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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02811 LG1 41000855 41003680 putative wall-associated receptor kinase-like 16
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 41000981 missense_variant p.Gly719Arg
C/A 41000983 stop_lost p.Ter718Leuext*?
T/A 41002665 intron_variant
T/A 41002667 intron_variant
T/A 41002669 intron_variant
T/A 41002671 intron_variant
T/A 41002673 intron_variant
A/G 41002792 missense_variant p.Phe297Leu
A/G 41002799 synonymous_variant p.Asn294Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02811.1
MELKVVTEMQVSLLLLLMMIALARTATAADDQALPGCPNKCGDVSIPYPFGVGVSNITGKNCSFQTDLKLNCTDSTLYVYNIPVLNITLLGQLEMSFLVSSICKVNISNGVTEADIVILNSPSFTISSTENKFMSIGCDTYGLLNSYVNQSTYSTTGCLTLCGDNLENLENMQTNDGKCAGRGCCQVDIPPAMKNIAIQTNTFNNFSNSSDSNSCSVSFVVKKGGYNFSMDHLNRVPFDMTPMIVDWSVGDAPCNVSKDKANYACKSDYSVCEDPPSAGGNGYLCKCKPGFEGNPYFPQGCTDFPDCKRGKHNCARAEYCHETPGSFECLCPDGMIGNATNEGGGCQPKQRADAFTKIVIGAGVGLIALFVGVSWLYLMLQKRRVLKLKEKFFQQNGGIILTQKLSTRRDSSQSTTIFSAEQLNKATNNFDENLIIGKGGYGTVFKGVLSNNQVVAIKKSKIVDVSQVEQFINEVIILSQINHRNVVKLLGCCLETEVPLLVYEFVKNGTLFDYLHKQSQVGNVSWKTRLRIGAEAAGALSYLHSAASIPIIHRDVKTANILLDDNNTAKVSDFGASRLVPQDQTEIATIVQGTFGYLDPEYMQSGQLTEKSDVYSFGVVLVELLTGEEPFSFQRAEDKRSLTFHFVCSLEEDHLFDVLQIGVEDEENKHEIMQVAILAARCLKLRGEERPSMKEVAMELEGIRLMDKYPWTNTSQNFEERQYLLSEAPSIREPGDSSGQQNAGYDSLKELQLIDFGDGR*


CDS Sequence:
>Vu_02811.1
ATGGAATTGAAGGTGGTGACAGAGATGCAAGTGAGCCTCCTGCTGCTGCTGATGATGATTGCGTTAGCAAGAACAGCTACTGCAGCAGATGACCAAGCCCTGCCCGGCTGCCCCAACAAGTGCGGAGATGTTTCAATTCCATACCCCTTTGGCGTAGGTGTGTCAAATATCACCGGAAAAAACTGTTCCTTTCAGACAGACTTGAAACTCAACTGCACAGACTCCACTCTATACGTATATAACATCCCAGTTCTGAACATAACCCTCCTAGGTCAATTGGAGATGAGTTTCTTGGTCTCCTCTATCTGCAAAGTCAACATTTCTAACGGAGTAACAGAAGCCGACATAGTCATACTCAATAGTCCATCCTTCACCATTTCCAGCACGGAAAACAAGTTCATGAGTATAGGCTGCGACACGTACGGGCTTCTAAACAGTTACGTCAACCAATCTACATACTCGACAACAGGGTGCTTGACATTATGTGGCGACAATCTAGAAAATTTGGAAAACATGCAGACGAATGATGGGAAATGTGCAGGCAGAGGCTGCTGCCAGGTGGATATACCGCCTGCAATGAAGAACATCGCTATACAAACAAATACATTTAATAATTTCAGTAACTCTTCCGATTCCAACAGCTGCAGCGTTTCGTTTGTGGTGAAAAAGGGCGGCTACAACTTCTCCATGGATCATTTGAACCGCGTCCCATTCGATATGACTCCCATGATTGTTGATTGGAGTGTTGGAGATGCTCCCTGTAACGTTTCCAAGGATAAAGCCAACTATGCGTGCAAAAGTGATTATAGCGTTTGCGAGGACCCACCCTCTGCCGGTGGAAATGGCTACCTATGCAAATGTAAACCAGGTTTTGAGGGCAATCCTTACTTTCCCCAAGGTTGCACAGACTTTCCAGATTGTAAAAGGGGCAAACACAACTGCGCAAGAGCAGAATATTGTCATGAAACTCCTGGCTCTTTTGAATGTTTATGTCCTGATGGAATGATCGGAAATGCAACAAACGAAGGTGGAGGATGCCAGCCAAAGCAGCGGGCTGATGCATTTACAAAGATCGTCATTGGAGCAGGTGTAGGATTAATTGCTCTCTTTGTGGGAGTTTCTTGGCTGTACTTGATGCTCCAGAAAAGGAGAGTCCTCAAACTAAAAGAAAAGTTCTTTCAGCAAAATGGGGGCATAATTCTAACACAGAAACTCTCTACTAGAAGAGACTCGTCTCAATCCACCACAATTTTCAGTGCCGAGCAACTCAATAAAGCCACCAACAATTTTGATGAGAATTTGATCATCGGCAAAGGAGGTTATGGAACAGTTTTCAAAGGAGTTCTCTCAAATAATCAAGTTGTCGCTATCAAGAAGTCCAAAATAGTGGACGTGAGCCAGGTGGAGCAATTCATCAACGAGGTCATTATACTGTCACAGATTAATCACAGGAACGTGGTCAAACTCCTAGGTTGTTGTCTAGAGACAGAAGTTCCTTTATTGGTGTATGAATTTGTTAAAAATGGCACCCTTTTTGATTATTTGCATAAACAAAGCCAAGTGGGTAATGTATCTTGGAAAACGCGTCTAAGGATTGGCGCTGAAGCAGCTGGAGCTTTGTCATATCTACACTCAGCAGCTAGCATACCCATCATCCATAGGGATGTGAAAACTGCCAACATACTCTTGGATGACAATAACACTGCCAAAGTTTCTGACTTTGGAGCTTCGCGATTGGTTCCGCAAGACCAAACTGAAATAGCCACAATTGTGCAAGGAACCTTTGGGTATTTAGACCCAGAGTACATGCAATCAGGCCAATTGACTGAAAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTAGTGCTTGTAGAACTGCTAACTGGGGAGGAGCCTTTCTCTTTTCAAAGGGCAGAAGATAAACGAAGTCTCACATTTCACTTTGTATGTAGCTTGGAAGAGGATCATCTATTTGATGTTCTTCAGATTGGTGTTGAGGATGAAGAAAATAAACACGAGATCATGCAGGTTGCTATTCTTGCTGCCAGGTGCTTGAAACTTAGAGGGGAGGAAAGGCCTAGCATGAAGGAAGTGGCAATGGAATTGGAGGGAATAAGGCTTATGGACAAATATCCTTGGACCAATACAAGCCAAAATTTTGAGGAGAGACAATACTTGCTTTCTGAGGCACCAAGCATTCGTGAACCTGGTGACAGTAGTGGCCAACAGAATGCTGGATATGATAGCCTGAAGGAACTTCAATTAATTGACTTTGGTGATGGAAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_02811::LG1:41003680-41005680(-)
TTTGAATTAAGTATACAATAAATAATAAAATTTTGACTTTAATTCTTTGAAAAAATAATATATTTATATTTTGTTCTTATTATTGTTACTCATTTTGATTGCTTCCCTCTATCTCTCACACTACGAATAATCAGTTTATATTCAAAATAACTTTGGAAAAGTTATTTCTTATATTCATTTTTTGTGTTTTTGAAATATAATAGTCACCGATTAATTAATTATCATAATCATAAAAAATAAATATTTTAAAAGTATTCATAATTTCTTAAAAGTAACTTAATTGCTCTTATTTATTTTTACGGTAATTATTTACTGTCAAAATTTCATTAAAATACATATAAAGACAAATGAATAATTTTAAATATTAATTAAATGGTTTTAAGTCTTGGTCAAGCTATAACATGTAGCTGATGTACGACTATCCCGGTGTGAATAAAACGAAGTGTAACATCGATCATTAATTTTTTTTTAAGTTAGTCTAAATTAATCTATTATTTCAAAGCTACTTTAAATTTTATTTTTTAAAAGCTATACTTTAAATTTTCTAACTTTAATATTTATTTATGTATTTTCATATTTTTCCCCTTTATTATCATAATTAACTTTTTATTTTGATATTAATTAAATTTAACCTACAATTAATATTAATTTCAATTTTAAAAATAATAAATTAAAAAAATTAGACATTTAAAAATAATATGAATAAAAGATTAGAAAAGCATAAAGAAATCTTAGGATAAGAATATGGCAGTAGAAACCTTCTTCTTTCAAATGATAAATTTAAGAGAGAGAGAGTAAGTAAATGAAATTGAAAAAAAAATTGTATTGTTTTAAGGAATGAAGAGATGAAAGTGAAAAAAATTTGAAAATAAAGTTTTAGAATAATTTGATAGATGTAATAAATAAAAAATTGTTTTAATATATAAACTTGTTAGATTATAGTTTTACCTCTATGATTAAAATTATATAAATAAAATGTAATTATTATTAGTTTTAGTATTATTAATATTATTATTATAATAACTATTATTATCAATAATGTTATTACTAATATAATTAACATCACTAATATTATTATTATTAATTATCCACGAGCTAAATTGGAATTTAAAGGAAAATGATGACATTTGAGTAAAAGCATAAGTGATAGGTTGAAATTTAAAGAAAACTGATGAACATTTAAGTAAAACATAAGTGTTGAGCTGATTAAAATATTTTATTCCCCTTAAATTTATTTGCCAAATCAGCTGTGACCTTGCCAAAATTTTTTAAATTTTAAAACCACGAGGTCAACCAGTTTGAAATTATTCAAGAAATTTCATAAACATATTTAAAGGAGTGAGAAAAATATGAAAAAAGAATCAATTTCCAAGTTAATACGTAAACTAAAAGTTAGACCTTAAAACACTAAAATAATTTTTTATTTTCTAATACATAGTCGATATGTTTTTCTAGGTATTCAATAATTTTTTTTAAATAAAGTATACATAATAAATGATAAAATTTTGATTTAAGTCTTTGAAAAAAATAATATATTCATATATTTTGTTCTAATTATTACCAGTCATATTTATTAAAAGGTATTCAAAATTTCTTAAAATAACTTAATTCCTCGTATTTATTTTCTACAGACGTGTCTGTAAATATTGCCTTCCAAAATTTCATTAAAAAAAATAATATTAGTTAAAAGGTTGTAAGTCTTGGTCAAGCTAACGAGTAAAATTACGTGTGACATGTTTTTCAAAGTTACTAATTTGACTGTTTTGTTGTTTTTGAAGTTCCTAATTCTAATATGAGCATGAAAAGTACGAGTGATGAGATAATAACAACATATGAAGAGTTGTCTGACTGAGTCACATAAACTTTGTACAACCAAACAAAACATTCTGATTCCAAACTGAACCGTTGTTGAAAACAGCGGCATTTTAGTTACTATAAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGCAAAGACTTTAGCTTATAGCTTACTATACA


Gene Sequence:
>Vu_02811(-)
ATGGAATTGAAGGTGGTGACAGAGATGCAAGTGAGCCTCCTGCTGCTGCTGATGATGATTGCGTTAGCAAGAACAGCTACTGCAGCAGATGACCAAGCCCTGCCCGGCTGCCCCAACAAGTGCGGAGATGTTTCAATTCCATACCCCTTTGGCGTAGGTGTGTCAAATATCACCGGAAAAAACTGTTCCTTTCAGACAGACTTGAAACTCAACTGCACAGACTCCACTCTATACGTATATAACATCCCAGTTCTGAACATAACCCTCCTAGGTCAATTGGAGATGAGTTTCTTGGTCTCCTCTATCTGCAAAGTCAACATTTCTAACGGAGTAACAGAAGCCGACATAGTCATACTCAATAGTCCATCCTTCACCATTTCCAGCACGGAAAACAAGTTCATGAGTATAGGCTGCGACACGTACGGGCTTCTAAACAGTTACGTCAACCAATCTACATACTCGACAACAGGGTGCTTGACATTATGTGGCGACAATCTAGAAAATTTGGAAAACATGCAGACGAATGATGGGAAATGTGCAGGCAGAGGCTGCTGCCAGGTGGATATACCGCCTGCAATGAAGAACATCGCTATACAAACAAATACATTTAATAATTTCAGTAACTCTTCCGATTCCAACAGCTGCAGCGTTTCGTTTGTGGTGAAAAAGGGCGGCTACAACTTCTCCATGGATCATTTGAACCGCGTCCCATTCGATATGACTCCCATGATTGTTGATTGGAGTGTTGGAGATGCTCCCTGTAACGTTTCCAAGGATAAAGCCAACTATGCGTGCAAAAGTGATTATAGCGTTTGCGAGGACCCACCCTCTGCCGGTGGAAATGGCTACCTATGCAAATGTAAACCAGGTTTTGAGGGCAATCCTTACTTTCCCCAAGGTTGCACAGGTAAATTATTTAATTATGCTGCCAAAACATTAACATTCTTTTTTCCACTTCTCAAAATTTACTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTCTTGCTGTAGTTCTCTTTTAGAAAAATATCTTTTTAACAATTTTTTTTATTTTTTTGATATTTTTTTAACTTTTTTAATATTTTTTTAACAACAACTTATCTGATAATACATTAGTCCGTTTCAAATATATAAATCAATAAAACAATTAAGTATCATTTCTTATCAAAAAATTATTAAAAAAAGTTAGTTAAAATATCGTCTCATTACATTTATAAGAACAGAAAACTGGTAGATAGAAGTAAAACTATGTGTTAATATATTATATTTCAGTTTTCTCATTTTACGAAATGATTATTTCTGTTTGGCCTTTGTGTAGACTTTCCAGATTGTAAAAGGGGCAAACACAACTGCGCAAGAGCAGAATATTGTCATGAAACTCCTGGCTCTTTTGAATGTTTATGTCCTGATGGAATGATCGGAAATGCAACAAACGAAGGTGGAGGATGCCAGCCAAAGCAGCGGGCTGATGCATTTACAAAGATCGTCATTGGTGAGCATATCATTACGACCATTAGAGTTTTGTTTTTCTTCCCTTTTGGCAAGACACTAAATTTGAGTTTATTTTGATAACAGGAGCAGGTGTAGGATTAATTGCTCTCTTTGTGGGAGTTTCTTGGCTGTACTTGATGCTCCAGAAAAGGAGAGTCCTCAAACTAAAAGAAAAGTTCTTTCAGCAAAATGGGGGCATAATTCTAACACAGAAACTCTCTACTAGAAGAGACTCGTCTCAATCCACCACAATTTTCAGTGCCGAGCAACTCAATAAAGCCACCAACAATTTTGATGAGAATTTGATCATCGGCAAAGGAGGTTATGGAACAGTTTTCAAAGGAGTTCTCTCAAATAATCAAGTTGTCGCTATCAAGAAGTCCAAAATAGTGGACGTGAGCCAGGTGGAGCAATTCATCAACGAGGTCATTATACTGTCACAGATTAATCACAGGAACGTGGTCAAACTCCTAGGTTGTTGTCTAGAGACAGAAGTTCCTTTATTGGTGTATGAATTTGTTAAAAATGGCACCCTTTTTGATTATTTGCATAAACAAAGCCAAGTGGGTAATGTATCTTGGAAAACGCGTCTAAGGATTGGCGCTGAAGCAGCTGGAGCTTTGTCATATCTACACTCAGCAGCTAGCATACCCATCATCCATAGGGATGTGAAAACTGCCAACATACTCTTGGATGACAATAACACTGCCAAAGTTTCTGACTTTGGAGCTTCGCGATTGGTTCCGCAAGACCAAACTGAAATAGCCACAATTGTGCAAGGAACCTTTGGGTATTTAGACCCAGAGTACATGCAATCAGGCCAATTGACTGAAAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTAGTGCTTGTAGAACTGCTAACTGGGGAGGAGCCTTTCTCTTTTCAAAGGGCAGAAGATAAACGAAGTCTCACATTTCACTTTGTATGTAGCTTGGAAGAGGATCATCTATTTGATGTTCTTCAGATTGGTGTTGAGGATGAAGAAAATAAACACGAGATCATGCAGGTTGCTATTCTTGCTGCCAGGTGCTTGAAACTTAGAGGGGAGGAAAGGCCTAGCATGAAGGAAGTGGCAATGGAATTGGAGGGAATAAGGCTTATGGACAAATATCCTTGGACCAATACAAGCCAAAATTTTGAGGAGAGACAATACTTGCTTTCTGAGGCACCAAGCATTCGTGAACCTGGTGACAGTAGTGGCCAACAGAATGCTGGATATGATAGCCTGAAGGAACTTCAATTAATTGACTTTGGTGATGGAAGATGA

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