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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02582 LG1 38973523 38982491 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108334037 isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   seed development, seed development, seed development, shoot system development, seed development, negative regulation of cellular process, shoot system development
Cellular Component   is active in   cytoplasm
Cellular Component   located in   cytoplasm, cytoplasm, cytoplasm
Molecular Function   enables   protein kinase binding
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02582.1
MTIVTGDRYLVKLVEFVEEQAGPLIEETKVLKMNPAGLHYVQSRLEALHEVENLLAGAPVDYLRAYVSDLGDHRALEQLRRILRLLTSLKIFSVLPHPIRDPTPLSFLPFGRLKALELRGCDLSTSAAKGLLELRHTLEKIICHNSTNALRHVFASRIKEVKNSPQWNRLSFVSCACNGLVLMDESLQLLPAVETLDLSRNKFAKVDNLQKCTKLKHLDLGFNHLRTFAPFTRVSPQIVKLVLRNNALTTLRGIENLKSLEGLDLSYNIVSNFSELEFVAGLPYLQSLWLEGNPLCCARWYRAHVFSFFAFPERLKLDEKEINTSDFWKRQIIIASMHKQPASFGIYVPAKDEAVVEGANIRRRKACRLVSIRNEEETTSIYSEEDSVSCANDIIQSREDPDLSDNEPEIVDLINRIEHMKKERSINWLRDFKDWMGIPSDKSVQTMKEGSTTLHHQKGNYIRNKTNPEQSGEVSRYASDSVLASGDDSSMNILESDSSFVDTSASFHRQQHFDYRGLLGNASGASLFDSGGVDMEKLKSSIEGIDSSLSQTRSSHADTLTTEGAQRMTENFNISPLTIIHDISGSQSSACPASPPHFQEDLLHRRQHLVEEILQLSTDSFSVASSDSNTSCSEVDCGEFEPSVSEVDNPQCKTYVDGVGSHLSQSQLKEKFCNPRQGNLERENGISSCSSSCDQTSKQHAIDFAENTLCASQDTCLLEKRKIRKKAKKRIISVLEEKLDGNASHDTQEKISQGHISTNLKQELDLNDFTEFSVHNYSTQEIDDFIVTYFNTTIADSEASEVCSHCMRCNCVLQRETNYKESEVAVLLSSQKKLYFLLINVASDGSGTILNVLSSHNIEEVCEVQVGMGLQVLRVNFENEETYLFVTRSIEKSRELLCTIHVLDSSDGNDRCSIRRSRLGCLTNKYVVVQM*

>Vu_02582.2
MTIVTGDRYLVKLVEFVEEQAGPLIEETKVLKMNPAGLHYVQSRLEALHEVENLLAGAPVDYLRAYVSDLGDHRALEQLRRILRLLTSLKIFSVLPHPIRDPTPLSFLPFGRLKALELRGCDLSTSAAKGLLELRHTLEKIICHNSTNALRHVFASRIKEVKNSPQWNRLSFVSCACNGLVLMDESLQLLPAVETLDLSRNKFAKVDNLQKCTKLKHLDLGFNHLRTFAPFTRVSPQIVKLVLRNNALTTLRGIENLKSLEGLDLSYNIVSNFSELEFVAGLPYLQSLWLEGNPLCCARWYRAHVFSFFAFPERLKLDEKEINTSDFWKRQIIIASMHKQPASFGIYVPAKDEAVVEGANIRRRKACRLVSIRNEEETTSIYSEEDSVSCANDIIQSREDPDLSDNEPEIVDLINRIEHMKKERSINWLRDFKDWMGIPSDKSVQTMKEGSTTLHHQKGNYIRNKTNPEQSGEVSRYASDSVLASGDDSSMNILESDSSFVDTSASFHRQQHFDYRGLLGNASGASLFDSGGVDMEKLKSSIEGIDSSLSQTRSSHADTLTTEGAQRMTENFNISPLTIIHDISGSQSSACPASPPHFQEDLLHRRQHLVEEILQLSTDSFSVASSDSNTSCSEVDCGEFEPSVSEVDNPQCKTYVDGVGSHLSQSQLKEKFCNPRQGNLERENGISSCSSSCDQTSKQHAIDFAENTLCASQDTCLLEKRKIRKKAKKRIISVLEEKLDGNASHDTQEKISQGHISTNLKQELDLNDFTEFSVHNYSTQEIDDFIVTYFNTTIADSEASEVCSHCMRCNCVLQRETNYKESEVAVLLSSQKKLYFLLINVASDGSGTILNVLSSHNIEEVCEVQVGMGLQVLRVNFENEETYLFVTRSIEKSRELLCTIHVLDSSDGNDRCSIRSLEQVQVGLFDKQVCGGSNVSIYQYAMVLVFCKNGSEESWLSRSLFVIGGYVLLCIEDVKQLYSFSSDASVSPYFRIDSFSSIADITEMVIEGGGSYCVTLSLTCPLAELHPFTQMNLESVNHENTAPSSLKLKLRWFSRNYLVKFVSLLKAIHEKKTGSPLVVRCIS*


CDS Sequence:
>Vu_02582.1
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>Vu_02582.2
ATGACGATTGTGACCGGAGATCGGTACCTGGTGAAGTTGGTGGAGTTCGTGGAGGAGCAAGCCGGTCCTCTCATCGAAGAAACCAAGGTCTTGAAGATGAATCCGGCGGGCCTCCACTACGTGCAATCGAGGTTAGAGGCGCTGCACGAGGTCGAGAACCTCCTCGCTGGCGCTCCGGTGGACTACCTGAGAGCGTACGTGTCCGACCTCGGCGACCACCGCGCCCTGGAGCAGCTCCGGCGGATCCTGCGCCTCCTCACCTCGCTCAAAATATTTTCTGTGCTGCCTCATCCTATTAGGGATCCCACGCCCTTGTCCTTCTTGCCTTTTGGGCGCTTGAAGGCTCTGGAGCTCAGGGGTTGTGACTTGTCCACTTCCGCCGCCAAAGGCCTTCTTGAGCTCAGGCACACGCTTGAGAAGATCATTTGTCATAACTCTACTAATGCTCTGCGGCATGTGTTTGCTAGCAGGATAAAAGAGGTGAAGAATTCTCCTCAGTGGAACCGCCTGTCGTTTGTGTCATGTGCGTGTAATGGCTTGGTTCTCATGGACGAGTCTCTGCAGCTTCTTCCTGCGGTTGAAACACTAGACCTTAGCAGGAACAAGTTTGCAAAGGTGGATAATCTACAGAAGTGTACCAAATTGAAGCATTTGGATCTTGGTTTCAATCACTTGAGAACATTTGCACCCTTCACCCGGGTTTCCCCTCAAATTGTTAAACTAGTTTTGAGGAACAATGCTCTAACTACTTTGCGTGGAATTGAGAATTTGAAGTCACTTGAAGGACTTGATCTTTCCTACAATATTGTTTCCAATTTTTCAGAGCTAGAGTTTGTTGCGGGCCTTCCATATCTTCAAAGCTTGTGGTTAGAAGGAAATCCTTTGTGTTGTGCTCGATGGTATAGAGCACATGTATTCAGCTTTTTTGCCTTCCCAGAAAGGCTGAAGTTAGATGAGAAAGAAATTAACACTAGTGATTTTTGGAAGAGACAAATAATTATTGCCAGTATGCATAAGCAACCTGCCAGTTTTGGGATTTATGTACCTGCAAAGGATGAGGCTGTAGTTGAAGGTGCCAATATCAGAAGGAGAAAGGCCTGTCGTCTTGTCAGTATCAGAAATGAAGAAGAGACCACTAGCATATATTCTGAGGAAGATTCTGTCTCTTGTGCAAATGATATTATTCAAAGTAGAGAGGATCCTGATTTATCTGACAATGAACCTGAAATAGTAGATTTGATAAATAGAATTGAACATATGAAGAAAGAGCGTTCTATTAATTGGTTGAGGGATTTTAAAGACTGGATGGGTATTCCTTCTGACAAATCAGTGCAGACTATGAAAGAAGGCAGCACTACACTGCATCATCAGAAGGGAAATTACATCAGAAACAAGACAAATCCTGAGCAGTCTGGTGAAGTCTCTAGATATGCTTCAGACTCTGTTCTAGCCTCAGGGGATGACAGTAGCATGAATATTTTAGAATCTGATAGTTCTTTTGTAGATACATCTGCTAGTTTTCATAGGCAACAACACTTTGACTATAGAGGTTTGCTTGGTAATGCCAGTGGGGCCTCACTTTTTGACTCGGGAGGAGTGGACATGGAGAAGCTTAAATCCTCAATTGAGGGCATTGATAGTTCACTTTCACAAACTAGAAGTTCTCATGCTGACACCCTGACCACAGAAGGGGCACAAAGAATGACTGAAAATTTCAACATCTCACCATTGACTATTATTCATGATATATCTGGGTCTCAGTCATCTGCTTGCCCAGCATCTCCTCCTCATTTTCAAGAAGACCTTCTTCATCGAAGGCAACACCTGGTGGAAGAAATTTTGCAGCTGTCTACAGATTCCTTTTCAGTAGCATCTTCTGATAGTAACACGAGCTGTAGTGAAGTTGATTGTGGTGAATTTGAGCCATCAGTTTCAGAAGTTGATAATCCCCAATGTAAAACTTATGTGGATGGTGTTGGTAGTCATTTATCTCAAAGTCAGCTTAAGGAAAAGTTTTGCAACCCAAGACAAGGAAATCTTGAAAGAGAAAATGGAATTTCTTCATGTAGTTCCTCCTGTGATCAAACTTCTAAGCAGCATGCGATTGATTTTGCTGAGAATACACTTTGTGCTAGCCAAGACACTTGTTTGTTGGAGAAAAGAAAAATCAGAAAGAAAGCCAAGAAGAGAATTATTTCAGTACTAGAAGAGAAATTAGATGGCAATGCTTCTCATGATACACAAGAGAAGATAAGTCAGGGACATATTTCTACAAATCTAAAGCAAGAATTGGACCTTAATGATTTTACTGAATTTTCTGTGCATAATTACTCTACCCAAGAGATTGATGATTTTATAGTGACATATTTCAATACAACTATTGCTGATTCTGAAGCCAGTGAGGTCTGTAGTCATTGTATGCGCTGTAATTGTGTCCTTCAGAGGGAGACAAACTATAAAGAAAGTGAAGTTGCAGTGTTACTGAGCAGCCAAAAGAAGCTCTATTTTCTACTGATCAACGTTGCTTCTGATGGGTCAGGTACAATCTTGAATGTGTTGAGTTCCCACAATATTGAAGAAGTTTGTGAGGTGCAAGTAGGAATGGGACTTCAGGTGTTGAGGGTAAATTTTGAGAACGAAGAAACGTATCTTTTTGTCACAAGAAGCATTGAGAAATCAAGAGAATTACTATGCACCATACATGTGCTTGATTCAAGTGATGGAAATGATAGATGCTCAATAAGAAGTTTGGAGCAGGTCCAGGTTGGGTTGTTTGACAAACAAGTATGTGGTGGTTCAAATGTGAGCATATATCAGTATGCAATGGTGCTCGTTTTTTGTAAAAACGGAAGTGAGGAATCATGGCTGTCGAGATCACTCTTTGTGATTGGAGGGTATGTGCTTTTATGCATTGAAGATGTTAAGCAGCTGTACTCGTTTTCATCGGATGCATCCGTGTCTCCATATTTCAGAATTGATTCGTTTAGCTCCATTGCTGACATTACAGAGATGGTTATTGAGGGCGGTGGCAGCTACTGTGTGACTTTAAGTCTGACATGTCCTCTGGCAGAACTCCATCCATTTACCCAAATGAACCTCGAATCTGTCAATCACGAAAATACGGCTCCTAGCTCTCTTAAATTGAAGCTTCGGTGGTTCTCCAGAAATTACCTTGTGAAGTTTGTGTCATTGTTGAAGGCAATCCATGAAAAAAAAACGGGGTCACCTTTGGTAGTAAGATGCATATCGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_02582::LG1:38982491-38984491(-)
