Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02524 LG1 36608053 36610181 PREDICTED: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1 isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   located in   extracellular region, extracellular region
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 36608084 intron_variant
G/A 36608133 intron_variant
A/C 36608237 synonymous_variant p.Ser21Ser
A/T 36608297 synonymous_variant p.Pro41Pro
C/T 36608299 missense_variant p.Ser42Leu
C/T 36608363 synonymous_variant p.Ser63Ser
G/A 36608374 missense_variant p.Gly67Glu
A/T 36608414 intron_variant
C/A 36608507 missense_variant p.Ser79Tyr
T/C 36608659 intron_variant
T/A 36608850 missense_variant p.Ile154Asn
C/T 36608890 synonymous_variant p.Leu167Leu
C/A 36608921 intron_variant
T/C 36608960 intron_variant
G/A 36609004 splice_region_variant&intron_variant
G/A 36609071 synonymous_variant p.Gln194Gln
G/T 36609093 stop_gained p.Gly202*
G/A 36609147 missense_variant p.Val220Ile
G/A 36609462 intron_variant
G/A 36609494 intron_variant
C/T 36609502 intron_variant
T/C 36609511 intron_variant
T/A 36609652 intron_variant
G/A,T 36609664 intron_variant
C/A 36609680 intron_variant
T/A 36609767 intron_variant
A/T 36609770 intron_variant
C/A 36609926 intron_variant
C/T 36609987 missense_variant p.Thr258Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02524.1
MKMKNWDDTYCSEWEGVECNSSTGRVAKLDLQCLWSVMFIPSDWHLSYADLVVFKDLKSLNLSRSYGIFDCANREGRENLEVLDLSDSNINVTDILLCLNGLPSLKYLYLSYNRFYTTFNVFETLSSQLLRLEILDISQNTLTNDMLPSLGGFTSMKELYLSDTGLNSDIHIQGLCSMSKNLEVLDLSYNNFNDSDIAYALRELSSLKSLNLGNTQLTPRSILIILFVLMVGFMPFDAPTHMALFKKATAGLRLLDGDTAKNILQAVREMFKNRSTLNVQPDAVSVIDGTQEGSYL*


CDS Sequence:
>Vu_02524.1
ATGAAAATGAAGAATTGGGATGACACATATTGTAGTGAATGGGAAGGAGTGGAGTGCAACTCATCCACAGGGAGAGTGGCCAAACTTGATCTTCAATGCCTGTGGAGTGTAATGTTCATCCCATCAGATTGGCATTTAAGTTACGCTGATCTTGTTGTCTTCAAAGATTTGAAGAGTCTCAACTTGAGCCGTAGTTATGGGATATTTGATTGTGCAAACAGGGAAGGGAGGGAAAATCTGGAAGTCCTTGACTTGAGTGACAGTAACATAAATGTCACCGACATTCTTCTTTGTTTGAATGGCCTTCCGTCTCTCAAGTATTTGTATTTATCATACAACAGGTTCTATACAACATTCAACGTTTTTGAAACTTTGTCATCGCAGTTGCTCAGATTAGAGATCCTTGACATAAGTCAGAACACTTTGACTAATGACATGTTGCCATCTCTAGGGGGATTCACATCTATGAAGGAACTGTATTTGTCTGACACTGGATTGAACTCAGATATTCATATCCAAGGTTTATGCTCTATGTCGAAGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCTTACAACAACTTTAATGACAGTGATATTGCATATGCTCTTAGGGAACTTTCATCTCTGAAGTCTTTAAATTTAGGAAACACTCAATTGACTCCAAGGTCAATTCTTATCATTCTCTTTGTACTTATGGTTGGGTTCATGCCTTTTGATGCACCAACTCATATGGCTCTATTCAAGAAAGCAACAGCGGGTTTGAGGCTATTAGATGGTGATACTGCTAAAAACATATTGCAAGCGGTGAGGGAAATGTTCAAAAACAGAAGTACACTGAATGTTCAACCAGATGCAGTATCTGTTATTGATGGAACCCAAGAAGGTTCTTACCTATAG


