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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04129 LG1 56142965 56148480 PREDICTED: BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 56143272 missense_variant&splice_region_variant p.Met369Lys
C/T 56143273 splice_acceptor_variant&intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04129.1
MVLRVSGNAEGDALTVFKNKVIDPTGALSNWNPNILTPCTWFHVVCNGENSVIRLDLGNAELSGQLVPELGQLPNLAYLELHNNNITGEIPNVLGNLTNLLSLDLYSNNITGQIPEELGNLKKLQSLRLNKNSLSGKIPMGLTNISTLMVLDLSYNNLTGTVPANGSFSRFTPISFSNNTYLVQAIPISPPATQKQNPSGNSFRSIGVIAGGVAVGAALLFAAPVIAFVYCKRRKPPDYFFDVAAEEDPEVNFGQLKRFSLHELLVATDGFNNKNIIGKGGFGKVYKGRLTSGDLVAVKRLNQERIRSEEKQFQTEVEMISLAVHRNLLRLIGFCMTTTERLLVYPFMVNGSVDSCLRDRPESQPPLQWPVKALLKEQKLETLVDEDLQGDYDGGELEKLIQIALLCTQSSPLDRPKMSEVVRMLEGQGLEEKWDQWGKKEDMIQKNYNPFNLYVGYDSISNIPPDELSGPR*


CDS Sequence:
>Vu_04129.1
ATGGTGCTCAGGGTTTCTGGAAATGCAGAAGGTGATGCCCTTACAGTATTCAAGAACAAAGTGATAGATCCTACTGGTGCTCTTAGTAATTGGAATCCTAATATTTTAACTCCTTGCACATGGTTTCATGTTGTTTGCAACGGTGAAAATAGCGTAATCCGTTTGGATCTTGGAAATGCAGAACTTTCCGGTCAACTTGTTCCAGAGCTTGGCCAGCTCCCAAATTTGGCATATCTGGAACTTCATAACAATAATATAACTGGGGAGATCCCAAATGTGCTTGGAAATTTGACAAACTTGCTGAGTTTGGATCTTTACTCGAACAACATTACTGGCCAAATTCCAGAAGAATTAGGCAATCTTAAAAAACTACAATCCCTGCGCCTCAACAAAAACAGCTTGTCAGGAAAGATTCCTATGGGTTTGACCAATATTAGTACACTGATGGTTCTTGACTTATCGTACAACAACTTAACAGGGACTGTCCCAGCCAATGGTTCATTTTCACGTTTTACTCCCATCAGTTTTAGCAATAATACTTACTTGGTGCAAGCCATTCCAATTTCACCACCCGCCACACAGAAACAAAATCCTTCAGGTAATAGTTTCAGATCTATTGGAGTCATTGCTGGAGGAGTTGCTGTAGGCGCTGCACTGTTGTTTGCAGCTCCAGTAATTGCATTTGTTTACTGCAAAAGAAGGAAGCCACCAGATTATTTCTTTGACGTTGCAGCTGAGGAGGACCCTGAAGTTAACTTTGGTCAACTTAAAAGGTTTTCACTGCATGAACTGCTAGTTGCAACAGATGGTTTTAATAACAAAAACATTATTGGTAAAGGTGGATTTGGCAAGGTTTATAAAGGACGCTTAACAAGTGGTGATCTAGTTGCAGTAAAAAGACTTAACCAAGAACGTATCCGGAGTGAGGAGAAACAATTTCAAACAGAAGTGGAAATGATCAGCTTGGCTGTGCATCGAAATTTGCTTCGCCTGATTGGTTTTTGTATGACAACTACTGAAAGATTGCTTGTGTATCCTTTCATGGTTAATGGAAGTGTAGATTCATGTTTACGAGATCGACCAGAATCACAACCACCACTTCAATGGCCAGTGAAAGCACTTCTGAAGGAGCAGAAGTTAGAGACACTGGTGGATGAAGATTTACAGGGAGATTATGATGGGGGGGAACTAGAGAAGTTAATTCAAATAGCTTTGCTGTGCACACAAAGTTCCCCTTTGGATAGACCAAAGATGTCTGAGGTGGTGAGAATGCTAGAAGGGCAAGGTTTGGAAGAAAAGTGGGACCAATGGGGGAAGAAAGAGGATATGATCCAAAAAAATTACAACCCCTTCAATCTCTACGTTGGTTACGACTCAATTTCAAATATTCCACCAGATGAACTGTCTGGTCCTAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_04129::LG1:56148480-56150480(-)
TTATTTCTTCTTCTTCTTCTTATAATAATAAAATAAAAATGTTCCATAATGAATTATAATCACAAAAAGAAAATTTTAATAGTTTTATTTTAGTGATATATAGATTATAAAACTTTTATAATTAATCCTAGGATTGTTTCCAAATACTTTCATTTTATTAAAGAATTAAAATAATCGATTGTGTTAATAGTCCACCATTCTCCCACATTTCTTCTTTGTTTTGTAACCAAGTTTTCTACATTTTCGTTTTCCTTTCATATTAAAATTCTTTAATTTTTCACATTTTCTTCCCTTTCATACTAAACAACCCTTTAAAAGCAAGTAATAACAACAAATGACTTCCTTGAAAGATTCAAATCATTGTAGTTAATCTTCCCATGCATCATGTTTCACGCAATATTCGGAATGAAAGCACATAAAATGAGAAGTTCAAAGAGGAATTATGTAGGTTTAGGGTGAATACATAAAATTGTAATAAATCACAATAGGGACGGAAAATAAAATAAGCTATGCCTCCTAAAACAATTTATAGTTCTACTTGCCTCAATAAAATTCTTCGAAAATATTTAAAAAAGAAAAATAAATAGTCTTTTTTTAAATTAGTATACTTGCAAATAAAAAAATTAATATAAAACAATTTCTTAATATTAGTTAATTTTAATTAATAAGAAACTTTTTTTATTATTTATAAATGTTTATTAAAAAAAAAGGCTATTTGAGATGTAAGTTTAAAGATAACAAAAATTAAGATAATAAGGAAATAGATTTTATAGTACTTCAATCTTTATTTAAGTAGTAAAAACTATCCCTAACTTAACTATAATTGTCATCTTCTATTTATTTAGTTAAGTGTGAAAGAGTAATATTAATAATTTGACTTGTTCTTTTGGAAAAGGAGAATGAGTTGTAAATATCCATGAAATGATGAATAACCAAGGGATAACAATAACATGTAACTCCTTGAGAGCAAGGCTCTAAAGCATACCAAATTTCTAGGACTGGTGACATATTTCATCAAAGAGTTGTCAATCTTTTCAAAGGATTGATCAATAGTATGTAGCTCAAAGCGCTTAAGAGACCATGCTTCTTACTCCAAAATGCATTCTATAAGTTCCTCAATGTAGCTAGGCTAGGATGTATTTTCCTTGTTATCATAAACAGATTTTAGTAGAAGAGAAAAAAGTTCTATTTCTGAAGAGTTCTACGTTGAACATAGTCTAATAAATTGAATGGAAATTACTGATTTAAATTTAGATCCATTTTAATTATTACGCAAACCTTTGTTTTTAAATCTATCAAATCTTATCATTGCAAACTCAAATAGGTCACCAGTCACTTGTTTATCCAACCAAATTCTTGTAAATACGACGATCTTGTTGTATTACCATTAAACCAATGCACTTCTTGAAAAGGTTAGATCCGTACTGGATTGTGGACATATGTGTACGAATCCGAACATACTCTAAATTTGGGTATATCAGAGGAGGGTAGGTAAAATTTCTTCCTCTCTCTATTTTTTTTTTTTAAATTTTGTTACTGTTAATGTAGTTAGCAAACTTATATTATGGAACAATCCCGAAAAGTGATCCCCAAACAAGAAGAAATAAGGAAAATAAAACAACATAATTAGTCAAGAGATTAAACAATTATTAAGCCAAAGAAAAGCAAAAAGCTAAACTTGGAAAAATGAAAAAGCAAGACTTGGGGCTGAGTACGTGTATGAATGATAAGAAGTTAAAGTATGCAGATGGTGGTGGGGACAATCGTCGGTTAATTATTATTGTTTCTATGTTGTGATAGGTACTGCTCTAAGTTGACTGGTAATGCAATGAAGATCTTATGGTCAATGAGATCTATCTGCTTATGAACTTGAAGAGGAATATTCATATTCATGCGCATGTGCATGTGCATGTACATGATTGAAGAGGATGAGTAACAAGGAGCGAGTTCCATCTTTAATATGCTTCTATATTCTGTTTTGGACATTTTTGGTTCATCAC


Gene Sequence:
>Vu_04129(-)
ATGGTGCTCAGGGTTTCTGGAAATGCAGAAGGTGACGTTTTGTACTTACTTGGTGCTTCAATTGATTGTTTTTGTTTGTTTTCTTGTTTCTGTTCTTTTATGAGTTGTTGACTTTTCAGCTCTGTTGGTTTGGCTCATATGTTTGAATGAGTTAAAACTAGACATGGAGTTAGTATTAGGCTTTTGTTCATTACTCGGCATAACAGAGTATGCAATATAATAACACAAACTATGAAATTAAATAGAACTCAAAATTTAGAGGATAAATTGAAACCTACTTAGAGGACAAAAAATACTGACTTTTTCCTTTTAAATTTTGCATGGTGTGTTGGTGCATAGCTCGGGCTTTTTGAAGGTTGTAAACTGAAAATGTTTCGGTGTTATGCTTGGGGAGTTATTGATGAACATGGGCTTCATTTTTTTACTTTCTGTATTTCGCACAATTTCATTGAAAGCAGCACAATACCTGTTTGATTTTTTACTCCTGTCAATTTAATATATTCAGTACATTTGTAATGGCACTCAAATATTACTTCTATGACAGGTGATGCCCTTACAGTATTCAAGAACAAAGTGATAGATCCTACTGGTGCTCTTAGTAATTGGAATCCTAATATTTTAACTCCTTGCACATGGTTTCATGTTGTTTGCAACGGTGAAAATAGCGTAATCCGTTTGTAAGATATCTGCTATTTTTACTTGTGCCTTTATGAAAGATTTTGCATAAAGTGAAAAATGTTGTTTGGCCAGGGATCTTGGAAATGCAGAACTTTCCGGTCAACTTGTTCCAGAGCTTGGCCAGCTCCCAAATTTGGCATATCTGTAAGTTATGCCTCCTTTGCTGAACAGATTTTGCATGACACTACTTTTTTTATTGACATTTCATCAGCTATTTCTTGTAATTCTTGAATGTTGGTTGAAACTAGTATTATTAGGCAAGGTTATTCTAAAAGTAAATGCTGTAACTGTCTCTCAGAAAACTACCTGTAGTGCCATTTTCTGTTATTCACTGAACTCGTTACTCTGCCAAAATCTAATTATTTTCCTTTTACATGACAGGGAACTTCATAACAATAATATAACTGGGGAGATCCCAAATGTGCTTGGAAATTTGACAAACTTGCTGAGTTTGGATCTTTACTCGAACAACATTACTGGCCAAATTCCAGAAGAATTAGGCAATCTTAAAAAACTACAATCCCTGTATGACCTGTTTTCCTTTTCTCATATCTTAATCAGCAAAACTTATTCAATTGAATTTCATTTTTGTTTCTTCTTTTTTAGCATTCATAAAATGGTGGCACATTATGCATCCACAATACCATTTCAGTTCCACATATCTTGTATTATGCTTTGAGCTATTGCCCCAAGAGAAGTATCATCCTACTTAATCACATGAAATACATGCTTGTATAACATTATGGCACACGCCCACTGCACTTGCTACTTAATCATTGTTTTTGTTCAATAGTTTATTATCTGCTAACCAAATGGCTCTACTCCCTGAACTAGGCGCCTCAACAAAAACAGCTTGTCAGGAAAGATTCCTATGGGTTTGACCAATATTAGTACACTGATGGTTCTGTGAGTTTAACTATATGTCTGGATACATTGCTATGTTAGTGTTGTGTTATTTTGTCTAAAACCTGACACCATGATCATTGTTGAATCTAGTGACTTATCGTACAACAACTTAACAGGGACTGTCCCAGCCAATGGTTCATTTTCACGTTTTACTCCCATCAGGTTGGTACAAATAAGAATTTTGTTCTGATGAGCTCATTGGGAGAACCAAGCACCAACACTTGCCAATAGCCATATGTTATAAAATCAGAAAAACATAAAAGGTTGTAAAACTAGAGAGAAAAAACAAAAAACAGAAAAGAGAGTTTTTCTTGTGATGATATAGTATGGAAGAAGGTAGACAGAGAGTCTTCTACAATATTTTGAGTGTAATAGCTTATATGTTACAAAAGGTTCTCTCTAATTAATAAGAGAAATGTAAATCTGCATAAAATTAAATATTACCACTCATTCTTACCTAACCACTAATTATACAATCAGCTTTCCCACAAAACAATATTTATAAGTAATATCAACCTGTGAGATAAGTTAACAAACAGGAAAAAATAAGATGTTAGAGTATCTAGGAAAGTATCATTTTCTTCGTCATAATACTGTTCGAGTGGCATTATAAATCTTACATCACAATTTATTAACCCGTCAGTCCGTTTTTACAGTTTTAGCAATAATACTTACTTGGTGCAAGCCATTCCAATTTCACCACCCGCCACACAGAAACAAAATCCTTCAGGTTTGTTATTATTTACTTTATTGTTGGTAATGAATTTAAATTTTCAAAGAATATAGCTCTTAAAGTACTAGGCTTTAGATTATTGTCTTACAAGTAAAAAGTTAAAAGCAAATAAACTTTGCTTTAAAATTGTAATACTGGAGCAGCAATCAAACTCTACACGACTTGGCCAACTAGAATTTGGTCCATGTAATTTAAACCACTAATATAATCAAAAACTCATAAAAGGTGTCATCCAACTGCAAATTAATTCTGTCTGAAAGGTTCAGTTTTGGCGGCATTTACATTTGTTTCTTTTACAAGCTGGATTCACTCCGTTATATATTCCATATACTAGCAACATTTCCTTCGCCCTTAGAAATGGAGGTATTGATAATAATGGATGGGTTGCACGGTTTTTTTCCAAATGCTTGTTATGCAATTTTGCATGATTTCCGTGACTGAACTTTTTTATACAAATTTTAAATTTACAGAAAAGGACAGGTTGATTGCTATGAACAATGATCTTTGGCGATGTGGATACCTAAATAAGAACATCTTCTGCATGCTTAAATGTATAGTTTCTTAAGGTGAATGTGTGACCTAATTCTGAGTCAACAAGGGAGAAGACTACAGTTTTTAGGGACGTATATCCTAGAAAAAAGAAAAGAGGGGGAAGGGGAATAGTTTCTTTGACTTGGTGATGCATGTTGTTAGCATTCTGTTGGGAGAAAAGGGAAATACTTAGTGATAGAGGAGGGTGGAATGAGAGGAGAGGATGAGAGAGGAGTTTCCAATTTTGTACTTAGTTCCTTTTGTTTGAAGAACACCACTATATTTTTCAGTCATTTGGGATTCTACTTATGCTTTTCTGTCTGGTATCTTAACATTATGTGACCCTTTGTCAAATACAAGGGAGTAAATAATAATGTAAAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTATTCCATTAATGCAAAGCAAAGTTTTGGAATTGAAATAAAGTTTTCCGTTTAATTCTGTTAATCCTTGTAGGTAATAGTTTCAGATCTATTGGAGTCATTGCTGGAGGAGTTGCTGTAGGCGCTGCACTGTTGTTTGCAGCTCCAGTAATTGCATTTGTTTACTGCAAAAGAAGGAAGCCACCAGATTATTTCTTTGACGTTGCAGGTTGGTGGATTAGCACGAAAAGATGGTATACACACTGATTTATTTATGATAATCACATCTAATTTTTGTGTCTTCCACCGGCAGCTGAGGAGGACCCTGAAGTTAACTTTGGTCAACTTAAAAGGTTTTCACTGCATGAACTGCTAGTTGCAACAGATGGTTTTAATAACAAAAACATTATTGGTAAAGGTGGATTTGGCAAGGTTTATAAAGGACGCTTAACAAGTGGTGATCTAGTTGCAGTAAAAAGACTTAACCAAGAACGTATCCGGAGTGAGGAGAAACAATTTCAAACAGAAGTGGAAATGATCAGCTTGGCTGTGCATCGAAATTTGCTTCGCCTGATTGGTTTTTGTATGACAACTACTGAAAGATTGCTTGTGTATCCTTTCATGGTTAATGGAAGTGTAGATTCATGTTTACGAGGTACCTCTATTAGGCTACTCTGTCGAGGAAGATTAATGTGATATGCTGCTTTTATTGCTAATTTACCTCAACTTGTTTCTCTAGTAAAACACCTTTCATCTTACATGTCCTTTTCGGGTAGTTATGCAAGCCTTAATTTGTTTCTGTTACTTTTTGTAAAATAAAAATTGTGTATGTCAGACATGTGTTATATCTAGCAGGAGCACATTCACACAACAGTTTAGATGAGTTTTTTAAATTTGATCCTTTGTCAGTACCTTTTTTTCTTTTCACAAAATTATCCAATTTTGTTTGACCACATCATTTGATGCGGTTGAAAGAGAATACAAATAAACTCTGCAGCTAAATAGTGCAAAAGCAATTGAAATTTCTTGTAGTTAAATTTCAGTAGGCTTTTTTTTTTCCTTCAAATAGTAATGTTTTATGTATGTTGATTTTATTTTGTAGATCGACCAGAATCACAACCACCACTTCAATGGCCAGTTCGGAAGCGTATTGCTCTGGGAGCAGCTAAGGGGCTTGCATATCTGCATGATCATTGTGACCCGAAGATTATTCATCGTGATATCAAAGCTGCTAATATATTATTGGATGAGGACTTTGAAGCGGTTGTTGGAGATTTTGGTTTAGCAAAGCTTATGGATTACAGAAATACTCATGTTACTACTGCTGTACGTGGGACACTTGGCCATATACCACCAGAGTATCTTTCAACTGGAAAGTCTTCAGAGAAGACTGATGTTTTTGGATATGGCGTGATGCTTCTTGAGATAATAACTGGACAGAGGGCTTTCAATTTAGCCCGACTTGCCATTAGTGATGAGGTTATGTTGCTCGAATGGGTAGGTATTATTATGTTCACTTAAGACATGCTATTAGTACTAGATCAATTAGCAGCCACATGTATTTTTCTAAGTGTTGAAGATTTCACATCCATCAGATAAGACAGATATATAATATAGAAGTGCAAACTTACAAACCGATTTCGTAAGATTTAGTTAACCTTAAAAGTCATATTGTTGAAGGAAATATTTTGGCACTAAACAGTTAATTCCTAGTTGTTGTTTTAATTGTTGCCATACATTTCTACTTGAAGTTTAGAAACCTCTTTTGTTCCC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