Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03565 LG1 48747716 48751226 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 48747851 3_prime_UTR_variant
C/A 48747880 3_prime_UTR_variant
C/A 48747951 3_prime_UTR_variant
G/A 48747961 3_prime_UTR_variant
C/T 48748175 missense_variant p.Gly456Glu
G/C 48748732 synonymous_variant p.Gly368Gly
A/C 48748788 intron_variant
C/A 48749137 intron_variant
A/G 48749156 intron_variant
G/T 48749566 intron_variant
G/C 48749760 intron_variant
A/G 48749787 intron_variant
G/T 48749824 intron_variant
C/T 48749835 splice_region_variant&intron_variant
C/G 48749896 synonymous_variant p.Val240Val
G/A 48749917 synonymous_variant p.Asn233Asn
T/A 48749934 splice_region_variant&intron_variant
A/T 48749938 intron_variant
A/T 48750013 intron_variant
G/A 48750036 intron_variant
G/A 48750174 intron_variant
T/A 48750197 intron_variant
C/A 48750457 intron_variant
C/T 48750466 intron_variant
A/T 48750627 missense_variant p.Phe194Leu
G/T 48751186 missense_variant p.Ala8Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03565.1
MCCIALCAVPSQANMFWIGEKESVRCARVLQNIMEGGRKPLKPRLERRNAMKNIDYRLKEDEDTDTETDIDIGSLDERSFRVEGIDGEFDRIFRSLGLSGPEDFAIPAAAWKEAQAQKARSTVNLQHEPPQNKKQREGGIKGVRPPILEPTQVTSTWTSQQPTVSDSVSRDEDSDVGVKAEIEKVSALVGNETFDIQNLSPNATGYFGSWQKGEILGKGSFGTVYEGFTDDGNFFAVKEVSLLDNDSQGKQSIFQLQQEISLLSQFRHDNIVRYLGTDKDNDKLYIFLELVTKGSLASLYQKYRLGDSQVSAYTRQILSGLKYLHDRNVVHRDIKCANILVDANGSVKLADFGLAKATKLNDVKSSKGSPYWMAPEVVNLRNRGYGLAADIWSLGCTVLEMLTRQPPYSHLEGMQAIFRIGSGQPPPVPTSLSTDARDFILKCLQVNPNKRPTAAGLLDHPFVKRPLLSPISPVSPSINLLLS*


CDS Sequence:
>Vu_03565.1
ATGTGTTGTATTGCGTTGTGTGCAGTGCCGTCTCAGGCTAATATGTTTTGGATCGGAGAGAAAGAGTCAGTGCGTTGTGCGCGTGTGCTTCAGAACATTATGGAAGGTGGCCGGAAGCCGTTGAAGCCGCGCCTTGAGCGCCGGAACGCCATGAAGAACATCGATTACCGGTTAAAGGAGGATGAAGACACAGACACCGAAACGGACATAGACATAGGTAGTTTGGATGAAAGGAGTTTCCGAGTGGAAGGAATTGACGGCGAATTCGACCGTATATTTCGGAGCTTGGGCCTGTCCGGGCCCGAGGACTTTGCCATCCCGGCGGCGGCTTGGAAAGAAGCCCAGGCCCAGAAGGCCCGCAGCACAGTGAACCTTCAACACGAACCGCCACAAAATAAAAAGCAGAGAGAGGGGGGAATAAAGGGCGTTAGGCCTCCCATTTTGGAACCGACGCAGGTTACCTCCACTTGGACCTCCCAACAACCAACGGTTTCTGATTCCGTGTCACGTGATGAAGACAGTGATGTTGGTGTTAAAGCTGAAATTGAAAAGGTTTCTGCTTTGGTCGGGAATGAGACCTTTGATATTCAAAACCTGTCGCCGAATGCAACCGGATATTTCGGGTCGTGGCAAAAAGGCGAGATCTTGGGAAAGGGCTCTTTTGGAACTGTATATGAAGGCTTCACGGACGATGGGAACTTTTTTGCCGTAAAGGAGGTGTCTTTATTGGATAACGACAGCCAGGGCAAACAGAGCATTTTCCAGCTTCAGCAGGAAATATCTCTTTTGAGTCAGTTCCGACACGACAACATAGTTCGATATCTTGGCACTGACAAGGACAATGACAAGCTGTATATCTTCCTCGAACTTGTAACAAAAGGATCGTTGGCAAGTCTCTATCAAAAGTATCGATTAGGGGACTCTCAAGTTTCTGCATACACAAGACAGATTTTGAGTGGCTTGAAGTATCTTCATGATCGCAATGTGGTTCACAGGGACATCAAGTGTGCCAATATATTGGTTGATGCAAATGGGTCCGTCAAGCTTGCAGATTTTGGATTGGCGAAGGCAACCAAGCTGAATGATGTTAAATCAAGTAAAGGCTCTCCGTACTGGATGGCCCCTGAGGTTGTTAACTTGAGGAACCGTGGATATGGGTTAGCAGCTGATATATGGAGCTTAGGATGTACAGTATTAGAGATGTTGACACGCCAACCTCCTTATTCTCATTTGGAAGGAATGCAAGCGATATTTCGAATTGGCAGTGGTCAACCCCCACCTGTTCCGACATCTTTGTCAACAGATGCACGAGATTTTATTCTTAAATGCTTACAAGTTAACCCAAACAAACGGCCAACTGCTGCTGGGCTATTAGACCATCCATTTGTAAAGAGACCACTTCTGTCTCCCATAAGTCCTGTTTCTCCAAGTATCAACCTTTTACTGTCCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_03565::LG1:48751226-48753226(-)
ATTATATCATATAAAAGTAAAAGGACTTCACATCATCATAATCTTTACTTAAATTATATACAATCAAATTTACAGGTTGACTTTTAAATAAAAACTATAACAAATTATTATACTAATTAAACTGGTTTTTTTTTAAAATAATCTAATGAATATATTGGTTTAACTGGTGAGATTTAAAACTAATTTTAAAATAAAATATCTTTTAATTATAGTTTAAATAGTTTAGAATTTAATTTACTTAAGTTATAGTATAATATTTCACTTCAAACAATTTAAATTATTATATATTGTAATTCAACTACTTAAAAATAAATTTCCCATTTTAGTTTACAATTTATGCATTTCCATATTTAAGTGTAAATTAAAAGAAGAGTTAACAACGTTATTTATTATTTTACAATATTCGTTGTGATTTTAATCTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCATGTATACACTTAAATTTATTCCCAAAATGTTAAAAGCAATTAATTTTTTACTAATTTTCCTCGTATCTAAAGTTTTCAATTTCTCAGTTTTCTTCCTCGTTTTTTTAGTATTTCGTTTGGTACATATATTTTTACGAGTTATATTTATTGAACTATTTGAGATCATATTTGACATTAAGCTTTCTGATTAAAAACATTATACTTTTCCTAAATCTGAAAAACATAATTTCCCATTTTCAAAACTTACAAAGTTAAGTATTTCTTTTTGAAAAGCTCCTCAAAATATATTTAGTTTTGCATCTTATCTCAAGTTTGTCCTAATAATTAAATTACTTGAGTAAAAAATATGATCTGAAAATTTTATGCAATAAAAAAGGTTAAAAAACTATTTACTTTTATTATTAAACATTAAATATAATTTAAAAATACTGCCACTACAAAAATAATATATTTTAAGAGAAATTATTTTTTGATGGTTAAAAAAACCTCAAAAAATTTCCGACGATTATGATTAAACCGTCCCTAATTTTTTTAATGTTTGTAACATGTACGGTACAAACACTAGTTATTATTTATACTTGAAATCTATATACGCAAACATATGTATTTATTAGAATCTAATTTTTATACATTTAAAATTGTTTACTATAAACGTAATGATGAAAAATATAATTAAATTTAATCTTTATTCAAAGTCATTAGAATCAAATTTTCATATGTATATCATATAGTATAGACGCACTTTATTTATTCTCATAAATGTATTGCATCACCTTTATTTTGAACATAAATCAAGGATACAGAAGAACTTTATTTTTTTCTTAATCATTAATAACACTAATAAAACACATTAAAAGTAATAAATCCAACAATAAGATTAGGAACTTTATCCGCACCTATTAAGATCTTCCACTGTTCACTTTCCATAAACTTGTTTTCACAAAAAGTATTGCAAGAAAAATAAAATAATTATTTACATGAACTTGTTATGAGAAAAAGAGAAAGATAATTTTCCAAAAATTATTTTTATTGAAATTTATCATCAAATACATTAGTTTCAATTTCTAACATTTTTACTTTATCTATAACCATAATAAATTCAATTTCCTCTTTGCTTTCTCTTTTAATCAGGTTGGTTTATCCTATTAACTCATTTATTACCTCTTACGTCGTTAAGTAAATAATCATATGTTATATAAATAGAGGTTAATACAGATTAAATTTTTAGAAATCTAATTTAAATTCAATTTATATTTAAATAATTGGATTCAAACTAAATCTAAAGTTACGTTGCTTAATTTGTATGGGTTTAAATACATTTTTACTTAATTAACTCGACACTAATTTAACTTAATAATTTTGATTTAAATTTTAGATAATAAACATAAACATGTTTTATGCATTTGGAGGTTAGAAAAAACAAAGACATTCCACCAACTGCCACGTGGCATAAGAGGTTTTCCTTATGTTACAAAAGTACAATGATTGGGCAAACAGTATTAAAAG


Gene Sequence:
>Vu_03565(-)
AAGGAATAAAGAATATAAATGTGTTGTATTGCGTTGTGTGCAGTGCCGTCTCAGGCTAATATGTTTTGGATCGGAGAGAAAGAGTCAGTGCGTTGTGCGCGTGTGCTTCAGAACATTATGGAAGGTGGCCGGAAGCCGTTGAAGCCGCGCCTTGAGCGCCGGAACGCCATGAAGAACATCGATTACCGGTTAAAGGAGGATGAAGACACAGACACCGAAACGGACATAGACATAGGTAGTTTGGATGAAAGGAGTTTCCGAGTGGAAGGAATTGACGGCGAATTCGACCGTATATTTCGGAGCTTGGGCCTGTCCGGGCCCGAGGACTTTGCCATCCCGGCGGCGGCTTGGAAAGAAGCCCAGGCCCAGAAGGCCCGCAGCACAGTGAACCTTCAACACGAACCGCCACAAAATAAAAAGCAGAGAGAGGGGGGAATAAAGGGCGTTAGGCCTCCCATTTTGGAACCGACGCAGGTTACCTCCACTTGGACCTCCCAACAACCAACGGTTTCTGATTCCGTGTCACGTGATGAAGACAGTGATGTTGGTGTTAAAGCTGAAATTGAAAAGGTTTCTGCTTTGGTCGGGAATGAGACCTTTGATATTCAAAACCTGTCGCCGAATGCAACCGGATATTTCGGGTCGTGGCAAAAAGGCGAGATCTTGGGAAAGGGCTCTTTTGGAACTGTATATGAAGGCTTCACGGAGTCAGTACTCTACACTACACTGTTCTTCATTCTCTTTCTTCTTCCTTTCTTGAGCTTCCCATGCATAGAGATTACTTACTTGATTTTATTGCTATATCTTAGTTGTTCCCATTTTATCTACAATTAGAAAGACCGTCTGGGTGGCTTTATTGAAATTTACACCAATTTTTTCATCTGGAAGGAAAAAACCAAGTGAGAAATGAATGCAGTTATCTTGTCTAAGATTATTTGGTTCAGAAGTTTTTCTTACAAATGCTATCAAAATAAGGTTTGCAAATTCGTACACCAACTATTTAACATGTTTTCAGGGTCAGACACTTGTATTGAAAAAAAGAGAACATTAACCAATTATAACTAGTTGTTTGATAATACTAATCTCCATACTAGTATGAGTGGCGCAACAACTTATTTAGGATAAGTTTTTTATTCTATCATAAATGCAGTAATCTGATGTAATTCAACTTTATAAAGTCAATATGTAAACAATTCCCTAAATATTCTGATATTGGTGCTTATCTTGTTAATGTAAAATTTCACAATTTTTATACTGTGCTTGTCGCGGATGTAACACATACATCTTCTTTTACTTGCAGCGATGGGAACTTTTTTGCCGTAAAGGAGGTGTCTTTATTGGATAACGACAGCCAGGGCAAACAGAGCATTTTCCAGCTTCAGCAGGTGAGAGAGTTGGGCTTCCCTTCTCATCAAACAAACATCATGGCATAGTCTAGTTTTCTGTCAAACCATGCACACATTCTTCGTTTGTTTGTTCCATCTTATACATAGGCGTTTGATAATATAAGTATGTTTGGTCTTCCAGGAAATATCTCTTTTGAGTCAGTTCCGACACGACAACATAGTTCGATATCTTGGCACTGACAAGGTATGCTGCTTTCTTGTTGGTAATTTTATTAGAATTTGTGTGTGGTCTGGCTTGTTTCTGTAATTGTTGGCACTGACAAGGAACCACAATTATAGTTTCTGTAAGACCATATATTGAAACAAATATACTTTATCTGTCTCTCTTATCTCTGAAAATTTCATCTTCCTTATGTTTTCTGATCCAGTTTCTATAATTAGCCGTGTATCCCAGTTTTGGTGATACTCCTTGAATTATTTTCGCTATCTGTATTTACGTCTTACTGTTTCTCAGGACAATGACAAGCTGTATATCTTCCTCGAACTTGTAACAAAAGGATCGTTGGCAAGTCTCTATCAAAAGTATCGATTAGGGGACTCTCAAGTTTCTGCATACACAAGACAGATTTTGAGTGGCTTGAAGTATCTTCATGATCGCAATGTGGTTCACAGGTAACACGAGTGAAATTTCTATCTTGATGCAATACAATGATTGTAACCATAATAATGACAATCTTTCTTAGGCATTTTGGATTTTCATTTCTTCTTTGGTATCCTGAAGAATCTATTTTGAGCCGATTTCCACTTTATATGACTATTGAAATCACTGAGTGGTCAAAGTTGGGTGCAGTGGTTGGAAATTGATGACCGAAGTATCTCAAATTTACATGGACTTCTACATTCTAACTTTACTTCATCCAAAATTTTAAATTTTAAGGGACATCAAGTGTGCCAATATATTGGTTGATGCAAATGGGTCCGTCAAGCTTGCAGATTTTGGATTGGCGAAGGTACATTTCTTCCACAAAATAAACTTTCTTGAGTCAGCACTTATCACTGCAAATTCCAATGCCAACCACTTGCAATTATATTTTTCTTTTTGTTCCTTTGCAGGCAACCAAGCTGAATGATGTTAAATCAAGTAAAGGCTCTCCGTACTGGATGGCCCCTGAGGTTTGTCTCTCTCCATGTAGTGAGAATTCATAACAATTTCTCTTGCTTCCACTGAATTTTTCTATATCGGACTGCAGAATCACCATTTTCAGTATTTGTAATTTCATGATGTGCTTAGAATGAGTTTGAATTGTTGGATCATAGGTTGTTAACTTGAGGAACCGTGGATATGGGTTAGCAGCTGATATATGGAGCTTAGGATGTACAGTATTAGAGATGTTGACACGCCAACCTCCTTATTCTCATTTGGAAGGAGTATGTCTAACATTTTACAGTTTTCTTTACCCTCGTTTCTATATTTTCCTAGATTCATTTATTACTGAGACTGAATTTTCCATGTAACCATTTCTTGTCCACTTCCTTAAATGATGCTAAATACCTTTTTGTTTCCATTTGTTACGACAGATGCAAGCGATATTTCGAATTGGCAGTGGTCAACCCCCACCTGTTCCGACATCTTTGTCAACAGATGCACGAGATTTTATTCTTAAATGCTTACAAGTTAACCCAAACAAACGGCCAACTGCTGCTGGGCTATTAGACCATCCATTTGTAAAGAGACCACTTCTGTCTCCCATAAGTCCTGTTTCTCCAAGTATCAACCTTTTACTGTCCTAAGAGATTCTCAACATCCTCTGAGATTGTTTTGCAGACATGACCCTAGCTTCTTCTTCTGGTCACGGTTCTTTTCCCTTTTTGTCAAGTTGTAAGTATTAGAGCAATGGTTATTAGTGTTTGTAGCCACCCTTTACATCTGTGAATAGGAAGCTAAGAAAGGGAAGTAGCTACCTAACAAAGGAACTGGTAGTTTTTATTGTAATCAGTCTGTCGACTTTCTCTTCAATTAGAACAACACAGGGCTTTTGTACATAGCTTAATCAAGGTTTTCAACTTCATCACAATGCAATTACCTTAAACATTCTTTATGTCAATCCTAATATAAAACTATTGTTTGTTTCTCTTAATGACACAATATGTTTAAATTCTTGCAT