Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03703 LG1 50272479 50278740 PREDICTED: protein MALE DISCOVERER 2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 50272702 5_prime_UTR_variant
T/C 50272819 intron_variant
T/A 50272966 intron_variant
G/A 50273072 5_prime_UTR_variant
G/A 50273135 5_prime_UTR_variant
T/A 50273554 synonymous_variant p.Thr45Thr
C/T 50273587 synonymous_variant p.Asn56Asn
A/T 50273771 intron_variant
A/G 50273777 intron_variant
G/A 50274070 intron_variant
C/T 50274193 intron_variant
G/T 50274283 intron_variant
T/A 50274574 splice_region_variant&synonymous_variant p.Leu102Leu
A/G 50274575 missense_variant&splice_region_variant p.Ile103Val
C/G 50275219 intron_variant
A/T 50275228 intron_variant
G/T 50275498 intron_variant
T/A 50275744 intron_variant
T/A 50275801 synonymous_variant p.Pro202Pro
C/T 50276277 missense_variant p.Leu331Phe
G/C 50276281 missense_variant p.Cys332Ser
G/T 50276364 missense_variant&splice_region_variant p.Gly360Trp
A/T 50276479 intron_variant
T/C 50276482 intron_variant
T/A 50276910 intron_variant
T/C 50276913 intron_variant
A/T 50276924 intron_variant
T/C 50276941 intron_variant
G/A 50277122 missense_variant p.Glu368Lys
G/A 50277124 synonymous_variant p.Glu368Glu
G/A 50277127 synonymous_variant p.Leu369Leu
G/A 50277138 missense_variant p.Cys373Tyr
C/T 50277151 synonymous_variant p.Ser377Ser
C/T 50277344 intron_variant
T/A 50277806 intron_variant
C/G 50278075 intron_variant
T/G 50278149 missense_variant p.Leu588Trp
G/A 50278150 synonymous_variant p.Leu588Leu
C/T 50278543 3_prime_UTR_variant
A/T 50278581 3_prime_UTR_variant
G/A 50278707 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03703.1
MESIWGPYGLWLRIYVGLISLWGTQHCLSLNDEGLSLLEFRGRITCDPFHALSNWNPNDCNPCQWYGVRCVGGKVRMLVLPELYLEGTLAPELGKLSHLKSLILYKNSFSGTIPEELGDLDKLELLDLRGNNMTGCVPAEIGHLLLSEQLFICDKKCESSDSQGIGKLRLPCSINLSTRLTTSSLGKNRKVAPRLKLVKATPHAHAEKWCGILTGSDDSEIDQNVENVVNSARRKLLDQSSNLAAAPFSGGPTIQISYIPITQSSGAFPAFPDTNKQQNQSPGQLPSTSNLTPTNQTSQPNSANVASGKLWEYIIIIAGVAVLVIIVLIMLCIWRKRAARVIKPWKTGISGQLQKAFITGVPKLNQAELETACEDFSNIINTFDECTIYKGTLSSGVEIAVDSTIVTSARDWSKTMETAYRKKIATLSRVNHKNFTNLIGYCDEEEPFTRMMVFEYAPNGSLFEHLHVKEVEPLDWSARMRVIMGTSYCLQYMHHDLNPPVAHSNLNSVAILLTDDFAAKISEIAFGKNVSSQANTPGHESQKCDLPPHADPETDVYNFGVLLLEIISGKLPYSEEHGHITDWAAEHLNNKQSVSNLIDPSLESFKEEELDVICEVIKECLQSDARLRPTMKDIAPRLREVLHVSPEQAVPRLSPLWWAELEILSLETS*


