Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03577 LG1 48899565 48903379 PREDICTED: disease resistance protein At4g27190-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 48899578 5_prime_UTR_variant
A/G 48899604 5_prime_UTR_variant
G/A 48899648 5_prime_UTR_variant
G/A,* 48899654 5_prime_UTR_variant
G/C 48899682 5_prime_UTR_variant
A/T 48899692 5_prime_UTR_variant
G/A 48899754 splice_region_variant
A/G 48899768 downstream_gene_variant
G/T 48899769 downstream_gene_variant
C/A 48899785 downstream_gene_variant
A/T 48899786 downstream_gene_variant
T/C 48899802 downstream_gene_variant
A/G 48899813 downstream_gene_variant
C/G 48900078 downstream_gene_variant
T/G 48900090 downstream_gene_variant
G/C 48900114 downstream_gene_variant
T/C 48900138 5_prime_UTR_variant
C/T 48900340 synonymous_variant p.Ser65Ser
C/T 48900341 missense_variant p.His66Tyr
G/C 48900679 synonymous_variant p.Val178Val
G/C 48900683 missense_variant p.Gly180Arg
A/T 48900689 stop_gained p.Lys182*
A/T 48900690 missense_variant p.Lys182Ile
C/T 48900708 missense_variant p.Thr188Ile
G/T 48900928 missense_variant p.Glu261Asp
G/T 48900985 missense_variant p.Lys280Asn
T/C 48901015 synonymous_variant p.Val290Val
C/T 48901660 synonymous_variant p.Asn505Asn
G/A 48901885 synonymous_variant p.Leu580Leu
G/A 48901889 missense_variant p.Gly582Ser
G/T 48902237 stop_gained p.Gly698*
C/T 48902397 missense_variant p.Pro751Leu
T/C 48902512 synonymous_variant p.Leu789Leu
C/G 48902591 missense_variant p.Gln816Glu
A/T 48902843 missense_variant p.Arg900Trp
A/T 48902951 missense_variant p.Ile936Leu
A/G 48902953 missense_variant p.Ile936Met
A/C 48902955 missense_variant p.His937Pro
C/T 48903132 3_prime_UTR_variant
A/G 48903146 3_prime_UTR_variant
T/A 48903219 3_prime_UTR_variant
A/T 48903349 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03577.1
