Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02064 LG1 25329354 25331378 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At1g11050
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SNP Position Effect Amino acid change
A/T 25329377 3_prime_UTR_variant
T/A 25329387 3_prime_UTR_variant
A/T 25329392 3_prime_UTR_variant
A/T 25329420 3_prime_UTR_variant
G/A 25329493 3_prime_UTR_variant
T/C 25329496 3_prime_UTR_variant
A/C 25329667 missense_variant p.Asp561Glu
G/A 25329739 synonymous_variant p.Ile537Ile
G/A 25329855 missense_variant p.Leu499Phe
A/T 25329892 synonymous_variant p.Gly486Gly
A/T 25330053 missense_variant p.Ser433Thr
G/T 25330074 missense_variant p.Pro426Thr
G/T 25330100 missense_variant p.Pro417His
C/T 25330125 missense_variant p.Ala409Thr
G/A 25330167 missense_variant p.Pro395Ser
G/C 25330187 missense_variant p.Ala388Gly
G/C 25330296 missense_variant p.Pro352Ala
A/G 25330501 synonymous_variant p.Arg283Arg
G/A 25330543 synonymous_variant p.Val269Val
T/A 25330559 missense_variant p.Glu264Val
C/A 25330608 missense_variant p.Val248Leu
C/T 25330657 synonymous_variant p.Ala231Ala
C/A 25330675 synonymous_variant p.Leu225Leu
G/C 25330776 missense_variant p.Leu192Val
G/A 25330833 missense_variant p.His173Tyr
G/C 25330975 missense_variant p.Ile125Met
C/T 25331052 missense_variant p.Val100Ile
G/C 25331243 missense_variant p.Ala36Gly
A/T 25331304 missense_variant p.Leu16Met
T/A 25331378 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02064.1
MDKQVRLFLLHLISLLTVFTQGAASSRCPMDLSYVASIPWNTSICRGHIDTDRCCDTLRSVFAIGLAELLKDTHRFYLPNANTSSACLHDFAGRLSALSVSQNMVRLCFPNPSRFVFNSSACGGIRNTEDWNISVDRNTPLYSTCNGDLKDKTRCRVCSDAAHTLTEKLTAIHPNADAKRCFYYIALYAAALVNPFGTTDISTTSCILCLEHDVVVHGSSHGVELWKLGFALLGVVIGVVLAFVMIFVYRKWDKRKRQSVYHREIENKVRACVLPNVGAKWFRVDELERATERFSRKNVVGQGGDGVVYKGTLSDGAVVAVKEIYYLEGKGDEQFCYEVEIISKIKHRNLLPLRGCCISSGDLEGKRRFLIYDFMPNGSLSDQMCSDAANRLTWPQRKKIILDVAKGLAYLHYEIKPPIYHRDIKPTNILLDSKMNAKLADFGLAKQGSEDESHLTTRVAGTYGYVAPEYALYGQLTDKSDVYSFGIVILEIMSGRKVLDVLDSSAGLITDWVWTMTESGKMEEVFDQSIREGQEKIMERFVLVGMLCSHLAVALRPTIVDALKMLEGVIDIPQLPERPMPLGHESFQSSLLNGLQSSG*


