Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03805 LG1 51542477 51548635 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   located in   trans-Golgi network, Golgi apparatus, nucleus, trans-Golgi network, endosome, extracellular region
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 51544486 downstream_gene_variant
A/T 51544493 downstream_gene_variant
G/C 51544572 downstream_gene_variant
A/C 51544575 downstream_gene_variant
C/T 51545056 downstream_gene_variant
G/A 51545073 downstream_gene_variant
T/C 51546197 downstream_gene_variant
C/T 51546374 intron_variant
A/T 51547620 intron_variant
A/G 51547737 intron_variant
C/G 51547884 intron_variant
A/G 51547960 intron_variant
C/T 51547962 intron_variant
T/C 51548074 intron_variant
A/T 51548082 intron_variant
A/T 51548085 intron_variant
A/T 51548104 intron_variant
A/C 51548218 intron_variant
G/A 51548219 intron_variant
G/A 51548299 intron_variant
G/T 51548304 intron_variant
A/T 51548384 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03805.1
MRERKRQKRKKLCREKIGEAESSTMLLQLIQLWMMLCFVSVSCSARQDPFAMRISCGARQNVQTRPTNTHWGEDFGYTGGIVANATLPSYITPPLNTLRYFPLSEGLQNCYVIDKVPKGHYLIRIFFGLVGQSRGTIIEPLFDISIEGTQIYSLKSGWTHQADQVFAEALVFLIDDSVSICFHSTGHGDPAILSIEILQIDDKAYYFVPRWSQGLILRTIKRLSCGFGQSKFDVDYAGDPWGGDRFWQRIKTFGEDSESSQPRSVETRIKHASHPPNFYPETLYQSALVSTNNQPDLTYTLEVDPNRNYSVWLHFAEIDYSVTTVGQRIFDIEINGDLAFKHVDIVELSGDIYTALVLNTTVSVNGRTLTIKLKPKEGNHAIINAIEIFEVIMAESKTESEEVSALQALKKALRLPSRFGWNGDPCVPQQHPWSGVGCQLNKSRGSWVIDGLGLGNQGLKGFLPDDISRLPNLQILNLSRNDIHGAIPSSLGTINTLQVLDLSYNFFNGSIPESLGQLSSLQILNLNSNLLSERVPATLGGRLLYRASFNFTDNAGLCGIPGLPTCGSHLSSGGKIGIGLGASFAFFLLTTCSVCWLKRRHNILRAQKIAARAAPYAKARTHFSRDIQLTRHHNNFGKTSTAAENGPILLS*


CDS Sequence:
>Vu_03805.1
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Promoter Sequence:
>Vu_03805::LG1:51548635-51550635(-)
AGGTGAGGAAAGATAAAATGGATATGCCATAGTATATACTTCATTTGTTGGCATAAGAACTAAAGCATCTGCTACGAGAACTTCCTCTACCATGACCTTAAGCTCATTGTCTGATAGCTCCATACCATGAAGAATTGTTGTTGTTTCAAAGTATTATTTCCCAAGCCACTAGTTTCCCCCTATACCATCCACAACATATAGTTCACATGGACGAGTGTCATCCATGTCATCCTCTAATGGAGGTGGAGCTGAACAACTCTTCTTTTTTGCTTTTACGTGAACAAATGTTAATGTAGGAACCTGATAATTGTATACGAGTTAACTTCCATTTCTCATGATGAGATAGTGGTGAAGGAAGTTATACACATTCATCCTTTAAAGATGGGGCCCTAGATTTTTCCTTTTCCTTTATTATCTTTTGTTCAAGTTTTCTATATCCATCACGAGACAATATATGTGGGTTTTTATTTTGAGCGCTTTGGACCTTTGCCTTGATCACCTTGTAACATAAAATCCATTTTATGAATTAGTTCAACTTGTACATAATCATCAATGGAGAAATGAATGAATCTCAACAAATTAACCTTCCATCCTTTAGATGTACGAATCTCAACAAACAGACACCTAGTTTCTTCATCAATTACCTTGTATCTAGCACATGAATTTTCATTTTTTTTAGCTCCAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACACACCTCAGTTTTATCTTAAAACTATGAAATTTCTCAACGACCAAAAATAGAGATTTATTTTTAAGCGTTTCCACATTTGGAATATCAAATGTCATATACAATAGTATTTAAGAAATTATCAATATAATCAAACTATGTTAAGACAAAACCATCTAAAAACACTTTATTTGAAGTTAAATAATATTGTCTATTGAAATAGTATTCATAGTAGATGGTTTAAATAACTCATTAATGTTATCTTACTAAACACTATCCCATCAGTGCTTTCTTTTAATAATACTTTCTAAAATTTCTCATTCAATGAATTGAACAAAAAAAGTTTTACCTTTAAATCTTTGAGTTTTTGACTAAATTAAAATATAATAGGTAAAATTAAAAGTATAATCACAAATTTGTGAAATTAAAACTTCGATAATAAAAGTTACTAAATTATAAAAATTTAATGATAAAATACGTAATTTAACTATCTGTAAAAAGAAAATTGAATGATAAAATTTACAAAATTATAAAATTAAATATCTTTAAATTTTATAATTTAGTTAATTGTTCTTTGCTGTATAACTGTTTTTGAAATATCCAAAATATACAAGCGTAAATCTCACACACATATTCCGGTGATTGCGCACTAATCACTCCCACTACTACCCAAATGTAGGTCAGAAGTCAAAAAGTTCAATCAAGCATCAATGACCATTCTGCACCATCTGATGTAAAAGCAGTATCATCATCAACGTCGACAATCATATTGTTCAGTTCTCAACATTAATAATTATCGTATTTTTTCTTCTATCATAAAACATTTTAATTTTTCATTGACGCTTTGAATCCAACAATAAATAACGTCAAATCCCCCTCTAACACGTAATTTACCTAATCTTAAATAAATGAGATCATGAACAAACTTTTAATAAGAATTATTTTGAGAAAAAAAAAGTAAATTTATTTACAGTTAAATTTAATAGAAACTTACAATATATTTTTTCTATTTTTATAATTTGTGCTTAAGTTAGTTCTAAGGGAAGAAAATTAATTTTTATTTTTTTGTCTGGAAGTTTTAAGTTTTAATTGGAAAAGTTAGTTGAAATAATACATACGATTAATATAGATACGGTGTGGAGTTAACACTTGCAGCAGATCTGCACCATGCGATTGTAAGTGCATGGATTATGATAAAGCTCAGCAGCACGGAACCACTGTGTTCGTTTCTTTGGCGCCCGCGAGTAAACTTGAACGAAGAAGATTTTCCTATCGTGGTG


Gene Sequence:
>Vu_03805(-)
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