Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_02058 LG1 25264920 25266158 transcription repressor MYB5
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 25264982 synonymous_variant p.Ser288Ser
A/G 25264999 missense_variant p.Cys283Arg
C/T 25265000 synonymous_variant p.Ser282Ser
C/G 25265064 stop_lost p.Ter261Serext*?
C/G 25265148 missense_variant p.Ser233Thr
A/G 25265208 missense_variant p.Met213Thr
C/T 25265420 synonymous_variant p.Pro142Pro
C/T 25265444 synonymous_variant p.Leu134Leu
G/A 25265460 missense_variant p.Pro129Leu
T/G 25265503 missense_variant p.Ile115Leu
C/T 25265511 missense_variant p.Arg112His
C/T 25265665 intron_variant
G/A 25265755 intron_variant
G/T 25265765 intron_variant
G/A 25265772 intron_variant
G/A 25265871 intron_variant
C/T 25265955 splice_donor_variant&intron_variant
T/C 25266000 synonymous_variant p.Lys53Lys
A/G 25266003 synonymous_variant p.Ser52Ser
G/T 25266027 synonymous_variant p.Ser44Ser
A/T 25266033 missense_variant p.Asn42Lys
C/T,* 25266067 missense_variant p.Ser31Asn
A/G 25266114 synonymous_variant p.Thr15Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_02058.1
MRNPSSTSTTKNKKTGGGSNSTTTSYNSNNSNNNNISSSNNNGSNTNTPCCSKVGLKRGPWTPEEDEVWSLIAGRIPGRTDNEIKNYWNTHLSKKLISQGIDPRTHKPLNPPSMNINIPSSSTPSTTFTVTPPSVPPPMIITGHNPCHDLTLVNQGIHAIHHLGQHLQPPVSNPFDNNNISNQVAAVTDDVSAMGFMDSEDCNDDININYYSDDVFSSFLNSLINEDAFASQQHHVQTELPSERCIPLPCDDRVDDPLVSMTTASTSQGYDDDLGVLWESPLVPSTTFAHHVNDPIIKMAHDHHHHNQ*


CDS Sequence:
>Vu_02058.1
ATGAGAAACCCTTCATCAACATCAACAACCAAGAACAAGAAGACTGGTGGTGGTAGTAATAGCACTACCACCAGCTACAATAGCAACAACAGCAACAACAATAACATTAGTAGCAGCAATAATAATGGTTCCAACACCAACACTCCATGCTGCAGTAAAGTTGGCTTGAAGAGAGGACCATGGACACCAGAAGAAGATGAGGTGTGGTCTTTGATTGCTGGGAGGATTCCTGGAAGAACAGATAATGAAATAAAGAACTATTGGAACACCCATCTAAGTAAAAAGCTCATTAGCCAAGGGATTGATCCCAGAACTCACAAACCTCTCAACCCACCGTCCATGAATATCAATATTCCTTCTTCTTCTACTCCTTCTACTACTTTTACCGTCACTCCACCCTCTGTGCCTCCTCCAATGATCATCACCGGCCACAACCCTTGTCATGATCTCACTCTTGTTAATCAAGGAATTCATGCGATTCATCATTTGGGTCAACACCTCCAACCTCCCGTTTCAAACCCCTTTGATAATAACAACATTAGCAATCAAGTGGCTGCTGTCACAGATGATGTTTCTGCAATGGGGTTCATGGACAGTGAGGATTGCAACGATGATATCAACATCAATTATTACTCAGATGATGTTTTTTCTTCCTTCCTCAACTCCTTGATCAACGAGGATGCTTTTGCGTCCCAGCAGCACCACGTGCAAACAGAGCTCCCCAGTGAGCGTTGCATTCCACTGCCGTGTGATGATCGTGTGGATGATCCTCTGGTTTCAATGACAACTGCTTCCACATCGCAGGGTTACGATGATGACCTTGGGGTTCTCTGGGAATCGCCTCTCGTGCCTTCTACTACTTTCGCCCATCACGTTAACGATCCCATCATCAAGATGGCTCATGATCACCATCACCACAATCAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_02058::LG1:25266158-25268158(-)
TTTTCAATACTGATTTTCTTTTTTATGTTTATAAGAAAAATATATGATTTGATCTATAAAAATATTGAAAGATTAATAAAAAGAAGTATGTTTATCATTTAAATATTCATGTATCATTGTTAATTATCATTGTCAATGATCAGGGTAGTCCAAAGTCGTTTTATATATTTTTTATTTATATATGTTTTGAAAGTGTAAGATATATAATTTGATGTATGGAAAAGGGTTAAAGCACATCAATTGCTTCTTATATTTTATTAATTATTTATCGTTGATAAAAATAATAATTATATTTTAAGTTCTTAAATTTAATTATTAACACAGAACACTTTAGTCCCTCAGATTAAGAAAATACAGTCCTTTAAATTTACCGTTTAGGAATTGAAAAAACACTTTAATTACTCAGATTTAGTATATAGCCTTTTTCTAAATTTGGAAAACTGAAAAATTTAAAATTTAAATGGGATTTACTTCACGTTTTATGAACTAAAAATATAAGTAAACCTATTTTTTCAATGTAAAACGTGTGGTTTAATTGAATAATATAGTTTTACCATGTTATCATTTTCAACATTTGTCCTTCGTTGTTAAGAAACTCCATCCAATGGACGAAAGACACGTCCTAGACAATGATTTCCAATACAGGTAATTATAAAATACACCCTTAACTAATTTTTTTTATTAATATGTAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATATAAACTTTAAAAACTTTATCATTATTCTTTATAATAAACTATTATCTCCTTTAATTTTCATACTTTTTATTTTATCCTCAATTATTTTTTAAATTTTGAAAAAATAAAGAATAAAAGTAATTATCTAAATGATAAGAGCACACATTTCAATCCTCCTTTTCACTAGTAATACTAAGGTGAATTGTCAAGTAATTATATTTTAAAAACTAACTGTCAAAATATAATTTTTTTAATCATTAATATAAAAAAAGCTCAGCCATGCTAAAAGGACCAAAATCAGTGATTATCCAAAGAGAACATAACTAAAAGTAATCACTGTTAATATGGTATAGATAAGATCGTACAAACTATTATTTTTATTTTGACAACCATCATAAAAAAATTGAACATAGTGCGATATCACGTGGATGTTAGTATTAACACAGATAGATTGTAATTCGACAGTTATTTGAAAAATTATTTTCAGAATAATTTAGAAAAAAAAATTGAATATGTTTACAAATTTTAATAATATATCAAAGTGCCAAACACACAAGAGAATATAAAGTGAGAATATAAAGTGAGAATAAGGACAAAAAGAAAGTAATAATAGTAAAAGTAAACGTAAAATATAACATGAAATAATACAAAATGTTACTATATATAACAAAAGAGAGAGATGAAACAATAAAGTCACAGAAGAAATAATTACATACTTTGATCATAGTCTCTACAGCTATTTTTTTTACCAATCATTGCTCAATAATTAAAAAAGTGATTTAACATTTAAACTTAAACGTGCTCAAACCTTTAATTTTTTTCACACGCACGTGCTCACTTATAAACCCTCAGTTTATTTTTTTTTTCTTTTTGTTAAGTGAAATCAAGAACTAAAAATGAATTAAAATTACAAAAAAAAAAAAATCACTGGCGGGTAATGATAGTTGCATGGTGTAGTGTTGGTTCCTACCAGAGAGATTTAAATATGTTTTTTAGAAACAAAAAGAGAGAGACAGAGAAACAGAATTATTAAAGGCACACAGTAAAAGACAAAAGGTTTAGTTGTCAAGTAAGAGAATAGAGATCTCCATCCATTCGTGGATCTCACTGGCGCCTGAGGCGCGTGTGCATTTGGGGTTTCTCAAAAAATAGAAAGATGATAGCTTGGAGAGACAGTTATATAGGCACCCTTTCCACGATCACTTCCTTCCTAAACCCAAACACAAACCCACTCAACACCACTATATATTTTTTCATTCCACTTCATTCCCTCAACCACAACAAC


Gene Sequence:
>Vu_02058(-)
ATGAGAAACCCTTCATCAACATCAACAACCAAGAACAAGAAGACTGGTGGTGGTAGTAATAGCACTACCACCAGCTACAATAGCAACAACAGCAACAACAATAACATTAGTAGCAGCAATAATAATGGTTCCAACACCAACACTCCATGCTGCAGTAAAGTTGGCTTGAAGAGAGGACCATGGACACCAGAAGAAGATGAGGTGTTAGCCAATTACATCAAGAAAGAAGGAGAAGGGCGTTGGAGAACGCTCCCCAAGCGTGCTGGCCTTCTCCGGTGCGGCAAAAGCTGCCGTCTCCGCTGGATGAACTACCTCCGCCCCTCCGTCAAACGCGGCCACATCGCCCCTGACGAGGAAGATCTCATCCTCCGCCTCCACCGCCTCCTCGGCAACCGGTAATATACATATTGTTTACATTCAGGGTTTAGGGTTTCTTCTTGTCAAAAACAGAATTAGGGTTCGTGTTATTTCTTCTCTTTTCTAGCTAGGGTTTGATTTCTTGTCTTGTGTATTAGGTGGTCTTTGATTGCTGGGAGGATTCCTGGAAGAACAGATAATGAAATAAAGAACTATTGGAACACCCATCTAAGTAAAAAGCTCATTAGCCAAGGGATTGATCCCAGAACTCACAAACCTCTCAACCCACCGTCCATGAATATCAATATTCCTTCTTCTTCTACTCCTTCTACTACTTTTACCGTCACTCCACCCTCTGTGCCTCCTCCAATGATCATCACCGGCCACAACCCTTGTCATGATCTCACTCTTGTTAATCAAGGAATTCATGCGATTCATCATTTGGGTCAACACCTCCAACCTCCCGTTTCAAACCCCTTTGATAATAACAACATTAGCAATCAAGTGGCTGCTGTCACAGATGATGTTTCTGCAATGGGGTTCATGGACAGTGAGGATTGCAACGATGATATCAACATCAATTATTACTCAGATGATGTTTTTTCTTCCTTCCTCAACTCCTTGATCAACGAGGATGCTTTTGCGTCCCAGCAGCACCACGTGCAAACAGAGCTCCCCAGTGAGCGTTGCATTCCACTGCCGTGTGATGATCGTGTGGATGATCCTCTGGTTTCAATGACAACTGCTTCCACATCGCAGGGTTACGATGATGACCTTGGGGTTCTCTGGGAATCGCCTCTCGTGCCTTCTACTACTTTCGCCCATCACGTTAACGATCCCATCATCAAGATGGCTCATGATCACCATCACCACAATCAATAG