Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02991 LG1 42622909 42627127 PREDICTED: probable inactive receptor kinase At4g23740
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 42622992 3_prime_UTR_variant
G/A 42623019 3_prime_UTR_variant
G/A 42623098 3_prime_UTR_variant
C/T 42623134 3_prime_UTR_variant
A/T 42623146 3_prime_UTR_variant
C/G 42623154 3_prime_UTR_variant
T/C 42623160 synonymous_variant p.Glu621Glu
C/T 42623373 missense_variant p.Met550Ile
A/G 42623490 synonymous_variant p.Thr511Thr
A/T 42623502 synonymous_variant p.Pro507Pro
T/C 42623592 synonymous_variant p.Pro477Pro
A/G 42623781 synonymous_variant p.Ala414Ala
A/T 42623921 intron_variant
C/T 42623946 intron_variant
T/C 42623955 intron_variant
T/C 42624054 intron_variant
G/A 42624331 intron_variant
G/A 42624431 intron_variant
A/T 42624579 intron_variant
T/C 42624598 intron_variant
A/G 42624691 intron_variant
C/T 42624708 intron_variant
C/T 42624714 intron_variant
T/A 42624794 intron_variant
A/T 42624795 intron_variant
T/A 42625156 missense_variant p.Glu297Val
T/A 42625190 missense_variant p.Asn286Tyr
C/T 42625350 synonymous_variant p.Ala232Ala
G/T 42625410 synonymous_variant p.Ala212Ala
A/G 42625455 synonymous_variant p.Ser197Ser
G/T 42625615 missense_variant p.Thr144Asn
T/A 42625940 missense_variant p.Met36Leu
T/A 42626100 5_prime_UTR_variant
A/C 42626168 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/C 42626184 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 42626231 intron_variant
G/C 42626352 intron_variant
G/A 42626414 intron_variant
T/G 42626436 intron_variant
G/C 42626580 intron_variant
G/A 42626620 intron_variant
A/G 42626654 intron_variant
T/C 42626668 intron_variant
A/C 42626671 intron_variant
T/C 42626726 intron_variant
A/G 42626730 intron_variant
G/A 42626773 intron_variant
A/G 42626780 intron_variant
A/G 42626943 5_prime_UTR_variant
A/G 42626973 5_prime_UTR_variant
G/T 42627029 5_prime_UTR_variant
T/G 42627046 5_prime_UTR_variant
G/C,* 42627108 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02991.1
