Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04011 LG1 54522161 54524110 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 54522299 missense_variant p.Thr47Ser
A/G 54522572 missense_variant p.Arg138Gly
C/T 54522796 synonymous_variant p.Tyr212Tyr
G/A 54522866 missense_variant p.Val236Ile
G/T 54522884 missense_variant p.Ala242Ser
G/A 54523268 missense_variant p.Val370Ile
A/T 54523652 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04011.1
MAVSCYCKKSYVRACLTVTLLLLITPHAASLEFDYQSFGDTGNFFNTSGDVKPQQGVLKLTKNETFSYGRVIYPKLLHLWDINSGKVTDFTTHFSFTISALNKKHADGIAFFLAHPGFPSLSPRDGAGIGLASRDQLRNQNYKVDHPFVAVEFDTFVNEWDPQSYPHVGIDINSIVSSATAEWFTSQPERGYEADISFDSSSNILSVTFTGYKADVVVQGNLSSVVNLKDVLPDWVEFGFSAATGDYYDEYALSSWSFNSSFHMEAHKGGSKRGLVIGLSLGLGAGILVVILGVTFLVRWMLRTTGMEDASLFDHAMDNDFEKVSLPKKFSFEELARATNNFARENKIGQGGFGAVYRGFIKELNTDVAVKKVSRESTQGVKEYISERPTMRQAVQVLSFEVPMPTLTPRVPFSDNNTSFSSMDSMTPAFSNNHFTV*


CDS Sequence:
>Vu_04011.1
ATGGCAGTATCTTGCTACTGTAAGAAAAGTTATGTACGTGCTTGTTTAACAGTAACGCTCTTGCTTCTTATAACACCTCATGCAGCTTCATTGGAATTCGACTATCAGAGCTTTGGTGACACCGGAAACTTCTTCAATACTTCGGGAGATGTTAAACCTCAACAAGGAGTGCTCAAACTCACCAAAAATGAAACATTCAGTTATGGTAGAGTCATATATCCCAAACTATTGCATCTTTGGGACATAAACTCAGGGAAAGTCACGGATTTCACTACCCATTTCTCCTTTACCATCAGCGCCTTAAATAAAAAACATGCAGATGGTATCGCCTTCTTTCTGGCACATCCGGGCTTTCCATCGCTTTCCCCAAGAGATGGAGCTGGTATTGGTCTTGCTAGCCGTGATCAACTCAGAAATCAAAACTACAAAGTGGATCATCCATTTGTGGCAGTGGAATTTGATACCTTCGTTAATGAGTGGGATCCTCAGTCGTATCCCCATGTGGGTATCGATATCAATTCAATCGTATCTTCTGCAACTGCAGAGTGGTTCACCAGCCAGCCTGAGAGGGGATACGAGGCTGATATTAGTTTCGATTCCAGTTCAAACATATTAAGTGTCACCTTTACTGGGTACAAGGCGGACGTCGTAGTTCAAGGGAACTTATCCTCTGTGGTCAATCTGAAAGATGTCTTACCTGATTGGGTTGAATTTGGCTTTTCTGCAGCAACAGGAGATTATTACGACGAATATGCTCTTAGCTCATGGTCCTTCAACTCTAGTTTTCACATGGAAGCACATAAGGGTGGAAGCAAAAGAGGGCTGGTGATAGGGCTGAGCCTTGGACTTGGTGCAGGTATTTTAGTTGTTATTTTGGGGGTAACTTTTCTTGTGAGATGGATGCTGAGGACTACAGGTATGGAAGACGCCTCGCTTTTTGACCATGCCATGGACAATGATTTCGAAAAAGTCTCTCTACCCAAGAAGTTTTCCTTTGAAGAACTGGCCAGAGCAACTAATAACTTCGCTAGAGAAAACAAAATAGGACAGGGAGGTTTTGGGGCCGTCTACAGGGGATTTATTAAAGAGTTGAACACCGATGTTGCCGTCAAGAAGGTATCTCGTGAATCTACACAAGGGGTGAAAGAGTACATATCTGAAAGGCCTACTATGAGGCAAGCAGTTCAAGTGCTTAGTTTTGAAGTGCCAATGCCCACACTCACACCACGGGTGCCATTCTCTGACAATAACACATCATTCAGCTCTATGGACTCTATGACTCCTGCTTTTTCAAATAACCACTTCACAGTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_04011::LG1:54520161-54522161(+)
