Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04467 LG1 62015455 62017690 PREDICTED: MADS-box transcription factor 3-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 62016118 intron_variant
C/T 62016141 intron_variant
T/A 62016168 intron_variant
C/G 62016259 intron_variant
G/T 62016261 intron_variant
C/A 62016355 intron_variant
T/A 62016543 intron_variant
A/T 62016544 intron_variant
A/G 62016686 intron_variant
T/A 62017104 intron_variant
A/T 62017296 missense_variant p.Phe132Tyr
T/A 62017366 stop_gained p.Lys109*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04467.1
MGRGRIPMDLIEKEKARKTTFQKRKNGLMKKVYEFSTLCSVDVGVIIFASKFLDEPEIWPQDPRELKRVIQKYLNTTSDRRPKVYDVEEYFDERMKRIEGEISKVHKGKIQLIYPTWDDSYNTLEEEQLRMFVSILDAKLDACNQRMNMFKRDSKGKVIAESDNDEALVPYLAPTLGDSNSRCKLEKLDERIGVLQGSCARLDEGNEVDDGGSEEKR*


CDS Sequence:
>Vu_04467.1
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Promoter Sequence:
>Vu_04467::LG1:62017690-62019690(-)
TTTATATCATATTTTACAAACTGGATTTTCGCAATACTTGGAAAAGCAGAAGAAATTTTATCTATTTAGTATTATTTTTTTTTGTTAAAACTTTTATTAATTTCCATATAACTTATGAGAATATATATTAATAAAACATGTGTATGGTAAAGACATGTATATATGATCGCAGTTAGTTTTTCTAAAATGATTGGAACATCTGGACGAAAAGAGTCCAAAATCTCGTCCCAAAAATATTACTAAATTATTAACAATAGTTTTCTGTAAGCTTATTATTGGGAATACGACTGTGATCACTAATGAAAAAGATTTAAAATATTAATGTTTCCATTTATTTAAAGTGAGCTTTTCAAATTTTAGTATATATACATAATAGAAAGAGAGAATGTGACACAAATAACATGTAAAATCATAACATATTAAAATAGATCTGAAAGTTTTTTAAATTTACAAATACTTTATATATTTAAATCAATAATAAACTAAATATGAAAGTTCTTTTAAATTTACAAATACTTTATATATATTTAAATAAATTTTGTGGTGACTAATGAAAATAAACGAGTTTCATCATAAATAATAAAGTAACCTAAAAATATCTCATTTTTATTTAAATTTCTAAAGTCATATTTCTCGTTATAATAATCAAATATTTACTTATAGTAAATTTTATCTTTTCATATTAATTATTATCATTGTATCTATTTATTTGTCACAAACAAATAAAATAATAAACATTTAAAACCAAACAATATAACTAAACAAATAAATAAGATCTTTATGTATAAATAAATATAAATATAAACAAGTAGAATTATGTGCAATTGAATATGTAAGATTTAATAAATAAATAAATAAAACAAGTACATGATTAAATACAATATAAAAGAATAATTAAATATGTATACGAAAATAAATACAAATAAACAAATTAATAGAATAAGTGTATGATGAGATATAAATATATTTGAATTGTAAGAGTCAAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATACTTACCAAATTTATTTTTTAGTTGACATTTTTTAATAAATATAGATCATGAATAAGAGTAAAATTGGTAAGGAAATATGTACATCAAAAACCAGTTATAAAATCGTTACAAATCATTTTTATTAATTTTATGAACAATTCTCTTTATCAATAGTCATAAAGAATAAAATGATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTAAATGTTTTCTTAAGTGATAAAAGTTGTCATCAATATTATTTCTGAAAATTCACGTTGTTACTATATATATTACTCAATGTCCATCATTAGAATTATTCTAAATCTTTTACTTACCGGATACCATTAATTAACTTTAAAAGATTTAAGTCATTAAATATATTTATTTGTATAAATAAAATAATGAAAATATATTTCATATCCGGATTTTGTAATAATGGTTTATATTTTTTGAATTAATTAAGGATAATCCAACTATAATCCAAACCTATAAACAAATTGAAAGGTAAAAAAGGAAATTAATTAAAATCCCGATTATTATTTGATCAGAGATTAAGACAGCGCTCATTATGCTATCATGCCATATATGTATAGAAAGCAAAGAAAACCAGAGAAGCTTAAGAGATAACACAAACCAGACTTTCTTGAAGAAGTAAACGATTGCTCGAAAAAAGGAAAAAGGAAGATCAAAGAGGTATGTGCACTTGTACTTGAACAAAATAGTAAACTTTGAATCATGAAAATGTTAATGTTATTTATGTTGTATGCATTCATGCGAAAACTTTGGTTCTCTTTTGCTGCATATCTTCAGCCTAACACTGTCATCGCAACCAGAACATAGATGAATTTGCGTTGCAAAGAAACAATTTTGTTGTTGCAAAATGTTGTTATATATTACTATTTGCGTATAAACTTTTGTGCAAACACTTGGATAGTGAATGTTGGCAATTGTTGTTGTGTGTGGCAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_04467(-)
