Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02598 LG1 39085990 39089154 PREDICTED: probable inactive receptor kinase At1g48480
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A,* 39086038 5_prime_UTR_variant
G/T 39087718 intron_variant
G/A 39088476 synonymous_variant p.Ala555Ala
G/A 39088567 missense_variant p.Asp586Asn
C/T 39088814 3_prime_UTR_variant
G/A 39088860 3_prime_UTR_variant
G/A 39088861 3_prime_UTR_variant
G/T 39088864 3_prime_UTR_variant
C/A 39088918 3_prime_UTR_variant
T/C 39088925 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02598.1
MLPHKHTLVVVAATLALMLAAADADLAAERAALLALRSAVGGRTLFWNATRDSPCTWAGVQCERDHVVELHLPGVALSGQIPVGIFGNLTQLRTLSLRFNALRGSLPSDLAKCVNLRNLYIQRNLLSGAIPSFLFELPDLVRLNMGFNNFSGPFPTDFNSLTRLKTLFVENNQLSGPIPNLSKLSLDQFNVSNNLLNGSVPLNLRTFPQDSFLGNSLCGRPLSLCPGDIADPISVDNNSKPNSHTSHKLSAGAIAGIVVGSVVFLLLLVFLFIFLCRSKTAKKTSAVDIATVKHPEADAPVLAEKGIPDVENGGHANGNSAAAVAAVSAGNKAEVNGGGAAKKLVFFGNAARAFDLEDLLRASAEVLGKGTFGTAYKAVLEAGPVVAVKRLKDVTISEKEFKEKIEAVGAMDHESLVPLRAFYFSRDEKLLVYDYMPMGSLSALLHGNKGAGRTPLNWEVRSGIALGAARGIEYLHSRGPNVSHGNIKSSNILLTKSYDARVSDFGLAHLVGPSSTPNRVAGYRAPEVTDPRRVSQKADVYSFGVLLLELLTGKAPTHALLNEEGVDLPRWVQSVVREEWTSEVFDLELLRYQNVEEEMVQLLQLAVDCAAQYPDKRPSMSEVVRSIEELRRSSLKEDQDQIQHDPVNDIEL*


CDS Sequence:
>Vu_02598.1
ATGCTGCCTCACAAGCACACTCTCGTGGTTGTGGCGGCCACGCTGGCGCTCATGCTCGCAGCAGCAGATGCAGATCTGGCAGCCGAGCGAGCCGCATTGCTCGCTCTCCGCTCTGCGGTCGGCGGCAGAACCCTCTTCTGGAACGCCACCAGGGACAGCCCCTGCACCTGGGCCGGTGTCCAATGCGAGCGCGACCACGTCGTCGAGCTCCACCTTCCCGGCGTCGCTCTCTCCGGCCAAATCCCTGTCGGAATATTCGGCAATCTGACACAGTTGCGCACCCTCAGTCTCCGCTTCAACGCGCTGCGGGGTTCCCTGCCTTCAGATCTGGCGAAGTGCGTGAACCTTCGGAACCTGTACATTCAGCGGAACCTGCTGAGCGGTGCTATCCCGTCGTTCTTGTTCGAGTTACCCGACTTGGTTCGCTTGAACATGGGCTTCAACAACTTCTCAGGCCCATTTCCGACCGACTTCAACAGCCTGACCCGGTTGAAGACTCTGTTTGTGGAAAACAACCAGCTCTCTGGCCCAATCCCCAACTTGAGCAAACTGAGCCTGGATCAGTTCAACGTCTCCAACAACCTCCTCAACGGCTCTGTCCCCCTCAACCTTCGGACATTCCCTCAGGATTCCTTTCTTGGCAACTCCCTCTGTGGCCGCCCACTCTCTCTCTGCCCCGGAGATATCGCCGATCCTATCTCCGTCGACAACAACTCCAAGCCAAACAGCCACACCTCCCACAAGTTATCTGCCGGCGCCATTGCGGGGATTGTTGTCGGATCGGTCGTGTTTCTTCTGCTGCTCGTCTTCCTCTTCATTTTCCTGTGCCGGAGCAAAACTGCCAAGAAGACCAGCGCGGTCGACATTGCTACTGTCAAACATCCTGAGGCCGATGCTCCGGTTCTTGCGGAGAAGGGGATTCCGGATGTCGAGAACGGTGGTCATGCCAACGGAAATTCTGCGGCGGCTGTCGCTGCGGTTTCGGCGGGGAACAAGGCGGAAGTGAACGGTGGTGGGGCAGCGAAGAAGTTGGTGTTTTTCGGGAATGCGGCTAGGGCGTTCGATTTGGAGGATTTGCTCAGGGCTTCGGCGGAGGTTTTGGGGAAAGGGACTTTCGGGACGGCGTATAAGGCGGTGCTTGAGGCAGGGCCGGTGGTGGCGGTGAAGAGGTTGAAGGATGTCACGATTTCTGAGAAGGAGTTTAAGGAGAAGATTGAAGCGGTGGGAGCAATGGATCATGAGAGTTTGGTTCCTCTCAGAGCTTTCTATTTCAGTAGGGATGAGAAGCTCCTTGTGTATGATTACATGCCCATGGGAAGCTTGTCTGCACTTTTACATGGAAACAAAGGGGCGGGTAGGACGCCACTGAATTGGGAAGTGAGATCAGGCATTGCGCTTGGAGCTGCCCGTGGCATTGAGTACCTGCATTCACGAGGGCCTAATGTTTCTCATGGAAATATAAAGTCATCCAACATCCTGTTAACCAAGTCATATGATGCCAGAGTGTCTGACTTTGGCCTTGCACACCTCGTTGGCCCCTCCTCTACCCCCAACCGGGTCGCCGGCTACCGTGCACCTGAGGTGACTGATCCTCGCAGGGTGTCTCAGAAGGCAGACGTGTACAGTTTTGGTGTGTTACTCTTGGAACTTCTGACTGGGAAGGCGCCTACCCATGCTCTCCTGAATGAGGAAGGAGTAGACCTTCCCAGATGGGTTCAATCTGTGGTTAGAGAAGAGTGGACTTCTGAGGTCTTTGATCTTGAGCTCCTTAGGTATCAGAATGTGGAAGAGGAGATGGTTCAGTTGTTGCAACTTGCAGTTGATTGTGCAGCACAATACCCAGACAAGCGCCCTTCAATGTCTGAAGTGGTAAGGAGCATAGAAGAGTTGCGAAGGTCTAGTCTTAAAGAGGACCAGGATCAAATCCAACATGATCCCGTCAATGATATAGAATTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_02598::LG1:39083990-39085990(+)
TTTTCACAAGCCAAAAAAGTTAACTGCTGTTCAAGAATCCTATGTGCATTGCAAGTAATTTTAATTGTAATTTTAATGATTACCCCCCTAAAAGTTTTCTACTTTCTGGGTTATTAACAAAAATAAAAGAACAAAATTAATTAAATTGTTTTCTTCCATGTTGGATTTGAATGTGTAAAATAATAGATTGTACTTGATGGTGTCTAATCGAATGAAGTTCATTTACACGGTGATTTGGTAGGAGTGATGTTATTGTTGAAACATGGTTGATAAAAACGTTTGGTTACTAATGGAGAAGTCAAATTTTGGAAAAAGGACATGACAAGCCAAACAAGGCTTACAGTTACCGTTTCCGATCAATGGGCCCTAATTATCCCATCTCTGTCCTATCCAACTCCATGCTAATTACGCCACAGCCGACACCTAATAAGCTTGTAATTAACTTGCAAATCAATGTTAATTAGTTCACTGATTTTGCAGTTCACGTATGTTACAAGTATTAACTAATAAATTACCACACTTGGATGGAGTGATTAAGAAGACAGTAATAGGAAAAGATGAACCACCATACTCGGTTAATCAGAATGCTTTGTTAATAAGAGAAAGTTTTAGAAGAAATTAAGAATGGTGTCTTTGTCGCGTGGCGTGGGGAGTAGAAAAGCAGACATGACACTAAGACAGGCTTTGCTTTTCCAACCGAATAGCCCTAGCAACAGCTAACTTTTGCTGCTCTTCCTGCATGCGTATGTTCTTCTCTATACACTTAAAATTTGTATGAAAGTATAATAATTTATCGTATCCAAAAGTGAGTTGAATTTCTCTTTTCAGTGGAATTAAGATAGCAGAGAGGTCGAAGAAGACAAAAGTGGTGAAAAAACAAGAACAAATATTACCATTAGCAAGTACACCATGAAAACAACTCTCAATAACCCATTCCCTCCATAGACTTTTAAATTTATCCAACTCTCTCATCAATTACTTTTTGTTGATATTTCCTGAATAAACTTGTTAAAAATGAGAATAACGAGAATTGTTTTTCAAACATTAATAATTAGATTTTGAAAAAGTGAATAGAAACAACTTATACATATAAGTGTTTGTTTTAGTAGGTGTTGGAGTTGTGTACATGATGTAGGTATGTATGTATGAAGAGGTGAAAAACCGTGTTAAATAGGTTTCTTAACTCATAATCAAACACAGCTTGTTACAATAAGCGACGCGAAGCTCCAACCGCTATTTTAATCAATTATCTGATTTTGAGCCAACAACACCTTACAAACTTTTCCAATTCAATGGAGAATGATAATAAAATTTTGATAACATTTTAATATCATTTACGTCTCATTATTATATGATTAATTCATATTAATATTTATGATTATTATTATTAACTGTAGAGTAATTTTAAACTAATAAAAATAATATATTAAATTAATGTTTAGATAATATTAAAATGTTATAAAAAATAATGTTTCTCAAATATCATTATCCAATTAAAAAATTTATCTAACAAACATAACACTTACCAAAGATGGGTTGAATTATTCACTTTATTTCTCGAACATTTTGTATCCAGGAAATGGGAATCTGGTTGTTGGGTGCTGTGGTGGTATGACATCATTCCTTTTAATAAATCCACCGCTTAACCAAACCGAGTATCACAGATTTACTCAATTCCTTTTCAAATATTTTATTTCCTTAGTTAGACCATCACCATTATACTAAATATATTTTAATTAACACCACTACACAAATTTAAATACCATTACTTTAAACTCGTATTTTTCTTCATAACACCACTGAGATAAATCTTTTATTTAGAGAACAGTATCATTAAAATACTTAACGAATTTGTAATATTTTTAAGTTTTTGACTTAATTGATTTAGTTAGTGGTGACAAAACTAATAATTAGTCGTATAAATAAAATTAATAGTGTATTTATTGAAGAGTGAGTAAATACGTAGATATACGAAAAAGATACGGGGAGGAAGGGAGGTA


Gene Sequence:
>Vu_02598(+)
AGGGTTATGTTATGTGCTAAGGAGCATCGAAATCCAACTCAGAGGAGTCTTATATTAATTCCAAGACTTTTAATTTAAAAAAGAGATATTATTTGGAAAGTGCAGAGTCCAACTTCTTCTGCATCTTCTGTGCTTATGCTTCTGGGTCTGTTTGGCTGGTCACTCTCTCACTGCTCCCTCTCCCATCTCATACGTTCCTAATTATATCCAAAATCCAAACAGACCATAGCCGCCTCCTCCTGCTGCTGAGGTTGCCTCCACTCACCAATGCTGCCTCACAAGCACACTCTCGTGGTTGTGGCGGCCACGCTGGCGCTCATGCTCGCAGCAGCAGATGCAGATCTGGCAGCCGAGCGAGCCGCATTGCTCGCTCTCCGCTCTGCGGTCGGCGGCAGAACCCTCTTCTGGAACGCCACCAGGGACAGCCCCTGCACCTGGGCCGGTGTCCAATGCGAGCGCGACCACGTCGTCGAGCTCCACCTTCCCGGCGTCGCTCTCTCCGGCCAAATCCCTGTCGGAATATTCGGCAATCTGACACAGTTGCGCACCCTCAGTCTCCGCTTCAACGCGCTGCGGGGTTCCCTGCCTTCAGATCTGGCGAAGTGCGTGAACCTTCGGAACCTGTACATTCAGCGGAACCTGCTGAGCGGTGCTATCCCGTCGTTCTTGTTCGAGTTACCCGACTTGGTTCGCTTGAACATGGGCTTCAACAACTTCTCAGGCCCATTTCCGACCGACTTCAACAGCCTGACCCGGTTGAAGACTCTGTTTGTGGAAAACAACCAGCTCTCTGGCCCAATCCCCAACTTGAGCAAACTGAGCCTGGATCAGTTCAACGTCTCCAACAACCTCCTCAACGGCTCTGTCCCCCTCAACCTTCGGACATTCCCTCAGGATTCCTTTCTTGGCAACTCCCTCTGTGGCCGCCCACTCTCTCTCTGCCCCGGAGATATCGCCGATCCTATCTCCGTCGACAACAACTCCAAGCCAAACAGCCACACCTCCCACAAGTTATCTGCCGGCGCCATTGCGGGGATTGTTGTCGGATCGGTCGTGTTTCTTCTGCTGCTCGTCTTCCTCTTCATTTTCCTGTGCCGGAGCAAAACTGCCAAGAAGACCAGCGCGGTCGACATTGCTACTGTCAAACATCCTGAGGCCGATGCTCCGGTTCTTGCGGAGAAGGGGATTCCGGATGTCGAGAACGGTGGTCATGCCAACGGAAATTCTGCGGCGGCTGTCGCTGCGGTTTCGGCGGGGAACAAGGCGGAAGTGAACGGTGGTGGGGCAGCGAAGAAGTTGGTGTTTTTCGGGAATGCGGCTAGGGCGTTCGATTTGGAGGATTTGCTCAGGGCTTCGGCGGAGGTTTTGGGGAAAGGGACTTTCGGGACGGCGTATAAGGCGGTGCTTGAGGCAGGGCCGGTGGTGGCGGTGAAGAGGTTGAAGGATGTCACGATTTCTGAGAAGGAGTTTAAGGAGAAGATTGAAGCGGTGGGAGCAATGGATCATGAGAGTTTGGTTCCTCTCAGAGCTTTCTATTTCAGTAGGGATGAGAAGCTCCTTGTGTATGATTACATGCCCATGGGAAGCTTGTCTGCACTTTTACATGGTTAGTCAGCTTTTCCATTCCTTCTCTCTTTTCAGTATCCCTTCACTCAATTTCGCCCTTTTCCAGTTCTTGGTCAATCATTACTGACTGTAATTGAGTTTCTTTTTTGGGCAATGCATCATGGCATGGGCTACGTTAGTGATTTTTCATTTCTCTGCATCTGCGGTGACATGCTTTAGGAATTAGAATCTTAAATGCATTTTACATTCCCTCTTTTATGTATATTGATGGGGTTATTGAAGATGTGATTTCGCACTATATCTTTTAGGTCCCAATGGATCACGTGAATGGTCGTTTATCTGAATTGCCTCTCCTTCTCCTGCTATTACTAGACTAGGCTTTAAGCAGATACTGATTTGTGTTCTAAGTACTTTTTTATTTTCTTTTTCAAGTTGTAAATTTTCACTGTTTATTTCAACAACGGCTTCCAAATCCCATAGGCTCATTGGAACTGTATGAAATACGACCTGAGGCCAAGGCTCATTCATTACTCATTAGTGTACCTACTGTGGTACGGTACCATGGGTGGTGTTTCTGATCTTTATTTGATTACAGGAAACAAAGGGGCGGGTAGGACGCCACTGAATTGGGAAGTGAGATCAGGCATTGCGCTTGGAGCTGCCCGTGGCATTGAGTACCTGCATTCACGAGGGCCTAATGTTTCTCATGGAAATATAAAGTCATCCAACATCCTGTTAACCAAGTCATATGATGCCAGAGTGTCTGACTTTGGCCTTGCACACCTCGTTGGCCCCTCCTCTACCCCCAACCGGGTCGCCGGCTACCGTGCACCTGAGGTGACTGATCCTCGCAGGGTGTCTCAGAAGGCAGACGTGTACAGTTTTGGTGTGTTACTCTTGGAACTTCTGACTGGGAAGGCGCCTACCCATGCTCTCCTGAATGAGGAAGGAGTAGACCTTCCCAGATGGGTTCAATCTGTGGTTAGAGAAGAGTGGACTTCTGAGGTCTTTGATCTTGAGCTCCTTAGGTATCAGAATGTGGAAGAGGAGATGGTTCAGTTGTTGCAACTTGCAGTTGATTGTGCAGCACAATACCCAGACAAGCGCCCTTCAATGTCTGAAGTGGTAAGGAGCATAGAAGAGTTGCGAAGGTCTAGTCTTAAAGAGGACCAGGATCAAATCCAACATGATCCCGTCAATGATATAGAATTGTAGAAGATGTATCTTCTGCCCAAGTTTCCTCTCGACTTTGCTTTGTCAGAGTCGGAGCCCATATTTTACCTGCTAAATCCTGTGCGTATGTTGGTTGTATTCTGTAGCTTGGGCCCCAAATTTCTTTGGCACCAAACTTTCGAATTTCTTCCTTCTTTTTTTTTTCCTCCAATCCCCATTGTGCCGTCTCCTCCTTTTTCTTCTCAATTAATACATTGGGGGGAGTGGATATCTGTTCCATTAGTTATTGCTGTTGGATTCTGGTTGATTGTAATTATTACTTTTGCTTTAAACATGGCTTTTACTTTTGTTGAATCCTTGTGTCCGTTGAAAACTTGTAATAGAGATGTTATAGCAGCTGTCCTTGGATGGTTGGTTGCGATGTCC