Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01801 LG1 21308059 21312401 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At1g80640
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   mitochondrion, chloroplast, extracellular region
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 21308313 downstream_gene_variant
C/T 21308363 downstream_gene_variant
T/A 21308846 downstream_gene_variant
T/C 21309212 downstream_gene_variant
C/G 21309238 downstream_gene_variant
A/T 21309337 downstream_gene_variant
T/A 21309350 downstream_gene_variant
T/C 21309409 downstream_gene_variant
G/T,* 21309416 downstream_gene_variant
G/A,* 21309417 downstream_gene_variant
A/G 21309475 downstream_gene_variant
A/G 21309492 downstream_gene_variant
G/T 21309539 downstream_gene_variant
C/A 21309555 downstream_gene_variant
C/T 21309570 downstream_gene_variant
A/T 21310049 downstream_gene_variant
G/C 21310211 downstream_gene_variant
G/A 21310216 downstream_gene_variant
A/C 21310217 downstream_gene_variant
A/C 21310275 downstream_gene_variant
A/G 21310337 downstream_gene_variant
A/T,* 21310377 downstream_gene_variant
A/G 21310390 downstream_gene_variant
T/A 21310392 downstream_gene_variant
A/G 21310561 downstream_gene_variant
A/T 21310657 downstream_gene_variant
A/G 21310660 downstream_gene_variant
T/C 21310662 downstream_gene_variant
A/G 21310671 downstream_gene_variant
G/A 21311104 stop_gained p.Gln170*
A/T 21311212 missense_variant p.Ser134Thr
T/C 21311266 missense_variant p.Thr116Ala
T/C 21311275 missense_variant p.Ser113Gly
C/T 21311330 downstream_gene_variant
T/A 21311360 downstream_gene_variant
A/T 21311370 downstream_gene_variant
A/G 21311415 downstream_gene_variant
G/A 21311422 downstream_gene_variant
C/G 21311790 missense_variant p.Gly61Arg
C/A 21311873 downstream_gene_variant
A/G 21311909 downstream_gene_variant
T/G 21311997 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01801.1