CDS Sequence:
>Vu_03703.1
ATGGAAAGCATATGGGGCCCATATGGATTGTGGCTCAGAATTTATGTTGGATTGATTTCTCTATGGGGAACTCAACATTGTTTGTCTCTAAACGATGAAGGATTATCCTTGTTGGAATTTCGGGGAAGAATAACTTGTGATCCTTTTCATGCTCTGTCAAATTGGAACCCAAATGATTGTAATCCTTGCCAGTGGTATGGTGTTCGTTGTGTAGGTGGTAAAGTGCGAATGCTGGTCCTACCTGAACTATATTTGGAAGGCACATTGGCTCCTGAGCTTGGGAAACTTAGTCATCTAAAATCCCTTATATTATACAAGAACAGTTTTTCTGGTACTATTCCCGAAGAACTTGGTGATCTAGACAAGCTGGAGTTATTGGATTTAAGGGGGAATAACATGACTGGATGTGTCCCAGCAGAAATTGGCCATTTGTTGTTGTCAGAACAATTGTTCATTTGTGACAAGAAATGTGAAAGCAGTGATTCTCAAGGGATTGGAAAGCTCAGATTGCCCTGTAGTATCAATCTTTCAACTCGTTTGACAACTTCATCACTTGGAAAGAACCGAAAGGTTGCACCCAGGCTCAAGCTAGTAAAGGCCACCCCTCATGCCCATGCAGAGAAATGGTGTGGCATTCTGACTGGCTCTGATGATTCAGAGATTGACCAGAATGTAGAAAATGTAGTCAATTCAGCACGACGGAAGTTGCTTGATCAGTCTAGTAACCTTGCAGCTGCACCTTTCAGTGGTGGGCCTACTATACAGATCAGTTATATTCCAATTACCCAGAGCAGTGGAGCTTTTCCAGCCTTCCCAGACACCAATAAGCAACAGAATCAGTCACCTGGACAATTGCCTTCAACTTCTAATTTGACACCTACGAATCAAACAAGTCAACCAAATTCAGCTAATGTTGCTTCTGGAAAATTATGGGAGTATATTATTATAATAGCAGGTGTAGCTGTCTTGGTCATTATTGTTTTGATCATGCTTTGCATTTGGCGAAAACGAGCAGCAAGAGTAATAAAGCCATGGAAAACAGGAATAAGTGGACAGCTGCAGAAAGCATTTATAACAGGGGTCCCCAAGTTGAATCAGGCAGAGCTGGAGACAGCCTGTGAAGATTTCAGCAATATTATTAATACTTTTGATGAATGCACCATATATAAGGGAACACTATCCAGTGGAGTCGAGATTGCTGTTGATTCAACTATTGTTACTTCGGCCCGTGATTGGTCAAAGACAATGGAGACGGCCTATCGCAAAAAGATTGCCACATTATCCCGTGTTAACCATAAGAACTTTACCAATCTTATTGGGTACTGTGATGAAGAAGAACCATTCACCAGGATGATGGTATTTGAGTATGCTCCGAATGGAAGCTTATTTGAGCATCTGCATGTTAAGGAAGTTGAACCTCTTGACTGGAGCGCAAGAATGAGGGTTATTATGGGCACATCATATTGTCTTCAGTATATGCACCATGATCTGAATCCACCAGTAGCTCATTCCAACCTCAATTCCGTTGCTATATTGTTGACAGATGACTTTGCTGCTAAGATATCAGAAATAGCTTTTGGCAAGAATGTGTCATCACAAGCCAACACACCTGGACATGAGTCACAGAAATGTGACTTGCCACCCCATGCTGATCCTGAAACCGATGTCTACAACTTTGGAGTGTTGTTGCTTGAAATCATTTCCGGAAAACTACCATACTCTGAAGAACATGGCCACATTACTGACTGGGCTGCTGAGCACTTGAATAATAAGCAAAGCGTCAGCAATCTGATTGATCCCTCGTTGGAATCCTTCAAAGAAGAAGAACTTGATGTCATCTGTGAGGTGATCAAAGAATGTCTTCAATCTGATGCAAGGCTAAGACCAACGATGAAGGACATAGCTCCCAGATTGAGGGAAGTGCTGCATGTATCACCTGAGCAAGCTGTCCCTAGACTCTCTCCCCTCTGGTGGGCTGAACTGGAGATCTTATCATTGGAGACCTCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_03703::LG1:50270479-50272479(+)