CTTTTGTCGCACTCACAAGCTCTCACGAACTTTCAACATGAACATTATTTTCCTCTCACGACACACTCATTTTTCTGCCTCTCTTTGTCGGTGTCTAGGATTTCTATCTTAACCTATTACAAATAGGAAATTCCATAGTAATCATAATGTATTTTGTAACATGCTATTATTTTTAAAAGCATGCAATGTAAGAATTTTACTCATCAACACTTTCAGCTATGTTCATGAAACAAAAATTGTAAGAAAATTTGAATATTGTATATACCTATATATTTATCTTTTTATCTTGTATTTGTTGTTACTTTCCTTCTCTCATCTTGTCCAGCAACATGGTAAGCTCATTGCAGCAACTGGAAACTCAAAACAGAAGATTAAGAGAGAAAGAAGGTAAAAGAATATATATAATAGAGTAGTTTGGATTGAAATCGAGATTTTTTTGGCTTTTACATGCAAGATACGTTGGATTAGTTGGTGCTCAATTTACTTTTGTATTCTGTTCACTGATAGCTACTTAGAATTGTGTTTTTCACAGTTGAAATCTTGCACTCCTACTCCACATAGATGGAACAAGTCCAATAGCTAAAGATATTGGGCGCCAGGTACAATAAATCTTAACAACTTTCATGACAAAAAAAAGTAAGAGGTTATGATAAGAATAACATAGTTTACCCTGTTCACAAATTATTTTAAGAAAAAAAAATACTTATGATTTGGAGATATATGGGTGTATGAGTTGTGAAAAAAAAATTCCATTTTCGATTAGGAATTTGATGATTAAATGAAAGGTAATAATTATACAACCAGAATGTAGACATTTTTTTGTGCTTACTTAATATTTAACATTTTTGGTAAGAGGTTGTATAAAACCTTCTTTTATCTTGGCTCATTACTTTTCTCTAAAAGTCATTTCAATGGCCAATATCATGCTCAAATTTCCTTGTTGTTTATATGTTTATATGATTGTCGTGCTTTTGTTGCAAAATCATCAAGGTCCATTGCCTTCACAGTTTGGTATGTTTCAATCATCATCGGTAATAATTGCTAAATTCATTTGTATAAATTTTTTTTATTAAATATATTATTAACTAACTATTATGTTATATTGTAGGTATTTGATCAAGCCAAACAATGAAATTAACGAAGAACAAAATTAGACAATGTTTCTTTTTTAGTAATGTAATGAACATTTCAATCATACTTTTAGTATTTTAATTTAGTATTGAACATCTTTCTTTTTAATATATGAACAATTAGTTGTATGAACATATTAATTGTTGAACAAGGTAGTTTATTTTATATATAATATTCAGTTTTAGTTTATATTACTTCATTGTTTGTTTGGTTAATAAAACTAATTTTATCATAATCTCATTTTATTATAATAAAAAACTAAAAACAAAAAATTGTACACATTTTTGGCAGTTTTAGCAAATCCCGGTTAGTTCCGGCGGTTTCAGCAAAACCACTGCTAATACCGGCGGTTTTTACAAAACACCTGCCAGTACCGGCGGTTTTCGCAAAACTCCTGCTAGTACCAGCGGTTTTGACAAAATCTCCGCTAGTACCGGCGGTTTTCACAAAACCCCCGCCAATATCAACGATTTTCACAAAACTCCTGCTAATACTGACGGTTTTGAGAAAACCACTGATAATACTTAGCGACGCAGTTTTTCCCAACGATTTTCCTAACTGGAGGTAACCTACTTTCAGGGAATTAAAATCGCCAACGGAAAAAATAACCTCCGATTCTTGTAGCGAGAGGAGTTCACATTCAATACGCAGATGTGGTTCAAAAAGCTATTAAACATGATTTTTCATCCTTTTTCTCGTAGAGAGTTGACTTAACCATGTTTGACTCATTCAATCATAAAACAGCGAGCAACAATGTTAATGAACAAAACAACTATCATTAACTACAACTCTAGAAGCAGGTACCGCAACCAAACCATATTTGTAGTATTCCATTTTCCATTGCACACCCAACATCTTTTCTCCAGTCA