MWEGSGEPLEDKEALLEFVNKFPPSRPLNWNESSPMCASWTGVTCNEDRSRVIAIRLPGVGFHGTIPPDTISRLAALQTLSLRSNVISGPFPSDFSNLKNLSFLYLQFNNLSGPLPDFSSWKNLTVVNLSNNHFNGSIPVSLNTLPQLSGLNLANNSLSGEIPDLNLSRLQVLNLSNNNLQGTVPKSLLRFPESAFSGNNISFGTFPPVSPAPQPAFEPALKSRRRRKLSEAALLGVVVAAAVLGLLAFVSLTFVCCSRRGEEDEETFGGKLHKGEMSPEKAVSRNQDANNKLVFFEGCNYAFDLEDLLRASAEVLGKGTFGTAYKAILEDATTVVVKRLKEVAAGKKDFEQHMEIVGSLKHENVVELKAYYYSKDEKLMVYDYHSQGSIASILHAKRGEERVPLDWDTRLKIALGAARGIARIHVENGGKLVHGNIKSSNIFLNTKHYGCVSDLGLATISSSLALPISRAAGYRAPEVTDTRKAAQPSDVYSFGVVLLELLTGKSPIHTTGGDEIIHLVRWVHSVVREEWTAEVFDLELMRYPNIEEEMVEMLQIAMSCVVRMPDQRPRMSEVVKMIENVRQIDADPYSSSGNQAEQLKLSQRDSGNSPSTPSYLPRGSE*


CDS Sequence:
>Vu_02991.1
ATGTGGGAAGGAAGTGGTGAGCCTCTTGAAGATAAGGAGGCGTTGCTTGAGTTTGTGAACAAGTTCCCTCCTTCCAGACCTCTGAATTGGAATGAGAGTTCCCCCATGTGTGCTTCTTGGACTGGTGTGACTTGCAATGAAGACAGGTCCAGAGTAATTGCAATTAGGTTGCCAGGGGTTGGATTTCATGGCACTATTCCACCTGACACTATTAGCCGCCTCGCAGCACTGCAAACTTTGAGCCTCAGATCCAATGTGATATCTGGGCCTTTCCCTTCTGATTTTTCCAATCTAAAGAACTTGTCTTTCCTCTACCTTCAGTTCAACAACTTGTCTGGGCCTTTGCCTGATTTCTCGTCCTGGAAGAACCTCACTGTTGTCAATTTGTCCAATAACCATTTCAATGGCAGCATTCCTGTCTCCCTTAACACCTTGCCTCAGCTTTCTGGTTTGAACCTTGCAAACAACTCTCTTTCTGGGGAAATTCCTGACCTCAACTTGTCCAGATTGCAGGTGCTGAATCTGTCCAACAACAATTTGCAGGGAACTGTGCCCAAATCTCTGTTGAGGTTTCCTGAGTCTGCATTCTCTGGGAATAACATTTCCTTTGGAACTTTTCCCCCAGTTTCTCCGGCCCCTCAGCCCGCTTTTGAGCCGGCTTTGAAGTCTAGGAGGCGTAGAAAGCTCAGTGAGGCGGCGCTGTTGGGAGTGGTTGTTGCTGCTGCTGTTTTAGGCCTCCTGGCTTTTGTTTCTTTGACTTTTGTGTGCTGCTCAAGAAGAGGTGAGGAAGATGAGGAAACCTTCGGTGGGAAGTTGCACAAGGGAGAAATGTCTCCTGAGAAAGCTGTCTCAAGGAATCAGGATGCAAATAATAAGCTGGTTTTCTTTGAGGGATGTAATTATGCCTTTGATTTGGAGGATTTGTTGAGGGCTTCCGCTGAGGTTCTGGGAAAGGGAACGTTTGGAACTGCCTACAAGGCAATACTAGAAGATGCTACCACGGTTGTTGTGAAGAGATTAAAGGAGGTAGCTGCTGGGAAGAAGGATTTTGAGCAGCACATGGAGATTGTTGGAAGTCTTAAGCATGAGAATGTTGTTGAGCTCAAGGCATATTATTATTCCAAAGATGAGAAACTCATGGTATATGATTATCACAGTCAGGGGAGCATAGCTTCCATTTTGCATGCCAAGAGAGGAGAGGAGAGGGTGCCTTTAGATTGGGATACAAGGTTGAAAATAGCTTTAGGTGCTGCAAGAGGCATTGCTCGTATCCATGTTGAGAACGGTGGCAAGCTGGTACATGGCAACATCAAATCCTCAAACATCTTTCTCAACACCAAACATTATGGATGTGTGTCTGACCTTGGTCTGGCAACCATATCAAGCTCACTGGCCTTACCAATATCACGAGCAGCCGGTTACCGGGCACCAGAAGTGACAGACACCAGAAAAGCAGCACAGCCCTCAGATGTTTACAGTTTTGGTGTGGTGCTGCTAGAGCTTCTGACTGGGAAATCCCCTATCCACACTACTGGTGGTGATGAGATTATCCACCTTGTGAGGTGGGTTCATTCAGTTGTGCGTGAGGAATGGACAGCTGAAGTGTTTGACCTGGAACTGATGAGATATCCAAACATAGAAGAAGAGATGGTGGAAATGTTACAGATAGCCATGTCATGTGTGGTGAGGATGCCGGATCAAAGGCCTAGGATGTCTGAAGTTGTCAAGATGATTGAAAATGTGAGGCAGATTGATGCAGACCCTTATTCATCGTCTGGGAACCAAGCTGAACAACTCAAGTTGTCTCAACGTGACAGTGGTAACTCTCCTTCCACTCCCTCCTACTTGCCCAGAGGAAGTGAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_02991::LG1:42627127-42629127(-)