TTGTGTAGAACATTTTGTTGAATTGCACTGGTCATATGATATCTTTTTAGTTGTCGGGGGAACTGTTCTTCATAATGTCTAGGACTAAATGAGATGTAAGGATCCATGACTTTATTCAAAACGTTTCACGCAGTATGATAAAATATTACTTCTATTTTCCTCTTTTCATGAGCTTTTGAGAGACTGAGAGTCTGAAACATTCATGTGTCCCGAAAAAAATGTATCGTGAAAACAATCTTTCTAAACATGGCTGAAGCTTGAAAATTTCGTCTGCCACAGGCTGAGGTTAAAAATCTTTCATATTGTTTCTGAATATGACATAACACTGAATAATTTTGCCTCTGTTGAATCTGCAGAAGCGTTTAGAGTCCCTAACAGAAGCAGAGCTACAAGCACTGCTTGAAGAAGTTGAGGAAGAGAAGAGACGCTAGCTAGTGGTGCGCAGGTGAACAGAAGTAGCTTGTTTGTATATATATACACTGAAATTTTGCCAAACTCATTGAAACAGAAATTTGAATCTATATGGAAATGGAAACTAGTTCAGAGAGGTTTTAGCTATGTTTTCTTCAGTTTACTCACGGACAAAGGGACGAGAGTTCAAAATTCTTAAGATGGTAATGCTTTTAAAATCCATATATTTTGTGACTTTTTCTGTGATTTTGTGACTCATTAAATGTCTTTCTGTGATTTTTTCTTCCTCCATTTTGGAGACCAGTGTTTATAATAGAAGTCATAAACGAGGAAAATTGTGTTTCTGATACTGATAAAGATCATGGAAAGTGGTAGAGTTGACAATCGTAATCGTGGATAAAGCTATCATTTGATGTTTCTTAATCATTGAAACATGAAATTGGATGGAAATGACGGTGGGTAATCTATACACTTTTTCTTTTCAATTTTTAAAATAAAATAAATATAAAATCAGACAAATAAGTATTTCCATCATTCTCATTTTATATTATTTCCTATGTTTCGTTCTTATCGAAGATATAAGCGTAAATGTTTGAATGTTACTCTTCATGCAGACATTTCACGTAACCTGCAGGGATGGGGCGAACTTGTTTTTTTAACAGCTAATGCTGATAAGGTTGATCACTTTAACTTATTTAATTAATACGAAAGCTATATTGTTAAATTCACACATTTAATTTTGGAAAATTCTCTGTTTCTTTTTATAATGTTTTTCTATTTTTTTTCTTGGATTGATTATTTATTAATTAAAATAAAATAGATACATTATTTTGATATATATTCTTTGTATGTATTATTTTATCGCTAAAATAATCATAATGAGCTATTATTTCCTTTTTTTTCATAATCTTTTCTCGAAAGAATTCACTTATTTTAATATATTATTTACTTTTTACATTCATTATAACTCTTTGATATTTTTTCAACAGAGTGAGCGAGTCTCTTTTTCTATTAAATAATAAATTATAATTTTCAAATTAAAGTAACCATTAATTAATATGGTAAATTAATTATGGACACTTTAAATATATAGAAATATAGATGTTGAAACGAATTGATTCGAAGGGAGATTACTCTTAATTGCGATGTCAATATATCTTGATCATTATGTATAAGATTTGGTATTGGAGAGTTTGATATATACGTCATTCTCTACGAATTAGAACATAATGGACGTATGTTGATAGTTTAAGGGGGTGATTACTTGAGAAAAGTAAGAAACTTAATTAATAAGAGATAAAAGCAATAAATTAATATCCAATATTTTCTCCCGAATAATAAAATAGGATTTAAACATCTAGATGCAGACACGTGTCATCTAGATGAAGACACGTGTCATTTTGATCTCAGTAGTATTAGTAATATTATTACTAGTTTGAAAACTTCTCCATATTCAAACACCAAACCCAATCATTACAATGCACTACTAACCTCAAGTAATTGCCCTTCTTTCTGTCACTAAACACGAAATGATTACTACATTGAATTTTTAAAAATATATATATATATATATAAGAATTGAAAACGTC


Gene Sequence:
>Vu_02582(-)
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