Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03970 LG1 53920343 53924538 PREDICTED: probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g48380
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 53921503 intron_variant
T/G 53921729 intron_variant
T/A 53921751 intron_variant
T/C 53921775 intron_variant
C/T 53921779 intron_variant
A/C 53921794 intron_variant
G/T 53921795 intron_variant
A/T 53921796 intron_variant
T/G 53922363 intron_variant
T/C 53922624 intron_variant
A/T 53922634 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03970.1
MSTEMGSQIKRDIFIHVFLYSLLRSLMVGNGVESDISCLISIKDSLEDPFNYLSSWNFDNRTEGFICSFVGVLCWHPDENKVLGISLENMGLKGEFPLGIRNCSSLTALSLSNNHLTGPIPSDISTLVPYATSLDLSYNKFNGSIPPTLANCTYLNSLRLDHNKLSGHIPQELGQLPLIKSASFANNHLSGSVPLFFQDISSVDYANNGELCGGPLPPCSLDSSHDFPQSFKRGLATGYAFSVTSVIVIYMSYCAPWEQSHHQRNKHRKKAKELGTIFWSIAGRKTRTQAPAEHELQPLQLQEKVVKENYTDKTCRLGTVALDAGKPKVKRDIILLDQRDATDCFSIDKAIGMGKIGIMYEGRLPNGWNLAIKRLFDSKQYKREFLLEIRILGKYRHRNIVPLLGFCVEGKERILVYQFMSNGRLSKWLHPLEGEVTLKWPQRIKVAIGVARGLSWIHHICNLHVVHLSISSECILLDKNFEPRLSNFGKAKFVNPNIEDGANTMFYVSDGKKDVYDFGSLLFELITGKTLKELSCSFSTATNLSGNPSNFVNAIDESLMGEGLENDVYTLIKVACKCVRPFADERPTMLEVYDTMKDIWVLHQVLQKKLSTELCVELFTDQTLHRALQALQAPFQIVRAIHKFFEAFIELLCGRPFHNSRLPG*


CDS Sequence:
>Vu_03970.1
ATGAGCACAGAAATGGGTTCTCAAATAAAGAGGGATATTTTCATCCATGTTTTCTTGTATTCTTTGCTAAGATCTCTAATGGTAGGTAATGGTGTTGAAAGCGACATCTCCTGCTTAATATCCATTAAGGATTCCTTAGAAGATCCTTTCAATTACTTATCAAGCTGGAACTTCGACAACAGAACCGAAGGTTTCATATGCAGTTTTGTGGGCGTTTTATGCTGGCATCCGGATGAGAATAAAGTGTTGGGTATCTCGCTGGAAAATATGGGGTTGAAGGGTGAGTTTCCACTGGGAATTAGGAATTGCTCGTCATTAACAGCCTTAAGCCTTTCAAACAATCACCTAACAGGACCCATCCCCTCGGATATATCCACCTTAGTCCCTTATGCTACCTCCTTAGATCTCTCATATAACAAATTTAATGGAAGTATTCCACCTACTTTGGCTAACTGCACTTACCTCAATTCTCTTAGGCTTGATCACAACAAGTTAAGTGGTCACATCCCTCAAGAACTTGGTCAGCTTCCCCTGATCAAATCAGCTTCTTTTGCCAACAATCATCTATCAGGGTCGGTGCCTTTGTTCTTTCAAGACATATCTTCTGTTGATTACGCAAATAATGGAGAGCTTTGTGGTGGGCCTTTGCCACCGTGTTCATTGGACAGCTCACATGATTTCCCTCAATCGTTCAAGCGGGGTCTTGCCACAGGCTATGCTTTTTCAGTGACTTCTGTTATTGTCATTTACATGTCCTACTGTGCACCTTGGGAACAATCACACCATCAAAGGAACAAGCACCGGAAGAAGGCTAAAGAATTAGGAACAATTTTTTGGTCCATTGCTGGGAGAAAGACACGTACTCAAGCTCCTGCCGAACACGAATTGCAACCTCTGCAGTTGCAGGAGAAAGTCGTCAAAGAGAATTATACTGATAAAACATGTAGGCTAGGCACAGTAGCTTTGGATGCAGGCAAACCAAAGGTGAAAAGGGACATCATTTTACTGGACCAAAGAGATGCAACAGATTGCTTTTCCATAGACAAGGCCATTGGGATGGGGAAAATTGGAATAATGTACGAGGGAAGGCTACCCAATGGTTGGAACCTTGCCATTAAGAGACTATTCGATTCGAAACAATACAAGAGAGAGTTTCTTTTGGAAATAAGAATTCTGGGAAAGTACAGACACAGAAATATAGTTCCCTTACTTGGGTTCTGCGTAGAAGGAAAAGAAAGGATTTTGGTGTACCAGTTCATGTCAAATGGAAGGCTTTCAAAATGGTTGCATCCTTTAGAAGGTGAAGTTACATTGAAATGGCCTCAGAGGATCAAAGTAGCAATCGGGGTAGCAAGAGGCTTATCCTGGATTCACCACATATGCAACTTGCATGTTGTGCATCTCAGTATAAGTTCGGAGTGTATCTTGCTTGATAAGAATTTTGAACCAAGACTGTCCAACTTTGGAAAGGCAAAGTTTGTGAATCCGAACATTGAAGACGGTGCAAACACAATGTTTTATGTGAGTGATGGGAAGAAAGACGTGTATGACTTTGGTAGTTTGCTATTTGAGTTAATCACAGGGAAAACATTGAAGGAGTTGTCGTGTTCATTCAGTACTGCAACTAACCTATCTGGAAACCCTTCAAACTTTGTTAACGCAATTGATGAATCTCTGATGGGGGAAGGTTTGGAAAACGATGTGTACACTCTCATCAAAGTTGCATGCAAGTGTGTTCGACCATTCGCAGATGAAAGGCCAACGATGCTTGAAGTTTACGACACTATGAAGGATATATGGGTTCTGCACCAAGTTCTCCAGAAAAAGCTCTCCACCGAGCTCTGTGTTGAGCTCTTCACCGACCAAACTCTCCATCGAGCTTTGCAAGCTCTCCAAGCACCTTTTCAGATTGTTCGAGCTATCCATAAGTTCTTTGAAGCTTTCATTGAACTTCTGTGTGGTCGACCTTTCCATAATAGTCGACTGCCTGGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_03970::LG1:53918343-53920343(+)
TCCCCTCAGCGGCCATTTGCCCCTCAGCGGTTCCAACGCCACCTCTTGAGTGCCGCTCAGCGGTAGTTTGCCGCTGAGCGGTGCCTTCGACTTCTCTTTTTGCACTCTTTCTTGTCTTTTCTAATGTCCTCTCTCTCATTCTTCACTTCTTTCACCAAATTCACCTCAAAACCTGCACAAAAACACTCAAATCAAGTATAAACCTGTCCAGCTCTCTTATTTCTGAAAATATAAACAAAATGCATGATTTCAAGCTAGTTTCTAAGTCTAAAGGTTGCTTTTAGTATCACTTTTAAGCATGAAAATAACAGTTTTTCAACTGTTATCAGTAAACGATTACAACAGTGTTTTTTTTGTAGATTAGCCATGCACTTCTCCAACTTGGTCCCTTCAGTAAGAATGGCTTCTTCCCTACTTTTTGGAGTCACCTCCCATCACCTACCACCCTCTACCACCAGTCAAACACCAACACCAAGTAAATACAAGTGGACTTGTGCTTTAAATTAACAGTTTTTGCTAATGATCACCCAGGACACCACAACTGACTACTTTAGTTCAACTTTCTGTACAAAACAGTGATTTCTCTCGTGTAATCGTTTACGAGGCCACCGACAATGTTTTTTCTGCAGATTAGCTCTGCACTTGTCCAACTTGGTCCCCTCAGTAAGAATGGCTTCTTCCCCACTTCTTAGGGTCACCAAACATAACCTCCAAACCAGTAATGACCCTTAAATTCACTTGTATGGTTTTTTGGTCAACAAATTCCACAACTTATATTCATTTCTGAAACCATTACCTACATTTTAAATACTTATTAATATTCTGCAGTCTTTTTTCAATATAACACCTTTGTTCATTATAACACACATAACGTAAAAAGAATTAAATTCATGACACCCAAACCGCCACCAAACTTCGAATCAGAAAAAAAATACAAGAATAGGGTTAGAACGACAGAGAAGATAGAGGTTAGATCGAGAGAGAAGATAAAAGGGATGAAAGAAGTGTAGAGGTGAGAGCGAAAAAACGAAAACCGCGAAACCAAAAATGTTAAACTTGTAAACTTTTCTTCCAATTTTGCCCTTAGTATGATAACCTCTCTCTATTTTTTTTTATTAAATTTGACCAATGCAAAGACGCCACCTGACGTTGTCAAATTGTTGGCAAAAATCGACATATCATTTTCCCAGGGATAATACCACTGCAACCAAGATGGAAAAATAATTTATGTAAAATAAAAATAAAATAAAATATAAAAGTATACATATCATGTACAATGAGAATATTTTTTCATAAATATTAGAGAGGTAACGTGCTAGATAACATATCAATTTCTTTCAAACATAACATGCAAGGACACTCTTTTTATCCGATCCCACCCATTGTGATCCTTAATATTCAGAAACTAAATGAGTTTAATTTTGTTACGCAATCTAATTTTTCTCCAACCTAACTTAAACAGTGCTCATAAGAAATAAAAGATCATATACGACTTCAACTTTCCCCAATCCGTCCAACGGATTAAATCATTCTATTTCCTTGAGATGAAATTCCAAACTCTGCATTTAAATATTTTGAAAACCTTAATATAATATTTATAATTTTCCAAAAACTCGTTCAAATGTGGCGAGTGGTCAACGTAATGGTCTTTGTACAGTGCAAACTGTACTGAAAAATTAGTGGTGAGAGTTTGAGAGTGATAGACAGACAAACTATAACCACGGAAAAATTAAGCCTCACTCTCCTTCTCTACAAGATTGACGTTTTCGTTAATATTAATAATTACTATCAAATATAAATAATGATTTGAATACTCTGGAGTGAATAAAATTCTATCAAATTAGGATTCGAATATTGTTTGAAGTTGGAGTTTCATTTCTGGCGTATTGAAAAGTATAATTGAAGAAAATTCAATTCCATTCTTCTCGTCTCTTAAATTCACTTTTCCAATCCTTCTCCTCTTCTTAACTTATCTTATATCAGAAAGGATCGTTTCTGCA


Gene Sequence:
>Vu_03970(+)
ATGAGCACAGAAATGGGTTCTCAAATAAAGAGGGATATTTTCATCCATGTTTTCTTGTATTCTTTGCTAAGATCTCTAATGGTAGGTAATGGTGTTGAAAGCGACATCTCCTGCTTAATATCCATTAAGGATTCCTTAGAAGATCCTTTCAATTACTTATCAAGCTGGAACTTCGACAACAGAACCGAAGGTTTCATATGCAGTTTTGTGGGCGTTTTATGCTGGCATCCGGATGAGAATAAAGTGTTGGGTATCTCGCTGGAAAATATGGGGTTGAAGGGTGAGTTTCCACTGGGAATTAGGAATTGCTCGTCATTAACAGCCTTAAGCCTTTCAAACAATCACCTAACAGGACCCATCCCCTCGGATATATCCACCTTAGTCCCTTATGCTACCTCCTTAGATCTCTCATATAACAAATTTAATGGAAGTATTCCACCTACTTTGGCTAACTGCACTTACCTCAATTCTCTTAGGCTTGATCACAACAAGTTAAGTGGTCACATCCCTCAAGAACTTGGTCAGCTTCCCCTGATCAAATCAGCTTCTTTTGCCAACAATCATCTATCAGGGTCGGTGCCTTTGTTCTTTCAAGACATATCTTCTGTTGATTACGCAAATAATGGAGAGCTTTGTGGTGGGCCTTTGCCACCGTGTTCATTGGACAGCTCACATGATTTCCCTCAATCGTTCAAGCGGGGTCTTGCCACAGGCTATGCTTTTTCAGTGACTTCTGTTATTGTCATTTACATGTCCTACTGTGCACCTTGGGAACAATCACACCATCAAAGGAACAAGCACCGGAAGAAGGCTAAAGAATTAGGAACAATTTTTTGGTCCATTGCTGGGAGAAAGACACGTACTCAAGCTCCTGCCGAACACGAATTGCAACCTCTGCAGTTGCAGGAGAAAGTCGTCAAAGAGGTGCTGTCTGTCCCTACCATATCTGCTCTGGATCAAGTCTCTTTTGTTTTCAAGATATATAAAAAAATAAAAAACCAATAAATATATAAAAACTAATTTTTCATTGGTATTATAATATATATATATGTTTAGTTATGTAAGGAGAATGGAAGATAATGTAATGGATTTTCAAAGGAGGATGTGCAGAAAATAGAACCAAATCACAAGGACTCAGTGAGACTAAAATGAATGGTTGAGTGAATAACAATTGGATGTGTGCAAGCTAACTGGGTGAGATTCGGCTATAGACAGAATTATACTGATAAAACATGTAGGCTAGGCACAGTAGCTTTGGATGCAGGCAAACCAAAGGTGAAAAGGGACATCATTTTACTGGACCAAGTAAGCAAACAAATAATTCATTCTAATTACAACACTTAAAGCATAACAGATATATCTGGAACAAAGACAAAATAGGCATAGTTACTGCATGCAGAGGGCACCTTGTGTCTATTGTTGATTAAGGAGGTTATCGGTGGAGGTTTCTAAGAGTCTAAAGGCAGAGCTACTGATGTTTTTATTTGAACAGAGCTAGTGATACATATGCCGACTGGATTTTCTTGTTTATGCTAAAGTCCACTGGTTATTACAATGTGATACTCAAATCAGAGCAAGTACACAAAGCTTTGTGGACTTATTAAAGAAGGAACATACCTGGTGTTTGAAAAGATATACATGGATATAACATTATATATCATAAGGTATAGACTAAGTATAAGATCAACAATGAATCGTATTGTTCCCAAAGAAAATGCAATGAGGCCCTGGATGGGTTTTCGCAGAATTTAAGGCAGAGGAATAAACCAAAGTTTGGTTTGTTGTTCGCGATATGACAAATGCAGTATGAAACAAGTAAAGTACAAGGCTAGATAAATGAATAGTCAGAAGAAGCTGCACAACAATAGTCTTGTCCCTTAAAAAAGGCCAACGTTAATGTAGTACCTAGATAATTGAAATCTAAGTTATATTGTATGCATGTTGAGGCAATGTAAACACTTTGTAAATAATGAACCGTGTATATATATAATTTGGGGGAAATAAAAAATAAAAAGATTTTTTGTACTTTTTATGAAAATTGATTCATAAAATACTCTTTTATTAATTATATAATAGAGAAGTGATAATGATAAGCTAATACACAATATTGTCTTAAACTATTAAATTATCTCAGATAAACAGAAATGTGTTACAAAGTTTGCACAGAAAAAGTAAGGATTAACTAGTTAAATGTCCATGAACTAAAACTATAGTAGTAATGTATTATAATGAGTTTAGCAATGATTAATATGGTTGTGGTTACATCAACAGATTTCTGTAGTAACAGAGAGAATGAAGTCTCGATGAGGTTCAACGAAGAGAGATGCAACAGATTGCTTTTCCATAGACAAGGCCATTGGGATGGGGAAAATTGGAATAATGTACGAGGGAAGGCTACCCAATGGTTGGAACCTTGCCATTAAGAGACTATTCGATTCGAAACAATACAAGAGAGAGTTTCTTTTGGAAATAAGAATTCTGGGAAAGTACAGACACAGAAATATAGTTCCCTTACTTGGGTTCTGCGTAGAAGGAAAAGAAAGGATTTTGGTGTACCAGTTCATGTCAAATGGAAGGCTTTCAAAATGGTTGCATCCTTTAGAAGGTGAAGTTACATTGAAATGGCCTCAGAGGATCAAAGTAGCAATCGGGGTAGCAAGAGGCTTATCCTGGATTCACCACATATGCAACTTGCATGTTGTGCATCTCAGTATAAGTTCGGAGTGTATCTTGCTTGATAAGAATTTTGAACCAAGACTGTCCAACTTTGGAAAGGCAAAGTTTGTGAATCCGAACATTGAAGACGGTGCAAACACAATGTTTTATGTGAGTGATGGGAAGAAAGACGTGTATGACTTTGGTAGTTTGCTATTTGAGTTAATCACAGGGAAAACATTGAAGGAGTTGTCGTGTTCATTCAGTACTGCAACTAACCTATCTGGAAACCCTTCAAACTTTGTTAACGCAATTGATGAATCTCTGATGGGGGAAGGTTTGGAAAACGATGTGTACACTCTCATCAAAGTTGCATGCAAGTGTGTTCGACCATTCGCAGATGAAAGGCCAACGATGCTTGAAGTTTACGACACTATGAAGGATATATGGGGTGAAGGACATTAATATAGTGATGGGTTCACCCACTCTACCTCGATATTTCTTCTTCTAGTATAGACAAACTTTTTTTCCTATAAGAACGGGCTTACCCATCTAACATTTGAAATTAGGATTTAAGGTTTATTGAGATATTATATACAAATTTTTTATATTCATTTCACCCTATTTTTTTATATTTTAAAAAAATTATATATATATATATATATATAATATATATATCATTTTATTTTTATTTTTATAATATGTGTTAAATAAATGGAAATGTCTCTCACTTTAATATATATTTTTTATTTTATTTTTAAGGTATGTTTCCTTTGGTTTCCAACTTACTACATTAAAGTTTCTCTTGTAAACTTCTATGTTGATTTCTTTTCTTTTGTTTAATGAACTAAAAAAACTGTTTTTTATTAACCATTTTTTTAGTGGTTATCTAAACTGATATAAATATTTTGATTTCTGTTAATTATTCTTAACTGTCACAATATTTTTTCATGTTATTTTAAATTTAGTTATATTAACTTAATCAGTAGATTAAATCTGATTTGAATATTTTCAATCCTTGTCTGTCTTTATAATTCTACAGATTCAGAAATATGCAAATCTATTGTGTTTAAATCTAATGTGTTTTCCTCTATTCATCCTATGATCTATGATCTCCTACGTCTACTCTTCTCTAGTGCATGTTTGCCTAAAATTTCTAGAAATTTGTTCAGGTAATCTTCAATATAAGATTTTCGAAAGCTTCTTGAGGTAATTTCTTCATATTGGAAGCGAGATTTCATATTTCAAGTCAGATTTTCTCTTTCCCTAGGTTAATATGCCCTTTTCCCCGAAGAGAGAGGAACTGACAACTCAGTTGACTTTGAGCTCTCTACACGTTCTTTCAAGTTCTGCACCAAGTTCTCCAGAAAAAGCTCTCCACCGAGCTCTGTGTTGAGCTCTTCACCGACCAAACTCTCCATCGAGCTTTGCAAGCTCTCCAAGCACCTTTTCAGATTGTTCGAGCTATCCATAAGTTCTTTGAAGCTTTCATTGAACTTCTGTGTGGTCGACCTTTCCATAATAGTCGACTGCCTGGTTGA