CDS Sequence:
>Vu_02064.1
ATGGATAAGCAAGTGAGGCTATTCCTTCTTCATTTGATATCCCTCTTGACCGTGTTCACACAAGGAGCTGCATCTTCCAGATGCCCCATGGATCTCTCCTACGTTGCTTCCATTCCCTGGAACACCTCAATATGCAGAGGCCATATTGACACGGATCGCTGTTGCGACACGCTAAGGAGTGTCTTTGCCATTGGCCTCGCTGAGCTCCTCAAAGATACTCACAGATTTTACCTTCCTAATGCAAACACTTCCTCCGCTTGCTTACATGACTTCGCAGGCAGGCTTTCAGCCTTGTCCGTCAGCCAAAACATGGTCCGTCTTTGCTTCCCCAACCCATCACGCTTTGTTTTCAACTCTTCGGCTTGTGGGGGTATCAGAAACACGGAAGATTGGAACATTTCGGTGGACCGGAATACCCCTTTGTACTCAACTTGCAATGGGGACCTCAAAGACAAAACTCGCTGCAGAGTTTGCTCTGATGCTGCTCACACACTCACAGAGAAGCTCACAGCTATTCACCCTAATGCTGACGCCAAAAGGTGTTTTTACTACATTGCGCTGTACGCTGCAGCTCTTGTTAACCCGTTTGGTACAACCGATATAAGCACCACTTCTTGCATACTTTGCCTGGAGCATGATGTGGTGGTACACGGGTCAAGTCATGGAGTAGAACTGTGGAAGCTGGGTTTTGCGTTGTTGGGTGTTGTTATTGGTGTTGTTCTTGCTTTTGTGATGATTTTTGTGTACAGGAAGTGGGATAAGAGAAAGAGGCAGAGTGTTTATCACAGGGAGATTGAGAACAAGGTCAGGGCATGTGTTTTGCCTAATGTTGGGGCAAAATGGTTTCGTGTAGACGAGCTTGAGCGTGCAACTGAGAGATTTTCGCGGAAGAATGTGGTTGGTCAAGGTGGTGATGGAGTTGTGTATAAAGGTACTCTTTCTGATGGTGCCGTGGTTGCTGTTAAGGAGATTTATTATTTGGAGGGTAAAGGGGATGAACAGTTCTGCTATGAAGTGGAGATCATAAGCAAAATAAAGCACAGGAATCTTCTTCCTCTTCGGGGCTGTTGCATTTCAAGTGGTGATTTGGAAGGTAAGAGAAGGTTTTTGATTTACGATTTTATGCCTAATGGAAGCCTCAGCGACCAAATGTGTTCTGATGCTGCTAATAGGCTTACATGGCCACAAAGGAAGAAGATAATCCTTGATGTGGCTAAGGGGCTTGCTTATTTGCATTATGAAATCAAACCCCCAATTTATCATCGTGACATAAAGCCTACCAACATACTTTTGGACTCCAAAATGAATGCTAAATTGGCAGATTTTGGGTTGGCCAAGCAAGGCTCTGAGGATGAGTCTCATCTCACCACAAGGGTTGCTGGCACATATGGTTATGTAGCACCAGAGTATGCTCTCTATGGGCAACTAACTGATAAAAGTGATGTCTATAGTTTCGGTATTGTTATTCTTGAAATCATGAGTGGAAGGAAGGTGCTTGATGTTTTGGATTCATCTGCTGGTTTAATTACAGATTGGGTATGGACAATGACAGAATCTGGAAAGATGGAGGAAGTTTTTGATCAGTCAATAAGAGAAGGGCAAGAAAAAATCATGGAAAGGTTTGTTCTTGTTGGAATGCTATGTTCTCACTTGGCAGTGGCATTAAGGCCTACTATTGTTGATGCCCTTAAGATGTTAGAAGGAGTCATTGACATTCCCCAATTACCTGAGAGGCCAATGCCACTGGGTCATGAGTCCTTCCAATCTTCTTTGTTGAATGGTTTACAGAGTAGTGGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_02064::LG1:25331378-25333378(-)
