Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03445 LG1 47458284 47460873 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase SAPK2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 47458433 synonymous_variant p.Leu259Leu
T/C 47458512 synonymous_variant p.Val232Val
A/T 47458513 missense_variant p.Val232Glu
G/T 47458561 missense_variant p.Thr216Asn
A/T 47459181 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03445.1
MERYEIIKDIGSGNFGVAKLVKEKWTAELYAVKFIERGFKIDEHVQREIINHRALKHPNIIRFKEARYFFQQLISGVSYCHSMEICHRDLKLENTLLDGSSAPRLKICDFGYSKSSVLHSQPKSTVGTPAYIAPEVLSRKEYDGKVADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEDPEDPRNFRKTLQRILSVHYSIPDYVRISKECRHLLSRIFVANPEKRITIPEIKMHPWFLKNLPVEFMEEGEGVLQNDMKESCETQSIEEILSIIQEARKPGEGPRVGEQFVGGSMDLDDIDADADIDDIETSGDFVCAL*


CDS Sequence:
>Vu_03445.1
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Promoter Sequence:
>Vu_03445::LG1:47460873-47462873(-)
GAAAAAAGACAATAAAGAAATATTAGGAATGTTGGGTTTTCAAAAAAATAAAAGAGGAAACCTTTTTATATTTAGCACCCTTTGTTGTCTAGCCTCATACCTCCACTTTTGATTTTAGTTAATAATTTAATCATCACTTTTAAAAACTATTCACACTCTTACTTAAAGTAAAAACACAAGTATTTAAATTTTAACACCGGTTACTAAACAAATCATTATTCATATAATAAACAATATAAAAAGTAATTTGATATTCATATAAAAAATAATTAAATAGTCCTAAATGTGATATTTGAAGTTGTGATGAGGTGTCAGATAAGCCTTTCTCCAAATTTGTGTAAGCAAGGCATGGCTCTGACCTGACCTGTCCATGCTCCTCCACCTCGTAACTCGTAACTTCTATCCCATTCATTCGCCTCTTTCTTCTCTTAATTGCACACTCATAACCACCCTCCGCGACTACCAAACTTCTCTACTCGCCTTTCTCACGCTCAAAATAGTCAACCCTCGTTGACTCCCCTTCTCTGTTTCACCACGCCAACGGAAGGGCGAGTACGCATCGTTGTCCTTACCCGACGTGCTTCTCGGATCAAAACCTTCCTACCACTTCAAACCAATTACTTCCTGCCATGTGTCACTTTCCATCTTCTTATATTATTCCTATATATACTAATTCTTTTTTCATATTTAATTATTTCTCTTCTTCTTTTTAATCTTTTTTATGTGTACCCAAGAAAAACAACTCTGGGATTTTTCATGTATACACTGTTCAGCTCGCACGTTGTTATTTAAGTAAAATTTAGTAAAGAGAGTGATCATCATCAAAATCCATAAATTAAATTCATGAAACTATATGATTAAAAACAATTTAATGTAAAACTACATACATTCTTACCATTTTTATTTATTTTTTCTCAATTATATATTATATCTATACTTTTTTTTCTTTCCAAAAGTATGTTTGATAAGGAGAAAAAAGGTAACGACATTTCTTTTTTTATTTTATGAAGAAAAAAATATACTAAATATTTCTTTTTCAACTTTTCTTTCGCTTCAAATTTAAAATTTCAGTTTTTCCTTCCTTCGTCACCTTTTCCTCCTCGTCTCAAACAAGCTTGATGTAACCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAATGTGTAAGTCTTATTATGCTTAAAACTTTTACGAATTCCCTTATTTGTTAAACACTTTTAGTTTTAAGCTTTGACGTTGTCATATCTCAATAAAGTAATTTTTCTCTAATGTATATGAAATTGTACCTTTTTTTTTCTTCTTATAAGTCAAACTAATTTATTTATCAGAGGAGTGAAATTATTTTAATACGTTATACATGTATTGTAATTTTTAATATGTGAGACAATTTTAAAGTGTGTAATCATGGTAAAGAGGAGGAGGAGAATGAGAATATAATATTTTTACATATAAAATATGAGTTCAATGACGTAAAATAAGACATAATGATATATAAATAATTATTATTGGCAACATTCTGTAATTGTTAAAAAAAAAACTAATTTTGAAAATACAGTATAAAATAGTTTTTTTTATAAAGATTGTGGTTATGAAGAAAAATATGTTATGTCATCCCTAATAAATTATACCTACCTAAACTAAATATAAATTTCTGACATACAAAAGTCCTGTGTCTGAGGGCATAGTGACAGTCCAATTGTAAATTGCAACAAAGGCATCAAAACCCAGAACCCAATCATCTTTTATTGCAAGCTTTTGCGCATTGGAATTTGGAGGCCTTAAAAAAGATGCGATGCTACACGCAAACTAGTAGTACAAGTCCAATAAGAAAAGCAACATAGAGAGATTGGCCAATTCTCTGGCTAGCTCACATCTCATTTAACACAATTCCCTGTTGCTGATACTTACACACACTTCAATTCAAGTTTCAAACTTGCTTAACC


Gene Sequence:
>Vu_03445(-)
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