TTTTAATTTATCATTCCGTTCTAATTTTTAATTTTGAATAAATTGATTCACAAGTATTAATCTTCATTCTTTAATTTTGTGAGATTAAAAATATCAGTTTGCCTTGTTAAATTAGTAATAAATTGATAGATTTTATTCATATTAAAAAAAGTTAAAATAAGTCAATTCGATTTACATCGGTCAACTCATCATAAATTGAGTTAAAAATAAATTTCTTACTTTTTTATTAGTTAAAAATTTTATAATCAAGTTCAATTCATATTTTATAGATGAATTAGTAATTTGACTCTTTAATAACATTTTATTCTTTTAATTTATTTTGTATATTTATTACAATACAATCAAAATGATTGATTTCGTTATTTTCTATAGTATTATAACTAAAGTGTTCAACTATTTTATAAAGCATTATTATTAATATATTATTTGAAAATTAAAGCATTAACCTAAATAATTTAAATAAACAAATAATTAAATCTCTAAACTCTTCAAATATTATTAGAGATTAATCTAGTATTTAAAAAATAAAAATATCAATATACACAATTGAAAGAACTAAATAATCATAATAAAAAACTTATGAAAAAAATGATAAAAAACTAAGATTGCTATTGAAGAATTACCAATCAACTTATTTTTAACTTAATTCATATTCATTTAATTCATAAATTAGGTTGAATTTAACCACATTTAAAAAAAAAAAACTATTTTTTTTAGCTCAAATGTATAATAAACAAGATTATTATAGATTTGATAACCCATTTTCCCCTCTCACCCTACAAACATTGTGTTCTTTTTAAATTCTCAATAACAAAACATTTAATATAATTTTAAAAGTATTTATTATAAAAGTTAATATATAACTGTATACAAGAATTTGTATTAATTTCAATATATTGTATTAATTTTAATATATAACTGTATACATTGACTCATAGTTTAAAAAAATGTTTATATAAATAATTAAAAGCTATTAAATGGCTAAAGTTGTCCATCAGTATTAATGATTTGACCGAGGCATTTTGCAATCACAAAATAGCAATAGAAGTTTTCAAATTAAAAAAACAGTAAGATAATATTTAACATGTTTTATTATAGTTATAATTCACATTTTACAAAATTGTAAATTAATACTAAAGTTTGAGTTATATTTTAAACAATAAACCATTGTAGACTAAAATAAAAGAAGTCAAACATATTATTAACTGAAAATTTAAAATATATACTTAATTTATTTATAAATATGTTAGTATTAGAGATTACATCCACAAATTATTAATTAATATTTCTAATATTTAAGATCTATTGATGCTGACTAATAGTATAAGGACACTCATTCTACTACAATAAAATAGACAATCAAATGTGAAAAATTTCAACACATGTACTAGTTTGACCCCACTCAACTTAATTCAATTAGTAGAATATCTAATAGTATAGTATTTAAATCTGAAAACATTCGTTTTTTTAAGAAAAAGGAAAAGGTCATGTAACAATTTGTATAATTATGAAATAATTTTAACAAAAGTTAAATTTTGTATTTTTAAAGAAAATAAAAGATAAAAAATAGTAAGAGATAGTGTCAAATAACTGTGAAAGAATATTCTGCTGTCAAAGTAGTATTATCTTTAAAAAAATTATCCAAAAGTTCTTAATTTTTATAAATGTCAAACTGATTGATCAATTAAAAAAAATGATTTTATTCTTTTAAAAAAACTATCCATAGTGCCATTTTACACAATTTCCCCTACATTCTGATTAGATACTAGATATAAACTCCACAGTTTAATTCTCTAATTAATTAAGAATCTAATAATAATCTTAAACAATTGGAACAAATTAAAGTCGAAAAGTAAATCCAAAATGAGAGACAGAGTGGTTGTTTTTTATCTTTGGAAGCCCAAAAAACCGAAGGAAATAAGAAGGAACCCACATGTCAATCTCTAATTCGTCCACGTCAGTAATCCCTATAAACCCATATCCCCATCAACATAGGAACA


