Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01726 LG1 20306609 20308996 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 40 isoform X2
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 20306988 intron_variant
C/T 20307062 intron_variant
A/T 20307138 missense_variant p.Phe225Leu
T/A 20307198 missense_variant p.Lys205Asn
C/A 20307201 missense_variant p.Arg204Ser
C/A 20307202 missense_variant p.Arg204Met
T/A 20307208 missense_variant p.Gln202Leu
T/C 20307211 missense_variant p.Tyr201Cys
T/C 20307222 synonymous_variant p.Val197Val
C/A 20307261 intron_variant
T/A 20307358 synonymous_variant p.Ile193Ile
T/A 20307371 missense_variant p.Gln189Leu
G/A 20307447 missense_variant p.Pro164Ser
G/T 20307449 missense_variant p.Ala163Asp
C/A 20307480 missense_variant p.Val153Leu
A/G 20307674 missense_variant p.Ile88Thr
A/C 20307712 intron_variant
C/A 20307772 intron_variant
G/A 20307788 intron_variant
T/C 20307824 intron_variant
T/A 20307904 intron_variant
C/A 20307955 intron_variant
G/A 20307991 intron_variant
A/C 20308123 intron_variant
A/C 20308126 intron_variant
G/T 20308138 intron_variant
G/A 20308187 intron_variant
C/T 20308190 intron_variant
A/T 20308231 intron_variant
T/C 20308234 intron_variant
G/C 20308284 intron_variant
C/G 20308349 intron_variant
A/T 20308407 intron_variant
T/A 20308413 intron_variant
T/A 20308416 intron_variant
A/T 20308422 intron_variant
G/A 20308444 intron_variant
A/G 20308446 intron_variant
G/C 20308577 intron_variant
T/A,* 20308600 intron_variant
C/T 20308626 intron_variant
G/A 20308633 intron_variant
A/G 20308638 intron_variant
C/T 20308656 intron_variant
A/G 20308693 intron_variant
G/A,T 20308714 intron_variant
C/T 20308735 intron_variant
G/C 20308768 missense_variant p.Arg77Gly
T/*,A 20308802 missense_variant p.Glu65Asp
C/T 20308973 synonymous_variant p.Gly8Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01726.1
MREGEVGGEGEGEGEGEGEGEKVSEGEGEKVFREGEGEGEKVSRRGRGRGEGFGKGKGRRFREGEGEGEGEKVSGKRKRKGRRFCEQDMVLEEELQRLRRENKRLTEMLTDLCDSYMVLQKQLTQLKNTNFEQDQLESRKRKAESECCTNKFGVVNNNNVECSSITEDSFKRYKDFSSSPKVSKVLVKTEASNNSLYVMDGYQWRKYGQKVTRDNPSPRAYFRCSFAPSCPVKKKVQRSLEDPTILVTTYEGEHNHGHQRGEIEGGKGSNPVSSPTPTIGSACPTVTLDLVKSGFFETAQKSSVQQFLVQQMATSLTRDPNFTTALATAISGKILQAKW*


CDS Sequence:
>Vu_01726.1
ATGAGAGAAGGTGAAGTTGGAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGAGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTGTTTCGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGAGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGGGAAAGCGGAAGAGGAAGGGGAGAAGGTTCTGTGAGCAGGATATGGTGTTGGAGGAAGAGTTGCAGAGGCTGAGACGTGAGAACAAGAGGTTGACTGAGATGTTGACCGACTTGTGTGACAGCTACATGGTTTTGCAGAAGCAACTGACCCAATTGAAGAACACAAATTTTGAGCAAGACCAACTCGAATCACGCAAGCGAAAAGCAGAGAGCGAGTGTTGTACCAACAAATTTGGTGTTGTTAACAACAACAATGTTGAGTGCAGCTCCATAACAGAGGATTCCTTCAAAAGGTACAAGGATTTCAGCTCCTCCCCAAAGGTTTCCAAGGTTCTTGTAAAGACAGAAGCTTCTAATAACAGTTTATATGTAATGGATGGATATCAATGGAGGAAATATGGTCAAAAGGTGACCAGGGATAACCCTTCTCCTAGAGCTTACTTCAGGTGCTCCTTTGCCCCAAGCTGCCCAGTTAAAAAGAAGGTGCAAAGGAGTTTAGAAGACCCTACAATACTTGTTACAACATATGAAGGAGAGCATAATCATGGTCATCAAAGAGGTGAAATTGAAGGAGGAAAAGGGTCAAATCCAGTTTCTTCACCAACACCCACAATTGGAAGTGCTTGCCCTACTGTAACGCTTGATTTGGTCAAATCAGGATTCTTTGAAACTGCCCAAAAGTCATCTGTCCAACAATTTTTGGTTCAACAAATGGCTACTTCTTTGACAAGGGATCCCAATTTCACCACAGCGCTTGCCACTGCCATTTCAGGAAAAATTCTACAGGCCAAATGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_01726::LG1:20308996-20310996(-)
GTTATTAAAATATAAATAAGTAGTCTATGACTTAACACTGTTATCCAATCAATTTAAAGTTAAATATACTTTTATCGCATTTATTTTAAAGTTATCCTAACGATTATTTTTATTAGTTGGTAACGCAAAATGACAATAACAGTTAATAGAAATTGAATTCTTAAGATTAAAATTTTTAAAAAGGTTTAGAAAAGATATAATTAATGATGTTATAGAAAATAATAAAAGAAAATAATAAAAGAAAATAAAAAGAGATACGAAGAAAGTAATTTAATTGAGTTTTATTTTAATTGAAATGCTCTTAATTTTTAATTGTGTTTGTATATTGTTTTAATTGAAATTAGAGAATGAATAGGTGGTGTAATTGGAAAAAATATAAATTTTAATTAGATTTATTTTTAATTAAATAGTATTATAGTTGATAACAGGTAAATTTTTACTTATAGGTGATTGCGTTAAATATTTAGAATATATTTTTCTCCAATAGTAATCGTTGTTTTAAAATAAAAATCAATTTAATCACTGAACTATTTTCTAAATATATTTTATGTAAAAATTACATAATTATGTTTTAAAATTTTAAAAGATAAATAATCATTTAATATAATAAGTTTTAACGTATTTAATTTTTAATATAATAAAATTAAAATTTTAATATAGTTTTTTAATTATCTCAATATTAATAAAATTTAAATAAATTAATAAAATATTTATTATACTAAAATTTTAATATAATTTTTTTATTATCTCAATATAATTTTAATATACTAAAATTATAATTTTTTTATTATAATAAATATTTTATAATTATAATAAATATATTATTTATTCAATCCTCAAAATGATGTTACATAGTGTTTCAATTGATAAACCAGTCTTTAAATGAATTCTTTAATGCCAATGAAATATATTAATCTAGATGCTAAATTAATATATATTTTGATACTTGAAAAGGAACTAAAACAATTTTATTAATTGGGAGAAAAAGTGGTAATTTGACAGATGACATATCATATCTATCAACAGACTCCGTATAATTAGGTGGAAGTTGAAATAGAATATCAAAGAATTTTTGTTCTAATTTTTTCGTGGACCTATATATAAATAATGGTTTAATAGGTTCGGAAGTTTCCTATATTTGCGGGTTAGTTTCAATTGGGTCCTCTAATTTTGGAAGTGATCAATTGAGTCCCTGTTTTGGTAAAATTGAATCAATAATGTCCTTGCCGTTAATCTTAGTAAACGGTGTTAACTTTCTAGCGAGGTGGCATGTTGAGGTGGCTTTTAATTAGCACGTGGCACGTTGTGTGGAAACCTTCTCCCCTTCCCCTTTCCCGAAACCTTCTCCCCTTTCCCATCCCCTTCTCGAAACCTTCTCCCCTTCCCCTTCCCCTTCTCGAAACCTTCTCCCCTTCCCCTTCCCCTTTCCCGAAACCTTCTCCCCTTCCCCTTCCCCTTCCTCTCCAACTCCAACCTCACCTTCTCCCATCTTTGGGAAACTTTCTTCTCGCCCTCCCACACCCACCTCTTCAACATCTACATTCACGCCCATCCCCCAATCCAACCGTCAAGCGCACCTCCCTTGCCTCCACATCTCTCATCGTCGCTCGCCGTCTCATTACTGCCGCACTCCTCCACAACCCCCTCAACCTCTACTTCGCCCTCCGCCGTTGTTTCGGAGTTGCGGTGGTGCACCAATGTCTACGGTTCAGGTTCGTGACAGACATTTGCAGCAATATTCCTGACCAGTCCAAACATTTGCAGCAACTCCTTTCTTTTTTCAATTTCTTTTTATGTTGGAATGTTGGTGTTATTTGTTGTAATGTCTGACAGTGATTTGAGAAAAATAAAAATAATATGGAGGTGCTGCCAAGTGCCATATTCAGGAGGAATCTGGCCGGAGAAAAAGTTGTCGCCGAGGTAGAGGTGGCGGAGGAGGGGCGCGACGGCGACAGGGAGATGGCGTGGGTGTGGGAGGGCGAGAAGAAAGTTTCCCAAAG


