Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02320 LG1 30615223 30618856 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase PEPKR2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   peptidyl-serine phosphorylation, peptidyl-serine phosphorylation, intracellular signal transduction, protein autophosphorylation, protein autophosphorylation, peptidyl-serine phosphorylation, protein autophosphorylation
Cellular Component   is active in   nucleus, cytoplasm
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   calmodulin-dependent protein kinase activity, calmodulin-dependent protein kinase activity, calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity, calmodulin binding, calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity, calmodulin-dependent protein kinase activity, calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 30615280 3_prime_UTR_variant
G/A 30615417 3_prime_UTR_variant
T/C 30615685 missense_variant p.Glu392Gly
A/T 30615687 synonymous_variant p.Ser391Ser
G/A 30615691 missense_variant p.Ser390Phe
C/T 30615699 synonymous_variant p.Ser387Ser
G/T 30616016 intron_variant
C/T 30616099 intron_variant
C/A 30616184 intron_variant
G/C 30616317 intron_variant
A/G 30616423 synonymous_variant p.Asp311Asp
A/C 30616532 missense_variant p.Phe275Cys
T/A 30616793 intron_variant
G/A 30617002 intron_variant
A/T 30617077 intron_variant
C/G 30617112 intron_variant
C/T 30617181 intron_variant
A/T 30617340 intron_variant
C/A 30617343 intron_variant
A/T 30617368 intron_variant
C/A 30617630 intron_variant
G/C 30618054 missense_variant p.His180Asp
C/T 30618058 synonymous_variant p.Ser178Ser
T/G 30618231 synonymous_variant p.Arg121Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02320.1
MRSPNEMKKKRKESEASERSNWPEVSRSHYSLERGSRFNKRCREDGVATVPTRGASSLLTAARGLKRKIGCIDDATRMGRSVRIEDDYVIGGSTIGQGKFGSVTICRARAGGVEYACKTLRKGEETVHREVEIMQHVSGHPGVVTLKAVYEDAECWHLVMELCSGGRLVDKMREGPCSEHVAAWILKEVMMVVKYCHDMGVVHRDIKPENVLITGTGMIKLADFGLAIRICEGQNLKGVAGSPAYVAPEVLLGRYSEKVDIWSSGVLLHALLVGFLPFKGDSQDAVFEEIKNFKLDFQTGVWESISKPARDLVGRMLTRDVSARITADEVLSHPWILFYTAQTLNTLPVKSKLKPQNAATCHKFVTAPESGFGGNRMDDCSLNGSSSFSSSESGNSEYDDDCEWIDALTTAVSHVTISEAKRTKLWGPTGPFDSQGSSNLKTNLCKAF*


CDS Sequence:
>Vu_02320.1
