Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01745 LG1 20615708 20616750 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 20615970 missense_variant p.Tyr261Asn
T/A 20616000 stop_gained p.Lys251*
A/T 20616037 synonymous_variant p.Leu238Leu
A/T 20616052 synonymous_variant p.Thr233Thr
C/T 20616104 missense_variant p.Arg216His
A/G 20616190 synonymous_variant p.Leu187Leu
A/G 20616208 synonymous_variant p.Ile181Ile
C/A 20616472 missense_variant p.Arg93Ser
A/T 20616707 missense_variant p.Phe15Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01745.1
MSKLLSQNAIIFVWFLCGIMFNAAFCNFNIRCNQQDMHALLNFKQGVADPPGVLSSWSTKLDCCDWKGVMCSNITSRVTGISLPCSTIPPIYRDKEDKSNCLTGSINLSLLLVELEFLEYLNLRNNDFLALQFDYLHNHNCHNLSTTISPRLCVNSSTLRHLDLSLNWNLVINSLQWLPNISSLEYLNLRDNDLSMETNWLQLVTMLPSLSFLSMRACQLKDLSLSLQYANFTKLEFLSLSANEFNSELPKWLFNLSSTIYTLDLSSSSLIGHLPKDLLNLRELDFLNMEDNNFDGPIPDWIYSHKFGKSINLDYLDCWLKSIDRSCV*


CDS Sequence:
>Vu_01745.1
ATGAGTAAACTTCTCTCTCAAAATGCAATCATTTTTGTATGGTTTCTATGCGGAATCATGTTCAACGCTGCCTTTTGCAACTTCAATATTCGTTGCAACCAACAAGACATGCATGCTCTCTTAAACTTCAAGCAAGGAGTGGCAGATCCACCAGGTGTCCTTTCTTCATGGTCCACTAAACTAGATTGTTGTGATTGGAAAGGAGTGATGTGTAGCAACATCACTAGTAGAGTCACTGGAATCTCTCTCCCATGTTCTACAATTCCTCCAATTTACAGGGACAAAGAAGATAAATCAAATTGTCTTACAGGTTCCATTAACCTCTCTTTGTTGTTAGTGGAGTTGGAATTTTTAGAATACTTGAATTTGAGAAACAATGACTTCTTAGCATTACAATTTGATTATCTGCATAATCATAATTGTCATAATCTATCTACAACTATTTCTCCTCGTTTGTGTGTCAACTCTTCAACCCTTCGTCATCTTGATTTATCACTTAACTGGAATCTTGTTATCAATAGCCTTCAGTGGCTTCCCAACATTTCCTCACTGGAATATCTTAACCTCCGTGATAATGATCTTAGCATGGAAACTAATTGGCTTCAATTAGTGACTATGCTTCCATCACTTTCATTCCTCAGTATGCGTGCTTGCCAACTTAAAGACTTGAGTTTGTCTCTCCAGTATGCTAATTTTACTAAACTCGAATTTCTTAGTCTTTCTGCAAATGAATTTAACTCAGAGTTGCCTAAGTGGTTATTCAATCTTAGTTCCACTATCTATACTTTAGACCTTAGCTCAAGTTCTCTAATAGGACATCTACCCAAGGACTTGTTAAATCTTCGAGAACTAGATTTCCTGAACATGGAAGACAATAACTTTGATGGACCCATTCCAGATTGGATCTATTCCCACAAATTTGGGAAATCTATCAACCTTGATTACCTTGATTGTTGGCTCAAATCCATTGACAGGAGTTGTGTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_01745::LG1:20616750-20618750(-)
ATAGTTTAAAATATATCTATTGGGAAAATATTTACATATTCAAACAATCATAATTAATTTTGCTAGTTTGATATTATAGTTACTATTTACATAAAGATATCATTTCATTATTATTATCTACTTGAGATAAGTATTATTTCAATAAAATTATTTTATATTACAACACAGGTCAACGATCTATGTTAATCTTATAAATACAACTAGTATTCTTAGAGAATACTTAGTCACTCTCTAATAATCATACTGATACTCACTATTCTCATAGATCTTAAAACTCTCTTATTGACTTGAGCGTCGAAAAATCTTTTATAGGTGAATCCTCCTTCACATTCCAACCTTCAAGAGTACACGTCAGGGACTTCAAAGTTGCTCAGATCATGTCACATGTCCAAAGGACCTCGTTCAAGACCTCTGGTAAGAACATTTAACACCACTATGGAGTCTCAGTAAACTTTTTCCCAGCCTCACCTTTCTATGGTCACCACCTAAAGTCAAGTCCAACTCACGAGATATAATCCAACCTAGTTTGAAGACCCTATAATATCAAATGCAAACGTTAACCCAACAAAATGAAGAACAACACAGGCTCTATGATGCCAAGCTTGTAGCCCTACGCTATCCACACCAGGCAGACCTTCAAGAACTGTAACAAAAGTTGTCTGACTTGGAGAATGAGAAATCACCCCCGACCTCAGCTTAACTCTCAGGAAGAAGGTCCACTTAATTTACGACCAAAGCGTAACTCGCCAACATTGCAAGGTTTGCGTGAAAGTTGTCATTGATCTCCTCGACACAAAACTCAAAGAGACGCTCAACACAAAATGGGAAAAACTCGTGGACATTCCTACCACTCAAAACGGGATCACGACAAGCACAAACATCATAGCCCAAGCCAAGATAGGTAGTAGAGTCCTAAGATTCTACAAGACATCCTTACAGGCGCGTCAACCGGGAACTTGTTGCTATATATTATTGATATTGGTATTGTCGAACTTGTTTGTTGTTCATACACCATATATATTCAAACTTAGAATAAAATTGAGAGTATATTATAGGAACTCTAAATGACCTAAACATTTGTTTAAAGCACCAAAAAATCATGAGAAGCCCCCACAAAAAAAAAATATTTGATCAAAATTCATAGTCAAATATATGAAATATTTTTGCAAAGTTTGAAAAAACAAAATAAACTGATGAAATATAGAAAACGACATTTTTTTTAAGTCTAGAAGGAATAGCTGGCTTTACAGGCTACCACATACTTGAAATTTTTTTTACCCGAAATTGATATATAAAAAGGTCAAATCTGTCAACCGGAGCAAAAGTTATGGTTATTTAAATATATGCAACAATTAACTTTCCAAATAATTTTTAAACTTCACTCATTGATCCAAAATAAGGGTTCCTGGGATTTTTCCCCTAAAACAGGGGTTCTAAGGATTGGTAAAAAAAATTCTACCAAAAACAATAATCATAGCTATCAAAATTAAAAATCACAAGTTAATAGTTAATATGCACTATTCATTATAATATAATTCGCTTGTGATAGTTTTTGTTTATAGTTCATATAAATTTAAAAATGAGTTCTGGATATATAAAATATTAAAATTGGACTATATTTGATGGTTTTTTACTTTTCAAGTTTTGGTAAAATTGTAAAAATAGATAACTATTTATTGTAAAAAACTAAAGGAGTTAATTGATGCCGAAAAATAACTATTTCTAACATCAATTAACACTAGAAAATGACTATTTCGAACATCAATCAACCTTTTGTTTTCGTGAGGACACATTTTGTCAAGAAATATGTTACAATCGGTTTCTCTAGTCAAGTCGTTGCAATGCTAATAAACTATACCTTTTTGTTTAACACAAAATTTCATTATATCTTAACCTATATTACGGGATGTGAAACTTTTGTACAGACTCCAATTACTATAAATAGAGTTTCTCTCCATTATATTCATCATCCATCGTCCTCTTCGTTTCTTTTGAAAATC


Gene Sequence:
>Vu_01745(-)
ATGAGTAAACTTCTCTCTCAAAATGCAATCATTTTTGTATGGTTTCTATGCGGAATCATGTTCAACGCTGCCTTTTGCAACTTCAATATTCGTTGCAACCAACAAGACATGCATGCTCTCTTAAACTTCAAGCAAGGAGTGGCAGATCCACCAGGTGTCCTTTCTTCATGGTCCACTAAACTAGATTGTTGTGATTGGAAAGGAGTGATGTGTAGCAACATCACTAGTAGAGTCACTGGAATCTCTCTCCCATGTTCTACAATTCCTCCAATTTACAGGGACAAAGAAGATAAATCAAATTGTCTTACAGGTTCCATTAACCTCTCTTTGTTGTTAGTGGAGTTGGAATTTTTAGAATACTTGAATTTGAGAAACAATGACTTCTTAGCATTACAATTTGATTATCTGCATAATCATAATTGTCATAATCTATCTACAACTATTTCTCCTCGTTTGTGTGTCAACTCTTCAACCCTTCGTCATCTTGATTTATCACTTAACTGGAATCTTGTTATCAATAGCCTTCAGTGGCTTCCCAACATTTCCTCACTGGAATATCTTAACCTCCGTGATAATGATCTTAGCATGGAAACTAATTGGCTTCAATTAGTGACTATGCTTCCATCACTTTCATTCCTCAGTATGCGTGCTTGCCAACTTAAAGACTTGAGTTTGTCTCTCCAGTATGCTAATTTTACTAAACTCGAATTTCTTAGTCTTTCTGCAAATGAATTTAACTCAGAGTTGCCTAAGTGGTTATTCAATCTTAGTTCCACTATCTATACTTTAGACCTTAGCTCAAGTTCTCTAATAGGACATCTACCCAAGGACTTGTTAAATCTTCGAGAACTAGATTTCCTGAACATGGAAGACAATAACTTTGATGGACCCATTCCAGATTGGTTAGGTGATTTCGAACGTTTAGAAACTCTTATTCTTGGAGTAAACAACTTTTCAGGATCTATTCCCACAAATTTGGGAAATCTATCAACCTTGATTACCTTGATTGTTGGCTCAAATCCATTGACAGGAGTTGTGTCTGA