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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04274 LG1 58734652 58736139 PREDICTED: tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 58734676 missense_variant p.Ser9Thr
T/G 58734951 synonymous_variant p.Thr100Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04274.1
MSSPSSSSSAYSLYNSYMVSNFMVSIIVPLFLFSLFVVHVSSCSQIDKLSLLAFSGNISTSPPFPYLNWSDSLDCCAWEGITCDGDLRVTHLLLPSRGLTGFISPSLTNLSCLSHLNLSHKRLSGGLQHQLFSLLSHLVVLDLSYNHLSGELPPFGIDNSGKNSSGAAIQELDLSSNFFNGTLPNSLLENLAAAAAGGSLVSLNVSNNSFIGHIPTSLFCINDRNSSSLRFLDYSSNDFDGAIQPGLGACSKLERFRAGFNFLSWPIPSDLFDAVSLTEISLPLNRLTGTIEDGIVGLTNLTVLELYSNHFTGFIPREIGKLSKLERLLLHVNNLTGTMPPSLMNCVNLVVLNLRVNLLVGNIPAFNFSGFLSLTTLDLGNNYFIGGLPPTLYACKSLSAVRFASNQLEGEISPSILELESLSFLSISTNKLRNVTGPLTILRGLKNLSTLMLSKNFFNEMIPQDVNIIEPGGFQKLQVLGFGGCNFTGCININK*


CDS Sequence:
>Vu_04274.1
ATGTCATCACCATCTTCATCTTCCTCTGCATATTCCCTTTACAATTCTTACATGGTTTCCAACTTCATGGTCTCTATCATAGTCCCCTTATTCCTCTTCTCCTTGTTTGTTGTTCATGTTTCCTCTTGTAGTCAGATTGATAAACTCTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCCACCTCTCCACCTTTTCCTTATCTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTGTCTCTCTCACCTTAATCTCTCCCATAAGAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGCTTTTTTCATTGCTCAGTCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGCAAAAATAGCAGTGGTGCTGCTATCCAGGAGCTGGATTTGTCCAGCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTCTTTGCTCGAGAACTTGGCAGCTGCTGCAGCTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTGGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTAGAGCAGGCTTCAATTTTCTGTCATGGCCTATTCCAAGTGATCTTTTTGATGCTGTTTCTCTCACAGAAATCTCATTGCCCCTCAATAGACTCACTGGAACAATTGAAGATGGTATAGTTGGCCTTACCAACCTCACAGTTTTGGAGCTCTACTCCAATCATTTCACAGGTTTCATCCCCCGTGAAATTGGTAAACTCTCCAAGTTGGAACGGCTACTCCTTCATGTCAACAATTTGACAGGTACTATGCCCCCGTCTCTGATGAACTGTGTTAATCTTGTGGTGTTGAATTTAAGGGTCAATCTCTTGGTGGGAAATATCCCTGCATTCAATTTCTCAGGATTCCTCAGCCTTACTACACTTGATCTTGGCAACAATTATTTTATCGGTGGTTTACCACCAACCCTTTATGCATGCAAATCACTTTCAGCTGTGAGGTTTGCATCTAATCAGCTTGAGGGAGAGATTTCTCCCAGTATCCTTGAACTAGAGTCTTTGTCTTTCCTATCAATTTCTACTAACAAGTTGAGGAATGTTACTGGGCCTCTGACAATACTCAGGGGGCTCAAAAACCTCAGTACCCTTATGCTCTCCAAGAATTTTTTCAACGAAATGATACCTCAAGATGTGAACATAATAGAGCCAGGTGGATTTCAAAAACTGCAGGTTTTAGGATTTGGTGGTTGTAATTTCACTGGTTGTATAAATATAAATAAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_04274::LG1:58732652-58734652(+)
GTTTTTGGGTTGAGTGAGGTGTGAACATTGAAGGGAATGAGAGTCGATTGGTAGAATAATTATGGAGAAAGGAGGTGGTGGGTGTAGGTGTTGTGGAAAAGGAGTATGAGTGGAAGAGAGGGAGAGGTTGGTAGGTTGCAGGTGAAGGACTTAATAGTGAGAGTGCCTCGGGTTGGGTAGCATGAATGAAATAATGTGTGAAGGGCTTAGTTTCTCATCGTGGTTATGTTGGGAAAGAAAGATAATAAGAAAGGGTTCGGCATGTGCAGGGAACATGCAAGGAATATTGTAACTAGGAAATATAGTTGGTTTTAGGGTGGAGATGATTCCAGGGGTCATAGTGAGTTTAAGGGTAAATTATTTGGGAAGAATAATGGTGGTATAGGGGTATAAGGGATTATAGAAGGGTTGAGCAGGGAATGGGTATACACATTCATTAGATTGTACTAACTAACCCTAAACATATATATAACTAAGCGTAATTAGGTGTATAACCAGCCATAACAAACCTCTCAAACGCCATTGTGAAGGGTTTCAACTCTTGAAATGATGCATGTATTGTTCATGTGTTTTTTCAAATCATAATTGTAAACAAAAGCATTACAATTACTAGAACTTGCCACTGTTTTCAATGGCAGCAGCTGGAAGAGATAGTCTTAGCTCCAAATCTGGTTCTGTGGTGTTGAAGGATGTTCCACCAAGGTCTACCACTGTTAAATGTTTAGAAGTAATTTAGAAGTGCCACTCTATTTTAGATAAAATTTAGAAAAACTTGGCATCACCACAACTTTGTGACGTTAGTCTTGATGATATTGATGATCAACACTTCCTGTGCTAATTAGTTGTTTTTAGACCATTATTAGTGTAGTGTCTTAAATTGATAGATTTCACTCACTTAGTTTAGTAGTAGTTTAAATTGTTTGGCTTTTCATTCTAAAATTGATTTGAATTTCACCAAAAGAAGTACTTCTTAGTTGTGTTAGATGAACATTAAAAATTGTTTTAGACAACTTAGTGGATTTTTAGATTACCCTTAGATAGATTTTGTTGTAGTTAGTGTGCATGTTAGTTGAACTGACTTTGTGGATGCCCACACTGGCCACCTGCTAGCAGGGTTTAGCTCTGCAACTCCTTTCTCTGCCTCATCAAAAAACATCCTTGTCCTCTTTATCTGTCCCTTCATGAATTTACTAGGTTTATCTATAACTTTACCCAGGAAAATGTCATCATCTAAAAGCCTAGCTTTTGCCAATTCATCTTGTCCCTCCTCCTAGTTTACTTCCCCTTTGTTGAGAATGGCATAGTACCTTATCTGCTACTCTTCTTTCTCTTAATTACGAATAATCTTCTGCAGATCAAGCTTTGTTTGTCAAATCTGCTTCTACTTCTTTTACTGCATTATTTGTTTAGGTGGATGATATTGTTTTAATTAGCAATGATATGGCAGAAATTAATCATCTTAAGCACATCTTAGATACCAAATTTAAAATCAAAGACCTAGGATCTTTAAGATACTTTCTCGGTCTTGGAATTACAAGGTCCAAATCTGGAATTCACATGAATAAGAGAAAATATATTCTTGAACTTCTCGATGACAGTGGTTTGATTGGTTCTAAACCTACTAACACTCCTTCTGATCCTTCTATTAAACTTATGGCAAATCATGGACAACTTTTATGTAATGCTGCTGGTTACTGGCAGTTAGTTGGCAAACTTTTGCACCTCACCATCATCAAGCAAGATATTGATTATGTGTACAACAACTCAGCCAATTTCTATGCAAACCTCTTGATACTTATTACAATGCTGCTCAAAGAATCTTTCATTACCTCAATGGATCCCCTGCTCATGGCTTGTTCTTCTTTGCTTCATCAGACCTTAGAATCTCGGCCTTTGCCAATTGAGATGAGCTTGCTGTTTGGATACCAGAAGGTCTATCATGGATCCCCTGCTCATGACCAACCATCACTTCAAACACTCCATTCTCTCAGTTTTTCTCA