MSELELVGPLVGEMGSIGVGEMHTTIASKIAFSKNLDDNCNILVKDTEMLHAIKKDKEMKAQRNSHKDTTNAYKLWTNRVSEATKEVQKLKLKYEEETLPWWRILKRSDLSEEMEKKSNCVRQLMNDECLKDFLVDKPPEPVLKELNVPQISGYPTLQGALDNTLVLLKNNKIKIIGVCGTKGVGKTTIMRNLNNNEEIAKLFEIVIFVKVTPNDRKLQEKIAHRLMLDKGINKEDSDDIARRIHRELEKKRYLLILDEVEDAINLELLGIPSDNNNGSKVVIVTRFPLVYKLNRVQRVIKVAELSPDEAWKMFRDTVYAFNPKIDSPDIQPTAKLVCKRCSRLPLLIYNIANSFKLKESASSWWAGLEDLKPWPELQSQGLEELYSCLKFCYDELNDKRKQKCFLYTSLYPADSKVYSDYLVECWAAQGLLGDINDTRSYQSARNCGIDILEHLANVSLLEKGGAMIYVNMNHCMRQLALHISSKDPECSFYLQDGEESENLSNSRAWQQARWVSMRKVHELRRSQDCSTILTLLLRKNPELTALPECFFENMSSLLLLDLYSSMITQLPSSLSKLTGLRGLFLNRCELLESLSSEIGLLQFLEVLDIRDTKVIFIPLQIGFLTKLRCLRIPFIASEDNEAQNVHVISKLHRLEELTIQIISYEQWCNDANNVLAHVASLENVTHLRCCFPSSIILGEFLSRSKSWHNKQNSFRFTVGCQNSRRPQILEFFEYKITNYLRYCNGGQRDDPAIIEVLPKTDAFELVCHKDIRKLSNFAGIACLERIRGLLIKRCNQVLTIVSGETSSNVMNGIQIQTAVILPNLEQLYLENLLNLKCAFRGPLHSGTFSRLQTLSLKNCPRLSQIFSNGAIQHFSELQKLKLEDCSIIEELIGEDIERERDVLPKLEILLLVNLPNFKSICTTHTLAWSSLELLRIHNCHKFKTLPLDSVNAVNLKSIKGQQEWWANLDWTNNEEVLQRLQPIFVASNEYFS*


CDS Sequence:
>Vu_03577.1
ATGTCTGAGCTTGAACTTGTTGGCCCTCTTGTTGGAGAGATGGGATCGATTGGGGTTGGAGAAATGCATACTACAATTGCATCTAAAATTGCATTTTCCAAAAATCTGGATGACAATTGCAACATTTTGGTTAAAGATACAGAGATGCTACATGCAATAAAGAAGGATAAAGAGATGAAAGCTCAAAGAAACAGCCATAAAGATACTACCAATGCTTACAAACTGTGGACAAACAGGGTATCAGAGGCCACAAAAGAAGTACAGAAGCTGAAGCTTAAATATGAAGAAGAGACCCTACCCTGGTGGCGGATTCTAAAGCGTTCCGATCTGAGTGAAGAAATGGAGAAGAAGAGCAATTGTGTTCGTCAACTTATGAATGATGAATGTTTAAAAGATTTTCTTGTTGATAAACCACCAGAGCCTGTTTTAAAGGAGTTAAATGTTCCACAGATAAGTGGATATCCAACCCTTCAAGGCGCTTTGGATAATACTCTGGTTTTGCTGAAAAATAATAAGATCAAGATCATTGGAGTGTGTGGAACAAAAGGGGTGGGGAAAACAACAATAATGCGGAATCTAAACAACAATGAAGAGATAGCTAAACTGTTTGAAATTGTCATCTTTGTAAAAGTCACACCTAATGATCGTAAGCTTCAAGAGAAAATTGCTCATCGGTTGATGTTGGACAAAGGGATCAACAAGGAGGATAGCGACGATATTGCAAGAAGAATACACAGAGAGCTAGAGAAGAAAAGATATTTATTAATTTTGGATGAGGTTGAGGATGCCATCAATTTGGAGCTGTTAGGAATCCCAAGTGATAATAACAATGGCAGTAAGGTGGTAATTGTCACTCGATTCCCTCTTGTTTATAAGTTGAATAGGGTGCAGAGGGTCATCAAAGTCGCGGAGCTATCTCCCGATGAAGCATGGAAGATGTTTAGAGATACTGTCTATGCCTTCAATCCTAAGATTGATTCCCCTGACATTCAACCAACTGCAAAACTTGTATGCAAAAGATGCTCTCGTCTTCCACTTCTCATTTACAATATAGCAAACTCTTTTAAATTGAAAGAGTCTGCTTCTAGTTGGTGGGCAGGACTTGAAGATCTTAAACCATGGCCAGAACTTCAAAGCCAAGGTTTAGAAGAGTTGTACTCGTGTCTGAAGTTCTGTTATGATGAACTAAATGATAAAAGGAAGCAGAAATGCTTTCTATACACTTCACTGTATCCTGCAGATAGCAAGGTTTACTCTGATTATTTAGTGGAGTGTTGGGCAGCACAAGGTTTACTTGGTGATATAAATGATACAAGGTCATATCAAAGTGCACGCAATTGTGGTATTGACATATTAGAACATCTTGCTAATGTCTCTCTACTAGAGAAAGGGGGAGCAATGATATATGTTAACATGAACCATTGCATGAGACAACTTGCATTGCACATATCCTCTAAAGATCCTGAGTGTAGCTTTTATCTCCAAGACGGTGAAGAATCTGAAAATCTCTCAAACTCAAGAGCTTGGCAGCAGGCTAGGTGGGTCTCTATGAGAAAAGTACATGAGTTACGAAGAAGTCAAGATTGCAGCACGATTTTGACTCTGTTGCTGAGAAAAAATCCCGAGCTAACTGCACTACCAGAGTGTTTTTTTGAGAACATGAGCAGTCTACTTCTGCTAGACTTGTATAGTAGCATGATTACACAACTGCCATCATCTCTATCAAAATTGACTGGTCTGCGGGGTTTATTCTTGAACAGGTGTGAGCTATTGGAATCACTATCATCTGAAATAGGATTACTTCAATTTCTAGAAGTCCTTGACATACGTGATACTAAAGTAATTTTCATACCTCTACAAATTGGATTCTTGACTAAGCTAAGATGCCTGCGAATCCCATTCATTGCAAGTGAAGATAATGAAGCTCAAAATGTTCATGTGATTTCAAAGCTTCATAGGTTGGAAGAATTAACTATTCAAATCATATCCTATGAACAGTGGTGCAATGATGCTAATAATGTGCTGGCACATGTGGCTTCTTTGGAAAATGTAACTCATCTCAGATGTTGTTTTCCCTCCTCAATCATTCTTGGAGAATTTCTTTCAAGAAGCAAATCATGGCATAACAAGCAGAATTCATTTAGATTCACTGTAGGATGCCAGAACTCAAGGCGACCTCAAATACTTGAATTCTTTGAATATAAAATTACTAATTATTTGAGGTACTGCAATGGTGGACAGAGGGATGACCCGGCAATTATTGAGGTACTACCAAAAACTGATGCATTTGAATTAGTCTGCCATAAAGATATAAGAAAATTGTCCAATTTTGCTGGCATAGCTTGTCTGGAACGCATTCGTGGTCTTTTGATTAAAAGATGCAACCAAGTTTTGACAATTGTGTCAGGTGAAACAAGTAGCAATGTCATGAACGGAATCCAAATACAAACGGCAGTCATCTTACCAAATTTGGAGCAACTTTATTTGGAAAATTTGCTCAATTTAAAATGTGCTTTTAGAGGCCCCCTGCACAGTGGAACATTTTCCAGATTACAAACTCTGTCATTGAAAAATTGTCCAAGACTGAGTCAAATTTTCAGCAATGGAGCAATTCAACATTTTTCAGAACTTCAGAAGCTGAAACTTGAAGATTGTTCAATAATTGAAGAACTTATTGGAGAAGACATTGAAAGAGAAAGGGACGTGCTTCCAAAACTGGAAATACTTCTGCTAGTTAACTTGCCTAACTTCAAAAGTATATGCACAACTCATACATTGGCCTGGTCCTCTTTGGAGCTGTTAAGGATACATAACTGTCATAAGTTTAAAACTTTACCACTAGATAGTGTCAATGCAGTCAACTTAAAGTCCATTAAAGGACAGCAAGAATGGTGGGCTAACTTGGATTGGACAAACAATGAAGAGGTTCTTCAGCGATTGCAACCCATATTTGTTGCTTCCAATGAGTATTTTTCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_03577::LG1:48897565-48899565(+)
