Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03274 LG1 45587846 45589309 PREDICTED: nodulation-signaling pathway 2 protein-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 45587990 missense_variant p.Gln440His
T/G 45588064 missense_variant p.Lys416Gln
G/A 45588123 missense_variant p.Thr396Ile
G/A 45588350 synonymous_variant p.Asn320Asn
G/A 45588438 missense_variant p.Thr291Met
T/A 45588624 missense_variant p.Asp229Val
T/C 45588752 synonymous_variant p.Thr186Thr
T/C 45589022 synonymous_variant p.Glu96Glu
T/A 45589026 missense_variant p.Glu95Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03274.1
MDYEEFDFSFGYPYMNQLHECCLENAFPFQTEDISSPNTIMDEMFGEESMEGLLLQHTNNQDFGFMNHNDSPEIELCDGFGSSPEENVHVSMEEEEEGDCYLKGIQAEVMEQTSLADLLLTGAEAVEAQNWDLASYIIEKLNNASSLEKGDGLLNRLAFFFAQGLYYKSTNAPELLLQRGAVSTHTDAFCLFQILQELSPYVKFAHFTANQAILEATEGVENVHIVDFDIMEGIQWPPLMVDLAMRKNSTTSLRVTAITVDQRGAASAEQTGRRLKEFAASINFPFTFDQTMMEREEDIEGIEVGETVIVNCMIDQWMPNRSFSLVKTFLDGVTKLWPRLVVLVEEELFNFSRLKSMSFVEFFCEALHHYSAVCDSLGSSVWGSHKMASRLIEKETLGLRILDSVRQFPCERNERKVWEEGFYSLKGFKCVPMSSCNISQAKFLVSLFGGGYWVQFEKGRLALCWKSRPLTVASIWVPKGYSSQKVN*


CDS Sequence:
>Vu_03274.1
ATGGATTATGAGGAATTTGATTTCTCGTTTGGCTATCCTTATATGAACCAACTCCATGAGTGTTGCTTAGAAAATGCATTCCCATTTCAAACAGAAGATATATCATCACCAAATACCATAATGGATGAAATGTTTGGTGAAGAGTCTATGGAGGGCTTGCTTCTGCAACACACAAACAACCAGGACTTTGGTTTCATGAATCACAATGATTCACCAGAGATTGAACTCTGTGATGGATTTGGTTCTAGCCCTGAGGAAAATGTGCATGTTTCAATGGAAGAAGAAGAAGAAGGGGATTGTTATTTGAAGGGAATCCAAGCAGAGGTGATGGAACAGACTAGTTTAGCTGATCTTCTGTTAACAGGAGCTGAAGCTGTTGAAGCACAAAACTGGGACCTTGCTTCATACATAATTGAGAAACTCAACAATGCATCATCTTTAGAAAAGGGTGATGGTCTGTTGAACAGGTTGGCTTTTTTCTTTGCTCAGGGTCTGTATTATAAAAGTACAAATGCCCCTGAACTGTTGTTGCAGCGTGGTGCTGTTTCTACACACACAGATGCTTTCTGTTTGTTTCAGATTCTCCAAGAACTATCTCCATATGTGAAATTTGCTCATTTCACGGCAAACCAAGCAATCTTAGAAGCCACAGAAGGTGTTGAGAATGTTCACATCGTTGATTTTGACATCATGGAGGGAATCCAGTGGCCACCCTTGATGGTTGATCTTGCAATGAGGAAAAACAGTACTACTTCCCTTAGAGTAACAGCGATCACAGTGGACCAGAGAGGTGCTGCTTCTGCTGAACAAACAGGAAGAAGGCTGAAAGAGTTTGCAGCTTCTATAAACTTTCCATTTACGTTTGATCAAACGATGATGGAAAGAGAAGAAGATATTGAAGGAATTGAAGTTGGTGAAACAGTGATAGTGAACTGTATGATAGACCAGTGGATGCCTAACAGGAGCTTCTCACTGGTGAAAACGTTTTTGGATGGTGTGACGAAACTGTGGCCGAGGCTTGTGGTTTTGGTGGAAGAAGAACTGTTTAATTTTTCAAGGCTGAAATCAATGTCCTTTGTGGAGTTCTTCTGCGAGGCTTTGCATCACTACAGTGCAGTTTGTGATTCACTTGGTAGTAGTGTGTGGGGTAGCCACAAGATGGCGTCGAGGCTGATAGAGAAAGAGACTTTGGGGCTCAGAATATTGGACAGTGTGAGGCAGTTTCCTTGTGAGAGAAATGAGAGAAAGGTTTGGGAAGAAGGGTTTTATTCATTGAAAGGGTTTAAATGTGTTCCTATGAGTAGTTGTAATATTTCACAGGCTAAGTTCTTGGTGAGCCTCTTTGGTGGAGGGTATTGGGTCCAATTCGAGAAGGGTAGGTTGGCCTTGTGTTGGAAGTCACGGCCTTTGACTGTGGCTTCAATATGGGTACCCAAGGGTTATTCCAGTCAAAAAGTCAATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_03274::LG1:45589309-45591309(-)
TTCTTGTTTTCTTTTCCCTACTATTGATTCCACTCACTCTTACTAATAATGTATTTGTTTATCACATCATCATTATTGATAATATTAAACTAACATTAAGTTTATTACTAATTTTAGTGAGGATTGCTTGATGTTGCTAAAACAATGTAGGAGTGTAAGTGTATAATATTTACCACCTTTTTTTTCAAGGAGATACCGAATAAATTTAAAATTAATCATATAAAAAATTAGAACATTATTTTTAATTTAAAATTTTAATATAATAAATACACTATTTCAAGTATGGGATGAAAGTCAACTGTTTAAACTCTGAGTCATCCAAAGTCTCAAATGTTGTCCTCAAATTTAAGTATGATCATTTAAACTTTTTGAAAAGTATTCTAATACAAAAATTTAACTTAAAATTAATGATACAATTAATACAAATTATCTATCTCCTTATTTCAAATATTTGTTTATAGATTAATCACGTTATAACTCTTTCACGCTAGTTTAATCACGACCCAAATACAGATAATCATATTTTACTTTTAAGTTAATTAATATTGAAATTAATGTGGTCTAAATGATAACCAATCGATTTATTATATGATTGGTCGAATACGTTGATCACTCATTATATAATTCAAGACATAATTGATGTTCGGTTTGATATTGACTTAACAATTATATGATACATATTTTTTTTTCTTTTACATATTATTCATTCTATTCATTTTTATTTAATATGAAACTTTTGTTAAATTCGTAACACATATTAACATCTAAACATTCTAATTGTTTTCATCATATTATTTCTAATAAATTTAAAATAATTTTGAAGGGAGAAAACAAATGCTACAAAGAGACACTTATTGTTCTGTATAGATTAAGATAAGAGGGTTATGCTTTGTTTTGTTTCTATAGTGTGAACAGAGGACGAGCTGGAAAATAAAAGATCAATTTAAAATGATTTAGAGAATAAGTGAATAGAAACTGAAGTGAATCGATTAAATGACAAGATAGTGAGATATAAGGAATGTGATTTAAGATTTGAAATAGTTATTAGATTAAATTAAATTCAAAATAAAATTATGAATTGAAAATTAAATGCTTAACACACGACATGAATTACAACACATTAATTTAATAAGACTGACAATGACTTCTTGAACTCTTATTGAAGATTTTTCTCTTCAGACTTAGTTACTTATTTAATATATGATATAATACAAATTTTAATTTATAATCTTTAAAGTTAAAATAATCTATTTTAATCCTTATAATTAATTTTAGTTCTAATACATGTTATTTTAATTTCTCTTAATTTTTTTTAATATATACAAATTAAAAGAAGTCCTAGTATAAAGGTTAAAAATTGACACGCAGGGCCACACAATATAATTTTATTTAAATCTATTTATTTACTTATAGTCATTAGAAAGATTCGAATTGTCTTTTTTTCTTTAATGAAAGATTAAAAACACATTATTGTTTTTATTAAATTTAATAACTGAAATTGAAATAGACAAAAACAAAAGTTTACTTTGGTCAAATCGTCACCACAATTAAAACAATCTCGTCACTAGTACGGAACCAATAATAAAGGGACACCATACTAATAATAATAGTACTAAACTGTTTAAATATTTGTGACAGTAGACATTATTTAATATTTTATTAACATGTTTCTTTATTAATTAAAATCATAAATAAGAATCATTAAAAAATATGGTTTATCATATCAAATTTCATGGTCATTGGTAAATTTTAATTATTAAAAACACATTCTTAAAAAAAATGGATTTTTAATCTTTAATTATCATTTTTATTGATTTTTTTTTTTAACTTTCAACCTTAATTACTTCTAGAAGGCAGTTTTCTCAACTTAACAGGTATTAGAGTTTATAAACTATCTAGTTGTTTAGTTATTTTCATTCAATATTAGGTTGTCTATAAATAGGAGTACTCCAACTTAGTTTCTACCAAGTTCTACCTTAACTTTTTCTTCATCATTAGTG


Gene Sequence:
>Vu_03274(-)
ATGGATTATGAGGAATTTGATTTCTCGTTTGGCTATCCTTATATGAACCAACTCCATGAGTGTTGCTTAGAAAATGCATTCCCATTTCAAACAGAAGATATATCATCACCAAATACCATAATGGATGAAATGTTTGGTGAAGAGTCTATGGAGGGCTTGCTTCTGCAACACACAAACAACCAGGACTTTGGTTTCATGAATCACAATGATTCACCAGAGATTGAACTCTGTGATGGATTTGGTTCTAGCCCTGAGGAAAATGTGCATGTTTCAATGGAAGAAGAAGAAGAAGGGGATTGTTATTTGAAGGGAATCCAAGCAGAGGTGATGGAACAGACTAGTTTAGCTGATCTTCTGTTAACAGGAGCTGAAGCTGTTGAAGCACAAAACTGGGACCTTGCTTCATACATAATTGAGAAACTCAACAATGCATCATCTTTAGAAAAGGGTGATGGTCTGTTGAACAGGTTGGCTTTTTTCTTTGCTCAGGGTCTGTATTATAAAAGTACAAATGCCCCTGAACTGTTGTTGCAGCGTGGTGCTGTTTCTACACACACAGATGCTTTCTGTTTGTTTCAGATTCTCCAAGAACTATCTCCATATGTGAAATTTGCTCATTTCACGGCAAACCAAGCAATCTTAGAAGCCACAGAAGGTGTTGAGAATGTTCACATCGTTGATTTTGACATCATGGAGGGAATCCAGTGGCCACCCTTGATGGTTGATCTTGCAATGAGGAAAAACAGTACTACTTCCCTTAGAGTAACAGCGATCACAGTGGACCAGAGAGGTGCTGCTTCTGCTGAACAAACAGGAAGAAGGCTGAAAGAGTTTGCAGCTTCTATAAACTTTCCATTTACGTTTGATCAAACGATGATGGAAAGAGAAGAAGATATTGAAGGAATTGAAGTTGGTGAAACAGTGATAGTGAACTGTATGATAGACCAGTGGATGCCTAACAGGAGCTTCTCACTGGTGAAAACGTTTTTGGATGGTGTGACGAAACTGTGGCCGAGGCTTGTGGTTTTGGTGGAAGAAGAACTGTTTAATTTTTCAAGGCTGAAATCAATGTCCTTTGTGGAGTTCTTCTGCGAGGCTTTGCATCACTACAGTGCAGTTTGTGATTCACTTGGTAGTAGTGTGTGGGGTAGCCACAAGATGGCGTCGAGGCTGATAGAGAAAGAGACTTTGGGGCTCAGAATATTGGACAGTGTGAGGCAGTTTCCTTGTGAGAGAAATGAGAGAAAGGTTTGGGAAGAAGGGTTTTATTCATTGAAAGGGTTTAAATGTGTTCCTATGAGTAGTTGTAATATTTCACAGGCTAAGTTCTTGGTGAGCCTCTTTGGTGGAGGGTATTGGGTCCAATTCGAGAAGGGTAGGTTGGCCTTGTGTTGGAAGTCACGGCCTTTGACTGTGGCTTCAATATGGGTACCCAAGGGTTATTCCAGTCAAAAAGTCAATTAG