Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04012 LG1 54546150 54548192 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 54546170 synonymous_variant p.Cys7Cys
C/T 54546284 synonymous_variant p.Asn45Asn
G/A 54546582 missense_variant p.Ala145Thr
C/T 54546821 synonymous_variant p.Phe224Phe
T/G 54546935 missense_variant p.Ser262Arg
A/T 54547554 downstream_gene_variant
C/A 54547642 splice_region_variant&synonymous_variant p.Val287Val
A/T 54547647 missense_variant p.Asn289Ile
C/T 54547648 synonymous_variant p.Asn289Asn
C/A 54547947 missense_variant p.Pro389His
C/T 54548170 synonymous_variant p.Ser463Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04012.1
MAASCYCKKSYVSACFHVTLTLLLLVTPHAASLEFNYQQFGDTGNDFNTSGDVQAVQGILQLTEYKPDSYGRVVYNKLLHLWDKSSGKVADFTTHFFFTINTPNKTYHGDGITFFLADPKFPDSKIDGSGIGLASREQLGSINYAKDFPFVAVEFDTLANDWDPKYDHVGIDVNAINTTHTTEWYTSMDQRGYDAEISFESVSNRLSVTFTGYKDNAKIEQTLFAVVNLSDILPEWVKFGFSSATGYTYEEHTLSSWSFKSSLEMEQDKGGSKRGLVIGLSVGLGVGSKTTVLAGTIGYLPPEATTRGKASRESDVFSFGVVALEIACGRKAIESNMKEEQMYLVDWVLELHSIGEVLKASDSSLYGHFDEKEMETLMIVGLCCTHTDYLMRPTIRQVVQMLNFEAPLPILTQRGSVYNASFSSMASGTPAFSNNQPLSSTSSSSVFTGSSQSTATLEIITPTAAHLHTY*


CDS Sequence:
>Vu_04012.1
ATGGCAGCATCTTGCTACTGCAAGAAAAGTTATGTAAGTGCTTGTTTTCATGTAACATTAACACTCTTGCTTCTTGTAACACCTCATGCAGCTTCATTGGAATTCAACTATCAGCAATTTGGTGACACTGGAAACGACTTCAATACCTCGGGAGATGTTCAAGCTGTGCAAGGAATCCTCCAACTCACCGAGTATAAGCCAGATAGTTATGGTAGAGTCGTATATAACAAATTATTGCATCTTTGGGACAAGAGTTCGGGAAAGGTTGCAGATTTCACTACCCATTTCTTCTTTACCATCAACACCCCAAATAAAACCTATCATGGAGATGGAATCACCTTCTTTCTGGCAGATCCAAAGTTTCCAGACTCCAAAATAGATGGAAGTGGTATTGGTCTGGCCAGCCGTGAGCAACTGGGGTCTATAAATTACGCAAAGGACTTTCCTTTTGTAGCAGTGGAATTTGATACCTTGGCTAATGACTGGGATCCGAAATATGATCATGTGGGTATCGATGTCAATGCTATTAACACTACTCACACTACAGAGTGGTACACTAGCATGGATCAAAGAGGGTATGATGCTGAAATTAGTTTTGAGTCTGTGTCAAACAGATTAAGTGTCACCTTCACCGGATATAAGGATAATGCCAAAATTGAACAGACCTTATTCGCAGTGGTCAATTTGAGTGATATCTTACCTGAATGGGTTAAATTTGGTTTCTCTTCGGCAACAGGATATACTTATGAGGAACATACTCTTAGTTCATGGTCCTTCAAATCTAGTTTGGAGATGGAACAAGACAAGGGTGGAAGCAAAAGAGGGCTGGTGATAGGGCTGAGCGTTGGACTTGGTGTTGGATCAAAAACAACCGTTTTAGCAGGAACAATTGGGTATTTGCCTCCTGAAGCTACCACAAGAGGCAAGGCCAGTAGGGAATCTGATGTATTCAGTTTTGGAGTAGTTGCTTTGGAGATAGCCTGTGGTAGAAAAGCAATTGAATCTAATATGAAGGAAGAACAGATGTATTTGGTGGATTGGGTTTTGGAACTCCATAGCATTGGTGAAGTTCTTAAAGCTTCTGATTCAAGCTTATATGGACACTTTGATGAGAAGGAAATGGAGACGTTAATGATAGTTGGCCTTTGCTGCACTCACACAGATTACCTCATGAGACCTACCATTAGGCAAGTTGTTCAGATGCTTAATTTTGAAGCTCCATTGCCCATTCTCACACAAAGGGGATCAGTCTATAATGCATCTTTCAGTTCTATGGCTTCTGGGACTCCTGCTTTTTCAAATAACCAACCACTGTCTTCAACTTCAAGCAGCAGTGTATTCACGGGGTCCTCACAATCCACAGCAACTCTTGAAATCATTACCCCAACAGCTGCACATTTGCATACCTACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_04012::LG1:54544150-54546150(+)
TAAAACTCACCTATCAAACCTCTATTTTTACTATAGAAAATGACTTATAACTTAGTCAAAATCACTTATTCTCAACTTCCTAACCAAATTGATACCATCAAGCATTTCAACATAAGCATTCATGAAAATTAATCAATTCCAAACGAAAACAGTAAGGTGCACTACATCATTCAACCAATTTTCATCATTTCAAACATTCAATACTTAATAACAATCGTCTTTAACACAACCAACAACATACATTAGTTATACACACCAGTAAATAACAATTCATACATCATAATTTAACTAAGATAAAAAAAAACTAGCTTCCTTTACCTTACACTGAAGCAACGAAATTCTATAAACACCGAAACCTTGATTATAGCTCAAGGAATTCTAGAAACACCTACAAAACACCAAACAAAGATCAGAGAGAGTCCTTAGGACCTCTAATCAACGAGAGACTAAGAAAGCACATTACAATTCACATGCGACAAAAAATCGTTAAGCATGATTTTAATTAAGAACGAAAAAAGAAAAAAGAGTCTAAACTTACATGCTATTAAAGAAAACAATCAGATAGGAATGTAGTCGTGGTCTATTAGACACCTCCTGATCGTCAAAGAGATGACTCAGGAGTTAGAATTCTTAGAAAGAAGGTATTGAACTCTAGAAAAGTGATTTCTAAAGATATTATATGTTTTAAAATAATAAAACTAATTTATAACAAAATTATTTATAATAAAACTATTTAATATTAAAATAACTTAGTCTCGTTATTTTTATACTACCATAAGTTATAAAATAGTTGGGGTTTTACATCGGGGAGTAAAATCAATTGCTTAGATATCTTTTTAATTCTATAAAAATGTTATTTTAACGTACTGATTTGGTAATATATTGGTATAGACTTTTAATTCTAGTCTGTCACGAAAATATTTTAATTTTTATTGCAATTATATTATATAATTTTTTCCATAACAATTTGTAATTGATAGTATCAATTGTTTGCACGAATAAAATATTAAGGTAAGGTTGTTTATATTACTTATAAAAATATATATTTTCAATTTCTCTTAAATATGTAAATTTCAATTTAGTTTTTTTTTAAATGTTGTTGTTTATTTTTTAATTTAAAATGGATAATGATATCTCTGCACCCCAACAAATTTACATCAGGTATTAATATATTTTTTTTACAATTGAAAATTTTATATTGTAATATGATTATATTAATATTAAAAGCATAGAAGCATAGTTTACATGGCTATATGGTTCTGAAACCATCATTTTTCTCTAAATGTTTTTTAAACTACTTTTTTCTTCTTATAAAAAAGCTGGCTAAATAAGTTAGAAGATGAAAAACGACAAAGAAGAGAATGAATGGGGTTGCAAATGCTGCAAATGGCACGAAATTGAGCAGTTGACAAGGTAAGAGGAACTGTGGGACATTGTCAATGCCTTTTTTGTTCGGAAATTTCTTAATTTATTTATTTGTTGTGGTTGTAGAAATATCTTCAACTAAGCTCTGCGGTCCCCAACAACTTTTATAGACTTCTTTACGTGTAATTGACAACTTCAATAAATGAAGCATTGACCACTCAAAGTTAAAAGAAAAATGTTTTTTTAACAAAATCTAGTAGTATGTACCTGTCAGATCATATTTGTTCTTAGACCAAGGATGAAAGAGTGAACACAACACTTCCAAACAACAAATGACTTGTAAATTTTTCTATAGAAATCATGTTTCTTGAGAAATTTCAATGGAATAGCCATTTAGAGAGGTTCACATTGAATACACAAATGTGGTTCAAATATCTATTAAACTTGCACTTTTCATCCTTTTTTTCGTAGAGGGTTCGTTTACCCATGTTTGACTCATTCAATCATAAAACAGTGAACAACAATGTTAATGAACAAAACACCTATCATTGACTAGAACTCTAGAAACAGCTACCCAACCAAACCATATTTGTAGTATTCCATTTTCCATTGCACCCAACATCTTTCTCCAGTCA