ATCATCTATATGAGTCTCTCTGCTAATCAGTAATTTTATGTCCAAATTGTTCTTATGGTGTTTCTATGTGTAGACAGAGCATCTGTCAATTAGGAGGAGCTTCGTCGGTTAAGGTCTTGTGAGTAGTTGAGTAAGGTAAGGGGAAACTAGTTGTTTTTTGTGTGCATGAGTTTGATAAATTTAATGATCTTCATGTTGTTGCTCTAATGCAATTGAGGATGAAATTTGATTATTTTTTATGAATTTGGCATGTTTTGAATGATTGTTGTGTTTTTGTGTGTTTTGGTTGATTTTTTGTTAATTGAGGGAATTATAATCTAAGAAATTGAGTAAATTGGTAAGTGTCCTAATATTAATTTTTTTTACCAAAGTACTAAGAAAGGAATACCAAATTAATCAATTGAATATGTCCATTTCCCCTAAATCACATAATTTCATCTAATGGTATATGGTATAGTAGTGAGCGATGACAAACTAGGAGCATTTTAACTCAAAGTCGTTAAGTACAAGTTTGTACCGTCGAACGTCATATTTTGTGAATGTCTTGACACTGAGCGGCAGTAGGACACTGTTGAACGCAACTTTTGTAAGAAGGATGGTACTGAACGTAGAACTATCGTTGAGCGCCACTTTTTGCAAAAGGTTTGACTCTAAGCACTACTTTTGAGTGCCAATTTGTATGTTGCATCTTCTTTTCTTCTTTGGTGGTATGAAATAGATTGTAATGGAATTAATGTATGCTTATAATATTGTTTATTATTATTTGTAGTGATGATTATGGTTGTAAACAAGTATAATGATGGTGTTGAGAGAATTTCAAGGAGAATTTTTTTGTGGTGACGATCTTAATGTATGCATTGACATTTAAGAGATCAATAAGGAAATATCCTATATTCTACCAACTATTCAAGTCATATAAAGAAAAATGGCGGGAAGGAAAAGAATGGCAGTAGATTTTAGCCACTGGACTATTTTATATTTTAGTCCTAGGTGCGAATGAGATTAACCTTGTGAGGGATAGGGTGATAACTTCTATATTTATGACTCTGCAAAATATACATATTATTACGAGTGCACGCTTCAGATGAAGCCCAATGTCAAACGTATGTATCGAGATAATTGAGTTTATTGTCAACTATTGGTGTGTATCTATATGATTTATTGTATTTAATTCATGTTTAACTTGTATTTAATATGATTTAATTATTTTAAGATAATTCTTTTGCACACTAGCTTACCCTATCATCTTTTTTGTATTTTCTTGTGTTTATTTGTCTCACTTCATGATGTGAACAGATGAGAAGTAGATAGTAATACGCCTTTGGTGGAAGGCGACTATGACATAGTAGTTTTTTTCAATTTATAGTGATGATTTTGTATAGAAGTTTTATTAAACTTTAAATCATCTTTATTTGTTTTATAAACATTTTATTTTTGTTGTTATTTACTTTTAGAGATAATTTTATTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAACACAATCTATTTTGTTTTACCAGTAATCTTATAATATCTTGTTTTATTTGTAAGTTGCTAAAAATGGATGTTTCAGATAACATCACCCCTATAAATTTTAAAATATAGATATTCTTAGTTTAATTTTTTTTCTAAAGATTGAAAATTTTCATTGTATAATGTTTGATTTAGCAAAATACAAACAAATCTTCTATATACAATATTCTATAAAAGACTAATTTTAAAAATATCGTAGCAGAAAATATTTTCTTTGTCATTTTGTTACTCCTTATTTAGAAGACGTACCTTTGTAATACTTTCTTTATTTAATTATTTAAGGATTTCTAATAAAATATGAATGCTCTAACTTTCTATAGGCATGTATTATAAATAAAAGTTACATAAAGTAATAGATTTTTTTTTAAAAAAAAGTAAGGTACTAATATTTTTATAAAAAAAGAAGAAAAATAATCTTACAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_03577(+)