Gene Sequence:
>Vu_04011(+)
ATGGCAGTATCTTGCTACTGTAAGAAAAGTTATGTACGTGCTTGTTTAACAGTAACGCTCTTGCTTCTTATAACACCTCATGCAGCTTCATTGGAATTCGACTATCAGAGCTTTGGTGACACCGGAAACTTCTTCAATACTTCGGGAGATGTTAAACCTCAACAAGGAGTGCTCAAACTCACCAAAAATGAAACATTCAGTTATGGTAGAGTCATATATCCCAAACTATTGCATCTTTGGGACATAAACTCAGGGAAAGTCACGGATTTCACTACCCATTTCTCCTTTACCATCAGCGCCTTAAATAAAAAACATGCAGATGGTATCGCCTTCTTTCTGGCACATCCGGGCTTTCCATCGCTTTCCCCAAGAGATGGAGCTGGTATTGGTCTTGCTAGCCGTGATCAACTCAGAAATCAAAACTACAAAGTGGATCATCCATTTGTGGCAGTGGAATTTGATACCTTCGTTAATGAGTGGGATCCTCAGTCGTATCCCCATGTGGGTATCGATATCAATTCAATCGTATCTTCTGCAACTGCAGAGTGGTTCACCAGCCAGCCTGAGAGGGGATACGAGGCTGATATTAGTTTCGATTCCAGTTCAAACATATTAAGTGTCACCTTTACTGGGTACAAGGCGGACGTCGTAGTTCAAGGGAACTTATCCTCTGTGGTCAATCTGAAAGATGTCTTACCTGATTGGGTTGAATTTGGCTTTTCTGCAGCAACAGGAGATTATTACGACGAATATGCTCTTAGCTCATGGTCCTTCAACTCTAGTTTTCACATGGAAGCACATAAGGGTGGAAGCAAAAGAGGGCTGGTGATAGGGCTGAGCCTTGGACTTGGTGCAGGTATTTTAGTTGTTATTTTGGGGGTAACTTTTCTTGTGAGATGGATGCTGAGGACTACAGGTATGGAAGACGCCTCGCTTTTTGACCATGCCATGGACAATGATTTCGAAAAAGTCTCTCTACCCAAGAAGTTTTCCTTTGAAGAACTGGCCAGAGCAACTAATAACTTCGCTAGAGAAAACAAAATAGGACAGGGAGGTTTTGGGGCCGTCTACAGGGGATTTATTAAAGAGTTGAACACCGATGTTGCCGTCAAGAAGGTATCTCGTGAATCTACACAAGGGGTGAAAGAGTACATATCTGAAGTAAAGATCTTTGGTCAACTGAGACATAAGAATTTGGTTCAACTCTTTGGGTGGTGCCATGAGCATGAGGACCTGCTGCTGATTTATGAGTTCATGGAAAATGGAAGCTTGGATTCTTATCTGTTCAAGGGAAAAGGCCTGCTAACATGGAAAGTGAGATATAATATTGCGAGAGGTTTGGCTTCAGCATTGTTATACCTGCATGAAGAGTGGGAAGAATGTGTGCTTCATAGAGACATAAAATCCAGCAATGTTATGTTGGATTCCAATTTTAATGCAAAGCTTGGAGATTTTGGGTTAGCCAGACTAATGGATCATGAGATAGGATCAAAAACAACTGTTTTAGCAGGAACAATTGGGTATTTGCCTCCTGAAGCTATCACAAGAGGCAAGGCTAGTAGGGAGTCCGATGTGTACAGCTTTGGAGTTGCTGCTTTGGAGATAGCCTGTGGTAGAAAGGCTATTGAAGCTAATATGGTTGAAGATATTTATTTGGTAGATTGGGTTTGGAAACTCTATGGCATGGGTGAACTCCTCAAAGCCTCTGATCCAAGCTTATATAGACACTTTGATGAGAAGGAAATGGAGACTTTACTGATAGTTGGCCTTTGGTGCACTCACACAGATTACCTTCAGAGGCCTACTATGAGGCAAGCAGTTCAAGTGCTTAGTTTTGAAGTGCCAATGCCCACACTCACACCACGGGTGCCATTCTCTGACAATAACACATCATTCAGCTCTATGGACTCTATGACTCCTGCTTTTTCAAATAACCACTTCACAGTCTAG