MKTKLLLLLLMPLLMLHKPIWTLASPYPFAPSPQVPLFSPFPNSMSASSPGMVMGAEQRQMDSHKKMVIAIAIASTSLGAVILSVLCIWIYHTKYPSKSKGKNVQRSDAEKGLASAPTLSKFSSIKLVGKKGCVPIIDYKQIEKATGNYKESNILGEGGFGCVYKAQLDDNLEVAVKKLHCENPCAEQEFENEVELLSKIQHPNVISLLGCSSNEATRIIVYELMHNGSLETQLHGPSHGSALTWHLRMKIALDTARGLKYLHEHCYPAVIHRDLKSSNILLDAKFNAKLSDFGLAITNGTQNKNNIKLSGTLGYVAPEYLLDGKLTDKSDVYAFGVVLLELLLGKKPVEKLAPAQCQSIVTWAMPQLTDRSKLPNIVDPVIKDTMDPKHLYQVAAVAVLCVQPEPSYRPLIADVLHSLIPLVPVELGGTLKVAQLPQQVLPANPHEDSSP*


CDS Sequence:
>Vu_01801.1
ATGAAAACGAAGCTTCTTCTTTTGCTTCTCATGCCCCTCCTTATGCTCCACAAACCCATTTGGACTCTTGCCTCTCCATACCCTTTTGCTCCCTCACCTCAAGTTCCACTCTTTTCTCCATTTCCCAATTCAATGTCTGCTTCCTCTCCAGGAATGGTGATGGGGGCTGAACAGCGGCAAATGGATTCGCACAAGAAAATGGTAATTGCCATTGCCATAGCCAGCACTTCGCTTGGTGCAGTCATTTTGAGTGTGTTGTGCATCTGGATTTATCATACCAAGTATCCTTCAAAATCCAAAGGGAAAAACGTTCAAAGATCAGATGCCGAGAAAGGGCTAGCTTCAGCACCAACTCTGAGTAAATTCAGCTCTATAAAGCTGGTTGGTAAGAAAGGGTGTGTTCCAATAATTGATTATAAGCAAATAGAAAAAGCCACCGGCAATTACAAGGAAAGTAACATCTTAGGTGAGGGAGGTTTTGGATGTGTTTACAAAGCACAATTGGATGACAATTTGGAAGTTGCCGTTAAGAAATTGCACTGTGAAAATCCGTGTGCTGAACAAGAATTTGAGAACGAGGTGGAATTGTTAAGTAAAATTCAACATCCAAATGTAATTTCTCTGCTGGGATGTAGCAGTAATGAAGCTACAAGGATTATTGTCTATGAATTGATGCACAATGGATCATTGGAAACTCAATTACATGGACCTTCTCATGGCTCAGCATTGACTTGGCATTTGAGGATGAAGATTGCTCTTGACACAGCAAGGGGATTAAAATATCTGCATGAACACTGTTATCCTGCAGTGATCCATAGAGATCTGAAATCTTCTAATATTCTTTTAGATGCAAAGTTCAATGCTAAGCTTTCTGATTTTGGCCTTGCCATAACCAATGGGACCCAAAACAAGAATAATATCAAGCTTTCAGGCACGTTGGGTTACGTAGCCCCGGAGTATCTTTTAGATGGTAAATTGACTGATAAAAGTGATGTATATGCTTTTGGAGTTGTTCTGCTGGAGCTTCTTTTGGGAAAGAAGCCTGTGGAAAAACTAGCACCAGCTCAATGCCAATCCATTGTCACATGGGCCATGCCACAGCTCACAGACAGATCTAAGCTTCCAAACATCGTGGATCCTGTAATTAAGGATACAATGGACCCCAAACACTTGTACCAGGTTGCTGCAGTGGCCGTGCTGTGCGTGCAACCAGAGCCAAGTTACCGTCCCCTAATTGCAGATGTTCTCCACTCACTCATTCCTCTTGTCCCTGTAGAGCTTGGAGGAACACTTAAAGTAGCACAGCTGCCACAGCAAGTATTACCTGCTAACCCACATGAGGATTCTAGTCCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_01801::LG1:21312401-21314401(-)
