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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02359 LG1 31499504 31502344 serine/threonine-protein kinase SAPK2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   intracellular signal transduction, response to osmotic stress, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, response to osmotic stress
Cellular Component   located in   cytoplasm, nucleus
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 31499644 intron_variant
T/C 31499659 intron_variant
T/A 31499677 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02359.1
MERYEILKDIGSGNFAVAKLVRENRTNELFAVKFIERGQKARFFFQQLISGVSYCHSMQICHRDLKLENTLLDGSTAPRLKICDFGYSKSSVLHSQPKSTVGTPAYIAPEVLTRKEYDGKIADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEDPADPRNFKKTIGKILSVQYSVPDYVRVSMECRHLLSQIFVASPEKRITIPEIKNHPWFLRNLPIELMETGSWQVNDVNNPSQSVEEVLSIVQEARKSLNVPIVGGLLNGGTMDLDDLEADEEDLEDVETSGEFVCPL*


CDS Sequence:
>Vu_02359.1
ATGGAGCGCTATGAGATTCTCAAAGATATTGGCTCTGGGAATTTTGCTGTCGCCAAACTGGTTAGGGAAAACCGCACCAATGAGCTTTTTGCTGTCAAGTTCATTGAGAGAGGCCAGAAGGCAAGATTTTTCTTTCAGCAACTGATATCTGGAGTCAGTTACTGTCATTCAATGCAAATTTGTCATAGAGATCTGAAGCTTGAAAACACACTCTTGGATGGAAGCACTGCTCCACGACTTAAAATTTGTGACTTTGGTTACTCAAAGTCATCAGTATTGCATTCTCAACCTAAGTCAACGGTAGGAACTCCAGCTTATATTGCACCTGAGGTTCTTACAAGGAAAGAATATGATGGAAAGATTGCAGATGTATGGTCTTGTGGAGTCACCTTATATGTGATGTTAGTTGGGGCTTATCCTTTTGAAGACCCTGCAGACCCAAGAAACTTCAAAAAAACCATTGGTAAGATACTTAGTGTCCAGTACTCAGTCCCAGATTATGTACGAGTTTCCATGGAATGTAGACATCTTCTATCACAAATATTTGTGGCAAGTCCTGAAAAGAGAATAACAATACCAGAAATTAAAAACCATCCATGGTTTTTAAGGAACTTACCCATAGAACTGATGGAAACTGGAAGCTGGCAAGTAAATGATGTAAATAATCCATCACAAAGTGTTGAGGAAGTGCTGTCTATAGTACAAGAGGCAAGAAAATCTCTTAATGTTCCAATTGTTGGTGGCCTTCTTAATGGGGGCACCATGGACCTGGATGACTTGGAGGCTGATGAAGAAGATCTTGAGGATGTAGAAACAAGTGGAGAATTTGTGTGTCCTCTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_02359::LG1:31497504-31499504(+)
TTAAACCATTCTATGTAACCATCAAATTTCATCCTAAATAAGAAATTGAAAAATGTTCCTCCTCATATCGTAATCCCAGATTTTAAAATTCTCAGTTTAAGTTCTCTAAACTTCTTTTTCTAAGTTTTAAAATTATTTTTACATTAAATTTTATCATAATTATTTTTACATTAAATTTATTTTAAGGAGTTACATAAGTTAGCAAACCTCTTATTTAAATTATTAAAAATAATAAAAATTTGAGAGTTTCAAGGAAACAATATAAAAAAACAAACAAAATTTAACTCATTCCAAAATAAAGTGGCTAAAAAGACAATTCTAGCCTTCAATTTTTTTTCTTCAATTGGTCTCCACAATTTTGAAAATAATGTTTTTAATCTAATTGTCTAATTGTCTAAAATAATTTTTTGATATGGGTTCCAGTTAACACACTTTATTTGTGCAAATAACAGGAAAGTAATTGCTAAAATAATTCTATTGACATTGAAATAAACAAATAATTTAAGTTTAACCTCATGTAGAAAGTATCACCTGTAAGTCCACATTAAAATAACATCTTAATGCGAACATTTGGACTAAAATTACTGATTGAGAATATACAAAACTAAATATCTTATTTTAATATACAAAACTAAAACTATGTATTCAAAATTAAGAAACTAATCATATTCTAGCCAAATACAAAATACAATTAAAACTGATTAAATAAAAATAATATGTAGGTACCTCAATTTCATTTAGAACAATTGAAATTAATCCAACATTTTGGTTCCGAATTCACCGTTTTATAGTAATGGGAATTAATTGTGAGAATCCGATGATCTATATGTCATTACTCAAAACCGTTCTTTGTCGAAAAATTCTTATATTGTCAAAATAGTATAATTTAAAATCATTGAAATCTTTATAGGTAAATATGATCCAAATTATTAGTAAATTTGAGAATAAAATTTTAATTGCCTCTAAAAGTACTTCATGGTTAAGTCTTGAGAATTGATTACAGAGCGAATAATTATCAGAGAAGCGCAAGTGAAAGAGGAAGACAAATTTGGATAGCCATCACTATTTTTTTAATCGTAAATTACAACTATTCTTTTCGTATTCTAACATAAAAAATAATTTTAAAAGATTGGATATATATACAAGAAACATAGGTAGCGTATCTACATAACTAATTTTTTAAAAATAAAATTCTTTTCACCACTCGTATTGATATCATTAAATATTACAAAAAAAAAAAATAGAAGCATACAAATTAAGAAGAGTCTTTTGGTCATAAATACTTACCTAACAATAATAGAAGTATGGCTAAAAACTAGAAATAATATTTTTTTGCCTCAGAAATAGTCACCTAAAAATAAATAGAAGTATAAATGTTTGAAGGAATATTTTTCCACACACCAGTTCTACCACAAGTTCTTCTAAGTTTTCAACAAATGACTGGCTGAAAATATTTAATAAAAGTAAGTACAAAATACAGTACTTTTTTTTTATCATTCTGAAATATTAATATGTTTATTTTCCTAACTAGGAAACCCAGTAAGCAATTTCTTAGAAAGAGGCAGCATTTAAGAAGTTCAGCAGTAGATATGAACAGGAAGTTTAATTTTAATTGGAAAATAGTATACCAAAAAAAAAACATCTTAAAAATTATGTTTTGTCCTATTTTCATAATTAAATTCAAAACGTGTCAAATGTTATGAGTTTGATTTATGCATTTGTTTTCTTTTTCGAATTTTTCTGTTCTCTGTTTTCCTATTTGTCACCCCGTGATTGTGGACAGCAACGTTCGTACTGAAGTCAAAGGGTGGGTTGGATTCCGTCTTTATTAAGACTTGATGGGCATTTTCACAAACCCGAGAACCTACTTTTCTGTCTCGTATGAATAAGACATTCATTTTGAGTTTGGCTTTTAATTCTTCATTCCTTTTATGTTAAAAAACGCAGCACACTGGTGTGTAGTGTAGTTGAATTGCAGTGAAATTGGCAATACTAAAACA


Gene Sequence:
>Vu_02359(+)
ATGGAGCGCTATGAGATTCTCAAAGATATTGGCTCTGGGAATTTTGCTGTCGCCAAACTGGTTAGGGAAAACCGCACCAATGAGCTTTTTGCTGTCAAGTTCATTGAGAGAGGCCAGAAGGTCTGCTTCATCTTCTTCGTCCTTTCAATTTCAGTTGCATAACTTTGTTTCTTTTTCTCTTTTTTGGCAAATTATTCATCTGGGTATGTGTTTTTTTTTTGCTCACTGTGGGACATTGGAATATGGGCTGCAGATTGATGAGCATGTTCAGAGGGAAATCATGAACCATAGATCATTGAAGCATCCCAATATTATTAGATTCAAGGAGGTTAGTAAAAGAATACTCACACTTCTAATAATGAGTGAAGGGTGGCTTCTATTTTTTTGGTTTTATGTTTAGCTCAATGATGAAATTCTGCAAAATATAAAATTCGCTTTTGGTCTTCATCCTACTTTTGAACAGCCTTTCTGTTTTGTTAATCTGTGCTATTTAGATGTAATATTTTAAGCATTCTTGGTTTAATTCTCTGACTACTTTTTATCGTTAAATGTTTTTTAACGTTTGAGGATCTGAATATTGGCCTAAAGAAAAGATGAGAATGTGAGATGCAAAGATTGTGTGGTGGTGGTGGTGGAAAGTAGTTACCACTCATGAAAGATGGGGAACTTGAGAAGTTAGCTTTGGAAACACTCATCATTATGACTTTGAATATTGATATACTTTTTATATTTTGGTCTCCTGTTTTGTTATTCTACCATGTATTGAAGTGGGTTGGGAATCAGAATTGAATTTAGCATAATACAAAGGTCCCCGCACCAAACTTTTTCGGATGTATTTATCCACTTTTTTTTTCAGTTTTCTTTTTTGCCCCCTTGATGTTTTTAGTTTAGACTGTGTGATTAGAAAAACCCATCCTACATTTTAGTTTTCTCTAATTTTCTATTTTTTATTTTCTCCTTTTCCTGTGTTTTGTGAATGGTATTGTTAATGTTTTGTGCTTCTGTTCGGAAAAAATTTAAATTTTATGATGAACTATGCACTAGGTATTTTACAATCTGAACATACTTACAATTGGAATCATATTCCAATCAGTTTCAAAAGAAGGAAAAAGATCCTTTGCGTGAGCTTTGATGAGTCTACTTGTAGGTCTTGCTGACACCAACTCATCTAGCAATAGTAATGGAGTATGCTTCTGGAGGAGAACTATTTGAGAGGATATGCAATGCTGGTAGATTCAGTGAGGATGAGGTAATATAGAAAGTGAGGTACTATTTGATTAGTTTATCTAGATCTATTTCAGTATAATGTTGTCTAGTTTTTATATTGTTGTTTAGGTTCCATTTGATAAGTCCAAAAGTTGAACTTAGTCTACTACACTTTTATTAATTTGGTCATGTTATGCTAGTGTATGCATTATTTCATTCAGAACTTGGGTCCTCAAGTCCTTGTTACTTTTTACCAGGCAAGATTTTTCTTTCAGCAACTGATATCTGGAGTCAGTTACTGTCATTCAATGGTATGAAACTAAACCTAACATGTGTCATGAACCATGTTCCTTCACAAAGAACAGATATTTATGGTAATGTCTATGCAGCAAATTTGTCATAGAGATCTGAAGCTTGAAAACACACTCTTGGATGGAAGCACTGCTCCACGACTTAAAATTTGTGACTTTGGTTACTCAAAGGTAGTATATAATGTTAACAAGGATTACAGCTTTGGATGATGATGCCCTTCTTCATGTGACATTAATTTATTATTTTCTTGTGTTTAGTCATCAGTATTGCATTCTCAACCTAAGTCAACGGTAGGAACTCCAGCTTATATTGCACCTGAGGTTCTTACAAGGAAAGAATATGATGGAAAGGTAAGGTCTTGTTTTTCCTCATTGCTTATGCTTTGGTTTTGGCTTTTTGTAACTTAGATACATGTGGTCCTTGCTGCTTTATTTTCTACTTATAAGTTTTCATTGGAAGCTATAGATTGCAGATGTATGGTCTTGTGGAGTCACCTTATATGTGATGTTAGTTGGGGCTTATCCTTTTGAAGACCCTGCAGACCCAAGAAACTTCAAAAAAACCATTGGTGTGAGTAAAATAACTGATGGCTGCAAATTTGTTGAATCCTTAAACAATTTTAGTATTAATATAAGAGTTTTTCTCACGATATGGTGTTTCAATTGGACCCTTTGTGGCTTATACAGAAGATACTTAGTGTCCAGTACTCAGTCCCAGATTATGTACGAGTTTCCATGGAATGTAGACATCTTCTATCACAAATATTTGTGGCAAGTCCTGAAAAGGTAACGGATTTAATATCTAGAATCTTAATTGTTTTCTGCATCTATAAAATACTTATTAGATAAAAGATTTAATTGCTTAATTTCTGGAGCAAAATGCTTATATAGATGCTCTTCATATTTATTCTCAGCTAACTTAATAGTTCCAGGTTTTGGCTTCTTCATGTTTTGGGCACAATTCTAGCAATGCTTATTGTTTCCTGTATTGAAATGCATTTAGACTCCTTTCCCATTGTATTGATCCATTTAAGGCATTTTACAGAGAATAACAATACCAGAAATTAAAAACCATCCATGGTTTTTAAGGAACTTACCCATAGAACTGATGGAAACTGGAAGCTGGCAAGTAAATGATGTAAATAATCCATCACAAAGTGTTGAGGAAGTGCTGTCTATAGTACAAGAGGCAAGAAAATCTCTTAATGTTCCAATTGTTGGTGGCCTTCTTAATGGGGGCACCATGGACCTGGATGACTTGGAGGCTGATGAAGAAGATCTTGAGGATGTAGAAACAAGTGGAGAATTTGTGTGTCCTCTTTGA

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