ATGGGGCGTGGAAGGATACCCATGGATCTGATCGAGAAAGAGAAGGCTCGAAAGACAACATTTCAGAAGAGAAAGAACGGATTAATGAAGAAAGTTTACGAGTTTTCAACACTTTGTTCAGTTGACGTTGGTGTGATTATCTTTGCTTCAAAGTTTCTCGATGAACCTGAAATATGGCCACAAGACCCAAGAGAGTTGAAACGTGTGATTCAGAAATATCTGAACACTACCAGTGATAGGCGTCCAAAGGTGTATGATGTGGAAGAGTATTTCGATGAAAGGATGAAAAGGATTGAAGGAGAGATTTCCAAAGTGCACAAAGGGAAGATCCAGCTCATTTATCCAACCTGGGATGACTCTTACAATACTCTTGAAGAGGAACAGTTGAGGATGTTTGTAAGCATTTTGGATGCTAAGCTTGATGCTTGTAATCAAAGGATGAACATGTTCAAACGAGATTCAAAGGGAAAAGTAATAGCAGAATCAGACAATGATGAAGCACTTGTTCCTTACTTGGCTCCAACTTTAGGTAATCACCTCAGTTTCATGCAGAACATGTCTCAAACACAGGTTTTTCCTACTAATGATAACAATCAAGTACCATTTTATCCATGTCATCTCAGTCAAAATTCTCTACCTTCTTTGTTTCAATTGGGTCAAAACTTTACCCAATTGATAGAAAAAAATATAGCAGTGGATTGGAATAATCAAGTTGGTACAAGTGATCACAGAATTGATACACAACAGGAGGATAGAACAAACAAAAACCAAAACCCATCATCGTGCTATTACGATGCAAATATTCAAACAATGCAGCCGTATAATAATGTTGCTTTGCAAACTCTTCCTGCTCAATTGCAGTGCGATGCAACATTCCAGAGCCTGTCAAATCGACCAGGTCCATCACAAGGATTTGAACCTAATGATGTTTCTAATATGCTTCAACCTCATTTTTTAAACTATATGCATAGAAGAAACTAGATCCTATTTATTTAGATATTTATTTTTTCTCTTACAGAATAGTATGTTTGGATTTTGGTTTTTTCTTTTTTTGTGTTTTAGCAGTTCTTGCCTACAACAGTTATAACAATAATTTTGTGTTAGATTCTTTTGATTTGTTTATTTAGAAAATTTTGGTGCAATGATTATTCCATGAAGATTGTGACATTTGTAGAATGAACTAGTATTTGTAAAGTTCATTGCACGAGTATTTTTTGAATTATATTTAATAATTAAAATAATTTTTATAAAATTAATAAACTTTATATATTTTATTTTAAAGTTAAATAATTATAATAATTAAGTAATAAATAATAAAAAAGTTATCAAAATATTGTGTATATATATTGTTAATTTGAATTATTATTAATATTTTTTTATAATGCTTACAAATATATTGTATTAAGGTTGAAATTGACTAGACAAATAACTGATTTGGTGTAAAAAGAGTCATTATATATTATTTATAATAGATAATTCACTTTGAATTAATTGATTTTTTATAATTAAATAAATATTATATATATATATATATATTATTCATTCACGTGTTTTATTTCATATATAATTTTAGAAAAATCAAATAATTTCAGTTATGTAATAAGTTGTAATAAAAAAATATCATATTAATTCAATTTTTTCTTAAAATTTATAGTTAATATTATAAAGGCTTAATACCTCTTTTTGTCCCTCTTTATTAGGGAAATGTTCAAGTTCGTTCTACCTTTTTTAAAAAGTTCAATGTGGTCCCAAGTTGTGAAAAAAGTGTCCAATTAAATCCTTTTCGTCACGGCGTTAAATATTTAACGATTCAGCTGATAGCGTAGAGTGATCTGTGCAACGTGGCTGTTTACCTTCATAACGTGGCAGTGGCAGTGATTAAAAAATTCTGAGTTAGGGTTTGGGTATTCGAAATCGTGATTTGGGGTAGGAGGACGAGCTTGAGCAGCGTCGTTTTTGCGAGTTGTTCTTGGTTTTCCTGTAGGTGATTCGAACTCGCGGTGTAAATTGGAGAAGCTTGATGAACGAATTGGGGTTTTGCAGGTATTGCGATTCTGATTTGTGGCTTTCGAATGGAGAACCGAATTGGGTTCTGAACTCGCGTCTGGGTGGTTTCAATTTGCATTTCGCGTGGTTCTTGCGGTTTGGGATTGACACTCTGCGATTTTAGGGTTCGTGTGCTAGATTGGACGAAGGTAATGAGGTGGATGATGGTGGTTCTGAGGAGAAGCGGTAG