Gene Sequence:
>Vu_02991(-)
GCGGTTTTCCGTTCCAATCCTTAATCCTTATTCTCTCCAATCTCTCTCCGCATTCACTCTCCACTTCTTACTTAGTGTTATAGCCATTAAGCTCCATGCGTGTATCTGTTACTGTTTCAGACGTTCCATTTTTTCTCCCCACAGTTACACTCACTGCTCCAAATAGAGCCGTTGCTGAATGCTCTTCAAAATTTCCTGTCTCCACATTCTTCTACCCTTCACAAAATCGCATTTTGCTTACCCCCTTTTCGTTTTGCATTGGAAGGTGCAACTTTTAGCTTGCTAACCTCAGAGCACTGTGAGCATTGTTCCTTAGAAAAACACATCTCGTAGGCTTCTTTTATTTTTTATTTTCTCAACTCTTTTGCATGTTCTCTATGTTATTTAATTATCTTATTTGAATTTGTAAGAGCGCAGAAGGTTAAACTTAAAAGGGTGTTTTGTTTTGTTTCTTTTTCGAAACAAAGAGGACATTCTTTTATCAGATCTGCAAAGAAGATAGAGTGGCTTAGAGCCAAGGAGTTCTAATTCAGCTTCTTTTATCTTCCTATAAAATTTGAATTTTCTCTGTTCGCCATCTCCTCTGAAAAGTTGCTACAGAATAAAGAGCCAAAAGATGCACCATACCTGCTAGAAGTTGAACACATATTATTACTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTAAACAGATTAAATAAATTATGTTTCCCTTTGTTAACTTAAAAACACAACCTGCAAGCTCATTCTTTTATGCACAAGTTTCTCAGTGTCCGCTTCTACTTTCTTAGACAATCTTCTAGGAATCTGATTTCCTTTTCCAGCTTCCACACTTTTTTTTTTAATTTTCATTCTCTTTTTCGGGTTTCCCCTTTGTCTTAAGGGGAAATGGTGCCTTTTTTTTCGTCTAAACTAACAATCTTGCGGTGATTGTTTCAGTCTATGGAGAAATAGTCTTTTGTTGCTGTGTAAATAAGGTAGCAGGAGAAACTTCTCGTTCCTACTGCTGTCAGGAGTGGAAGGAAAATTTGAAATGGACATTCTACCCATTTTATGTTCCATTTCCCTTTTGTGTTTGGTTATGTGGGAAGGAAGTGGTGAGCCTCTTGAAGATAAGGAGGCGTTGCTTGAGTTTGTGAACAAGTTCCCTCCTTCCAGACCTCTGAATTGGAATGAGAGTTCCCCCATGTGTGCTTCTTGGACTGGTGTGACTTGCAATGAAGACAGGTCCAGAGTAATTGCAATTAGGTTGCCAGGGGTTGGATTTCATGGCACTATTCCACCTGACACTATTAGCCGCCTCGCAGCACTGCAAACTTTGAGCCTCAGATCCAATGTGATATCTGGGCCTTTCCCTTCTGATTTTTCCAATCTAAAGAACTTGTCTTTCCTCTACCTTCAGTTCAACAACTTGTCTGGGCCTTTGCCTGATTTCTCGTCCTGGAAGAACCTCACTGTTGTCAATTTGTCCAATAACCATTTCAATGGCAGCATTCCTGTCTCCCTTAACACCTTGCCTCAGCTTTCTGGTTTGAACCTTGCAAACAACTCTCTTTCTGGGGAAATTCCTGACCTCAACTTGTCCAGATTGCAGGTGCTGAATCTGTCCAACAACAATTTGCAGGGAACTGTGCCCAAATCTCTGTTGAGGTTTCCTGAGTCTGCATTCTCTGGGAATAACATTTCCTTTGGAACTTTTCCCCCAGTTTCTCCGGCCCCTCAGCCCGCTTTTGAGCCGGCTTTGAAGTCTAGGAGGCGTAGAAAGCTCAGTGAGGCGGCGCTGTTGGGAGTGGTTGTTGCTGCTGCTGTTTTAGGCCTCCTGGCTTTTGTTTCTTTGACTTTTGTGTGCTGCTCAAGAAGAGGTGAGGAAGATGAGGAAACCTTCGGTGGGAAGTTGCACAAGGGAGAAATGTCTCCTGAGAAAGCTGTCTCAAGGAATCAGGATGCAAATAATAAGCTGGTTTTCTTTGAGGGATGTAATTATGCCTTTGATTTGGAGGATTTGTTGAGGGCTTCCGCTGAGGTTCTGGGAAAGGGAACGTTTGGAACTGCCTACAAGGCAATACTAGAAGATGCTACCACGGTTGTTGTGAAGAGATTAAAGGAGGTAGCTGCTGGGAAGAAGGATTTTGAGCAGCACATGGAGATTGTTGGAAGTCTTAAGCATGAGAATGTTGTTGAGCTCAAGGCATATTATTATTCCAAAGATGAGAAACTCATGGTATATGATTATCACAGTCAGGGGAGCATAGCTTCCATTTTGCATGGTACGTACTACTGTTTTAGCTCATGGCAATCTGTCTTGCAGTTGACTTATGTTCTAATTTGCAATAATGCACTTTAATCAAATGTTAGTAGAGATATGTATTGTCAAATTCACCAATTTAGATGTGCAAAATTCGTCATAAAAATGGATGTGTTGACTATTCAAATTGTTTCTATGCATGTTACGTTTCTGGCTAGTCACTGACAAGTATGTATAAGTGTTTAAATATGAAGTCTTCTTACACTTTTTTTCGAAAAACTTCATTGGCCCTCCAGTGAATTTGACTCATCTAAAATGAAGACTGTAAAGTGAGAAAGTAAAGCATTTCCATGGTTTTAAACTAAAGTATTTGGTAGAAACGAGTCTTTTGATTATTCAAATTATCAAATAGCTTCAGTTACATCTTCATTCCTATGACTTAGTTATTGTCACTGACAAGCATGCCTGTATGTGTAAAGTCCAAGACCGTATTCTACTTCTTATGACTAATTTAAAATAAAGATTGTAAAGTGAGAAAGTAGGGTATTTTCATTGTTTTAAATTAAAGTACATTGAAAAGTTAACTCATTTGAAATCATCAGTGAATACAACTTTACTTCCTTTTACGTCTTCTTCTAATAAATCACACATAATTTTACTTTAAAGGAATTAAATTCTCTTTCTCTACATTAAACTTTGAGCATATACTTCCATAACGTGCTGATACATTTATCGCATTTTATTCTCTCTGATTTCTCGCATTTTAACTTGTATCGAGCAAATCAAATCCTTATTGGTATGTTATGATGTTTTGAAGTGTGACTGTTATTTGACTTCATATTATTTACAAATGGTAGTTAAAGTTATTCAAGTACTCAAATATTGAACATGCTGTATTTCAAAAGAAGTCAAGATTCAAACGATGCAAATAAACTGTTTGTCTTGAAAATGCTAGTTTGGTACATTCTACACATTACACGACTAACCACATCTATTATACACTGTCCTTACATGTAAAATGCATTATTCTTTCTGAAAATTTCAGCCAAGAGAGGAGAGGAGAGGGTGCCTTTAGATTGGGATACAAGGTTGAAAATAGCTTTAGGTGCTGCAAGAGGCATTGCTCGTATCCATGTTGAGAACGGTGGCAAGCTGGTACATGGCAACATCAAATCCTCAAACATCTTTCTCAACACCAAACATTATGGATGTGTGTCTGACCTTGGTCTGGCAACCATATCAAGCTCACTGGCCTTACCAATATCACGAGCAGCCGGTTACCGGGCACCAGAAGTGACAGACACCAGAAAAGCAGCACAGCCCTCAGATGTTTACAGTTTTGGTGTGGTGCTGCTAGAGCTTCTGACTGGGAAATCCCCTATCCACACTACTGGTGGTGATGAGATTATCCACCTTGTGAGGTGGGTTCATTCAGTTGTGCGTGAGGAATGGACAGCTGAAGTGTTTGACCTGGAACTGATGAGATATCCAAACATAGAAGAAGAGATGGTGGAAATGTTACAGATAGCCATGTCATGTGTGGTGAGGATGCCGGATCAAAGGCCTAGGATGTCTGAAGTTGTCAAGATGATTGAAAATGTGAGGCAGATTGATGCAGACCCTTATTCATCGTCTGGGAACCAAGCTGAACAACTCAAGTTGTCTCAACGTGACAGTGGTAACTCTCCTTCCACTCCCTCCTACTTGCCCAGAGGAAGTGAATGAAAGAAAGGTGTCACCTTTGTTTGATTTCAGTGTTTGTCCATTTTTAGAGCGTGGTTATCATTATCACTACTATTTTTTCTGATATTTAAGTTGCTATTAATTATTAACTGATTTGATCCTGGTAGAAGAGTACCATGCCCTGGTATAGCAAGAAGTGGTCATAATGTGAAGCATTCCTTTTGTGTGTGTGAACTGAGACAGCCTTTACTAAGGTGTACCTTTACCTTTAACTATTGTTTTTCCCTTGC