Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02919 LG1 42035355 42041450 serine/threonine-protein kinase HT1 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, root epidermal cell differentiation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, root epidermal cell differentiation, signal transduction, root epidermal cell differentiation
Cellular Component   is active in   cytoplasm
Cellular Component   located in   cytoplasm, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, cytoplasm, cytoplasm, nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   ATP binding, protein kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, ATP binding, protein kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 42035384 5_prime_UTR_variant
G/T 42035392 5_prime_UTR_variant
A/C 42035394 5_prime_UTR_variant
A/C 42035398 5_prime_UTR_variant
T/A 42035627 intron_variant
T/A 42035677 intron_variant
A/G 42035680 intron_variant
T/G 42035682 intron_variant
G/T 42036301 intron_variant
T/A 42036706 synonymous_variant p.Arg95Arg
G/T 42038385 downstream_gene_variant
T/A 42039492 downstream_gene_variant
G/T 42040467 downstream_gene_variant
C/T 42040477 downstream_gene_variant
G/A 42041399 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02919.1
MLEGGAKFPGIIDLNKNNNNYYDFSQGFYHKLGEGTNMSIDSVGSLQTSNGGGSVAMSIDNSSVGSNDSHTRMLDHQGLRRRANDNYSVAHSANRRGRVTHALSDDALAQALMDNSSPTEGLDNFDEWTIDLRKLNMGEPFAQGAFGKLYRGTYNGEDVAIKILERPENDPAKAQLMEQQFQQEVMMLATLKHPNIVRFIGACRKPMVWCIVTEYAKGGSVRQFLMKRQKRSVPLKLAVKQALDVAKGMAYVHGLGLIHRDLKSDNLLIFGDKSIKIADFGVARIEVQTEGMTPETGTYRWMAPEMIQHRPYTQKVDVYSFGIVLWELITGMLPFQNMTAVQAAFAVVNKNVRPIIPNDCLPVLRDIMTRCWDPNPDVRPPFAEVVGMLENAETEILTTVRKARFRCCITQPMTAD*


CDS Sequence:
>Vu_02919.1
ATGTTGGAAGGCGGTGCGAAATTCCCGGGAATAATAGATCTCAACAAAAATAATAACAATTACTATGATTTCTCTCAGGGCTTCTACCATAAGCTTGGGGAGGGTACCAATATGTCAATTGACAGTGTTGGGAGCTTACAGACAAGTAATGGTGGCGGATCTGTTGCGATGTCAATTGATAATAGCAGTGTTGGGTCCAATGATTCCCATACTCGCATGTTGGACCACCAAGGGTTGCGGAGGCGTGCCAATGACAACTACTCTGTTGCACATAGTGCCAATCGTCGTGGAAGAGTTACCCATGCTTTGAGCGATGATGCTTTAGCTCAAGCTCTAATGGACAACAGCTCTCCTACTGAAGGGCTTGATAATTTTGATGAGTGGACAATTGATTTGAGGAAACTCAATATGGGTGAGCCTTTTGCACAAGGAGCCTTTGGGAAACTCTACAGAGGTACTTACAATGGTGAAGATGTTGCTATTAAAATATTGGAGAGGCCGGAAAATGATCCAGCAAAGGCTCAATTGATGGAACAGCAATTCCAGCAGGAGGTCATGATGTTGGCTACTCTAAAGCATCCTAACATAGTTCGATTCATTGGCGCATGCCGTAAGCCAATGGTGTGGTGCATTGTGACCGAGTATGCTAAGGGTGGTTCAGTTCGACAATTTTTAATGAAGCGGCAAAAGCGATCAGTTCCCCTCAAATTGGCTGTCAAGCAAGCTTTGGATGTTGCAAAGGGGATGGCTTATGTTCATGGCCTTGGGTTGATCCACAGGGACTTGAAATCTGATAATCTTTTGATTTTTGGTGACAAGTCAATTAAAATTGCTGACTTTGGAGTTGCCAGAATTGAGGTTCAAACTGAAGGAATGACACCTGAGACTGGAACATACCGTTGGATGGCTCCGGAGATGATCCAGCACAGGCCATACACACAAAAGGTGGATGTATATAGCTTCGGAATTGTTCTATGGGAACTCATCACCGGTATGCTTCCATTTCAGAACATGACAGCAGTGCAGGCAGCATTTGCAGTTGTCAACAAAAATGTTCGTCCGATCATACCCAATGATTGCCTACCTGTTCTCCGTGACATCATGACAAGATGCTGGGATCCCAACCCTGATGTGAGGCCACCATTTGCTGAAGTTGTTGGAATGCTCGAGAATGCAGAGACTGAGATCTTGACAACAGTTCGGAAGGCCCGGTTCAGGTGTTGCATCACTCAACCAATGACTGCTGACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_02919::LG1:42033355-42035355(+)
ATTAATAATATAAATAAAATTTCATAGAAATTATATTTGTTAAAAGTTTATCAAGAATGATCATGTTAACAACTAAGAATCTACAACCAAATGGCTAAAATAAAAACTTGTACAAGAATGCACATGTTATACATTAAAATCACACAGACAATGAAGCAAAATATATTAATAACTATTATCAATTAATTATCTGTAGAGTGTATATATATAACAAGTATTAAATGTTACATTAATGTTTCTCTGCTTTGCTTATAAATATATATAAATATAAACTGATTAATTATCAATCAATGCACACACATATTTATTATACTTTTACATAAAAATTTATTACGTATTGAATTGTGTGAGAAAAAAAAATTTAAGTAACGTGAAAGAAAACGTAGCAGTTTCACAACTTTATTGTTTAAAATTTAAATAATGTATTAACTGATAATAAATGCACATTTATCTTTATATATATTTAATATTTATAGTTGTTATGTGCATTTATTCCCGTCTTGACGGTGGAAGAAAAAGACAAATAGTGGGGTTAGCAATGACATAACGGAGGTAGGTTTTTGTTCAAAAAGTCAAGAAACGTAAAAACGCACAGCGTACTTAACGGGATGCACAAAAAATGTGAGTGCGCCTTGGGTACTTGCTAACCCACATTGTGTCTCACGAATGCTTAACTTACTTTAACTTCTTTATATTCACAAAACAAAATTAATATTTTAATTATATATATAAATAATTAATTTCAAGAAATTATTGATGATTTATAGGAGTGTATTATTCTTCATTTATATTATTTTTTGTTATTTTTGTATTTTTAATATTAGTATTTAGTGCATATATTATTTAGTTATAATAATAATAATTTTATTAATTTTATATTAACATATAATTATATTAATGACACACTATACAATCAAGATTAATATATATTGTTAATTTGAAAAGTAAGATATCACAAAAAAATTATGAAAGTGAAAATTTCAATAAAAACTCATTTTCAAGTTACTCAAAAGTTTATTAGATAATTTTTAAAGAGAATGATTAAAAATGAAATTATTATTTTAGTGCAAGTTTCACTTGCTTAAAAAATAAAGGAATACTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTCATTAATCTAGCTATTGTTGCTAATACTAATAGTATATAAATAAAAATATTATTTTAATTTGATATCATACACATATATTATTTATACTGGCAATTTTCTTTAGTTTATAATCAATTTACTTTAATTTTAGCATTTCATAAGTACAAATTTTGTATTAAAATATTTATATTTGAAATAAATTACATTCTAATAATTTTTTTCCTAAATTTAAGTAACTTATATGTATTGCTAAAATTATTATATATAGTTTTGATTTAATTTTTATAGATTTAAATTTGTGATATCAATTGTAAGATTTTTTTACAATTTTTATGTTTTATTTTATTTTTTATATTTTAAGAATAAAAGGTCTTATTTAATACAAACTATATTAAGTTTTATATTATGCTAACTTAATTTAATGAGAAAAAATTTGTAAGATTTGAATTATATATTTTTTTAAAAATGAGTATGAACAATAATGAAAATAACTTAAATAATTTCCATAAGAAATATGTGTAAACATTTTTTAATTTTTACATATTATTCATTTAAGATTATTATTTTTATGTAAATATTATTTATAATTTTTAAAATATTTATATATCATAAGAAATATTTCTTTACTCAATTACTTGCATGACTTATAAAATAAGATTAAAGATCGTAAAATATATATTTATTTTAATAACTAAATAAAAAGCGCTATTGTACATATATTTTACAAAAAATTAAATTAAGAAAGTAATTGTAAGAATCCTGAGATGAACTGTGTTCAGAGGAGTGACGTGTAGAGAAGAGAGTTTATTTAATAATGTTACAAGTAAATAATAAATAAAAAGAATAAAAGGAGTGAAGAAAAAGAAGCTATGAAG


Gene Sequence:
>Vu_02919(+)
GACTTAGAATGTTAGAAGAGGAGGGGAAAAAGACTAGGCATATAAAAACCTGATAAATAAATAGAAAAATCAAAAGAAAGTCATCCATTTCATTTCCTTCTGCCTTCTTCTCTGGTCTCTGGCTTCCTTTGTACGGGAAGAACTCAATCTTGTCCATTTCCGTTTGTTTTTTCTCTCTTCGATCTCTCCACCTTCCTTTCGACGACTCTCTTACCACAGCTCGTGTAGTTAACCTGAGCCCTCTCCCTTGAGGTACGCGTTTCCGCGTCTTCTTAACCTTTTGCTTCTAAACCCTTTTCAGATTTTAGGGTTTGTTCATGTTTTCACTCTTTTCTTTCTTTTTTGTAAGATCAGTGACGGCTTCGTCAATATTTGTTTGAGATTTGACTGCAAAGCTGGTTTGGGAGGTTTTAGTGTTTTCTATATATAGTTTTTTTGATTTTTTTAATTATTGACTTGTTTGTGTCTTGTAGGTACTTTGGTCTCTCTGCCTGTTTGTTGTTTTGAGAAATTCTATTTGAATTTTGCTTGCTCTGTGTTTGATGTGTTAGACACGAGTAGCTGCTGGAGTTCCTTGCTTCTAATCGGTGGATTTCATTTAATTGTGGTTAATTTCTTAATTGTTGTCTTGGAAAGTGGTTGTGTTCGGGAGAAGTCTGGGTATGCCTTGATTTGCACAAGGAGAGGCTCGAAAATCTGGTCTTTGCGTGTTTGCTTCTGAAATTTGTTTTGATAGAACGTTATTGGATAGTGGAGGTGTTTTTTATTTGGTGATGATATCTAAACCAGCTTTTGCATGTTTATTTGTTTTCTTCATAAATCTGGGTTGCAATTGGAATAGCACTGTTTTTTTTTTCTCCTTACTGGCATGTTTAATTGATGATGAGGCAAATGCATTCATGAATGTTGTCATTGTTGCTGTTATTAAACTTTTTATGTTGATTGAGGTGCTAAATTCTTATGTGGGTTTGTTTTGGTTTTAGGGTTTCTCCAGGTGTGATTTGATTTACAATCTCTGATGCTGAAGAATAATAGTGCTTGAAGGCTTTGCTCTTCTGTGTGAAAAAATGTTGGAAGGCGGTGCGAAATTCCCGGGAATAATAGATCTCAACAAAAATAATAACAATTACTATGATTTCTCTCAGGGCTTCTACCATAAGCTTGGGGAGGGTACCAATATGTCAATTGACAGTGTTGGGAGCTTACAGACAAGTAATGGTGGCGGATCTGTTGCGATGTCAATTGATAATAGCAGTGTTGGGTCCAATGATTCCCATACTCGCATGTTGGACCACCAAGGGTTGCGGAGGCGTGCCAATGACAACTACTCTGTTGCACATAGTGCCAATCGTCGTGGAAGAGTTACCCATGCTTTGAGCGATGATGCTTTAGCTCAAGCTCTAATGGACAACAGCTCTCCTACTGAAGGGCTTGATAATTTTGATGAGTGGACAATTGATTTGAGGAAACTCAATATGGGTGAGCCTTTTGCACAAGGAGCCTTTGGGAAACTCTACAGAGGTACTTACAATGGTGAAGATGTTGCTATTAAAATATTGGAGAGGCCGGAAAATGATCCAGCAAAGGCTCAATTGATGGAACAGCAATTCCAGCAGGAGGTCATGATGTTGGCTACTCTAAAGCATCCTAACATAGTTCGATTCATTGGCGCATGCCGTAAGCCAATGGTGTGGTGCATTGTGACCGAGTATGCTAAGGGTGGTTCAGTTCGACAATTTTTAATGAAGCGGCAAAAGCGATCAGTTCCCCTCAAATTGGCTGTCAAGCAAGCTTTGGATGTTGCAAAGGGGATGGCTTATGTTCATGGCCTTGGGTTGATCCACAGGGACTTGAAATCTGATAATCTTTTGATTTTTGGTGACAAGTCAATTAAAATTGCTGACTTTGGAGTTGCCAGAATTGAGGTTCAAACTGAAGGAATGACACCTGAGACTGGAACATACCGTTGGATGGCTCCGTAAGATCATTTACTGCTCTCTTTTTTTTTTAATATTAATATGCTTCTTGCATCTTTGTTTCTGGATTTTTGTGGACATCTTCCCTATTATAGTTAACTTTTTAAAGATATTTAATGGAATATTGCTTATATTTCAAATGCTGCTAACAAACTGTTGCTCATTTCTTATAGCTTGTTTTCTTTGTTCCTAATCTGTTGTTTGTGAATTGTGATCCTGGACAGAAATGGCATATACAGCTGAAATAGTAATTATGCAATTTCCTTATGAGACATATGCTTTCAGTGTACAGCTTTTTTTGCTTGCTTCTGGCTTTAATATTGCCTGGCTCTGGTTAACCATGCTATTTTAATTTTAGCTAAATATTTTTCACTATAATTTAATTATGATATGCATTTTTTCTCACATTGTCTTCTTATTATACACTTTCATGCATCAAGAAATGGAAGGAAATCTTCTTCTGTCATTTTTGTTTTGACCCAAATGGTAAGGGCATCTCTACCATTATATCAGACTAACCCTACAGAAAGATAATTGCAATCAGGTTATGGAAGTGAAGCTTGAGTGTAGTCGTCATTTGTTTTAGAAGCAAACTTTAATGATAATGCTATTTTTTGAAAGTTGCCATTATTGGAAGTTTTAAAAATTAGTCTTGGTTTTGGATCCTACTTGTTTATATTCTTCTTAAGTTTTTTCCTTTTTTCTTGTGACTTGTACGCAATTATGGGCTTATAAGTTATTTTTAACAATGGTGCTGTCAATTTTTCTCTCATCCGTTGTCTGTTTTATTTGTGTACCCCAGCCTGCCCAAATCCTTCCTTGGAATATGATAGATGTATTTTGCATCTGTACTGAATAAACAATCAATCTTTTAATCTGACATCAGAAAATTTTGGCTGGATGAATTTGTGAATCTCAGGATACTTTTTTCTTTTGTTTAGTGTTCATATCTTTGTGGCTTGATTTATTTGTGTTGATGCATACACTCTGCTTGCTAGAAGCTACTAACCATGGTACAAATATTTTGGTGGCAGAGTTGGCAATCCTGCTTAGGGGATCATTGACCTTGTTTTTGATACCCTAGAACAATGCTTAAAACCTATTGCTCATTCTTCAGACAAATCCAATATTCATGTGCTTGTCCTATTAGTAAAGTCTTTCCAGTTACTACCCCCCTGTCAACAAGAAGTTAAATGAATCAAAGTGGCCACGGCTTGGTTTTCAGTTAGTGATCTTGTTGTGGTTTAGGGTAAACTGCTATGCCAGAGTGAGGCTAAGTTGTTTTTTGCCACTTTCAGGTATTTTGTAGGGAATTTTTCACAGGGTGAATTTTGTTTCTTGTATTTGAATTGGGGAAGTGAAAGTAGTAGTGTGTTGTGGTCTTTTATGTGTTTATTATTTTAATATAATGGCGTGATTTGGAGACTATGTGGATGATGCTATCAAACAAGAAAAACTAAAATGTCCATAAGTTCTTATTAATTGGGCAGAAGTATTTATAGAAGGGGGAAGTTGGGAAGAAGTGAAGTTGCAGTTTGCGTTTCATTTTGCATGAAACCAATACACTTGGTCTACAGGTGAGTGTTGGGTATGCATTCATATATATTCCCTATAAATACTGACGCGTATACTTACCTGATAGGGTTGTGGCACATGCATCTAGTTGCCTGGCTGGAATGCAATAAGGTAGACAGGATGGTGTAATCTTTAGATAACTTTCATATTCTGTTATGTTTGGTTCAAGTGAAGCATAGATTTTGGTTCAAGAAATATGCTATGGTGCTCTCCTTTAACTAATCCAGCTCTGGGTGACCCAGCTGGTCTGACCTATATTTTCCCATATAGGTTTACATTTGACCCTCCTAGACTGCATTATAAGCTTCATGCTTCATGTGTTGGTTTCTTGTCTTGCTATATTGTTGCCTGCGTAGCCCTGGGTTGAAGCTTAGCAGTTTAACAATGTTGTGGTATTGTTATGAAGTGTGAAACTGTTTGATTATGGGCTATCCTATTACATTCCTGCATTATCTCATGCATATCATGACGCAGGTGGTCATGCCTTGATGGGTCACAGTCATTGCATGATGAGTGAGTTATGTTTCTATTTTAAACTCTTTCATGCTCTCTGCCCCGAAATAGAACCTATTAATTATTTTTTTGGTAATATTTAATGACATGTCTCCCATATCTTTATTTGAACTGTTACACTGTTTGATTAGTTAATTTAACTGTATTGAGCGGTGTGATTTAGTCTTCTTATAGAAATGTTAACATGGAATCTATATGGAGGAGTATAAATAGATAAGATGATTGTTTCTTGTGTCTGACTCAACCAGGATAAAAGACGTGTTTATTGTTGTAATTCTCTAGGTGTCCTGAAGGGCATCTCTTCTATGAAAAGTCAAACTAAGGGGTCATGCTGACCCTTGTAAATGTCAATGTTTTAGTTTTTCTTTTCAAATACATTACAAATATTTTGTTATGCATTTCTAACATTATTTTGGTGTTGCATAAGAGATATTATTAAAACTGTTAAATTTGCTTGAATAAGCTTACTTTATTATGATGATTGTTTTAAGTTTTATTTATCTAAATAAAGAAATACTTTGTGAACTTAGTTGAATTACATTGGTATTGTAATAATATTTACAATAATAGTTGATTTTTGTAATAGCCACTTTAAAAGTCCTGTAGGGTTTAATTTGTTGACAGTTTTACAAGTGCTTCAAAATTAGAATCATTTTATTAACAGCATAGGCTTTTAATTTGATCCTTCAAAATTTCTTGTGATCATTTAAGCCCTCCAAAGATTTTGTCAGCAAATTAATCTATGAAAAATTTAATTTGTTACCATATTAGTTTCCCAGATATTCTTTTTGTTATTTCTTCAGTCCATTTTAGACCACTGAGGTATTATTTAGTGATGGACTAAATCTTTGAGGTGTACTAATTTGGTGACTATGGGTAAGGGAGAGTATTTAAGGCAGGACATTGATTAGTTAGTTTGGGGTGCCTTTAAGGGGAAAGGAGGAATTCAGATGTGTATCGTTCGTAAATTGAGCATTAGTTGTTAGATATTGAGATAACTAGAATGCCATTTAGCTGTTTTTTTAGTGACTTTCTTATGATGATTAATGATATATTTACCATTTTCTTTCTGTCTTTCTTATTTCTTTTAAGACTATTCTCTGCCGAGTGAGGTATGTTGTTAATTTCTAGAACTAGGTGATAATCAATAATAATACCATCTGGGAGATTTATTTATGCTATTTTGTACCAGCAATTATAATGTATATGTATATGGACAGCTCCATTCATGACAACACATAATATTACTGTTCAAGTCGGATTCAGATTCTGCGTTTTTATATTTCTGCTATGACCAAAATCCAGTTATCTAACATGTTTGAAATGTATAAATTCATAATTAGTTTCAAGTGTTATTTGCTTGTTTAAAAGTTAATTTGGTGTAGTATTTAGATATGTTGTTCGCTGATGAACTGCAGGGAGATGATCCAGCACAGGCCATACACACAAAAGGTGGATGTATATAGCTTCGGAATTGTTCTATGGGAACTCATCACCGGTATGCTTCCATTTCAGAACATGACAGCAGTGCAGGCAGCATTTGCAGTTGTCAACAAAAATGTTCGTCCGATCATACCCAATGATTGCCTACCTGTTCTCCGTGACATCATGACAAGATGCTGGGATCCCAACCCTGATGTGAGGCCACCATTTGCTGAAGTTGTTGGAATGCTCGAGAATGCAGAGACTGAGATCTTGACAACAGTTCGGAAGGCCCGGTTCAGGTGTTGCATCACTCAACCAATGACTGCTGACTGATCCTGCGACTGCATATGCAAAAGTCATATAAACATAGACTGGAAAATTTGGGAGCAAGATGAAACTCTGGTAGTGAAGGGTGACTATATAATAGCTTTGTGTATTTGTGTGTTTTATTTATTTCTTCTGAAGAAAAAAAATGAAAATCTTATCTGGAGACCTTTTGCTTATTCGGTTTCTTATTACTGAATGTCTGTTCTGAATTAGTAAAGAGGAGATGGTGTATGTAATACATGCATGTTTTACAGTTATGTATAGCTTGAGTTCAGAAGGC