Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_03633	LG1	49509692	49520286	hypothetical protein	Map

Annotations

category	relationship type	keyword
Biological Process	involved in	cytoskeleton organization, protein phosphorylation, protein phosphorylation, supramolecular fiber organization, protein phosphorylation
Cellular Component	is active in	plasma membrane
Cellular Component	located in	plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane
Molecular Function	enables	protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding

SNP	Position	Effect
A/G	49516827	intron_variant
A/T	49516909	intron_variant
A/T	49517610	intron_variant
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A/T	49517731	intron_variant
A/T	49518035	intron_variant
G/A	49518052	intron_variant
T/A	49518201	intron_variant
A/G	49519077	intron_variant
A/T	49519095	intron_variant
A/T	49519439	intron_variant

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
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CDS Sequence:
>Vu_03633.1

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Promoter Sequence:
>Vu_03633::LG1:49520286-49522286(-)

GACAGTAGGAACAGTCTCTTCTCTGTAATTTCGTCCTGTTCATCTTAATAAAAAGAAAGAAATGAATAAAAAGGAAAATAAAGGAACCCTGTCTTGTTACTACTCCGTTAGTAAGACAAGTTTTCCTCAGCTTTGTAATGTATTTCTTTTTCTATCAATCTCATTAAGAGAAGTATGTGATGGTGTGTTTTTAATACCAGAGTTTAATAGTGTAATTCATTTTACAGAGAAGTAAAAATATTTTATGGTAAAATATGTTCTTGGAGCAAGAAATTTGAAGAAAGATTAAAATTCTAAAATTGGATGAGGACAATTTCATTACTTTAAAATTAGAGAATTCCTAAAGGTGAGAACTTGAAATTCGTATCCACCATTAAAGCACACCAAGTCTGGGTTAAATGGAACTTGCTCCTTGAGTTCAATAACAACTTGGTAAGAGTTTTGAATAGTTTCTATCTTGTACTTGGTTAAGACTCTGATTCCTTTGAATTAAATGAATATTTTGTTATTTTATGTTTATGCAACCGTATTCCTAAATCTTGGATCTCTAAAGTGATAGGGTTCATCAACCTCAAAACCTTGGTGTTTTTATTACAACAACCGTCTAAATTGATCATCAAGACAAACCTGAATCTTCTTGATGTTTTTCTTTCTCTTTCGATAGAGGATTCATTAGAAAGTGACAATATAAATGAGATATTGTAAAAATATCAAGATAAGAGAGCTCGGCCAGCCTGGTAGGAACTCGGTTTTCTTTGAAGGAGCTCGGCCAGTCAGGTAGACAACACCAACCTCACGAACCTGTGTGCTGCGCTTGAAGACGGTGCAACGAACTCACGAAACTTTTCGAATCAAGACAAAAAGAAGATGACGGCGGAAGATTTGATCATCCACAAGAAGTGTTTACTCCAATCCCAAGATATCCACAAGAAATAACACTAAAACCCAAGAAAAGACCACGTCAGAGACCAAGCTCTGATTCCATGTCAAAATATCAAGATAAGAGAGAGCGTACGAGAGATTTATTTTCTTAGAATTGTTTGTTTTTATTCTGCAGCGCTCTTATCTTAAACAGGCAACATAGAATATTTTTACATTAATATTGGAGAATGTAAGAGATATGCAATAAAGATATTTACAGAGTAAATATGAATAAAGTCTAACAGCACTATATTAAAGGTAGAAAATAATAATCTAATAAAACCATAATCAAATACATGAACAGATAAGTCCAACTTACATAAAAAATTAACATCATTCTCAAGTCAAAACTTTAAAGTAATGAATCTATGAATCTTCTTTTTTATATAGTTCAATTTTCTCATCTTTACCTAATATAGAATTTAGATTTACACTTGGAGTTCAAACATGCATACACACACAGAGTAAGAAGCAATGGTGATATAAATAAAAAGTTAACGTTCAAAGATATAATGAGTAACTAAACTTTTCACAGAAATAATTCATTCAATAAATCAGTTTTGATGGTTTTAATCCTGGGATTGCTTGTTCTTGTTAAAGATATCCTTTTTCCTATTTACCTTTTCAGCTCCAGCAACCAACTAGTTGATATGAATATGATACCATGACAATTCTAAACGATATCACTTTCTCTATAAGAATTTATAGTAAGATTTACCTTTTGGAGTATGAATATCTCTCTTCTCTCTTTAAAAGTTTCTTAGATTTTGCTATTAAACTTTTAAACCAATAATTTCTTGCGTACAATTGTCAATGACATTATGTGCAGTTCAAACATGTAAACCTCTTTGATTTGAAGACTTTGCCGCTTTTTCTAGTTGGTATCAGTTAGACAGTGAATCTCTGGTGTCAGTTCACCTGATTATATATATGGAGATACCTAAGGTCTAGCTTTATTGAACTCCTAGTTCAAACATTGATTGATGTTGTTTCCTTTTCTTCCATGCATTTTGATTTGTTATGTTATAGTGACTGTCAAAAAAATTACAGTTGATGCTCTTAAGGAAATCACTAGCACG

Gene Sequence:

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