Promoter Sequence:
>Vu_02524::LG1:36606053-36608053(+)
CGCTCAGTGGTAAGTGCGTGACTTCTATTTTGCCCCTCAGTTGTAATTTTGCCCCTCAGCGGTGTTTGCGGGTCTTCAAAGTGTTGCTCAGCAGTAAATGACGCTGAGCGGTACTTGCAACTTCTTCCTTTTATGCACTTTTTCTTCCTATTCTTAATCCAACTCCTAGCTCCTTCACTTCTTTCACTCAATTCATCTTAAAACCTGCAAAAACAAGGAAATCAAGCATAAAACCTGTTAAACTCTCTTATTTCCAAAACTTCAACAAAAACATGATTTCAAGCTAGTTTCTAAGTCATAAAGAGTGTCTTTAAGGTCAAATTTCAGTATAAAAATAGTAGTTTTTCAACTGCTATCATGGACACATATGAGAAAATCTAGAACTGGGGAAATTCTCCCAAAAGCTATATTACCTAGACATAGGGATAGGAGGGTTGGTTACCTTTAAGCTTCTATGCGAATGTAATGCATGATTAATTGCTAGGGAGACAAGACATTGTGAACTAGTAATTAGGCGTAGGCTTTCTTCATCGAGACATCGAGTTTAAGGTAAATTAGAAAGTGGCATTAGCATTAATGAAGAAGATGAATTCATAAATACATGAGAGTGGATAGGATAAGTAGGAAACCTCAATAACATAATCATCCATATTCAATATCAATCACCTTTGCGTCTTTCTATCCAATTGATCAAAACTTGCATGCATATTTATTTTCCTTAATACAAATACAATGATTTCGTTTATAAGTCATAATTAATCAAGAAATCATATGAATGTTTAGGTCGTGAGTCTCTAGGAAAACGATACTTGATCTTACCATTTTTTATTTATTAAAATTTATTAAATGTTACCATTGAGTTTACTTATATTATTTTTTTAATTTTTAATTCAAAAATTAACTTCGTCAAATTAGGTCATTTAAACTTAAACTTTTTAATTTCTAAAATCTATTAAATGCTATTAGCTTTGATTATATTTTTAATACTATTTTATGGTAGTTACTTGTTTCACACTAGTGGAAAAAATAACATTCTATGACGACCTATTATGACGGACAAAAATTATCCATCATAATAGGTTGACCGGTGGCAGTATTGTAATAAACTTAAGACATATTATGACTTAGTTATGAAAACCCATCATAATATGCAACGCGGTGGCAAACTTGTAAATAATTTTAAAATGTATTATGACGGAGTTATGTATATCAGTCATAATATAAAATGCGGTGACAAATTTGTAAATAAATGAAACATTATCAAAATTTTCCACCCCTTTCATGTATTATAAAAATGCTTACTTCGTCCTCATGTTAAGAGGTGAATTTTTGTTTAGTATCCAGTTTTAAAAATGAAGACATTGGGTCCCTATGTTATGAAAAATATATGAATAAGGTCCACAAAGAAAGAACAACTTCAATAAATCATCAAAGAAAAAGCTGAATAAGAGAGAGAAAAAGCTGGATAGCAGAAGAGAGAAGAGAAAAAGTACGACCACATCAGCATGGACTTAACGTTGTTGTTATAGGGACGCAATGTCTTCATTTTTAAAACCGGATACTAAACAGAAATTTACCTCTTAACATGGGACGAAGTAAGCATTTAAGCCTCATAATATCTATAGCATTTCACCATCCTGTAAGGGTATGTGAAAACCTAATGACTCTTTCTTCTTTCTCAAAGTCCATCCTCGTGAACCTTGTGCATCACGTGGTCTTGACTCCATCGGCAGGGGCACCATCACGTTTCTTGACTGTATCGTCGATGCGGCTCTAGATCTGGACCGGTGTGCGTCCCTTTGCAATCCCTCTCCATGGAAGAGATATCAAGAGAAAAACCCTAACTTGTAGATCGTCATTGCATTCTGTCTCACCTCTATCGTTGATAGGGTTCCAAATGTGGACACTTACGGTTAGGAGCACATTGGGGATGACGAGGATATGGTAGGGACCTTTCTCGAAGAGGTTGGCTTCTTTACTATTTGACTTTTGTTTGAAGA


