Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04195 LG1 57262336 57267225 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 57262808 missense_variant p.Ala132Val
C/T 57262851 synonymous_variant p.Ser146Ser
C/T 57263000 missense_variant p.Ala196Val
C/T 57263001 synonymous_variant p.Ala196Ala
T/C 57263090 missense_variant p.Val226Ala
T/G 57263253 intron_variant
C/T 57263508 intron_variant
A/T 57263533 intron_variant
T/A 57263543 intron_variant
T/A 57263641 intron_variant
A/T 57264450 intron_variant
T/A 57264570 intron_variant
C/A 57264709 intron_variant
A/T 57264800 intron_variant
A/C 57264818 intron_variant
G/C 57265244 intron_variant
T/A 57265763 synonymous_variant p.Pro381Pro
T/C 57265932 splice_region_variant&intron_variant
T/G 57266249 intron_variant
T/A 57266317 synonymous_variant p.Leu437Leu
A/G 57267001 3_prime_UTR_variant
T/A 57267006 3_prime_UTR_variant
C/T 57267011 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04195.1
MEWRRRTKKQAQAQAQPRLQRLNAKKGFNYQPPPSPPSPSSTSSSSHFDRQTSFRLFGIEGEFDRIFQTLGLSGPEDFAIPTADWEARKARVASSKAPGPTPTPNALIHSSTEIHPLSVTTTSATTLQDDVASVHVSVMGSSPWSSGEHDAGRGSVGRLRNGERSVLFTDSGSFTTSHDDDSDIGGERVSSVSNSAAPDELVVPFVSSFSFEWFRQTFSSWQKGDVLGNGSFGTVYEGFTDEGFFFAVKEVSLLDEGNQGKQSIFQLQQEISLLSKFEHKNIVRYYGSDKDKSKLYIFLELMSKGSLSSLYQKYRLNDSQVSAYTRQILCGLKYLHDHNVVHRDIKCANILVDVSGAVKLADFGLAKATKFNDVRSSKGSPYWMAPEVVNLRDQSGYGLAADIWSLGCTVLEMLTRQPPYSDLEGMQALFRIGKGELPSIPDYLSKDAQDFIRECLQINPNKRPTAAQLLDHPFLRRTLLSPLSFASPQRKMYRS*


CDS Sequence:
>Vu_04195.1
ATGGAGTGGAGGCGTCGGACCAAGAAGCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGCCGCGGTTGCAGCGCCTCAACGCCAAAAAGGGCTTTAATTACCAACCACCACCGTCTCCGCCGTCTCCTTCTTCAACCTCTTCTTCCTCGCATTTCGATCGCCAAACCAGCTTCCGCCTATTCGGCATCGAGGGCGAGTTCGACCGCATCTTCCAGACCTTGGGTCTGTCCGGCCCGGAAGACTTCGCCATCCCAACAGCAGACTGGGAAGCCCGCAAGGCCCGCGTTGCTTCTTCCAAAGCCCCCGGGCCCACCCCTACCCCTAACGCGCTTATCCACTCTTCTACCGAGATCCACCCTCTTTCCGTCACCACTACTTCTGCGACTACCCTCCAAGACGATGTCGCTTCAGTTCACGTTTCCGTTATGGGTTCCTCCCCTTGGTCCTCCGGGGAGCATGACGCGGGTAGGGGTAGTGTCGGCAGGTTGAGGAATGGAGAAAGGAGCGTGCTTTTCACCGATTCAGGTTCCTTCACCACTTCCCACGATGATGACAGTGACATTGGCGGCGAGAGGGTTAGTTCGGTTTCTAATTCCGCCGCCCCGGATGAGCTGGTTGTGCCTTTTGTTTCCTCCTTTTCCTTTGAGTGGTTCAGACAGACTTTCTCATCCTGGCAAAAAGGTGACGTCTTGGGAAATGGGTCTTTCGGGACCGTCTATGAAGGCTTCACTGATGAGGGATTCTTTTTTGCGGTAAAGGAGGTGTCTTTGCTGGATGAAGGTAATCAGGGAAAACAGAGCATTTTCCAACTTCAGCAGGAAATATCTCTTTTGAGTAAGTTTGAGCATAAAAACATAGTTCGATATTATGGCTCGGACAAGGACAAAAGTAAACTATATATCTTCCTTGAGCTTATGTCAAAAGGATCATTATCAAGTCTCTATCAAAAATATCGTTTAAACGATTCCCAAGTTTCTGCATACACAAGGCAGATTTTATGTGGCTTGAAGTATCTTCATGATCATAATGTGGTCCACAGGGACATCAAGTGTGCTAATATACTGGTTGATGTAAGTGGGGCAGTCAAGCTTGCAGATTTTGGGTTGGCAAAGGCAACAAAATTTAATGATGTTAGATCAAGCAAAGGCTCCCCTTACTGGATGGCCCCTGAGGTTGTTAACTTAAGGGACCAAAGTGGTTACGGGTTAGCCGCCGACATATGGAGCTTAGGGTGTACAGTTTTGGAGATGTTGACACGCCAGCCTCCTTATTCGGATTTGGAAGGAATGCAAGCATTATTTCGGATTGGCAAGGGTGAACTTCCAAGCATTCCGGATTATTTATCTAAGGATGCCCAAGATTTCATTCGTGAATGCTTACAAATTAACCCAAATAAACGTCCAACTGCAGCTCAGCTATTGGATCACCCATTTCTAAGGAGAACATTACTGTCTCCCTTAAGTTTTGCTTCTCCTCAAAGGAAAATGTATCGGTCATAA


Promoter Sequence:
>Vu_04195::LG1:57260336-57262336(+)
TCATATAAATATATAAATGTAAGAAATGAAGATCAATATACTTAGTAATAACATTAGTATAGTATATGTATTTATTAGCGTCGAAGAAAAAAAAACAAAAATGATAAGATAACACTTGCATTTCAAAGAATTGAATTCTGATGTGAAATAATATAAATATAATTTATGGATCATATTGAAAACAACAAAAAGAATGATATAAAGATTAAAATAGATTCCAATTTGTATGTCAAACTAGATAATCCTCAAGACAATTAATATATTTCCACCGATCATCTCACTACACATTCATTTCCCATTTACCATAAAAAAAACATTAAATCATGACATCATTTGAAAATTACATAAATAAAAGTAGAAAATGATATTAACTTACTATTCTAAATAAGCACCGTCCCGTAAATATTTATTGTTTTGTAAGTTTTCCTTTTTATATTATATCAATCCAAGAGTCTTCGTCCACTTGTAAAAAAGTGATTCTTTGTAATATAGTTTCTAATTCACCATAAACTTGCTTTATCTTCAAACTTATAAATCTCATTTCATTATAAGTTCTAGATTTAGTCATGAGACCTCGATAATATAAAAAGTGTTTTTAAATTGACTTCCATCGATTATTAAAATTTGAAACGCTAAAATTATACAATTACAAAAATTGGTGGAGTGAAAGTTCCATAAACACAAAATTCAAAAACAAATTCATATTTTTAAAATAATTATATCATCAGGAATTAGTATTTATTTTAATGTTTTGACACTTTATATATAATTACATGACGTAAACTCACAATTCCCACATTCTTAAAATTAAAAATTATTTTATTAGACACGTCCTGTTTAATATAAATTTAAAAATTCAGTATATAATACAAAAACAAACAGAAAATTTATTAATTAAAATAAACAAGAACATGTCCTTGACTTGTATCCAGAAAAGAAGATAGTGACAAAGAGACTCAGAAGCTTTTTCTTCTGTTTTTTCGCTGGCTGCCACTGCTTCCTTCCATCATCGAGGAAACATCCTTTTGCATATGCGTCCAAATCCAGCTAATTTCTTGTTTATCATATGCTAATTTCAAAGAAACTCTAAATATCGTAAATTTCAAACATTACCCCTTTTTTATTTGACTTCTCATTCTCCAAATTCAATGACATAACACCATTCACAATGCTAAACATTTTTCTTTTATAACAATTGCATTCCAAGAGTTAAGTTTGATGTGATTGGTGAAGTTTAAACAAAAATAGTTTCTCATTTGTGTGATTCATGATAAAAATAATCACTTTTTTTTTAAAATTAAGGGTATGTTTGCTTGAGCTTTTTTCTTTAATAAAAAAAGTGGTTTCAAAGTAAATTATACATCTACAAATTATAATTACTGTGTAAGTTTACTAGAAATTATTTAATTTTTTTCCTAAGAGTCCCTACTGATAGAACTTTTTGAGGCAGCTTATTTATCCGTTTTTTATAGATGTTTTTTTTCATAAGTTAAAATTAAAAATATATAAACTACTTTTACCAATTAGTTAATTTTAGTTTATAAATTAATGATTTTACTTTTATTCCTTTTCTTGAAAACAGTTTATGTAAAGACTCGACCAAATAGGTCGTGAAGTTAATTTCGATCAGAACTGAAATAAATAGATGTTGTTATGTTTCGCATTAAATTTCGAAGTAATTAATGAAGAAGGTATAGATAAAAAGATTAAATGCATGCAACGTGTTGAAAATATGAACATATACATTATATTTGTATTTATTAATCGTGATTTTGTTAAAATCTTTAGTTTACATGAATTGGCTGAATAATTAAGAAGAAAATAATAAAATTGAAAAAGCTAAACTATGATTTAGAAAAAAAGTGTTGCGAGTAAAAATGGAACTAGATAAAGCCAAAAGAAAGGGTATAAAAACAGTATGATTGGTTTATTCATTATAATAATAAAAGAAAAAGAAGACTGAAAGACCATAAAAAATAGAAAGAAATAAAATAATTAAA


Gene Sequence:
>Vu_04195(+)
AAAGGAAAAGAAGAGAGAGAAGTAGAGGAATATCAATTGGGTGAGGAGATTCGTTTTCAGTTGGGAGCATCTGAACCAATGGAGTGGAGGCGTCGGACCAAGAAGCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGCCGCGGTTGCAGCGCCTCAACGCCAAAAAGGGCTTTAATTACCAACCACCACCGTCTCCGCCGTCTCCTTCTTCAACCTCTTCTTCCTCGCATTTCGATCGCCAAACCAGCTTCCGCCTATTCGGCATCGAGGGCGAGTTCGACCGCATCTTCCAGACCTTGGGTCTGTCCGGCCCGGAAGACTTCGCCATCCCAACAGCAGACTGGGAAGCCCGCAAGGCCCGCGTTGCTTCTTCCAAAGCCCCCGGGCCCACCCCTACCCCTAACGCGCTTATCCACTCTTCTACCGAGATCCACCCTCTTTCCGTCACCACTACTTCTGCGACTACCCTCCAAGACGATGTCGCTTCAGTTCACGTTTCCGTTATGGGTTCCTCCCCTTGGTCCTCCGGGGAGCATGACGCGGGTAGGGGTAGTGTCGGCAGGTTGAGGAATGGAGAAAGGAGCGTGCTTTTCACCGATTCAGGTTCCTTCACCACTTCCCACGATGATGACAGTGACATTGGCGGCGAGAGGGTTAGTTCGGTTTCTAATTCCGCCGCCCCGGATGAGCTGGTTGTGCCTTTTGTTTCCTCCTTTTCCTTTGAGTGGTTCAGACAGACTTTCTCATCCTGGCAAAAAGGTGACGTCTTGGGAAATGGGTCTTTCGGGACCGTCTATGAAGGCTTCACTGAGTAAGTGTTTCCTTTTTTGTACTTCACTCTTTTATTAGTTGGTGGCTTATTTAATGACTTGGGTTAAACCCTTCTTCTAATATCCGTTTGGGGTAGTAGGTTTTTGTCGGTGTTGTTTGGACTAACTTCCACTTTCAAGGAAACCCTGATGACCTTAGTTTCTTTATGGTTGTTGACATGATTTAAATACCATTTTTGCGCTAGGGTTGCATTCAATTTGCAGAGAATGTTCACCAGTCAGAAAATATTATAGATGAAATCTTATAATTGCTCATAAATTCTTGCGCACCATTTCATGCTTAATTGTATTTGCAAGAGTTGTGATGGAGATCCCACTACATATATGGTCAAGTTATAGTGAATAAAATATGCCCAAATTAGTATATAAATGGGTGTAAATCTTAAAATCAATTTTATATGATTAGTTAGACTTAAATTTCGCTTTAGTTAAGATGGAATGATAGTTTTCAGAATCTATCTTAGTAAAGTTTGTTGAGTTTATACTTTCATTCACTATTGAGCTTCTCCTAGTTTCACACTAGGGGTTGTATTGGAGATTCCACTCGACAAGAGATATAGGAAAACACTTCACTCAATAAACCCCCTTAGAGAATTTGACTAACCATGCAAGGATAGATATCTATTGTATAGTAATTAATCACCAAATGGCTATTTTTGGTTCAGCTTAGCTTTTTCTTAAGATGCACTTTTGATAAGTTGGTCAGCTTTTAGAAGTTCTTATAACTTGATACGACCTCCTAGTGAGTTTGTTGCTTATCTCCGTTTAGAAATGTGACTCTTTATAGTTGGCATATGATAAACCACAACTATTGGTGCCAAAATTGGGACAGGAGACTGTTTGGAAATTATCTAAGGATTAAGGAGGACTTAAATATGTTGGAAAGTAGGTTTACCTGGTTTAATGGTGTGTCAGCTCTATCTTTGTGCTGGCCGTCTGTAGGATTTGGTTTGCAAAATTTATTTGTGGCAGATACCGCAGTGGAATCTTATATCGGAAACAAAGAATCCAATTATTTTATTATCCCAATTATTTTATTATCAAACTTGTTTCCAACAGACCATCCAGAGGTCCAGTTTTTTAGTTTTATAGTTTACATTGTTTTTAGTGTTAACATTTTCATTTTCTTTTCCTGTAGTGAGGGATTCTTTTTTGCGGTAAAGGAGGTGTCTTTGCTGGATGAAGGTAATCAGGGAAAACAGAGCATTTTCCAACTTCAGCAGGTTGGGGCACCCGAGATTTTCATCAAGACTTATGATTTAATCATTAATTCTTATATGGAAGTATTCTTATATATGATGTCTCTGGCCTTCCTTTCAGGAAATATCTCTTTTGAGTAAGTTTGAGCATAAAAACATAGTTCGATATTATGGCTCGGACAAGGTATGCTGTGTTTTCTAGGAAGCAAGTCTCTTTTATTCTGAAAGATTATGAATTCTAGGAAGAACATTTGCGTTTCCATCACTTGGGTAAATAAGCATATACTTGTCTGAAAATCACTTTGTTCATTAAGCATCTTGGGAATTGTGGCAAGTCTAACAAATTGCTTTTTTCCTACTGATATGTATGTGGAAGGAGGAAATGAGACCATTATGTTACAAAAAAGAGGGAATGAGATATAACGTTCTTTTGGAATCGTACATGAAATGCAGAAAAACATAAAATGTTTCATTCCCCAATCAGTTTAATGTCAGTATGTCACTAAGCTTTTGTAGACCAAGTCGGGCGTTCTAATTATTTTTCATAGAGTAAATTAGGGATTTACTAAATTTTTTGTTGTATTTTTAAATGAATTATTTTTCTTATGCTTTTATTGATTCTCTTTGTTATTTACATTTGAATTTAATATTTTGCAGGACAAAAGTAAACTATATATCTTCCTTGAGCTTATGTCAAAAGGATCATTATCAAGTCTCTATCAAAAATATCGTTTAAACGATTCCCAAGTTTCTGCATACACAAGGCAGATTTTATGTGGCTTGAAGTATCTTCATGATCATAATGTGGTCCACAGGTAACTTGGATGAATTTCCTATCATGATACTGAGCAATAATTGTGCCTATGATAACAAAACTATCATTTGATTGAGTTCCATGAGTAAGTTTTATGGTTGGATTAATGATGTTAAAAGTGATTTGTGGAAAAGGGTCAACATGTTTTTGTTTCGTTTATAATATTACAGGGAAAAACCCATTTTAAGAACTTATTACAACTTAATCTAAGAATTTAAAAGTTTCAAAGTGAAATGGGGATGTGTAAGAAGAGTAACTTGGAGAAAGTTGGACGCAGTGCTTGGAAATTCACTTCTGAAATATCTTGAATTGCCCTTGATTTGCTATATTCTGAATATTTCAATTCAAATATTGAATTTTAAAGGGACATCAAGTGTGCTAATATACTGGTTGATGTAAGTGGGGCAGTCAAGCTTGCAGATTTTGGGTTGGCAAAGGTAACCTTAAACAAAGCTAAATTTCTCTTTTAAGCTTCTAATCTTGCACAATCTAAATATGTTACTTGTAAATTGTAATAATTTAATTTATATTTTTCTGGTCTTTAACCTTCTCAGGCAACAAAATTTAATGATGTTAGATCAAGCAAAGGCTCCCCTTACTGGATGGCCCCTGAGGTTTGCCTCTGCACTTTTATCGTTTATCTAATTCAGTTTTAGTCTGTCGTACATATTCCAAATGTGCCAGAGTGCAGATTCATCATTTGTGATTTCTGAGATATGCTTCAGTGAACTGGCAAATGAATGTTTATACTGGTGAGCTTTTTGTGTGACAGGTTGTTAACTTAAGGGACCAAAGTGGTTACGGGTTAGCCGCCGACATATGGAGCTTAGGGTGTACAGTTTTGGAGATGTTGACACGCCAGCCTCCTTATTCGGATTTGGAAGGAGTATGTATTATAAATAACAGCACTTCTTAAGTTATCGTTCATAATCTTAAGTTTGTTACTTTCCTATTTTTCATTAATATTGATTTATAGAGACTGTATTTACCCTCCTTAGTTTTTCACTCCTTCCAATCATGTGTGGATATTCAGGATTTTAGTTTAGTTGGTTACTGCGCTAGGCAATTGGATAGCTGGTAATACTGTATCTAAATGTCTTTTCTGTCGCAACAGATGCAAGCATTATTTCGGATTGGCAAGGGTGAACTTCCAAGCATTCCGGATTATTTATCTAAGGATGCCCAAGATTTCATTCGTGAATGCTTACAAATTAACCCAAATAAACGTCCAACTGCAGCTCAGCTATTGGATCACCCATTTCTAAGGAGAACATTACTGTCTCCCTTAAGTTTTGCTTCTCCTCAAAGGAAAATGTATCGGTCATAATTATTAGAGTTCTAAATGACTATCGAAACTGGCACTGCGAAGTTCAAGTTTATCCATACTCATCTTGGGTCTACTGGTGGAATGTCCAGGAAAAGTTTAATGGGTTTGCAGATCTACAGTTGCACCTAACAACTCTCTGTCTTGAATGTTGATCCCATGTTGAATTCATGGAGGGAGAATGCATCATTATCAGAGTCTCACAGAGGCATAAGTTTGACCTCTATGCAAAATGAGAGAGCAACGGCTCTGTAATCCAACAATGTGGATCTCTTACTAAATTGGGAAATGGAGTATTGAGAAGTGCCCACTATAACGTTGCTATGGCCAAGTACAGTTGTTGGTCATCTGATCCTGTTGCACCTACTCACTAGATTCTATCAGGAGCTCATGTTCTTGCGGAAAAATTGTACATCACCACCTCATTCTCTACTCATCCTATCAACATGTAAATAGATGGGAAAGGGGCAGGTGCAAGCATTGTGCTATGATAGAGCAACAATTAAAGTAGAAATTTTCCACTTTTTTTTCTTAGAACAATTAAGCAGTACATAATTGCAGCACCACTCTCCCCACCCACTTGTATTTATACTCTTTTGTAAAATGATGACACGTGTAATATTTTTGTTATATGTGGCTATTTCTAGATGTATATCAAATTTTGATAATTACCTAGGGGTGTCTGTGTAAACTTTTATTTATATGTATCAAAAGAAATTGTTCACTTAATCATC