Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_03181 LG1 44624255 44625772 PREDICTED: myb-related protein 308-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 44624332 stop_gained p.Cys259*
T/C 44625000 intron_variant
T/A 44625152 intron_variant
G/A 44625158 intron_variant
G/T 44625191 missense_variant p.Pro80Thr
T/A 44625231 missense_variant p.Glu66Asp
T/A 44625428 intron_variant
T/A 44625433 intron_variant
T/C 44625437 intron_variant
C/T 44625450 intron_variant
A/G 44625514 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_03181.1
MGRTPCTEKQHLFKGAWSKEEDELLINYVNRHGVGNWSSLPKAAGLLRCGKSCRLRWMNYLRPNLKKGNFTQEETDLIIHQHSLLGNKWSQIAACLPGRTDNEIKNYWNTQIKRQLYANGIDPVTHKPLNKETTDTTDPPANSQVSEVATTNEINNNNSSSSFTTDGSNQIRYFNVFLNSKVQIRSDGYSAGDKGECSNNCSGVTIEEAHPQINLNLSLSPPPKPQDFCVNPEWLQSQGQQEERALSARNMNVDGGKRGLCLWCSLGLQSNHACSSKDKGNSDDC*


CDS Sequence:
>Vu_03181.1
ATGGGTAGAACACCCTGCACTGAAAAACAGCACCTTTTTAAAGGAGCATGGTCTAAGGAGGAAGATGAACTCCTCATTAATTATGTCAACCGTCATGGAGTAGGCAACTGGAGTTCTCTTCCTAAGGCAGCAGGTTTGCTTCGGTGTGGTAAAAGTTGCAGACTCAGATGGATGAATTACCTGAGACCCAACCTCAAGAAGGGAAACTTCACTCAAGAAGAGACTGATCTCATCATTCACCAGCATAGCTTACTAGGAAACAAGTGGTCACAGATAGCAGCATGTTTACCTGGAAGAACAGATAACGAGATAAAAAACTACTGGAACACCCAAATCAAACGTCAGCTCTATGCCAATGGAATCGACCCTGTGACCCATAAACCACTCAACAAGGAAACCACTGACACAACAGACCCACCTGCTAATTCTCAAGTGTCTGAGGTTGCCACCACAAATGAGATTAACAACAACAACAGTAGTTCCAGCTTCACTACGGATGGCAGCAACCAAATCCGCTATTTTAATGTTTTTCTCAATTCAAAGGTGCAGATCAGAAGTGATGGTTACTCAGCAGGTGATAAAGGTGAATGCTCGAACAACTGTAGTGGTGTTACCATAGAGGAAGCTCATCCTCAAATCAACTTGAACCTTTCCTTATCTCCACCACCAAAGCCCCAAGATTTTTGCGTGAACCCTGAATGGCTGCAATCACAAGGGCAACAAGAAGAGCGAGCTTTGTCTGCAAGGAATATGAATGTTGATGGTGGTAAACGAGGTTTGTGTCTGTGGTGCAGTCTAGGGTTGCAAAGTAACCATGCTTGTAGCAGCAAAGACAAGGGTAACAGTGATGATTGCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_03181::LG1:44625772-44627772(-)
TTCTTTAATTTACATTTATTTTTATATGTTAAAAAATGTCTAATATATTTTAAAATATTAGAATAAATATACATTGGTATATTTTAAAGTTCATACTAAATGAATAAAGATATAGCAGATAAATAATACTAAAAGTGACATGTTTAAATTTCTTTCTTGATATTTAAAAAAGGTGAAATATGAAAAAAAGTAATTATTAAAGAAAAATGGAAGTATATCCATATCAAAAATTTTCATATTTTTTATGAGAAAAATTATTATGTTAATAGTTAATTTAGCTTTCATTTATAGAAAATAATATAGGTGGTTTAATGTTCTATTTTCATGTATTTGTTTAATTTTTTTCTTCCCTAACAAATATAGTTTGTTCATATTTCGTAAAGTGTAATCTTTAGGGTTAAATATGTTTTTGGTCCCTTAACTTTCAGCGAAAATTGGAATTAGTCCCTCTTCAAAACTTTGGACTAATTTAGTCCCAAACTTTAAAAATGTGTGAATTTAGTCCTTTTAACCAAATTTTGTTAACGTTATTTGATGTTTCAAACGCATTTATCAGTGAACGTTGAAGCAAAAATGTGTCAAACAGTGTAAACAACTCAAATGCTATCATGAAACGCACTTGAAACATCAAGTAAAGTTAACAAAATTTGGTTAAAAGGACTAAATTCACACATTTTTAGAGTTTGGAGACTAAATTAGTCCAAAGTTTTGAAGAGGGACTAATTCCAATTTTCGCTGAAAGTTAAGGGACCAAAAACATATTTAACCCTAATCTTTATTCTGAGTTTGGTGTGGTCTGCTCATATTTTATATTTTTTATTTTATTTATTTTTTAATAAATTTCCATACATAAGAGACATTATAATCTTTACATAGTTGATATATCAAAGTAAATAATGATATATAACCTAACCTTATTTGAAAAAAAAAACCTGAATTTATCTTTTAAATCAAAATTCTTATTTTGATATCTATTGGAAGTCTCACGTCGACATCGACTAGAAATAATGTTAATTTATAATATATAAGTAAGTGCAAACCTTATCTTATAAACTGATTTTTTTTTGTTGAGTTAGGTTTAAAGTTCATTTCTTAATATGGTATCAGAGCTATAGTTAGAGTCTATCCTAGCAATATTTGTTGTTTGTTAGGCATATTGCTTCACCCATTATCGGATCACCCATTAATGTCTAGTCTCACACTCGAGATGATGTCTATATCTCGGCCACATCAATTAGAGATAAGGCCAAGCCAAGTGGGTCCAAACCTCACCTTATAAGTTGATTTTATGGGATTGAGTTAGACTTAAAATCCACTTCTTAACAACATCCCATAAATTTTTACATTCATTTTATATTTATTATTTTACTTTAAAAAAAAATTTCTATACAAAAAATATAAAAGTTCATTTTCTAATTACTAAACTATTTTTAAAATTGAATTGTAAAGTGACGTATTTAGTGTAAAAAACATTATATTCAATGTTTTCTTGTTTACTTTGCATCCCTCTGTATGTCTTCAAACCATCTGTTTTGATATATTAAAAAAAAAATTAATGTATTTTAAAACATTAAATTAATATACATCTTTATTTTAAAGTTAGAGACAACATCATAAACACAGACAAAAATAACAGAAACGTGACAAAAATTCCAAGTTTGTGCATGTGTATTTAGAAAAATGATGAAAAAGAATTAATAAATGTATAATAATGGTTTCATAAAAGAAGCTTTAGCATGAGTGGAAAGTGTAAATAAAAGACGAGGTGGGAATGGAAATAAAAATAAATGTGGGTAGTGAAGAAAAATGGAAAGAAGTTGAGAGAGAGAAAAAGTGATGCTACCTACCCAGTTGAGCACAAACTTAATTGTAACTGCTCCTCCTTTCTCACCAACTCATCAATGTCTTCTTTTTGAGAAAATGAAGATCCCCAACTGAGTCACTCCATTGCACCTCTTCTTCTATCTTCTCTCTTTCTCTCTTCAAATCTCAAACATCAA


Gene Sequence:
>Vu_03181(-)
ATGGGTAGAACACCCTGCACTGAAAAACAGCACCTTTTTAAAGGAGCATGGTCTAAGGAGGAAGATGAACTCCTCATTAATTATGTCAACCGTCATGGAGTAGGCAACTGGAGTTCTCTTCCTAAGGCAGCAGGTATATTTCTTACAACAATTAAAGATATAGATTTTCTTGTTGATCTTCTTTGATCAGAATTTGAAGTAAAAGCTAACACATATCAGTTTGTATATCATTGAAATGAAACTGTAACAAAAGAAAATTGCAAGAAACAGTAAAGAAAACGTATACAGAATTTGATATAGATCGAATGTGTATTCTACAATAGAATTTCAAAAATATTTAATAGAGGGTATCTGAAAATCTGAGTTTTGTCTTGAATTCTCATTCTGAAAAACTCACTCAGAAGTTTCAGTGTTCCTCTTTATGCAGAAATGTATGTATGTGGAATTCTAATTAATGGATTGATTATTTGCACAGGTTTGCTTCGGTGTGGTAAAAGTTGCAGACTCAGATGGATGAATTACCTGAGACCCAACCTCAAGAAGGGAAACTTCACTCAAGAAGAGACTGATCTCATCATTCACCAGCATAGCTTACTAGGAAACAAGTATGAACACAGACCAAGTAATTGTATATATGCATATTCATTGAAGTATCTCATTCACGTCATATAACTGACTGTGCACTGAATAATTGTTTAATTTTAGCAGTTCTACAAGTTATTGCCAAAAATAATTGTTTAAATAATTGCCAAAGCTTTTGGTGTGTGTATGAATTGTGTTCGTTACTCTCTAATTTTAATTGAAGAAACAGTGTCAACCAAACAATGAACCATGCGTAGGGTTCTTCTGCTTAAGTTTTGCGATGATGAGATAGATTTGAGATGGGTTGATGATGTTTTGTGCATTTTATTATGGTTTCTCAGGTGGTCACAGATAGCAGCATGTTTACCTGGAAGAACAGATAACGAGATAAAAAACTACTGGAACACCCAAATCAAACGTCAGCTCTATGCCAATGGAATCGACCCTGTGACCCATAAACCACTCAACAAGGAAACCACTGACACAACAGACCCACCTGCTAATTCTCAAGTGTCTGAGGTTGCCACCACAAATGAGATTAACAACAACAACAGTAGTTCCAGCTTCACTACGGATGGCAGCAACCAAATCCGCTATTTTAATGTTTTTCTCAATTCAAAGGTGCAGATCAGAAGTGATGGTTACTCAGCAGGTGATAAAGGTGAATGCTCGAACAACTGTAGTGGTGTTACCATAGAGGAAGCTCATCCTCAAATCAACTTGAACCTTTCCTTATCTCCACCACCAAAGCCCCAAGATTTTTGCGTGAACCCTGAATGGCTGCAATCACAAGGGCAACAAGAAGAGCGAGCTTTGTCTGCAAGGAATATGAATGTTGATGGTGGTAAACGAGGTTTGTGTCTGTGGTGCAGTCTAGGGTTGCAAAGTAACCATGCTTGTAGCAGCAAAGACAAGGGTAACAGTGATGATTGCTGA