCAATAAATAAATAAAAAATGTTCCAACGAAGAAGCTTCAGAAAATATAATGCTTAAGTTAGAGTATTTTATGTGTGTATAAATGGAGATCCTAATATTCTAGCACTTCAACTTTTTTTGGAATGTCTTTTGTTTTGTTGGAATACTTTGATAATAACAATGAACGCATTTAATGCATTCTATTTAATAATAAATATTTTTCTTTATCAATCTCTTAATAGTTAGATGTATTAATTATTTATTTTTTGAGTAATATATATTTTCTTTATTTATCTTAAATTCTAGTGTCTTACAACGTAGAGAGTTCTTCTAACAATGGAAGAAAAATACCTTTAACTATTTGTCCAAGAAGTTATATTTATGAAACTTGTCATTTATTTAATGAATCTCTTATGTTAAACCAGAAAAAAAGAAAACATTCCCTAAAATATAAACTAACCTTTTTTCATTTTCTATTTGAATAAGTGTTTCATTATTTAAAAGCATTTATCAAATGAATACTAGACTAAGTAATATTATATATATTTAAAAGCTTATTCTACTTTTCTATGCGGTTAATGATTTAGATGTACTAAAAAAAATCAAATTAAACATAAATTACGATATTAGAGATTACATTGAACATTCTTCCCACGTCTACGCCGTTAATGATTTAGATGTCGTCAGAAAAAAGAACCAAATTAAACATAAATTACAAAATCAAATACATTTGAAAAATATAAGTTATACATTAAACAAAATTAACAAATATAGAAAAAAAATGATATTAAGCAAAAAAGAATTTATATTATATTACTTTTGTAACGTACATAAATTTACATATTTTATAAATATAACAAAAATAGATTTACGTCTTTTACATTGCAAGTGACTAAAAAACCTAAAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGATTTTTTTATATTAGTAGTTCCTTATGTATAAATAATAATATCACATTAATCAATTTATTAAAAACATCACTCTCTTTAATATCGCATATATTAAAAACTAATTTAGTTATTCACCGTGCAATCTATCTATTAATTTTGCTTAATAATTTATATGCATTTTTTCAAATAAATATTTTAAAAACATTTTAACATTTTGTGAAAAGATTCATAACTTTAAATTGAAAAACCTGAAAAACTAGGAAAAAGAAATTAGGTATTCATTTTATTAATATTTTAAATCATTGCATTAAAATTTAATATTTTATATCAACATTTATTTTAATTACTAAAATTATTGTCTAATATTAATAATGTTCAAATTTTCTTAAAAATATTTTTATTTTTCTAATTTAGTATTTTATACATATTTTAAAATAATCTTTATAAAGTATTTCTTACGTGAATAAATTTAATTTGGGAAATTTGTATCTGAAATCTATTAAATAAAAGAAGACTCCAAATTTGGGTCTTGCATAGTGTATTTATTTCCAGAAGGAAAAAGTAACAAAAATATTAAAAACACTCGTGTTAGGAAATAACGTTGAGACCAGATTTCCCTTTATAAACCAAATAGATCTAGTATCATGAATATTATTGGAGGAATTTTTTTTTTTGGAGTTTATTGAAGAAAAAATTCATACCGTAACAGAGTCAATCGAAAGTTCAACGAGTGCAACACGCTTCTCTCTTCTTTTCCATTGTTTATTTGTTCTTCTGTGCCAACAAAAGCTCAATTTTCTCCTCCAACTCTAGTTTCCCCACGAACCCATTTTTCATTTTCCCCAAAAGATCACAACTTTGCTTCAATCTATACTTCCTCTTTTCCTGTTCCCGTTTCCGTTTCATGGGCATCTCTTGAAATCTGGAACCATAGACATTCTCATTACACACCGCCA


Gene Sequence:
>Vu_04475(+)
ATGGACAGGGACAAGGACAAGTCTCACACTCACAGTTTTTTTCGCAGTTTCGTTAAACACTTCAAATTCGGTTCCAGTAAAGGTAATTCCTCTCTATTCTCTTCAATATCTGTTTAAAACGTTTAATTTTCTGGTAGACGAGTTGTCTGATTTTACCAGAATTCTGTTTCTGCTCTGTTGTGTTTGGTCAGAGGGAAGCGATGAAGCTGACATACAGAAAATGGCTGCGCAAGAGCAGAAGATTTTTGCCTACGAAACCTTGGCTTCTGTCACCAAGAATTTTAGTGATATTCACAAGCTAGGCGAGGGAGGTTTTGGCCCTGTCTACAAGGTATAATAAAAATCAAGAAGCTTTTAATTGGTTTGTTCTGGTTCATGTTTTCTCTGAAATTCAATCCAAACCTAGTTCTCTATTCCAAATTAAAGGTTGGATTCAAGGACTTGATGTTTTTCTAGTATTTTGCTTTTCCCCTTTTGTGAAAATTCTCGAAAATAAAAATGCTCCCTATTGTATTCAACGTGTTTGTGATTAGTGGAATTTGGGTTTGTTTGCAGGGTAAGTTGAATGATGGGAGAGAGATTGCTGTGAAGAAGTTATCACACAGTTCAAATCAAGGGAAGAAAGAGTTCATGAACGAGGCCAAGTTGTTGGCTCGTGTGCAGCATCGGAATGTGGTGAATCTGGTGGGCTATTGTGTCCATGGCAACGAAAAGCTACTTGTTTATGAGTATGTTGCTCATGAAAGTCTAGACAAGTTTCTTTTCAGTGAGTGCTTCTTCAATGCCACTCCTCATTCATTCATCAAATCATCTCAAACCCATCCTCAATTCCTCATTTTTCCCGATCAGTGTCGTTTATGCTCTTCACCATTTCCGGGAGAAAACTGATTAGAATTTAGTAATCGAGTCTGAAGAAACTTTGTGTAACAAAGATAGCTGAACCTGAAGAAACTCTAGAAGAGACCTTGACTTTTCCGTATTGATAAGAGAATGTTTACAATGAAACTCTCCAATTCATATTATCTAAGCTATGACATGGCATGAGGACTTTTGTTGCATGAAGCATCCCTAGGATTTTGTTTACCTTTAGAATCATGCACATGTGGTAATGAATGAAAAGTAGTAGCAGTTGTTGAGAGTTGTTAGCAGAGGAACATTCAAATTTGGATTAGGCATCCACTTTCTAGGAAGGATAGTATATGGAAATGAACTCTTTGTTTCTAGATTGTTTGTTGTGGTTGTCACTAATAGCACGAAACATAACAAAATGTTGATTGGGGAATTTAGGAGGAAGAATTGAGGTTGTGTTTTGTTGATGTTGATGTTGATGTTGTTTTGATCAGTGAATTGTTATTTTTATAACAGTGGTAAGTTGAAATGGATGCAGAATCACAAAAGAGAGAGAAGCTGGATTGGAAACGTAGGTTGGGCATAATCACAGGCGTGGCAAAGGGTTTACTTTATCTGCACGAAGACTCACACAATTGCATCATCCATCGCGACATCAAGGCCAGTAATATCTTGCTTGATGACAAATGGACGCCCAAGATTGCAGATTTTGGCATGGCTCGTCTCTTCCCCGAAGATCAGACCCAAGTCAACACACGTGTGGCTGGAACCAAGTAAGCCTTGCCTTTGCCTCTCGTTTTATTTTTATTATTATTTTTTTTTCAAAAGATTTCTACCAAATTTTGAATATGTTTCTGCATAAATAATCGCATGTTGCACCTGGGAATAAAGCCAAACAAAATTTAATACGACTTCTTCATTCGCATACACACTAGTTTGGATCATTTCCACGTTTTTTGGTATCAGGTAGTATATTTTAGGTTTAATTGCTTCCTTTGTCCCCAGTTTGGTTGAATTGTGTCAAATTCATCCTCATTTTTAAAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTGTCAATTGAATCCAAACATAGAAAAAATTTGTGTCAAAGTAGTCATTTTTCCTATATCTTTGTGTCTTCCTTTCATACAATCAAGTACAGATATTCATTTTACCTTATCCAATTTAAGGCTTTTCATAGCTCCAGAGAAGTGACATATGAAAGGAAGACACAGATATATAGGAAAAATGACTACTTTGACACAAATTTTTTCTATGTTTGGATTCAATTGACACTTTTATACCACGTGAGGACGACAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTGGGGACAAAGGAAGCAATTAAACCTATATTTTATTAAGGATACTTTTTTTTTCTCGCTCGGTTGTTTTTTAGACGAATTTAGTTAGTAATTCAAGATTATTATAATTTAGTGAAGAAACTTGACACTCTTACGTAATTTTATTCAATGGACAAACCTCATCTATTAGATTAATCTGATTTGGTACAAAGATAAGTGAAATTTAATAAAATAATTAATTTTTTTGCCAAGGATCCAACTCAAAAGTTTGAATGATTCAATTTTAGGCTCAATCATACATGAGCTTTTTATGATGAGGAAAATAACTATTACATAAAACTGTGCAATTTAATTATATTTAAAATGGCATAAAAATTAGGGTTTAGAACGTATTAGATAAGAAAAACTAAAGTGAATAAAATAATTAACCGTACAAGTTAAAAATATATGCAACCTGAAAGAATAATAAGAAAAGATAATTGAAAATATCATCATGGGCAGTGTAGCGGAAATAACATAATTAGGTAACATTAATATTTATAACTACAAACAAAGTGAGCTCATTTTCTTTCTACGTATTTTAATTTCAAATATACCCTTTAATTATATAAATCACTTTACTTATTTATTTTCTGCGGTACCCCTTCCAAGTAACTTGAAAAACTGATTCCCTCCCACCGCTTATCTTTTTTATTTTATTTTTTATACTTTGTAAGTTCTTATCCAATTATTGACTTCAAATTTTTGTAATCTTAAATTTTTTAAATAATATTATTAAATTTAAACGAAACAACAATAATTAAATTATATAGATAGATATATTTAAAAATATAAATTAATATACACATTTACGTATCAATAATGATTAAATTTTAACTTTATAAAATAAAATAACATGATAAAAATTCGGACATGCCAATTAGTCCATATCTTATTGCTAATTTAAAAAACGAAAAAAAAAACGTAATATCATTGCAAACTCGTTTTTCTTAACCTTACTAATTTTCTCTTTTTGATAATGTACAGAAGTATTTATTTTATCAAACATTATCAACTACTATAAATAAATAACGGACTTGAAATAAAATTTTATAAAAATCTTCTTGAAATTTGAATTCAAGTATATTTTTATTATTTTTTTCATTTCGGTAAACAGTTTCATTTGAATCGTCAGATCAAGTTAAAATTAAACGGTCATAATACTTTGTTGAAAATAAATAAACTTATATACATATAATATTTTTTACATTTAATAATAATTAATAAATTCTGAAGTGTCAATTATTAGATTTAAACGTCTTATGAAATCTTCTATAGTTTTAAAAGTAAACAACATTAAACAGTATGTTGTCAGGGCTCATCATAAGACTTTTACATTTTTATCACTAAAATATATATGTAAAAAAGCTCTCTAGCTTATTCCTTTTGGCATCAACCGGTAGGATCTCCCAATATATCAAATCACCAGATTAAGAAACTGGCGTATTAGCTACGGCACTCTTGCATTGCACGTATTTGATGATATGACTGACTAGTCAAGTCAAGTGTTTTGACCAGTTTGTTTGTGGCTTATAGTTTTTTACTCTGAACTAATTATAATTACTCTACGTGGGAATTTTTCAGTGGATACATGGCTCCAGAATATGTTATGCATGGAAATCTATCGGTGAAGGCAGATGTATTTAGTTATGGAGTTTTGGTATTGGAATTGATCACCGGCCAAAGAAACTCCTCTTTCAATTTGGACGTGGACGCCCAGAGCATGCTTGATTGGGTAACACTCTTTATTAATACTATTCTTTACTTCCGTCACTTTATTATTATTATCTCATTTATAGAATTTTCTTGTTCTAGTTGACATTTCAGCAAGTTCTGAAGACTTTTTCTTTGATCAACCGATTAATTAATGAATTGTAGATCTTTTGAGTCTTCACAAAATTAACACCTCCAACCTAACATCAGCACCATTACTGCATGCCCACATAAGCAAGTTGCATCTAGAATTGATGGAGACTGGTTTGTTTTTTGTGTGGTTATAATAGGCATACAAGATGTACAAGAAAGGGAAGAGCTTAGAAATTGTGGAACCGACGTTGGCAGGTACAATGGTAGGTGAAGAGGTAGCGATGTGCATTCAGATGGGTTTGTTATGCACTCAAGGTGATCCACAGCTACGTCCCACGATGAGGCGTGTGGTGGTGATGCTGTCAAGGAAACCAGGCCAGATGCAAGAACCAACCAGACCAGGGGTGCCTGGTTCTAGATACAGAAGACCTCGAAGACACTCTGCATTGTCTTCCACATTGGGTACCTCAGGTGCCTCCGATTCACACACTTCTGATTCAAGTAATTATACGACTGTTACTACTAGTGCCACTGGGACCAGCTCTGCCACTGTTGAATCAGACCCCAAGGGTAAACGTCCAATGAGGGAGGGTTAA