Gene Sequence:
>Vu_01726(-)
ATGAGAGAAGGTGAAGTTGGAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGAGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTGTTTCGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGAGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAAGGGGAGAAGGTTTCGGGAAAGCGGAAGAGGAAGGGGAGAAGGTTTCCACACAACGTGCCACGTGCTAATTAAAAGCCACCTCAGCATGCCACCTCGTTAGAAATTTAACACCGTTTACTAAAATTAACGGCAAGGACATTATTGATTCAATTTTACCAAAACAGGGACTCAATTGATCACTTCCAAAATATAAGGACCCAATTGAAACTAACCCACAAATATAGGGACTTCTGAACCTATTAAACCATAAATAATAGATAAACTTATGGTTTATTAATATAAATTTTAATATATTTTTAGTATCTATTTTTGCTACAAATTAAAATTTATTTTTATTTGAAAATTCGATACTTTTTAATATTTAAATTTTAAAAATATTTAATATAATCATTTTAATCTAATAATGTTAAATTTTTTTAAAATTTGAAATTTAATTAACAGTAACATTTAAAGTGTTGTTTATATTTTTAACATGTTTTCATTTGAATATCAAAAGTTGATAAGTCAAAAAAATTTAACAAAATTAAATTAAAAGTATGTATTCATTATTTTTAAAATTTTAAAAACAAAAATATATTAAAATTTCAGACAAAAAAATAGATCTTAATTTAACAAAAAGATTTAAAACACTAAAAATATATTTAATCCATTCATATATAATAATAATAAGAAGAAAAAAAACAGTATTTCCAAATCCAAACGTGTATGCTTAAATATACACCAAAGCATAGCAATGACGACATTTTCATGACGTGAGTTCATCTGTTGCTTTTCTGCTAATTTCCTGCAACTTTCCTCCCTTCTCCTTACGCTTATATATCTCATCCCTCACTCGCTCCCAAACATTAATTTCATTTTCTCTTCCAACAATCTTCAATGGAACCAACATGCTTGGATACTTCACTCAATCTCAACGTTGATCCTTCTTCTGTTCACACGGTTAGTATATATTCCCACACACAAACAACATCGATTTTCTCAAAGAATCAAACTTGTTGTTACGTGTGAAGGTTTGTAGGCAGAAAAGGGTACAAAAAGAGCATATAAAATACGGTTAATTTCTGTTTTTCATTTTATTTGTTGAATTTCTGACACCGAAGGTTCTGTGAGCAGGATATGGTGTTGGAGGAAGAGTTGCAGAGGCTGAGACGTGAGAACAAGAGGTTGACTGAGATGTTGACCGACTTGTGTGACAGCTACATGGTTTTGCAGAAGCAACTGACCCAATTGAAGAACACAAATTTTGAGCAAGACCAACTCGAATCACGCAAGCGAAAAGCAGAGAGCGAGTGTTGTACCAACAAATTTGGTGTTGTTAACAACAACAATGTTGAGTGCAGCTCCATAACAGAGGATTCCTTCAAAAGGTACAAGGATTTCAGCTCCTCCCCAAAGGTTTCCAAGGTTCTTGTAAAGACAGAAGCTTCTAATAACAGTTTAGTAAGTTCCTAAAAATCTTCAATTTTGATCCATTTATAGTGAAATTTGATTAGTTAACTCTTAATAATAATAATAATAATACTAACTGGGAATCTCGATTTTGTTTCTGGGTGTAATTGAAGTATGTAATGGATGGATATCAATGGAGGAAATATGGTCAAAAGGTGACCAGGGATAACCCTTCTCCTAGAGCTTACTTCAGGTGCTCCTTTGCCCCAAGCTGCCCAGTTAAAAAGAAGGTAATTTTTCAGACTTTAAATATTATTATAGAATTCCAGTAATACGTAGAAACTTATCAGACTAATTTAGAATATATAAATAATACAAACCTCGTTTTCGTGAGATTGAATTAAGCTTGAAGTTAACTTGTTAACAATTTCGTACGAACTTCACTGAAAAGTTTATGTTGGTGCGAATATTATGCAGGTGCAAAGGAGTTTAGAAGACCCTACAATACTTGTTACAACATATGAAGGAGAGCATAATCATGGTCATCAAAGAGGTGAAATTGAAGGAGGAAAAGGGTCAAATCCAGTTTCTTCACCAACACCCACAATTGGAAGTGCTTGCCCTACTGTAACGCTTGATTTGGTCAAATCAGGATTCTTTGAAACTGCCCAAAAGTCATCTGTCCAACAATTTTTGGTTCAACAAATGGCTACTTCTTTGACAAGGGATCCCAATTTCACCACAGCGCTTGCCACTGCCATTTCAGGAAAAATTCTACAGGCCAAATGGTGA