TTTTCTTATCATAAAACTTAATGATTTATGATTTGTTAGTATTGTGCATGTTAATTATTTCTCAGAGACAAGAGACTCAAATACTATTAAGAAAAAAAAAATTGTCTCTAATGTTTGTAATGATATAGCATGATTAAGAATAAAGGAACCCTAATAATAATCACTCATTCATTAATAACTTGTTTATACAAAGCTCAAATATGAACCAACAAGTTCTTCAATAACAAACCAAACCTCAACGACCAACCCAGCAATAGCTAAAAGAGGAAAATATTCTTTCAAGAAAATGTATCTAACAAGCTTTTAACACAATTTATTAATGAGAATTCACTTAACTTACTATTAATCAAAATTAATATCGTTTTTAAATAATAACATAATATATTTTTCTTATTCTTTTTTTGTATTACTATTTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGGATAATAACACACAATTATAATACCCGAGGAACCAAAAAGGTAATTAATTTTTTTTAAGAAAAACTAAAATTAGTTTATACAAACTAATTTATAAAAAAAATCCCCAAAAACTTATTTTTAACACATATATACATAACCTAATTTTAACTTGGAAAAAAATATTATTTTTTATTAATGTTATCTCGAAATTTATTAAAAAAATTGTATAGGACCATAAAGCTTGTAGATTTACGGAATTATTTCAATTTGAATAATACTTCCAAAGTTTAAGTATATAACTACCATAAATATTTATGAAAAAAATCTCAGTGTAATGATTGCTCGTACTAAAAACAATAATAGGTTCAGAGTTAGAAAAATATGGTTTAATTTGATTTAACAATTATTTTTAACCAATAATTTTCCTTTAGGTACCAATGATTCGACTATGCTTTTAAGATTTTTCTTATCCATGAGCAGTGACAATGACATTTGTGATTGTAAGTATTAACTATATTAGACTTTCCTACAAAATGAACAAGGAAAAGGGTACTAAACAATTAACGTAATTAGTTATATTTTTTTACTCCCTTTGATTATGGCATTTTCGTTTTCAAATGACCCTAAATTAGAACAAATATTTTCACACCAAACCATCTAAATATAGTTATTGTATGTTAATACCAATCAAATTTAACTCACACATGTTTAAAAATTCATATTTTCGTAAACTTACAAAGATTATATACGTAGATTTGTTCAATCTTCCACGTTACATGATTAGGGTTCGTCACATGGGGTCAGATTAAAGAAAAAAAAGGAAAAATTCAAATTGATTGATTTAGGTTTTGTTGGAGGCAATTTTGCCAAAAAACCAAAAATCCAACTTAAGCTATGGTTAGACCATATTAGCTAATGAATTAAGTTTATGAACTACCAGCTAAAAGTTGAATAGCGAAAAATTAGTTTATTGAAATAAAAGTAAATGATAATAACATTAATCTTTTTTCCTTGATGATTTGAATAAAATCTATTAAAAAAATTGGGGTGATGCTCACAAGTTTCTTTATCCTTCTTTAAAGTTTGGGCTTAAAGATTGTGGGTGAAAGGAGTGTTTGTTTCAAACATTGAAAACAATGCACGAGTGCACATGATTGTCGTGCAGTTGCCCCCACCTTAAAATTAAACCTCATCAGTTCATTGTTGTCCCTTTTTCTTCCATTGAGAAAGCATGAGAAAGACAGTTAAAGAAGGAGATAAAGGAGAAAGATGAGACAGAGAATGCTCAAATAAAAAAAAAAAGGGTTAAAAAAGATAACATAAAGCAAATGTTTTTTTGGAAGTTTAAAAGAAGAGGTCAAGCCTCAAAGATCTCAAAACACACTCTCACTTTCTCTCACTCTGGGAGTGTGGTGGTGTTGCTTTTTGTGTTTGTGTTTGTGTGACACAACAACCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTCTTTCTTTTCTTTCTTTTCTTTCACTCACACATCTATTCTATCTTTATCTTCATGTTTTCTTAGAAAGAAACA


Gene Sequence:
>Vu_01801(-)
