Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02178 LG1 27392023 27399912 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   biological_process, biological_process
Cellular Component   is active in   cellular_component
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   molecular_function, molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 27392036 3_prime_UTR_variant
T/C 27392049 3_prime_UTR_variant
A/G 27392260 3_prime_UTR_variant
A/G 27392280 3_prime_UTR_variant
A/G 27392518 downstream_gene_variant
A/T 27392598 downstream_gene_variant
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T/G 27392954 missense_variant p.Thr860Pro
T/A 27393641 missense_variant p.Ile631Phe
T/A 27393645 synonymous_variant p.Thr629Thr
T/G 27393647 missense_variant p.Thr629Pro
A/C 27393648 missense_variant p.Asn628Lys
T/C 27393735 synonymous_variant p.Pro599Pro
G/T 27393861 synonymous_variant p.Ala557Ala
G/C 27393862 missense_variant p.Ala557Gly
C/A 27393928 missense_variant p.Gly535Val
A/T 27394365 synonymous_variant p.Pro451Pro
T/A 27394476 missense_variant p.Leu414Phe
C/T 27394635 synonymous_variant p.Pro361Pro
C/T,* 27394642 missense_variant p.Gly359Asp
G/T 27394869 synonymous_variant p.Ala283Ala
T/A 27394920 synonymous_variant p.Gly266Gly
A/G 27394976 synonymous_variant p.Leu248Leu
A/C 27395391 intron_variant
A/T 27395395 intron_variant
G/A 27395493 intron_variant
A/T 27395517 intron_variant
T/C 27395967 intron_variant
C/G 27396095 intron_variant
C/T 27396224 synonymous_variant p.Lys110Lys
G/A 27396243 missense_variant p.Ser104Leu
C/T 27396286 missense_variant p.Glu90Lys
G/A 27396417 missense_variant p.Ser46Leu
G/A 27396712 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/T 27396802 5_prime_UTR_variant
C/T 27397177 5_prime_UTR_variant
G/T 27397198 5_prime_UTR_variant
T/A 27397233 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02178.4
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>Vu_02178.3
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>Vu_02178.2
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CDS Sequence:
>Vu_02178.4
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>Vu_02178.2
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