AAGGCATGAATATCGTAGACTTCATGCGTTGACTCAAAAAAAACTCAGAGAGCAATTACTAAACACCTTGGATTCGTCATTTTGAAAAAGTCAGAACAATCTATGCACAAGCTGCTGGCAGAAGTAGACACCATGAATCTTTTTTCTTAACTGTCGGCATGGATTCTAATTCTTAACTGTGTTTGCTCCGGTATGTTTCCCTCAGATAGATCCCAATTCTCATGATCACCCTTGTTCTAGCTAATTTCATTTTGTATACTAGTTTCATTTTAACTGTTGCTAATTCCACACTCACTGGTTTTACCTTATCTAAAAATATATCCGTAAAACCTTTAATATTAACAAAAAAAAAAATATTTGTGTGCTTCTTAATGATTACATGCAATTTAGTAAATGGTGATTAATAAACGGTTCAATATCAGTTTTTACATGTTGAAGCTTTGGAGTGTTTCATATTCATATTGAATAACCTGATGTGTTTGTTTATACTTCAAAATTCTATACTGCTGATGCCTAGGGTTCAAGTTGTGTAGTAGTTTTACACTTTCAGCTTTTCTTTGTTATCTTAGGCTTTCAAAATAATGTCTGAGCTTGAACTTGTTGGCCCTCTTGTTGGAGAGATGGGATCGATTGGGGTTGGAGAAATGCATACTACAATTGCATCTAAAATTGCATTTTCCAAAAATCTGGATGACAATTGCAACATTTTGGTTAAAGATACAGAGATGCTACATGCAATAAAGAAGGATAAAGAGATGAAAGCTCAAAGAAACAGCCATAAAGATACTACCAATGCTTACAAACTGTGGACAAACAGGGTATCAGAGGCCACAAAAGAAGTACAGAAGCTGAAGCTTAAATATGAAGAAGAGACCCTACCCTGGTGGCGGATTCTAAAGCGTTCCGATCTGAGTGAAGAAATGGAGAAGAAGAGCAATTGTGTTCGTCAACTTATGAATGATGAATGTTTAAAAGATTTTCTTGTTGATAAACCACCAGAGCCTGTTTTAAAGGAGTTAAATGTTCCACAGATAAGTGGATATCCAACCCTTCAAGGCGCTTTGGATAATACTCTGGTTTTGCTGAAAAATAATAAGATCAAGATCATTGGAGTGTGTGGAACAAAAGGGGTGGGGAAAACAACAATAATGCGGAATCTAAACAACAATGAAGAGATAGCTAAACTGTTTGAAATTGTCATCTTTGTAAAAGTCACACCTAATGATCGTAAGCTTCAAGAGAAAATTGCTCATCGGTTGATGTTGGACAAAGGGATCAACAAGGAGGATAGCGACGATATTGCAAGAAGAATACACAGAGAGCTAGAGAAGAAAAGATATTTATTAATTTTGGATGAGGTTGAGGATGCCATCAATTTGGAGCTGTTAGGAATCCCAAGTGATAATAACAATGGCAGTAAGGTGGTAATTGTCACTCGATTCCCTCTTGTTTATAAGTTGAATAGGGTGCAGAGGGTCATCAAAGTCGCGGAGCTATCTCCCGATGAAGCATGGAAGATGTTTAGAGATACTGTCTATGCCTTCAATCCTAAGATTGATTCCCCTGACATTCAACCAACTGCAAAACTTGTATGCAAAAGATGCTCTCGTCTTCCACTTCTCATTTACAATATAGCAAACTCTTTTAAATTGAAAGAGTCTGCTTCTAGTTGGTGGGCAGGACTTGAAGATCTTAAACCATGGCCAGAACTTCAAAGCCAAGGTTTAGAAGAGTTGTACTCGTGTCTGAAGTTCTGTTATGATGAACTAAATGATAAAAGGAAGCAGAAATGCTTTCTATACACTTCACTGTATCCTGCAGATAGCAAGGTTTACTCTGATTATTTAGTGGAGTGTTGGGCAGCACAAGGTTTACTTGGTGATATAAATGATACAAGGTCATATCAAAGTGCACGCAATTGTGGTATTGACATATTAGAACATCTTGCTAATGTCTCTCTACTAGAGAAAGGGGGAGCAATGATATATGTTAACATGAACCATTGCATGAGACAACTTGCATTGCACATATCCTCTAAAGATCCTGAGTGTAGCTTTTATCTCCAAGACGGTGAAGAATCTGAAAATCTCTCAAACTCAAGAGCTTGGCAGCAGGCTAGGTGGGTCTCTATGAGAAAAGTACATGAGTTACGAAGAAGTCAAGATTGCAGCACGATTTTGACTCTGTTGCTGAGAAAAAATCCCGAGCTAACTGCACTACCAGAGTGTTTTTTTGAGAACATGAGCAGTCTACTTCTGCTAGACTTGTATAGTAGCATGATTACACAACTGCCATCATCTCTATCAAAATTGACTGGTCTGCGGGGTTTATTCTTGAACAGGTGTGAGCTATTGGAATCACTATCATCTGAAATAGGATTACTTCAATTTCTAGAAGTCCTTGACATACGTGATACTAAAGTAATTTTCATACCTCTACAAATTGGATTCTTGACTAAGCTAAGATGCCTGCGAATCCCATTCATTGCAAGTGAAGATAATGAAGCTCAAAATGTTCATGTGATTTCAAAGCTTCATAGGTTGGAAGAATTAACTATTCAAATCATATCCTATGAACAGTGGTGCAATGATGCTAATAATGTGCTGGCACATGTGGCTTCTTTGGAAAATGTAACTCATCTCAGATGTTGTTTTCCCTCCTCAATCATTCTTGGAGAATTTCTTTCAAGAAGCAAATCATGGCATAACAAGCAGAATTCATTTAGATTCACTGTAGGATGCCAGAACTCAAGGCGACCTCAAATACTTGAATTCTTTGAATATAAAATTACTAATTATTTGAGGTACTGCAATGGTGGACAGAGGGATGACCCGGCAATTATTGAGGTACTACCAAAAACTGATGCATTTGAATTAGTCTGCCATAAAGATATAAGAAAATTGTCCAATTTTGCTGGCATAGCTTGTCTGGAACGCATTCGTGGTCTTTTGATTAAAAGATGCAACCAAGTTTTGACAATTGTGTCAGGTGAAACAAGTAGCAATGTCATGAACGGAATCCAAATACAAACGGCAGTCATCTTACCAAATTTGGAGCAACTTTATTTGGAAAATTTGCTCAATTTAAAATGTGCTTTTAGAGGCCCCCTGCACAGTGGAACATTTTCCAGATTACAAACTCTGTCATTGAAAAATTGTCCAAGACTGAGTCAAATTTTCAGCAATGGAGCAATTCAACATTTTTCAGAACTTCAGAAGCTGAAACTTGAAGATTGTTCAATAATTGAAGAACTTATTGGAGAAGACATTGAAAGAGAAAGGGACGTGCTTCCAAAACTGGAAATACTTCTGCTAGTTAACTTGCCTAACTTCAAAAGTATATGCACAACTCATACATTGGCCTGGTCCTCTTTGGAGCTGTTAAGGATACATAACTGTCATAAGTTTAAAACTTTACCACTAGATAGTGTCAATGCAGTCAACTTAAAGTCCATTAAAGGACAGCAAGAATGGTGGGCTAACTTGGATTGGACAAACAATGAAGAGGTTCTTCAGCGATTGCAACCCATATTTGTTGCTTCCAATGAGTATTTTTCTTAAATATTTTCTTTCATGCTGTTGAGTGTCAAAAATAAGATGTGCTTGCTTGTCCTTCCTTACTTTATCGGAAGAAACTAGAGAGAAAGGCAGCTTGTATTGTATTGTTTTATGGTTTATTGTGTGTTTGTACCTAACAAACTTTTAGACTTGGAACTAAGTCAATTAGAAGGTGCAAGATGTGCTTGGGTTGAAAAAGAACCACTAATGTTTTCTCATTCAAACTTATATTACTTCTTATGCATATTATTTGTCTCT