TCTTTTGTGTGGTGATCGTTCGGTCACCTCCTCTCTTTTGTTTTATGTGATCGTTCGGTATTTGGCCTTTGTAAACCGTTCGGTAGTGTTTCCTCTCATCTGGTATAGGTTAAGTTTGTAGCTTATGAAAGGCCGTTCGACCGTAAGCGTTCGTTGTTTTGTGTAAGACTGAACTGAGATATTATCAAATGTAATTATTTCTATTATATGGTTATTAGTGTATTTTTGGGATGTTACACTATGTAATGAATTAACCATTTGATATATATTTTGTTTTTCAGTATAAAAACATTATTATATTAAAATTTAATGAGATGTGTGTGTAATATAAAAATTAATGATGATGCAATATTTTAAAAAAGATAGACATTTGAATAGAATTTTGGAAGAAAAAAAATTGAGGTTTAAGTCTTATTTGAAAAATTATCATTTACTCTGTTTTATATTTTCAATCTAGAATGATAAAATATTTGAAAAGAATGTGTTGCCAGTTTTATTTCTTTTTATTTCATTAGATCACTTTCCAAAATTTTCTTCTTATTTTCGTTCTTATTATCCACTCCAATGCAAAATGGGATGCACGTTCACAGATTTCTTAGGAAAAACATATGACTTTGTCTTCTCATATTATACATATTAATAGCATTACAACGAATCATTTGACAGCAAAAAAAGAAACTAATCAGAACATCATACAGAAAGATTGTATAAACTTCTTCCTCCTTTTATGGCAACAAAATAACATTCCGCAACCCTCTCACATTCTCAAGAAATACTATAACTTCTACATCCATAACAGTTTATTTAATGGTTTTTATGATTATCTATAATGACAGGTTTAATTAATCATATAAAATGTATAAATAAATACAACAAATCTAATTAATTATATAAAATGGTTTTTATGAATTAATAAATTAGACACTTATATATTTTACCTTTAAGATATGACATTACTCTTAAAAAATGTTCATCTTTTTCAGGGCAAAGTATATTCGTTTGTAGAGCTTAATAAAGAGAGTTTTTGGCAGTTTTTGTGTAAAATGCTGAAGGAAAAAAGATCCATGTAAGATCCTTGTCGTGTTTCTCTAACTCACGCTAAAGATTCCAACACCTTCACTTCACTGTCATTGGAAAGAACATGGGGTGGTAATTAGTTAAGACTTCGAAATATTTTATGTTTCAAAATATTTATTATTAATTTAAATTGTCATTTGATATATAACTTTGTTGAAATGATTTATTATTTGCTATTATTTTTATTTTTACGAACATGTCTCAAAATATGTACACAAGTATACTAGTATCATTTGTTTTAAAAAGGTATGAAAATAGTCTATGTCTATTTTAAATGTTTCCTCTCCATCTAAAACAAAATTGTTAAATTAGTATAAACTTAAGTTTTATAAATAAATATATAATCAAATAAAAAAATAAATTTAAAAACATGTTAGCAATAAGATTACACGGTTAACTAAAGTTTCTTTTCGTATTTATTATTTTATATACATAGCACATTAACTATTTTTCTTATTGAGAATATTTTTCTTATTGAAGTTTGGACACATCCTCAAAAGGAATAAATAGCATGAGCAAAATGCAACCAATAGCAAGACATTTATGATTCAGAAATGTTGGTTAGAGGTCAATTTTGCATAGTCAGACACCAATATTATGTTTGTTGATTCGTCTCTGCTACAGATCGTGACAAGCAATTCCTAATATGTTTTTATTTTGTTCATGACAGTATCTATTTTTTAATAATTGAAGAATAGATTGCACATATTAAGAAGACAATCTATTCCAAGAAATTTTTTGATGATATATAGTAAAAATATAAACTTTTTTAACAGAAAATGGAAAACAGATACATATTTATCATTAATAGTGAACCGGCAGAAACAAAAAGCGCGTGCGAGTAATTCGGAAGAGGTGGCCAATGGGACCTACAGCGAATTTTAGGAAAAAGGAAAATATGAGAGGGGGGAATTGTGTGTGTG


Gene Sequence:
>Vu_03703(+)
GGGTGGTGGGGGGTGATGAGAGAGAAACTGAGACAAGAGACAAAACAACCTTAACATTGTAAGAGGATGAAGGTGGTCGGAGAGAGGGTCATCTGAGACTCCTCTCTAAGGGAGCAATTGAGCCAAACATTCAATATTCCATATATCAAATCGTTGAATCTTTTGCTTCCTTTATCTGATTCCCTGTCTCAGTTTACCCCCCCACCTATCACCACCAACTTGCGTTAGATTTCATCATCAATCATTCTTGATCGTTCTCTTACATCCAACAAAGGGCATCTTTTCCTACACCCTTTTCTCCCATTTGCATGGTAATTCAATGCCCTTTTAACCCTTTTTTTTTCTTAGCATTGGTGCGATGGCACACACCCACAAAGTTTGCTTGCTGATGGGGTTATTCCTTGTTTCTTCTTTCTTATGGTTTTGATTGTCTGTCAACGTTGTCATTTTTCATTGATTCTTTTATTGTTGGAATAAAAACTTCTTTTTTTTGTTTCCTTGGATGTAATTTCTTACAGCCCCAGCCCCCATTGGTGGGAGATCATTTGGGAGGAAGATCGTGAGCCGGGTATGCCGTTGTTGAGCAAAAGGTTGTAAGGAAAAGATTGAATAGAAAATGAGAGACCCTCAAATGATCTTTGGACCCAAGAGCTTTTGATTGTAATATACAAGTTTTGTCTAGTTAGTGAAATTTCCTCAGCTTCATCCACATAGGTGGAAGGGTTTCTATGTACAGAAAAAACCTTCCTATTTTGTACATATGATATGTACTGCTCATAACGACATATAGGTCTTGTCTCTACCAAAGCGACATTGCCTTCATATATCAATGGAAAGCATATGGGGCCCATATGGATTGTGGCTCAGAATTTATGTTGGATTGATTTCTCTATGGGGAACTCAACATTGTTTGTCTCTAAACGATGAAGGTGATTTTCATGGATTGTCCTTTTAGTTTCCCTAATTTGCAGAGAATCGTTTAATGCATTCCTTGTATCTTGGTGTTTGATTTTTGTTGTTGCATTTGGAATGGATATACAGGATTATCCTTGTTGGAATTTCGGGGAAGAATAACTTGTGATCCTTTTCATGCTCTGTCAAATTGGAACCCAAATGATTGTAATCCTTGCCAGTGGTATGGTGTTCGTTGTGTAGGTGGTAAAGTGCGAATGCTGTAAGTTCCTTTTGATTTCCTCTTTCTAATCTTCCATTGAGACTGTATTATTTTTACTTTTTTTTTTTGCCAAGGCAAACTATAATGCATATAATGATATAACTGTTCTTGACGCCTAAAGAAAACAACCATTTTGATTGACGTGAGTGCAGAATTTTTATGCTTATATGCTTTTGCACGTTCCAATGTTTCTTGTAGGGTCCTACCTGAACTATATTTGGAAGGCACATTGGCTCCTGAGCTTGGGAAACTTAGTCATCTAAAATCCCTGTAAGGGTTCTTGCCATGTTACCATTATGTCAAAAGTAAAACACGTTATGCTGGTAAAAGCGCTGATTGAACTTTATCTTATAATAATTTAACTTAATCCAAGAGCTCAATATTTGTCATATGGAGGTCATTCTTAAATTTCAGGATGTGCTTGAAGAATGAAATGGTGATACTTGTTTTGTATGTTGTTATTGTCTGGAATGCATCCAATAATTCAAGAGACTGGTAGCAATAAATGTTCTGTCTCTCTGTGTATGATTTTTATCACTCCTCTATTTTCTTCTATCTTCTATGCAATGCTAGTTTTGTAAGCTTGCCTGCAATATAGCAGTTCGCTTCCCATAAAAAACTCTGAAAGTGGCTATATTCTCTAGTATTTTCAGTTAATTTCCTCTCAGCTGCATTATAAGGCCATGTTAGCGTCCATCATGATTCTTTGCCTTTGTTGGACAGATTATGATGAGCCCTTCTGTACAATTATTATAGCTCTTGTTGTGTTGTAACTTAATTTTATGTTGTTTTTTAATGAAAGACTAAATTATGGGCCATTTCTCCAAAAGTTTAAAAATCCAACAGCTCATTTTACTTAATATTGTTATTTATATTAATATATATTTCTAATTCAGATAAACCGTTATTTCTTTGAAATAGTATATTATACAAGAACAGTTTTTCTGGTACTATTCCCGAAGAACTTGGTGATCTAGACAAGCTGGAGTTATTGGATTTAAGGGGGAATAACATGACTGGATGTGTCCCAGCAGAAATTGGCCATTTGTTGTTGTCAGAACAATTGTAAGTTAACTCTATTTTTTTTTCTATTTGGTTACATTTGTGGGTTACCTACAATGAATTTATTTTTTCCCTAGGTTCATTTGTGACAAGAAATGTGAAAGCAGTGATTCTCAAGGGATTGGAAAGCTCAGATTGCCCTGTAGTATCAATCTTTCAACTCGTTTGACAACTTCATCACTTGGAAAGAACCGAAAGGTTGCACCCAGGTAAAGAGAAAGTGACAATGTATATTCTTTCTTGAATGGAGGTCTATGTTGGTAAAGACAAACTGAAATGTGTTTTTTTTTTTCATTTTTTTAATTTGTTATTTTAACTCTTGAAAAACCAGTTTTTCACTTTGTTTTTGGTTACACGTTGATAGCAGGAGTCACACTCTCTTTAATTATGATTGGCTCTTGTGAAATTACATGTGCTGCAAAGATTAAAATTCATCTAACTAACAATAAAAGCAACCTGTTTATCATTTGTCATTTGATATCCTAATGGTTGGTGAAAAGCAAGCTGTTAATCATTTTGTTGTCTATTGGAAATTCTTGGTGTACTTTAGCGTATAAACTCGAGAGACTTGCAGAATTGCATGTGTTCAGTGTTTTTATTTTATTTGATTTTCTTAAATTTGATCACCATAGTTATCGTATTGTTATATGAGTAACTGAAATTTTAATGTTGTATGGCTCTGTTTTATGCTGGTAAGATTAGATGTTGCAGTATCAAACTGACAGTACCATCCTATGGGATTGTATTCCTAATTTGCTTCATCCTTTATGGTTCACAAGAAGGGATGAGTTTCTTATTTTTTTTACCTTTCGATGCATATCTGAAAAGTATACAACAACATGGCGTGAAAATTTTATGGCACAGAAATTATAAGCAATGGAATGGGGCAGATTCATCTTTTATTCCACTTAAAGGAGCACTAAAAAAATACGCCAATGCTGTCCTTGCTATGGCACTTCCACTGTGTGTTGATAACTTTCTACCATCTCAATCTGAAGATTTACTTATATTTTGTTCTTGCATCATGTTTACCTTACTAAAATAGTCTGCTGTTATTTGAAGGCTCAAGCTAGTAAAGGCCACCCCTCATGCCCATGCAGAGAAATGGTGTGGCATTCTGACTGGTGAGTGGAGAACCTTGATTGATTTATGGCCTGTGAGAAATTGATATCTATGCTTTTAACTGACTTTCAAGACATACCTTCCGTAATGTAGGCTCTGATGATTCAGAGATTGACCAGAATGTAGAAAATGTAGTCAATTCAGCACGACGGAAGTTGCTTGATCAGTCTAGTAACCTTGCAGCTGCACCTTTCAGTGGTGGGCCTACTATACAGATCAGTTATATTCCAATTACCCAGAGCAGTGGAGCTTTTCCAGCCTTCCCAGACACCAATAAGCAACAGAATCAGTCACCTGGACAATTGCCTTCAACTTCTAATTTGACACCTACGAATCAAACAAGTCAACCAAATTCAGCTAATGTTGCTTCTGGAAAATTATGGGAGTATATTATTATAATAGCAGGTGTAGCTGTCTTGGTCATTATTGTTTTGATCATGCTTTGCATTTGGCGAAAACGAGCAGCAAGAGTAATAAAGCCATGGAAAACAGGAATAAGTGGACAGCTGCAGAAAGCATTTATAACAGGTATTATTTTTAGTAAATATGAGGCTGTGTTTGTAAACCCAATTTATCTTGGTTTCAATTCATTCTTTAAACCTGTTCAAGGGAAGCTAGGGCATGTTTAATTTTTTGAGCACAACTTAGAACAGCATTATTATTAGTGTTCACCAAAGAATTTCAGATACCTTAAAGAACTTGACGGTAATAAATTATTGATTTGAAAATGAAGTTTTAACTTGGCTAATGGCAGCTTGCCAAATTTTAAACGCCTCATACTTCCCTCATATATGTTCTTTAGTATGTAATAATGCGATTGATTATTTTCATTTCTTTATGGAAGTTACAATAGGTCCATAACCATTTTTTATTAAATGTTTGGAGACTCTCCTGTTCAACTTGTTCAACCATCATCATCTTTCTAATTTGAATAGCAACAATTTTATGAAATCTTTTGTTAGTTTATGGTCAGCCAATTGCAAGAAAATGGACTCTATCTTTTTGTTATGCAATATATATACCATCTGAAGTGTCAAACTGTGAATCGGTTATGTCTAATCTCTTCCGTAAGTTATTAGCTCAATTCAAAATTCCTGCTAAGTGTTATCTGGGCTTAGATTTATTACCAGGGTTAGGGACTCTGGAAGAGGTTATAGCCAACAAAATGGTAAAAAGTTCCCAATGTGCTCCGTAGATAAAAAAAAAAATAGAAGTTAATGTTAACATATGTTGACTGTGTTTTGTACTTGTATGTAATGTAGGGGTCCCCAAGTTGAATCAGGCAGAGCTGGAGACAGCCTGTGAAGATTTCAGCAATATTATTAATACTTTTGATGAATGCACCATATATAAGGGAACACTATCCAGTGGAGTCGAGATTGCTGTTGATTCAACTATTGTTACTTCGGCCCGTGATTGGTCAAAGACAATGGAGACGGCCTATCGCAAAAAGGTTTTCTCTTTCCCTAGTCAATGGAGAGGAAAAAGTTGATTTGGGTGTCCCAACCCAATTGAGTGACTGTCAATTCTTAATTACCTGTTGCTAATTTTGTCCCTTGTTCTTCAGATTGCCACATTATCCCGTGTTAACCATAAGAACTTTACCAATCTTATTGGGTACTGTGATGAAGAAGAACCATTC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