Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04392 LG1 60727407 60728491 PREDICTED: probable inactive receptor kinase At1g48480
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 60727695 intron_variant
C/A 60727729 intron_variant
T/C 60727778 intron_variant
T/C 60727785 intron_variant
T/A 60728100 intron_variant
C/A 60728102 intron_variant
G/A 60728141 intron_variant
G/A 60728143 intron_variant
T/C 60728145 intron_variant
G/A 60728146 intron_variant
G/A 60728157 intron_variant
G/C 60728163 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04392.1
MAAVSAGNKAEVNGGGATKKLVFFGNVAKAFNLEDLLRASAKVLGKGTFEMTYKARLEAGPVVAVKRPMSRVAFFLLAPPSETTSLVSQRFLLATTFSAMIIGNERGER*


CDS Sequence:
>Vu_04392.1
ATGGCTGCGGTTTCGGCGGGGAACAAGGCGGAAGTGAACGGTGGTGGGGCAACGAAGAAGTTGGTGTTTTTCGGGAATGTGGCTAAAGCGTTCAATTTGGAGGATTTGCTTAGGGCTTCGGCGAAGGTTTTGGGGAAAGGGACTTTCGAGATGACATATAAGGCGAGACTTGAGGCAGGGCCGGTGGTGGCGGTGAAGAGGCCCATGTCGCGTGTCGCGTTCTTCCTCTTGGCACCGCCGTCTGAAACTACATCGTTGGTGTCGCAACGCTTCCTATTGGCCACCACGTTTTCAGCCATGATAATCGGAAACGAACGGGGAGAGAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_04392::LG1:60728491-60730491(-)
TTATCCTATATGTATAATCAATTATCTAAGCACTTAAGCCTATTATTGATTCATTTGACAGTTTTAACATATTATGCTATTTATGTAATGGATTAGACTATATGTTCTCTGTTTTAATCGATTAGCAAACTTATGTAATTGTTTATTTCCACACTAAGCCATATTAGTCATCCATTTACTATCCTTAACAGATTATCTGACTTATGTAACAGATTATGGCCTTCTTTTTGTTTTAATCGGTTATGTACTTTGTATAATCGATTGCAACAGGGAAGTTTGCCCTTGTTATGCTTTCTAAGTGATCTGGTTAAATCTAACATACTATATACCCTGTTTAATTGATTATTTATACCAGAAATGAGATTATCAATCTGTTTTGAACATGATTCATTCAACAATAATGGATTCACATATCTAGCATAAACATGATAAAGATATATACATTTCTTATGCCAATTATTGTGCAGGAAACCAATAAACCATTTTATTGTTCATCATAAAAAAACAAAGATATAAAGAGGTTAAAGCCCCCTATCAATATTTACAAATATTTTTATTAAAAATAATATTTTTATTAAATATTTTTAACAAGATTATATTTATTTAAAATTATATTTTACATTGAAATTTATTTAAAATTGTTTTCAAATTTTAAATTTGTTTATTTAAAATTATTATCAAATTGTTTAAAATTATTTTAAAATGTTATATATGAATTTACAAAATTTTTAGTTTTAAATGAATACAAACAAATTATTGAATTTTATACATTTTAAAAAGCGTTAAATATGTATTTAGTCCATAAACTATTAAGCGAATTTGTTTTTCTTCCCTCTTTCAAACTAAGGTACACTTTGATTCTTCTCCATAAGGAAACTATAATTTGTTGTCCTTCAAAAGTAACGACGTTAAAAATCAAGTGAGGTGGCTAACGGTGATGTGCCACGTCAATTCTTCTTTTCTTCTCCTTAAGAGAAACACCTTCCTCCACTCTCTCTTTTCTTCTTCTTTCTTTCTTCCACTACTAACAGTAAATTCCTCAATCCTAATAACCGTTTTCCTCGCTCTTCTATCTCCCGATTTTTAATATTCCTCCGCCTTTCGCTCCTTCCGGCCACCGATATGGCAGTCGTTTTGCGAACTACCACCACCTACTCCTAAAGGCACTTATCCTGACGACACTTCGATAAGGAAACCAAAGCCTCTACTGCCAATACTTTCTCGTGCTCTGCCTCGGTTTCTGCTAATTCTTCAATGCAGAGGATTGTCACACGTGGGGGAAAAGTGATTGTTGCTGCTATCCTTCCCATTGGAGATGTCGTGGTTGTCACGGACCCACTCACCAAGCAAGATCTTTTGGATTATCTTGCCTCGGGTTGCAAGCTTAGGGAAAAATGGAGGTGTCCTTTTCTTATTTTGCCATTCGGCCTTTCTTTAACATGTGTTTTGCTACATGATTGTTTTGTTTTTATGTGCTTCTTTCTCTTTTCTTGTTTGGTTTAAGAGTATTAATCATGCTCCTTTTCATATCACTTTTTTTTCTTGTTTGGTTTAAGAGTATTAATCATGCTTCTTTCTCTTTTTTCATTTGCATTAAAGCTAACAACCAATAACTAATTTGTGTTTAGCCGCCCAACATTATATTAGCATGCAAAAATTCAACACTTCGGTAATGGATTCTGGGTGTACCATGTCGACCTTTTGTCCAACCGCTGGTTCAAGAGACTGTGTTTTTTTTTATCACCTTGAAGCTGTTGTAGTAGAATTAAGATGATTATTAATTAGTCTCCTTTGTTGACTTGGTTTATGGTTCTAATGTGGTAAGTCTTGTTTTTTGGTCCTGGTTTCATTTTCTATTTCCGCAACAATGTGACTATTGTTGGTCCCCCGAGTTTTGTTGTGGATAGAATACGGGTAACAAAGTAGAGAATGTAAGTATCTGTGACTGTAATTGCAACTGTAACACAAAGGTTTTTGCGGACGACAATTCTGCGACGGTT


Gene Sequence:
>Vu_04392(-)
ATGGCTGCGGTTTCGGCGGGGAACAAGGCGGAAGTGAACGGTGGTGGGGCAACGAAGAAGTTGGTGTTTTTCGGGAATGTGGCTAAAGCGTTCAATTTGGAGGATTTGCTTAGGGCTTCGGCGAAGGTTTTGGGGAAAGGGACTTTCGAGATGACATATAAGGCGAGACTTGAGGCAGGGCCGGTGGTGGCGGTGAAGAGGTTGAAGGATGTGACGATTTCTAAGAAGGAGTTTAAGGAGAAAATTGAGGGACAGGGAGGGAGAAAATATGAAAAAAATTGATTCGGTGTCAGAAAAAGAAAATGACGTGGCACACCACCGTTAGCCACTTCAGCTGATTTTTAACACCGCTGATTTTGGAGGACGAAAAATTATAGTTTCCTTAAGGAGAAGCATCAAAGTGTACCTTAGTTTGAAAGACTGACTAAAAACAAATTCGCTTGATAATGTAGAGACTAAAAACATATTTAACCCTTTTTTGGGTTAAATATGTTTTTCGTCCCTTAAGTATCACACGATTTTGGTTTTAGTCCCTACTCGAAACTTTGATGGTTTTTAATCCTCATAGTTTTGAAACTCTTACTATTAGTCCTTAAAATTGGATGGCGTTAACTTTTAGTAGATGTGACAAACGGTGAGGTCACATTTTATGCCAACTGCTCTCTTCACTCTTTGTCACGTTTGTTTTCTTTTTGGTTTTCTTTTTATTCATGAAATTAAGTGATTGACACCTGTTGTTGATTGAAATCAGGTTAACAATTAGGGTTCTTAATTGGGCAAAGTTTTTTTTTTCAATTGGGGAAAAGTAGTTTTACTCGAAGATTTCGACAAAGGATTTCCGGCTCCATGTCCGTGAACGCGGTGGAGGCCTCGATGGACAGGTTGACGCCACCGTGCTCCCCAAACTCGTGACGCGTCCAAACTCGTGACGCGTGAGGGCTAATGCAGCGGGCAGGCCCATGTCGCGTGTCGCGTTCTTCCTCTTGGCACCGCCGTCTGAAACTACATCGTTGGTGTCGCAACGCTTCCTATTGGCCACCACGTTTTCAGCCATGATAATCGGAAACGAACGGGGAGAGAGATAG