Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03511 LG1 48132542 48135694 PREDICTED: putative receptor-like protein kinase At3g47110
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 48132634 missense_variant p.Pro755Arg
A/G 48132638 stop_lost p.Ter754Glnext*?
T/G 48132728 missense_variant p.Thr724Pro
T/C 48133297 downstream_gene_variant
A/T 48133533 downstream_gene_variant
A/T 48133662 missense_variant p.Met678Lys
T/A 48133663 missense_variant p.Met678Leu
C/A 48133879 missense_variant p.Val606Leu
T/G 48134501 synonymous_variant p.Ile398Ile
G/A 48134633 synonymous_variant p.Pro354Pro
G/T 48134683 synonymous_variant p.Arg338Arg
A/G 48134716 synonymous_variant p.Leu327Leu
T/A 48134786 missense_variant p.Leu303Phe
A/G 48134788 synonymous_variant p.Leu303Leu
A/T 48134792 synonymous_variant p.Pro301Pro
G/A 48134834 synonymous_variant p.Val287Val
C/T 48134837 synonymous_variant p.Gln286Gln
A/G 48134936 synonymous_variant p.Asp253Asp
G/A 48135165 missense_variant p.Ala177Val
A/G 48135285 missense_variant p.Leu137Ser
C/T 48135316 missense_variant p.Glu127Lys
G/C 48135332 missense_variant p.Ile121Met
G/A 48135359 synonymous_variant p.Asn112Asn
C/A 48135457 missense_variant p.Gly80Cys
C/G 48135465 missense_variant p.Gly77Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03511.1
MLLHHLQLHYLFVGVSAATLSITTDTEALISFKSQLKNDTLIPLSSWNQSSSPCNWTGVQCDSLGQRVISLELPSLGLSGQLSPYICNLSSLQSLQLQDNQLTGLIPDQIGNLFSLRVLNISSNMLEGNLPSNITRLNQLQILDLSSNKIVSKIPQDIGSLKKLEVLKLGKNSLYGAIPASLGNISSLKNISFGTNFLTGSIPSDLGRLHDLIELDLILNNLNGTVPPSVYNLSSLVNFALASNSLGGEIPQDVGLKLPKLIVFNICFNYFTGGIPGSLHNLTNIQVIRMASNFLEGTVPPGLGNLPFLRMYNIGYNRIVSSGVGGLDFITSLTNSTRLNFLAIDGNMLEGVIPETVGNLSKDLSTLYMGQNRFNGSIPRSIGLLSGLKLLNISHNSISGEIPHELGQLAELQELSLAGNEISGVIPDSLGNLLKLNLIDLSRNKLVGRIPTSVGNLQSLLYMDLSSNQLNGSIPVEILNLPTLSNVLNLSMNSLSGAIPQIGRLSGVASIDFSSNQLDGDIPSSFSNCLSLENLFLNRNQLSGSIPKALGEVRALETLDLSTNRLSGAIPVELQNLQVLRFLNLSYNDLEGAVPSGGVFQNLSAVHLEGNENLCLQAPCVNRGEGRRNVRYYIIIAVAVALVLCLTVGSILYIRSRKVKVATLSSSPSEQLKPLAPMISYDELRLSIRRWMHSAFKEKTMEAIDPELVSLILNDDPSEGPNNVQVYCVEAIVGVAISCTADNPDERIGIRDAVSQLKSSRDSLLNHFDHTSAAHTNSYLKVLLK*