Gene Sequence:
>Vu_04274(+)
ATGTCATCACCATCTTCATCTTCCTCTGCATATTCCCTTTACAATTCTTACATGGTTTCCAACTTCATGGTCTCTATCATAGTCCCCTTATTCCTCTTCTCCTTGTTTGTTGTTCATGTTTCCTCTTGTAGTCAGATTGATAAACTCTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCCACCTCTCCACCTTTTCCTTATCTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTGTCTCTCTCACCTTAATCTCTCCCATAAGAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGCTTTTTTCATTGCTCAGTCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGCAAAAATAGCAGTGGTGCTGCTATCCAGGAGCTGGATTTGTCCAGCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTCTTTGCTCGAGAACTTGGCAGCTGCTGCAGCTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTGGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTAGAGCAGGCTTCAATTTTCTGTCATGGCCTATTCCAAGTGATCTTTTTGATGCTGTTTCTCTCACAGAAATCTCATTGCCCCTCAATAGACTCACTGGAACAATTGAAGATGGTATAGTTGGCCTTACCAACCTCACAGTTTTGGAGCTCTACTCCAATCATTTCACAGGTTTCATCCCCCGTGAAATTGGTAAACTCTCCAAGTTGGAACGGCTACTCCTTCATGTCAACAATTTGACAGGTACTATGCCCCCGTCTCTGATGAACTGTGTTAATCTTGTGGTGTTGAATTTAAGGGTCAATCTCTTGGTGGGAAATATCCCTGCATTCAATTTCTCAGGATTCCTCAGCCTTACTACACTTGATCTTGGCAACAATTATTTTATCGGTGGTTTACCACCAACCCTTTATGCATGCAAATCACTTTCAGCTGTGAGGTTTGCATCTAATCAGCTTGAGGGAGAGATTTCTCCCAGTATCCTTGAACTAGAGTCTTTGTCTTTCCTATCAATTTCTACTAACAAGTTGAGGAATGTTACTGGGCCTCTGACAATACTCAGGGGGCTCAAAAACCTCAGTACCCTTATGCTCTCCAAGAATTTTTTCAACGAAATGATACCTCAAGATGTGAACATAATAGAGCCAGGTGGATTTCAAAAACTGCAGGTTTTAGGATTTGGTGGTTGTAATTTCACTGGTTGTATAAATATAAATAAATAA

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