ATGCGATCACCGAATGAAATGAAAAAGAAACGAAAAGAAAGCGAGGCCAGTGAGCGGTCGAACTGGCCGGAGGTTTCGAGGTCGCATTACTCGCTGGAGCGTGGTTCGAGGTTTAACAAACGGTGCAGGGAAGACGGCGTGGCCACGGTTCCCACTCGCGGCGCGTCGTCACTTTTGACTGCGGCCCGGGGATTGAAGCGGAAGATAGGGTGCATTGACGATGCCACGCGGATGGGGAGGAGCGTGAGGATCGAGGACGATTACGTGATCGGAGGGAGCACGATCGGGCAGGGGAAGTTTGGGTCGGTGACGATTTGCCGCGCACGTGCGGGGGGCGTGGAGTACGCGTGCAAGACTCTCAGGAAGGGGGAGGAGACGGTGCACCGCGAGGTGGAGATAATGCAGCACGTGTCGGGGCACCCTGGGGTCGTAACTCTTAAAGCGGTGTATGAGGATGCGGAGTGTTGGCACCTTGTGATGGAGCTGTGCTCCGGGGGAAGGTTGGTTGATAAGATGAGGGAGGGGCCGTGTTCGGAACACGTTGCCGCTTGGATACTGAAGGAGGTAATGATGGTGGTTAAGTATTGTCATGATATGGGCGTGGTCCATAGGGATATTAAGCCTGAGAATGTTCTCATTACTGGAACTGGGATGATAAAGCTCGCTGATTTTGGCCTCGCCATCCGAATTTGTGAGGGTCAGAATTTGAAAGGTGTGGCTGGGAGCCCTGCATATGTTGCACCAGAAGTGTTGTTGGGTAGATATTCTGAGAAGGTGGATATATGGAGTTCTGGGGTGCTCCTGCATGCTTTGTTGGTTGGTTTTCTTCCATTTAAAGGCGACTCACAGGATGCAGTTTTTGAGGAAATAAAAAATTTCAAACTAGATTTCCAAACAGGGGTGTGGGAATCGATATCTAAACCTGCTCGAGATCTTGTTGGGAGAATGTTGACTAGGGATGTTTCAGCAAGGATAACAGCCGATGAAGTACTGAGTCATCCATGGATATTGTTCTATACGGCGCAAACATTGAACACGCTGCCCGTTAAATCAAAATTGAAACCCCAAAATGCTGCTACTTGCCACAAGTTTGTTACTGCACCTGAATCTGGGTTTGGAGGAAACAGGATGGATGATTGTTCCCTAAATGGTTCAAGCTCGTTTTCATCCTCTGAAAGTGGCAATTCAGAATATGATGATGACTGTGAGTGGATTGATGCCCTTACCACTGCGGTTTCACATGTGACGATATCCGAAGCTAAGAGGACCAAGCTGTGGGGTCCCACTGGTCCATTTGATTCACAAGGTTCATCTAACTTGAAGACTAACCTCTGTAAAGCATTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_02320::LG1:30618856-30620856(-)
AACACACATAACTAAAATAACGCGTTTATTTGGTGAGATAATTAACTAAAAAGTAAGATATGGTGATTCTAATGCCTCCCACCTCTCCTCTTTAACATCGACATCAGAAATAGCATGCAAACTCTTTATGACATGTGGTTTATTTTGAATTTTATTACATGTGATGGCATCTAACTTATTATAACAGTTTTTTAGACTAATCATAATATGTTTTTTTAAATATAATTTTAATTTTGCTGCTATATTAACCTATTACAATAAGTTTTTCAAAATATGTCATAATATACAAAAGTGTCACTTATTATGGTTCGTGGATTTCATCTATTATAATAATAAAAAAAAATTTCATTAATTGATATTATAAACTTAACTTCTTAATAAATTTTTTTTATAAAAACTAAAATCCAAAACAAGTTATTAAGAGACTAAAAAAATAAACAAATTTTAGAGATAAAAAATATAGTTATATCTTAATAGTTATCTTTACGTATATATTGATTGGTAACTTAACTTATTTGCAGTTATTTACATTAACTAATCACTAACTGATACTAAGGGTTATAAATTAAATTATGACTTATCGTTTTATTCTGGCAGCAAATAGTAAATGTTCATCTTTAATTTCATTTTTGGTTTTTATATTAGAGAGAAAGTTAATTTATTAGCATTAAAAACTAGTATTTTATTTTACGATATGATAATTAGGAAACGGGGCATTAAATTATCTCCATTATGAGATTAATATCTGATTAAGGACTTATTGTTACTTTTAAGGTCTTTGTCGCTTCCTAATGCAGTGAATCAATGCCTTATCAATTAAGTCACACTTATTAAGTTTTCTTATAGACTTTGAATAATCTAATAAAATATTTTATGTATTAACTTTTTTCTGTTTAAAGTGGAAGAAAAACCATATTGATATCTCCACTTTTAATTATTCCATGTAAATAGAAATGCATCAATAATTAAGGTGCGAGTTCTAAGGTAAACAAAATATTAAATCGCAACTCCAATAAAAGAAAAAAAAAAGTACTCAATGGACACAAATAGAGTTTGACTGTGTGAAAAATAAAGTGCATTATCTCTATCTCTAAATAGAAATTAACACACTAACTCAAAGAAAAAAAATAAATTATTAGAAGAATGTTAAAGAAAAAAAAAATTTCTTATTTTCTAAACACTTAAATGGAAGAGATCAGTTTTGGTATTCCTTCAAAATATAAGAAAAAGCTTCCCTATGTAAGAAAGTTGGGAGGCTTATTGTTTCCGTAGATATTTTCGCGTATATCTTAACCGAATCGTAATAAAAACTGAAAAATGCCACATATAAAGATCTTTAAAATATTATTATTTTTCGAATACAATCAGATCAATGTGATAATTGAAGTAATCGTACTCATAATAAAAACAAGATTTTATGCGGAACAAACATTATTTATAAACTAGTACAACTTTTTCTACATTCCAACAAACTTTTATTCATTTTTAAATACTAATTAAAAACTAAATCTAAAAAAATCAATTTGGATTTGAACCATTAAGAAAACGTAACTATAACTTTAATGTAGACGAGGAAACGACTTTTGCCGTTAAGGATGTCATGTGTTAGGAATCAGAATAGGCAAATTCCGACGAACCCAAATTGCATGTCATAGCGACCAATACAACTTCTCATTTCTTAAAACGGGTCTATTGAAGTTGACTGGGCTTGATTTGGGTCATTAAATCAGCAGCAGAGGGCCCAGTTGAACAAGCAGATGGGGCCCATCTGTTAAACCACGTGTCGTCAATCTTTTTCGGTTGGTCTATCAACAAATAAAATAAACTAAAGGGAAACGCCACGTCACGTAACCTCAATCTTGTCCGCATATCCAAGCCCTCACTTGGGCCAACAAAACAATCAACGATCAAAACGAGGCCCTCCTATATTCTTATCGTGGTATGTTTCACGCCAGAATATCCTAGTCTATATATAACCCATCTAAGCAAAATGATAGATC


Gene Sequence:
>Vu_02320(-)
GAGAGTGTCATAGTGAGAAGACTCTTTGACTCGATAACAAACAAGCACCGTCGTGGTTCTCTTTTCTCGCGTGCCGTACGGTAATCCTAACCGAACTCACTCACTGCTTCGCTTCTTCACTCATTTACCCCAATCTCTGATCCCTTAATTTTAGGGTTTCACCCTCGATTTCTGGTTCTCTCACTGCAACTCATCTGATAATCTTTATTTTTCTTCAGATACCAGTGTTTTTTTGACGAGAGACAGGATCGTGTACTATCCGCTAATGCGATCACCGAATGAAATGAAAAAGAAACGAAAAGAAAGCGAGGCCAGTGAGCGGTCGAACTGGCCGGAGGTTTCGAGGTCGCATTACTCGCTGGAGCGTGGTTCGAGGTTTAACAAACGGTGCAGGGAAGACGGCGTGGCCACGGTTCCCACTCGCGGCGCGTCGTCACTTTTGACTGCGGCCCGGGGATTGAAGCGGAAGATAGGGTGCATTGACGATGCCACGCGGATGGGGAGGAGCGTGAGGATCGAGGACGATTACGTGATCGGAGGGAGCACGATCGGGCAGGGGAAGTTTGGGTCGGTGACGATTTGCCGCGCACGTGCGGGGGGCGTGGAGTACGCGTGCAAGACTCTCAGGAAGGGGGAGGAGACGGTGCACCGCGAGGTGGAGATAATGCAGCACGTGTCGGGGCACCCTGGGGTCGTAACTCTTAAAGCGGTGTATGAGGATGCGGAGTGTTGGCACCTTGTGATGGAGCTGTGCTCCGGGGGAAGGTTGGTTGATAAGATGAGGGAGGGGCCGTGTTCGGAACACGTTGCCGCTTGGATACTGAAGGAGGTAATGATGGTGGTTAAGTATTGTCATGATATGGGCGTGGTCCATAGGGATATTAAGCCTGAGAATGTTCTCATTACTGGAACTGGGATGATAAAGCTCGCTGATTTTGGCCTCGCCATCCGAATTTGTGAGGGTAAGTTGATACTTGATATAGATGTTTGGGTGATCGGTTTGGTCATATTAGGTTCATCAAGGCCTTAGGATGGGGCTTTAGTCAATAGGTTGTGATTATGGGTTTGTGATAGTTGACATCGCAGGATAAATGTCGCCGCAACCGTAATTGCGGCTAACGATTGCGAATTTATCGTGATCTTGAAATTATGGGAAATTGCGCAGAGTTGAGGCTGAGACTCTGGTTTTGGTTGCAGATTGGAGTTTTGTGACAAATGTGGTTGTTGCAGATTGCAATTTCTTTCAATTCTTAACTTTTTTGGAAATTGCTAGCATCGACCGCGGCAATTATTGTTGCATTCTTAGTTAGGGGTTTCGTGGTGATTCTTGACATTGTAGTAATTGAATCTTGTGGTCACCTATAATTGAGATGAGGATTGTCTTCTTTATTTACATATTTTGATCATTTCACTATTTCATGTGAGATCTCTGTTTCAAGATTTTTACAAAGTCCTTTGCAACGGCAATCGCAGTAGCATGAGCTGAAATTTTCATCTATTTTCTGCTATATAGGATTGTGATAAAAACCGTAGCTGTGACTGTGACCAAAATTTAAAGTCTTGTGTTTAATTGACTGTCCTTGTTGAAGTAAATTGAAAATAATTAATGTTGTCTTAAACTTGTTTGATAGTGGAAAATTCTACCCTGGTTAGTCTGTTAGTAAAATTTCTAGGCGGGTATGCAAGTATTTTTGACTATGTGATGAAAGTGTGAAGAAATTCTAACTACATTTTTACTGAAACAGTTGCTGATGGTGTTCATTTGACTGGTATTGTTGTTAGTTACAAGAGTAATTGAATTTTGGAATGGATCCTCTCATGTTAAAAAGATGATATTCTTAAGTGTGATGATGTCACCATTGACTGTATAAAATTTTCACTTTATGTTTTAATATTTTATTTACAAAATTTATACATCGCTGGAGAGAAATCATCCCCACAAAGTGTTGCTTCTGTTGCGACACTAAAATCAAATGCAAGAAGTTGTAGAGTCAAACACTAATGATAAATCACATATTTAGTTTGACATTTGGAGTCTCAAATCCACGGACGTGAAAAATTTAAGTTATTTATAGTAATTTTAGTTTGGGTGGGGAAATATAACATGAATTGTAATTTATACAGCGTTTATTGGATTTGTGTTCAAACACACAACGTCATTGATACCTTGCCTAATTGTTTGAAAATTTGTATTGCAGGTCAGAATTTGAAAGGTGTGGCTGGGAGCCCTGCATATGTTGCACCAGAAGTGTTGTTGGGTAGATATTCTGAGAAGGTGGATATATGGAGTTCTGGGGTGCTCCTGCATGCTTTGTTGGTTGGTTTTCTTCCATTTAAAGGCGACTCACAGGATGCAGTTTTTGAGGAAATAAAAAATTTCAAACTAGATTTCCAAACAGGGGTGTGGGAATCGATATCTAAACCTGCTCGAGATCTTGTTGGGAGAATGTTGACTAGGGATGTTTCAGCAAGGATAACAGCCGATGAAGTACTGAGTAAGTTTATGATAGATATATTATTGAGAGCTTGCCTGCTTTATCTTTTTCCCACGACTATGAACATACCAAAGATTTTAGTCAATTTGATCTTTTGTTGTTGTTAATTTAGTCTTGTAATAATTAACATAGATAGTATTTCCTGGTTTTATTGAAACTATGTTTGGCTCTCTGGTAGATTCTTATTAATGAGAGTGGTTTACCTTGTTTTGACAAACTGAGCTGATCCCTTGACATATACATTTTGTAAATGCTTGAGTGGGTCAGTTTTTTTTCTTGTTGGGGATAACAGTGAAAACCTACTACTAGTTTTACATGATTCTGTCGTTTTTATTACATACTTCCCTTGTATGTGGATAAAGTCTCTTTTCCCCAATTGCTTTTACTTTTAATAACAAAAAATTAAAGCTATACTTTTATGGACTCTGATGTATTGGTTCAGTCTTTCGCACTCGTTGTGTGCATGTTAAATTAACACTCGGTGGTTCATTTCCAGGTCATCCATGGATATTGTTCTATACGGCGCAAACATTGAACACGCTGCCCGTTAAATCAAAATTGAAACCCCAAAATGCTGCTACTTGCCACAAGTTTGTTACTGCACCTGAATCTGGGTTTGGAGGAAACAGGATGGATGATTGTTCCCTAAATGGTTCAAGCTCGTTTTCATCCTCTGAAAGTGGCAATTCAGAATATGATGATGACTGTGAGTGGATTGATGCCCTTACCACTGCGGTTTCACATGTGACGATATCCGAAGCTAAGAGGACCAAGCTGTGGGGTCCCACTGGTCCATTTGATTCACAAGGTTCATCTAACTTGAAGACTAACCTCTGTAAAGCATTCTGACCTACTGACAGAATGACACCGACCGCATACACCACAATATCGACTGCTTTAGCTGCGGTTTATAATAAACTTAGCCCAACAAATTCTACAGTTGGCAAAAGTGGATTTCATGCTAACATCCCATATAAGGTTGACCGCTGGGTACCAGTATCTGCCTTATTTTTTAGTGAAAAATCTAGTTACATTAATCTTCTTTTGTTCCTTTGTCCATATAACCTACTTTTGTAACCCCAGTTGTACAGAACTAGTACATATAATGTTAATGTGTGGCTGCATGATTTTACTCTTGC