AAGTGACATTCTCTAACATCCTTACTCCAAGAGTTGTCCGACCTCTCTTAAAGAACTCCTAAACACATCATTCAACACTATAAAAGTCACCATGACCAAAACACTTAGTCTTGTCCCATCATCAAATATCCATCTTCCATGATTTTTCTTTTAGTTTTGGTCCAATTTAGTTAGGAGATTGTCATCAATAAATTCGTAAAATCTTATAACTTTATCAATTAAGTTCTAATTTTAATTATAATAATAAATAAAAATACCATAAGAGACAAAATACATAATATATATATATATATATATATATATATATATTTATTAACATATAAAAACACACAAACCAACATTAACTTCATCAACTTATAAGTATGAATTAAAACTAGCATTTTTATTAAATTATAAACTTAAAATCTAACTAAATTTAACGACTTTCAGATTTTATTCTTCCAATTTCTCTGGGATATTTGTTATCATACAATAAGAGTCAATTGGATTAACTCCATTTGTATGTTTACAGTAATAAGCACATGTACATACTTTACTAAATATTATTTAAATCACGAAGTGATAGTATGCAAATTTTAAACAAAAATAAAATTATTGACGTATATGATTCGACAAAATAACTAATTAACCATCAAAATTATTAAACATTTTTAATAACATTTTTTTTAAAAAAAAACTTAAGTATCAAAATTACATAATTCAAACAGTAAATAACTATAATAATAAATAAAAACATTATAATTTTTTTTTTGGATTATTCATTCATTCATCTTAAATTCACCTAACCCACAAATTAAGTTTGACAGATTCATTTATTCCATATTTGGAAAACGTTTTTAACACAACCTGAGTTTTGAAGCCATAATAAATGAAGTTAAACTGACATGTGTGAACTCATTCTAACACTCCCGAGGCTTTTAGAATATGAAACCTAGAAAAGTGCGCAAATTTGGACTCATCGCTTTCTCGTAACTATAACAGCATGCACTCCTCTCTAAATACGTATATGAAGAGAATGAATTTTAGTAGATTTAAGATTAAAGTATTTAAAAATTTATATATAATATAATGAATAAAATAGATGAAAAATGTTTTAATAAATAAAAACTAAAAAAGTATTATTTTTCTCTTAATTATAAAAGTAATTTAATATAAAATATAATTAATAATAACATTATTATTATAAATATGAAGGCCCAATCCTTCCTCATTGAAAACAACATTACTGTTTGAACCGACAGCCACCACCTAATCCGCGTTTACATTCTAGAAGTAAACAAAAGGCTACGTTTTGGTTCCAGCGTCACAGCGCTGATTTCATTAATAACTATTTACAAAATATTACAGAAATTAAAAGTAATCGTGCTTCAGACTTTCCTTGCTCATATGCCAAGAAAGTGAAGGGAAGTTGTTCTTTTATAATTTTATATTAACATTTTTACTTATAAAATAAACCAATAATCTATTAAAAATTATTTAATTAAAAAGAAATAAAACATATTAATGTATATTTATTCTTTTGTTATAATATAATAACTAAGAAAAAGTTCTATATTATTTTTTATTTAAATTTATTTGAATTGAAATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTTAATAATAAATATAAATAATACTAATTTTTATTTTCATCTATTAAAATATTTTTTAATTAAATCTATTGTATCAATTTATTAATAAACAAAAGAGAGTGAAATAAAGAGGGAGTGACATAATTGTATGTCAAAATAAATGAGAGTGAAATAAATTGTATATCAAAATAATGTTAATAGAGACAAATAAAAAGTTTATAACAACAAAAAAAAACATTGTGTAAATATGTAAACAAAATACTTGAGTGAAGCTCAAGTTTTTGTTGTACTTGAGACGTTTGACCAATGCAAGAAGAACAACGTGTGTACATAGAAAAATCTACTCTGCTTAGAAAAAAAGAGTCTAGTTTTTATATTAAGGTTTCAAAGAGTCCAAAAGG


Gene Sequence:
>Vu_02064(-)