Gene Sequence:
>Vu_04012(+)
ATGGCAGCATCTTGCTACTGCAAGAAAAGTTATGTAAGTGCTTGTTTTCATGTAACATTAACACTCTTGCTTCTTGTAACACCTCATGCAGCTTCATTGGAATTCAACTATCAGCAATTTGGTGACACTGGAAACGACTTCAATACCTCGGGAGATGTTCAAGCTGTGCAAGGAATCCTCCAACTCACCGAGTATAAGCCAGATAGTTATGGTAGAGTCGTATATAACAAATTATTGCATCTTTGGGACAAGAGTTCGGGAAAGGTTGCAGATTTCACTACCCATTTCTTCTTTACCATCAACACCCCAAATAAAACCTATCATGGAGATGGAATCACCTTCTTTCTGGCAGATCCAAAGTTTCCAGACTCCAAAATAGATGGAAGTGGTATTGGTCTGGCCAGCCGTGAGCAACTGGGGTCTATAAATTACGCAAAGGACTTTCCTTTTGTAGCAGTGGAATTTGATACCTTGGCTAATGACTGGGATCCGAAATATGATCATGTGGGTATCGATGTCAATGCTATTAACACTACTCACACTACAGAGTGGTACACTAGCATGGATCAAAGAGGGTATGATGCTGAAATTAGTTTTGAGTCTGTGTCAAACAGATTAAGTGTCACCTTCACCGGATATAAGGATAATGCCAAAATTGAACAGACCTTATTCGCAGTGGTCAATTTGAGTGATATCTTACCTGAATGGGTTAAATTTGGTTTCTCTTCGGCAACAGGATATACTTATGAGGAACATACTCTTAGTTCATGGTCCTTCAAATCTAGTTTGGAGATGGAACAAGACAAGGGTGGAAGCAAAAGAGGGCTGGTGATAGGGCTGAGCGTTGGACTTGGTGTTGGTGTTTTAATAGCTATTGTGGGGGTAACTTTTCTTGTGAGATGGATGATGAGGACTAGAGGAATAGAAGATGTCTCCCTTTTTGACCATGCTATGGACAATGATTTCGAAAAAGTCTCTGTACCCAAGAAATTTTCCTATGAAGAACTAGCCAGAGCAACCAATAACTTCGCAACAGAAAACAAAATTGGACAGGGAGGTTTTGGCGCCGTCTACAGGGGATTTATAAGAGAGTTGAACACCTATGTTGCCATTAAGAAGGTATCTCGTGGATCTAGACAAGGGGTGAAAGAGTATATATCTGAAGTAAAGATCTTTGGTCAACTGAGGCATAAGAATTTGGTTCAACTCTTTGGGTGGTGCCATGAGCATGAGGACCTGCTGCTGATTTATGAGTTCATGGAAAATGGAAGCTTGGATTCTTATCTGTTCAAGGGAAAAGGCCTGCTGACATGGAAGGTGAGATACAATATTGCGAGAGGGTTGGCATCAGCATTGTTATACCTGCATGAAGAGTGGGAAGAATGTGTGCTTCATAGAGACATAAAATCCAGCAATGTTATGTTGGATTCTAATTTTAATACAAAGCTTGGTGATTTTGGGTTAGCCAGACTAATGGATCATGGAATAGGATCAAAAACAACCGTTTTAGCAGGAACAATTGGGTATTTGCCTCCTGAAGCTACCACAAGAGGCAAGGCCAGTAGGGAATCTGATGTATTCAGTTTTGGAGTAGTTGCTTTGGAGATAGCCTGTGGTAGAAAAGCAATTGAATCTAATATGAAGGAAGAACAGATGTATTTGGTGGATTGGGTTTTGGAACTCCATAGCATTGGTGAAGTTCTTAAAGCTTCTGATTCAAGCTTATATGGACACTTTGATGAGAAGGAAATGGAGACGTTAATGATAGTTGGCCTTTGCTGCACTCACACAGATTACCTCATGAGACCTACCATTAGGCAAGTTGTTCAGATGCTTAATTTTGAAGCTCCATTGCCCATTCTCACACAAAGGGGATCAGTCTATAATGCATCTTTCAGTTCTATGGCTTCTGGGACTCCTGCTTTTTCAAATAACCAACCACTGTCTTCAACTTCAAGCAGCAGTGTATTCACGGGGTCCTCACAATCCACAGCAACTCTTGAAATCATTACCCCAACAGCTGCACATTTGCATACCTACTGA