ATGAAAACGAAGCTTCTTCTTTTGCTTCTCATGCCCCTCCTTATGCTCCACAAACCCATTTGGACTCTTGCCTCTCCATACCCTTTTGCTCCCTCACCTCAAGTTCCACTCTTTTCTCCATTTCCCAATTCAATGTCTGCTTCCTCTCCAGGTTCTTTCCCTCTTTTTCTCTGTGTGTGTTTTTCTTTGTTATTCGGGGACAATTATGTTCAGATACTAAATGTAGATACTTGTTGCAATTTTATGTTTGTCTGTTGCTGTGTCTGATTCATTACTTATGTTTCTGTTCCATTTTGTTGTCCTGTCACAATCTGTGTCACTTCTGATGGAGTGGCATTCAACAGTTTCGAATTTGAATTTGAAAATCATGATAGGCACTTAATGCTGATAGGTTGTAGTAACTAATTTTTATTCATTTCTTGACTGGTGCGTTTTATTGTGTGGATTTGGATCCTGCACTACCCTTTTGCTTAAACTCTATTAACTTGTCATTAATGGTTTGAAATTTGAATGAATTGGACATGTTTTGTTTCCATGTATTTGATTTGATGCTCACTGCTATATACTGCATATTTGTCAGGAATGGTGATGGGGGCTGAACAGCGGCAAATGGATTCGCACAAGAAAATGGTAATTGCCATTGCCATAGCCAGCACTTCGCTTGGTGCAGTCATTTTGAGTGTGTTGTGCATCTGGATTTATCATACCAAGTATCCTTCAAAATCCAAAGGGAAAAACGTTCAAAGATCAGGTTTTTTCCCCTTTTTTTCACAATTCCATTTCTCAGAATCTCATGAAATGTGGTTTGGTTAAACTTTCTTTTTTTACGTTTTTCTGTTTTTACTTTGTTTCCTATTTTCTGAAGAATGAAAACAGAAAACAATAAATAGTTGTTTTCACTGTTCTCAATGCAAACCTTTAAAATCAAGAACTACAGTTAAGAAAATAAAAGCTTTTCTTTTTTCAAACCAAAAGATCTCTTAGGTTTCTATTTCGCTTCACAAATCACTATTTTTGGGATTTCAAGGAACTTTTGACATTAATTTGCGTTCTTGGTAATGTCTGAGGTTTGTAATTTTTTCCCTTTTTTTCTGTAATTTGAATTCCAAGATGCCGAGAAAGGGCTAGCTTCAGCACCAACTCTGAGTAAATTCAGCTCTATAAAGCTGGTTGGTAAGAAAGGGTGTGTTCCAATAATTGATTATAAGCAAATAGAAAAAGCCACCGGCAATTACAAGGAAAGTAACATCTTAGGTGAGGGAGGTTTTGGATGTGTTTACAAAGCACAATTGGATGACAATTTGGAAGTTGCCGTTAAGAAATTGCACTGTGAAAATCCGTGTGCTGAACAAGAATTTGAGGTAATCCTTGCTAATAATTTATTCATTTTTCCATCATTATTATATTGAATAGTTGTGCTTCTATGAATTTACAGAACGAGGTGGAATTGTTAAGTAAAATTCAACATCCAAATGTAATTTCTCTGCTGGGATGTAGCAGTAATGAAGCTACAAGGATTATTGTCTATGAATTGATGCACAATGGATCATTGGAAACTCAATTACATGGTAAAACATTTTTTATATGGTTTATTACCTAGTATAAGACACATGATTAAGATATAATGAGGTCGGCTGTAAAATTATTATTATTTGAAGGACCTTCTCATGGCTCAGCATTGACTTGGCATTTGAGGATGAAGATTGCTCTTGACACAGCAAGGTGACCTTTCCTAAACAATTCTTTATCTATATCATCCTATTTGCTTAGAAGCAATGCTAGTTTCACTGTTTTCCATGCATTTTTTTATTATTCTTGAAATTTATTGGAAGTCACAAAATAATTAGCCATCTTATTCAATTGGTCTTATTTACTCCTTCCATCTCATTGCTAATGTAGTAGTATTAAAAGAAAAAATAAATTCTAAAATTACTGTCATTTTAGTTTTCTAATATAGGGTGAGTTTATTTGTGTTTTTTTCTTAAATATTTTATATATAAAATAAGCATATTGATGTGTTTTTTTAAAAAAAAAAATTGCTTATTTTAAAAATAATTAGTAATATGCATGTTTTTAAAAGAAGCAAATTCTACCTTCTTCTTAAATAAGTGATTTGTTTTAAAAATTATTTACTTCAAACACTTTTATGAGTAACCAAACTGATCCATAATAATAATTACTTCTTCTTTTCATTTCTACCACTGATAATCTTTTTTAGAATGCTGGTGTTTTGTTAAATTGTTTCCAACAAAAAACTATGACAGTGAAAGAGTATGTATAGTTTAATTACATTCAATAATTTTCTGTTAATGATGAAGTGTGTTAAAAGTGTGTGAGTGTGTTGTTTGCAATTTTTTATCTGGTTTATTTTGTCTTTGTTGACATGGTATTTGATTAATGCCAACCAGGGGATTAAAATATCTGCATGAACACTGTTATCCTGCAGTGATCCATAGAGATCTGAAATCTTCTAATATTCTTTTAGATGCAAAGTTCAATGCTAAGGTAAAACAAAAAGGCCATGTTCAATTTGCTGCATTTATTATTCTTTTTTTGTACCATTCATTTTTATTGTGTTCACAAAAGCTTCTTTTCTGCGTGTTGTAACTGGTGCATTCAGCTTTCTGATTTTGGCCTTGCCATAACCAATGGGACCCAAAACAAGAATAATATCAAGCTTTCAGGCACGTTGGGTTACGTAGCCCCGGAGTATCTTTTAGATGGTATGAACTGAACTCATATGACATAATTTCATAGCATATGAAATGGTCTGACAAGTTGCTAAATGTTTAAAACTTTCAACATACCAGATCCAAGATAATTGTATTTTTGGACACTAAAGGGTGGCTTTGAAAGTGTGATCTGTGCAAGAAACATGATTGGATGATTCTAAGCAAATCCTTACATAATTTATAGATTTTGATAGTGTAGTTCTTTTGATTACGTACTGTGCAGATAGACTGTCAAATTTACTTACAGAACAACCGTTATGAAACTAATATTGTGTATAAATTGTTTTTCTTTTGTTAATTCATTTTCGTAAATTAAAAAACCTGATTAAGTGTGATATGAAGATTGATTGAAGGTATGAACACATGATAGTCCTGAGCCATTTAATAGCTTTTAGTTGTGTGTACCTTGTGCTTCTCTTGGGAATGTACGTGCCATCTGATCTGGCAAGTTATATAGATTATTATTAAATTAATATGTTGTCTGTTACACCTTACAGTCCCATATGCCTAGTTTGCTCCAGCTGCTTCTTGTCCGTGATAAAAAATAATAATGATAATAATAAATGTCCTAAAGATGCGAACTGAAATTTGTTCTCAGCTAGTTCAATTGATTCCTGTCTTAAAGATGAGAAACATCGAAAGTATAATACCTTTTTTATTCAGTTGAAAACTTTAATCATGTGGCAAGTTTATTTTTAATTATCATACTGTGAATCAAATTACTACACGTTAATAATGAGATGTTCTTGGATCGCTTTTCCAGGAATGTTCTTGGAATACGGAGAAACAGTTATTGCAAAATTTGAACTTTTATATATTAAGGAAGTTTCATTTTGAATTTCAGGTAAATTGACTGATAAAAGTGATGTATATGCTTTTGGAGTTGTTCTGCTGGAGCTTCTTTTGGGAAAGAAGCCTGTGGAAAAACTAGCACCAGCTCAATGCCAATCCATTGTCACATGGGTACTGTTTGCTCGATGATCATGAAATTTAACTGGGTGGTTGGTATTGGAAATGACATGTAGCTATTTATGATGTTTGCAGGCCATGCCACAGCTCACAGACAGATCTAAGCTTCCAAACATCGTGGATCCTGTAATTAAGGATACAATGGACCCCAAACACTTGTACCAGGTTTGAGTGCCTCGGAAACAGAACTCACATATTTTCCAGTTTATTACTACTACCCTTTTTGGCCATTATGAAGATTGTTTCGAATTAAAACTATACTTAACATCATGAAAACATAAAAAATAAAATAAAAAAATTGATGTTTTCTTCATTTTGAAAATAAGATTAATAGAAAGAAATTATATACAACTATTAAGTCAAATTAATTTTAATTTATAGAAAACAATTTTTTTTTCTTTTACGTGTGTATGAAAAACTTTATCAAATAGACTTTGCTTAACTACAACATTTTGTACTTTGTAGGTTGCTGCAGTGGCCGTGCTGTGCGTGCAACCAGAGCCAAGTTACCGTCCCCTAATTGCAGATGTTCTCCACTCACTCATTCCTCTTGTCCCTGTAGAGCTTGGAGGAACACTTAAAGTAGCACAGCTGCCACAGCAAGTATTACCTGCTAACCCACATGAGGATTCTAGTCCATGA