Gene Sequence:
>Vu_02524(+)
ATGAAAATGAAGAATGTTAGTTTGATTTACTGATTTTTGTTTTGGTGGAAGTGATATGGTGCGAAGTGTGTTGGAAGGAAGAGAGGGAAGCTCTTTGGGATCTAAATGCCCGTTTTGGCTTCTCTTTGTCTTGGCAGTGGGATGACACATATTGTAGTGAATGGGAAGGAGTGGAGTGCAACTCATCCACAGGGAGAGTGGCCAAACTTGATCTTCAATGCCTGTGGAGTGTAATGTTCATCCCATCAGATTGGCATTTAAGTTACGCTGATCTTGTTGTCTTCAAAGATTTGAAGAGTCTCAACTTGAGCCGTAGTTATGGGATATTTGATTGTGCAAACAGGGAAGGTTATTCTCTTACACATTCTATTTCTTAATCATTGTTTACTCACTAAAAAGTGAAGTATGAATAATTATTTCCATTTAATTTGAATACTTTGTAGGGAGGGAAAATCTGGAAGTCCTTGACTTGAGTGACAGTAACATAAATGTCACCGACATTCTTCTTTGTTTGAATGGCCTTCCGTCTCTCAAGTATTTGTATTTATCATACAACAGGTTCTATACAACATTCAACGGTAAGTATATAGATTATGATGATGATGATGACGGCGTGATAAGCATCGTTTTAATATTTACTACAAAATTGGTTGGCTTCTTCTACAACCTTTGACTAATACATGTGTATACCTTTAGTTTTTGAAACTTTGTCATCGCAGTTGCTCAGATTAGAGATCCTTGACATAAGTCAGAACACTTTGACTAATGACATGTTGCCATCTCTAGGGGGATTCACATCTATGAAGGAACTGTATTTGTCTGACACTGGATTGAACTCAGATATTCATATCCAAGGTGGAATAATTTTCCCATTTCATTTGTAAAGCTAAGGATACTGATAATAGCTTCAGGATAATATATATACGTATGTAATGTAAGACAGTTTACCTTGCAGGTTTATGCTCTATGTCGAAGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCTTACAACAACTTTAATGACAGTGATATTGCATATGCTCTTAGGGAACTTTCATCTCTGAAGTCTTTAAATTTAGGAAACACTCAATTGACTCCAAGGTCAATTCTTAGTATGTTACACTTCCTACATTTCAACTTCCCTAATCTTCTTTCTCCAGCACCATTACTTTTAAATATAGATTGATAAAATTGATAGAGATTCAATTTGTTTATGGCCATATTCATTGTATTTTATTCTCTTTATACATCTGACATTTGGTCTTGCGGAGTCATTCTCTTTGTACTTATGGTTGGGTTCATGCCTTTTGATGCACCAACTCATATGGCTCTATTCAAGAAAGTAAGTCATTTTAGATTATTATTGTTACTATTAATATTTTATTACCTATGGCATGAGAATTTATGATAGGCCCTGGTTAGTTCACAAAAGGAGAGAAAGAATTAAAGAGCCTAACTGTATTAATGGTTAGGAGGAGAGTGGGAAAGTATTGTATAAATAACCTTTGTTTAGTAGGGGGGTTGTTGTTAGTTGTATTTGGTCAGGTTCTTTGAACCTTGTGAGGGAGGTTATGCTCTCAGATTATTGATTGTAAAGGCTAATACTTGTGAAATACCAGAATTCTTTCATTCATCTTTGCTTCTTGTGTGTGTGTGAGAGTGATTCGGCTAGGTTTCCCATTTAGAAACCTAACATTGTTTATACAAGTCCAAATCTATAATTCACTGCTTCAAGGAAACAATATTAGTGCAGACAAAAACTCACTTTGATAAACTCTGTGTTCTAAAAACAATTAATCTATGACTAACTATTTGGAAATATCTTGGTGAAAACATAAATAAAATGGTGTGTGAGTGCAAAAGGAGTTTATAGATGACCTCTTTTCAATGTTGAATGTGAAATGCAGGCAACAGCGGGTTTGAGGCTATTAGATGGTGATACTGCTAAAAACATATTGCAAGCGGTAACCATGAGACTAATTCATGTTTTTATCTTGTTAACTATGCTTTCAATGTATTAAGTGTTCATTTTCTTGTTTAAAGGTGAGGGAAATGTTCAAAAACAGAAGTACACTGAATGTTCAACCAGATGCAGTATCTGTTATTGATGGAACCCAAGAAGGTTCTTACCTATAG