AGTGTTTGTTCTCCACCACAAACTGAAAAATGGATAAGCAAGTGAGGCTATTCCTTCTTCATTTGATATCCCTCTTGACCGTGTTCACACAAGGAGCTGCATCTTCCAGATGCCCCATGGATCTCTCCTACGTTGCTTCCATTCCCTGGAACACCTCAATATGCAGAGGCCATATTGACACGGATCGCTGTTGCGACACGCTAAGGAGTGTCTTTGCCATTGGCCTCGCTGAGCTCCTCAAAGATACTCACAGATTTTACCTTCCTAATGCAAACACTTCCTCCGCTTGCTTACATGACTTCGCAGGCAGGCTTTCAGCCTTGTCCGTCAGCCAAAACATGGTCCGTCTTTGCTTCCCCAACCCATCACGCTTTGTTTTCAACTCTTCGGCTTGTGGGGGTATCAGAAACACGGAAGATTGGAACATTTCGGTGGACCGGAATACCCCTTTGTACTCAACTTGCAATGGGGACCTCAAAGACAAAACTCGCTGCAGAGTTTGCTCTGATGCTGCTCACACACTCACAGAGAAGCTCACAGCTATTCACCCTAATGCTGACGCCAAAAGGTGTTTTTACTACATTGCGCTGTACGCTGCAGCTCTTGTTAACCCGTTTGGTACAACCGATATAAGCACCACTTCTTGCATACTTTGCCTGGAGCATGATGTGGTGGTACACGGGTCAAGTCATGGAGTAGAACTGTGGAAGCTGGGTTTTGCGTTGTTGGGTGTTGTTATTGGTGTTGTTCTTGCTTTTGTGATGATTTTTGTGTACAGGAAGTGGGATAAGAGAAAGAGGCAGAGTGTTTATCACAGGGAGATTGAGAACAAGGTCAGGGCATGTGTTTTGCCTAATGTTGGGGCAAAATGGTTTCGTGTAGACGAGCTTGAGCGTGCAACTGAGAGATTTTCGCGGAAGAATGTGGTTGGTCAAGGTGGTGATGGAGTTGTGTATAAAGGTACTCTTTCTGATGGTGCCGTGGTTGCTGTTAAGGAGATTTATTATTTGGAGGGTAAAGGGGATGAACAGTTCTGCTATGAAGTGGAGATCATAAGCAAAATAAAGCACAGGAATCTTCTTCCTCTTCGGGGCTGTTGCATTTCAAGTGGTGATTTGGAAGGTAAGAGAAGGTTTTTGATTTACGATTTTATGCCTAATGGAAGCCTCAGCGACCAAATGTGTTCTGATGCTGCTAATAGGCTTACATGGCCACAAAGGAAGAAGATAATCCTTGATGTGGCTAAGGGGCTTGCTTATTTGCATTATGAAATCAAACCCCCAATTTATCATCGTGACATAAAGCCTACCAACATACTTTTGGACTCCAAAATGAATGCTAAATTGGCAGATTTTGGGTTGGCCAAGCAAGGCTCTGAGGATGAGTCTCATCTCACCACAAGGGTTGCTGGCACATATGGTTATGTAGCACCAGAGTATGCTCTCTATGGGCAACTAACTGATAAAAGTGATGTCTATAGTTTCGGTATTGTTATTCTTGAAATCATGAGTGGAAGGAAGGTGCTTGATGTTTTGGATTCATCTGCTGGTTTAATTACAGATTGGGTATGGACAATGACAGAATCTGGAAAGATGGAGGAAGTTTTTGATCAGTCAATAAGAGAAGGGCAAGAAAAAATCATGGAAAGGTTTGTTCTTGTTGGAATGCTATGTTCTCACTTGGCAGTGGCATTAAGGCCTACTATTGTTGATGCCCTTAAGATGTTAGAAGGAGTCATTGACATTCCCCAATTACCTGAGAGGCCAATGCCACTGGGTCATGAGTCCTTCCAATCTTCTTTGTTGAATGGTTTACAGAGTAGTGGTTGAACATGTAAGGCACTTGTTTATCTTATTTGAGTATGAGCAAAATGTAAATACAGATCCGTTTCCTTTAGAATTAGGTAGCACTTTTACTAGTAAAGTTCAAAGAAAAAATCATATTGTAAAATGTTTGTGTATTCAAGAGTAAGAAAATTAGTTATTATGATTAAATGTATTTTAGGTTCCTCAAACCTTGCTTTTG