CDS Sequence:
>Vu_03511.1
ATGCTCCTCCATCACCTTCAGCTACACTATCTCTTCGTTGGTGTATCAGCAGCCACTTTAAGCATCACCACTGACACAGAAGCCTTGATCTCATTCAAGTCTCAACTGAAAAATGACACTCTTATTCCCTTATCTTCTTGGAACCAAAGTTCATCCCCTTGCAATTGGACTGGTGTGCAATGTGACAGCCTTGGCCAAAGGGTAATTTCCTTGGAACTTCCAAGCTTGGGACTCTCAGGTCAATTAAGTCCTTATATCTGTAACCTCTCCTCTCTTCAGTCCCTCCAATTGCAGGATAACCAACTCACTGGACTCATTCCTGATCAAATTGGCAACCTATTCAGTTTGAGAGTTCTAAATATCAGCTCTAACATGTTAGAAGGAAATCTTCCTTCCAACATCACCCGCTTGAATCAGCTCCAGATTCTTGATCTATCCTCAAACAAGATTGTCAGCAAGATTCCTCAAGACATTGGCAGCTTGAAAAAGCTTGAGGTTTTGAAGCTGGGAAAGAATAGCCTCTATGGTGCAATCCCAGCTTCTCTAGGAAATATTTCTTCTCTCAAAAATATCAGTTTTGGCACCAACTTTCTCACTGGTTCGATTCCCAGTGACTTGGGTAGGCTTCATGATTTGATTGAGCTTGATCTCATTCTTAACAATCTCAATGGGACCGTTCCACCTTCTGTGTATAACTTATCTTCCCTCGTTAACTTTGCCTTAGCTTCAAACTCTCTGGGGGGTGAGATTCCTCAGGATGTTGGTCTCAAACTTCCAAAACTCATAGTGTTCAACATCTGCTTCAATTATTTCACAGGTGGAATTCCAGGGTCTTTGCACAACCTCACCAACATTCAGGTCATTCGCATGGCTTCCAACTTTTTGGAAGGAACAGTGCCACCTGGTTTAGGAAATCTCCCATTTCTTCGCATGTATAATATTGGTTATAATAGGATAGTGAGTTCAGGTGTTGGAGGTTTAGACTTCATTACCTCTTTGACAAACAGTACTCGACTCAACTTTCTGGCAATTGATGGAAATATGCTGGAAGGTGTGATTCCCGAAACCGTTGGCAATCTCTCCAAGGACCTGTCAACGTTATACATGGGACAGAATCGTTTCAATGGAAGCATACCCCGCTCCATTGGTCTTCTTAGTGGCTTGAAGTTGTTAAACATAAGCCACAATTCAATATCTGGAGAAATCCCACATGAGTTAGGCCAGTTAGCGGAACTACAAGAACTATCTCTAGCTGGAAATGAGATATCAGGGGTTATTCCAGATTCCCTTGGTAATCTCCTCAAGTTAAACCTGATTGATTTGTCAAGAAACAAACTTGTGGGGAGAATACCTACCAGTGTTGGGAATTTGCAAAGTCTGCTTTACATGGACTTATCAAGCAACCAACTCAATGGAAGCATTCCTGTGGAAATCCTCAATCTCCCAACTTTGAGCAATGTTTTGAACTTGTCAATGAACTCTTTGAGTGGAGCAATACCTCAAATAGGAAGATTGAGTGGTGTTGCCTCCATTGACTTTTCTAGCAATCAATTGGATGGTGACATTCCCAGTTCATTCAGCAATTGTCTCAGCTTGGAAAATTTGTTTTTGAACCGGAATCAGCTTTCGGGTTCCATTCCAAAGGCTCTTGGAGAAGTGAGAGCCTTGGAAACTTTGGACCTATCCACCAACCGACTGTCTGGAGCCATTCCTGTTGAACTTCAAAACTTACAGGTTCTTAGGTTCTTAAACCTCTCGTACAATGATTTAGAAGGAGCCGTTCCAAGTGGTGGAGTTTTCCAAAATCTCTCTGCTGTACATTTAGAAGGCAATGAAAATCTCTGCTTGCAAGCCCCATGTGTAAATCGTGGCGAAGGAAGAAGAAATGTGAGATATTACATCATCATAGCCGTTGCTGTAGCATTGGTACTGTGTCTCACAGTTGGCTCAATACTATATATAAGGAGCAGAAAGGTGAAGGTAGCAACATTATCATCATCACCATCTGAACAGCTAAAACCTCTTGCACCAATGATCTCTTATGACGAGCTTCGCCTAAGCATAAGAAGATGGATGCATTCAGCATTCAAAGAGAAGACAATGGAAGCCATTGACCCCGAGTTGGTGTCCCTCATTTTGAATGACGACCCTTCAGAGGGACCAAATAACGTACAAGTGTATTGTGTGGAAGCAATTGTAGGAGTAGCCATATCTTGCACTGCAGACAACCCAGATGAACGCATTGGCATTAGAGATGCTGTTAGCCAACTCAAATCTTCCAGAGACTCTCTTTTGAATCACTTTGATCATACTTCTGCTGCACATACCAACTCTTACTTAAAAGTTTTACTAAAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_03511::LG1:48135694-48137694(-)
TCATCTTCTCCATTTCACAATTAAAGTTTGACTTCTTTCTATATATCTATTTTTATGACTTTTTTTTCTTCCAAATATTACTATAATTTAACAAATATAAATATAATTATTATCACGTGGAGAATGTATTGTTAATGATATAAAACGTCATCAAAAAACTAAATTAAATAAAAATTACGAAAATTAAAGTCATATTAAATATTAAAAAAAATCAAATCCCACATTGAATGCATTGAATAAAGGAGGAAGATAAAAAATGATATTAAAACAAAGAAAAAATAATCTACCAATTTACTTCTTTTAACTTTATTAAATTCATTTTTACCAATACGCAATTGTCCATCTTTTATAGATAAATTGTATATATAATCTATTAATACAAATATTAAAGCTTTAATATTAAAAGAAAGACAATATAGATTGTCCTTTTCCCCAATATGTTGTTAGTATATGGAGACTGCATTTTGTAATATTGAAACAATTCTTAGAAGTTAAATCTTACAACATAGTTTTAAGTTTACCAAAAAAATTACAATTCTTTTAACGAAAATTAAAATAAAACTACAAACTAAGCGAAAATAAAAAATGTTTTTAAACATCTAATAGAAAAAAAAATATATGAGTGATTCAATAAAAAAAAATATCCAGTATTTTTTAAAACTTAATTAAGCCATAAGATATTACACCTTTAGGTTTTTTAAATTAAAAACAATTGATCAAGTTAGTTTGACTATCACTTTCAGTAAACAGGCCATTTAATACGGTGATGGACTATTCTCCACCTTCATACATCGATTCAAAGAAAATTACAATCTACTTCTTGAAACGCTTTCTTTCTTTTTTTCGTAGAAATTTTTATAGAAATTAGTGTACACATAACATTTTGGCTTACTTTGAAATATTCAATTTAGTTACATTCACATTGACACTATCTTCATTAGATATTAAAATTTAGGTTTACGTTCTTTTTTTCTTATAACCTCTAGTTTATCGAGTTCTTTTGTTTTTTTCTTTCATCTTTCTTCACTTCCCATTATCTTTCTCTACCTTTCTCTGTCTCTTATTACTTTCGACACGTAAGATTAGTGATCCTAAATCCTATACCACAAAAATTTCATATAAATTAAATTCAAAATTTTATTTCACTTGGAAGAATTTAATAGTAAAAAATACTTGGATAGGAATCACAAGTCGGACACGGACAGTGTCTATCTACAATCCAAATTGTCGGATAAAACTGTACTCGCTACCCGACCCACTACCTGTGCGGGTACCCGTTTAAAAAATACCTATGGGTATTTTAAAACTCGCAGATATTCACGGATATCTCAAAAAAATAAAAAATAAATATTTTATATTTTTAAAATAAAATTTAAATAAAATTACAATATATATATATATATATATAATTAAAATTAAAATAAATTTAACATAATAAAATATAATTTTATTTTATTTTTACTTAAATTTAATTAAAAAATATATAAATTAATTTTTTATTTTATTTTTACCGTAGGTTGGGTAGTATACTATCCATACCCGATCCGTTTAGAAACGGATATTAAAATATCCGCTATCCGTTATCCGCGGATAGTAAATATGCGCGGATAGTAACTACCTGCTGTGGATTTTATCCGTGAATACCTGTGCCAGCGGATTTTTTTGTCATCCCTAATATTATCTTTATGTTAACACCAATTTAACGATAAAAACTAAATTGAGTTATTTTTGTAAAAAAAAGACTCAGTATAAAAAACATATAAAAATTTAATTAAATAAAAAATAAATATAAAGACCAAATAAATAAAAACTTAAATATAAAAAATAAATTATATTTGTTTTATTATTAAAGAGAAAAGCACGTCATGGTTCCGTGTGTTGCTGCAGGTGCATTTGGACAACTATAAATACATGTCAGGGTAAGAGTTGAATATCATAAGCCAAAGGAGAAAAATATGGCTTTGTCTTGTCAATTACTTGTTCACTTTGGCTTATTGATT


Gene Sequence:
>Vu_03511(-)
ATGCTCCTCCATCACCTTCAGCTACACTATCTCTTCGTTGGTGTATCAGCAGCCACTTTAAGCATCACCACTGACACAGAAGCCTTGATCTCATTCAAGTCTCAACTGAAAAATGACACTCTTATTCCCTTATCTTCTTGGAACCAAAGTTCATCCCCTTGCAATTGGACTGGTGTGCAATGTGACAGCCTTGGCCAAAGGGTAATTTCCTTGGAACTTCCAAGCTTGGGACTCTCAGGTCAATTAAGTCCTTATATCTGTAACCTCTCCTCTCTTCAGTCCCTCCAATTGCAGGATAACCAACTCACTGGACTCATTCCTGATCAAATTGGCAACCTATTCAGTTTGAGAGTTCTAAATATCAGCTCTAACATGTTAGAAGGAAATCTTCCTTCCAACATCACCCGCTTGAATCAGCTCCAGATTCTTGATCTATCCTCAAACAAGATTGTCAGCAAGATTCCTCAAGACATTGGCAGCTTGAAAAAGCTTGAGGTTTTGAAGCTGGGAAAGAATAGCCTCTATGGTGCAATCCCAGCTTCTCTAGGAAATATTTCTTCTCTCAAAAATATCAGTTTTGGCACCAACTTTCTCACTGGTTCGATTCCCAGTGACTTGGGTAGGCTTCATGATTTGATTGAGCTTGATCTCATTCTTAACAATCTCAATGGGACCGTTCCACCTTCTGTGTATAACTTATCTTCCCTCGTTAACTTTGCCTTAGCTTCAAACTCTCTGGGGGGTGAGATTCCTCAGGATGTTGGTCTCAAACTTCCAAAACTCATAGTGTTCAACATCTGCTTCAATTATTTCACAGGTGGAATTCCAGGGTCTTTGCACAACCTCACCAACATTCAGGTCATTCGCATGGCTTCCAACTTTTTGGAAGGAACAGTGCCACCTGGTTTAGGAAATCTCCCATTTCTTCGCATGTATAATATTGGTTATAATAGGATAGTGAGTTCAGGTGTTGGAGGTTTAGACTTCATTACCTCTTTGACAAACAGTACTCGACTCAACTTTCTGGCAATTGATGGAAATATGCTGGAAGGTGTGATTCCCGAAACCGTTGGCAATCTCTCCAAGGACCTGTCAACGTTATACATGGGACAGAATCGTTTCAATGGAAGCATACCCCGCTCCATTGGTCTTCTTAGTGGCTTGAAGTTGTTAAACATAAGCCACAATTCAATATCTGGAGAAATCCCACATGAGTTAGGCCAGTTAGCGGAACTACAAGAACTATCTCTAGCTGGAAATGAGATATCAGGGGTTATTCCAGATTCCCTTGGTAATCTCCTCAAGTTAAACCTGATTGATTTGTCAAGAAACAAACTTGTGGGGAGAATACCTACCAGTGTTGGGAATTTGCAAAGTCTGCTTTACATGGACTTATCAAGCAACCAACTCAATGGAAGCATTCCTGTGGAAATCCTCAATCTCCCAACTTTGAGCAATGTTTTGAACTTGTCAATGAACTCTTTGAGTGGAGCAATACCTCAAATAGGAAGATTGAGTGGTGTTGCCTCCATTGACTTTTCTAGCAATCAATTGGATGGTGACATTCCCAGTTCATTCAGCAATTGTCTCAGCTTGGAAAATTTGTTTTTGAACCGGAATCAGCTTTCGGGTTCCATTCCAAAGGCTCTTGGAGAAGTGAGAGCCTTGGAAACTTTGGACCTATCCACCAACCGACTGTCTGGAGCCATTCCTGTTGAACTTCAAAACTTACAGGTTCTTAGGTTCTTAAACCTCTCGTACAATGATTTAGAAGGAGCCGTTCCAAGTGGTGGAGTTTTCCAAAATCTCTCTGCTGTACATTTAGAAGGCAATGAAAATCTCTGCTTGCAAGCCCCATGTGTAAATCGTGGCGAAGGAAGAAGAAATGTGAGATATTACATCATCATAGCCGTTGCTGTAGCATTGGTACTGTGTCTCACAGTTGGCTCAATACTATATATAAGGAGCAGAAAGGTGAAGGTAGCAACATTATCATCATCACCATCTGAACAGCTAAAACCTCTTGCACCAATGATCTCTTATGACGAGCTTCGTTTGGCAACTGAGGAGTTCAACCAGGAAAACTTACTAGGAGTTGGGAGCTTTGGCTCAGTTTACAAAGGCAATCTAAGTGATGGAACTACTGTTGCAGTGAAAATTCTTGACACCCTAAGAACTGGTTCTCTAAAGAGTTTCTTTGCAGAATGTGAGGCTATGAAGAACTCGAGGCATCGAAATCTGGTTAAGCTTATCACATCATGCTCCAGTGTTGACTTCAAAAACAATGACTTTTGGGCTCTGGTGTATGAGTATATGTGCAATGGTAGCTTGGAAGATTGGATTAAGGGGAAGAGAAAGCATGAAAATGGAAATGGATTGAACCTTATGGAGAGATTGAACATAGCAATAGATGTTGCGTGTGCACTGGACTACCTGCACAATGATAGTGAAATCCCAGTTGTGCACTGTGATTTGAAGCCTAGCAACATTCTCTTGAACGAAGACATGACTGCAAAGGTTGGAGACTTTGGATTGGCCAGGTTGCTTGTTCAAAGATCAACCAATCAAGTTTCCATTAGCTCCACTCATGCTCTTAGGGGCTCTATTGGTTACATACCTCCAGGTTAATGCATTTTCCAATTAATTAGTTTCTCTATTCCCTCTTTATGAACCTTTTCATTTCATAACAAATTATGAAATACGATGAATAATTAGTATGGTTGGTTTTGCAATGCAGAATATGGATGGGGAGAGAAAGTAAGTGCAGCTGGAGATGTGTATAGTTTTGGTATAGTGTTGCTGGAGCTGTTCTCTGGGAAAAGTCCAACTGATGAATGCTTCACTGGAGGCCTAAGCATAAGAAGATGGATGCATTCAGCATTCAAAGAGAAGACAATGGAAGCCATTGACCCCGAGTTGGTGTCCCTCATTTTGAATGACGACCCTTCAGAGGGACCAAATAACGTACAAGTGTATTGTGTGGAAGCAATTGTAGGAGTAGCCATATCTTGCACTGCAGACAACCCAGATGAACGCATTGGCATTAGAGATGCTGTTAGCCAACTCAAATCTTCCAGAGACTCTCTTTTGAATCACTTTGATCATACTTCTGCTGCACATACCAACTCTTACTTAAAAGTTTTACTAAAATAA