Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01708 LG1 20100668 20102518 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 20100798 missense_variant p.Gly44Val
A/T 20100799 synonymous_variant p.Gly44Gly
A/G 20100823 synonymous_variant p.Glu52Glu
T/C 20100849 missense_variant p.Leu61Pro
T/C 20100928 synonymous_variant p.Asp87Asp
T/C 20101156 synonymous_variant p.Asn163Asn
C/G 20101252 synonymous_variant p.Leu195Leu
G/A 20101284 missense_variant p.Ser206Asn
G/A 20101363 synonymous_variant p.Gly232Gly
T/C 20101873 upstream_gene_variant
T/C 20102017 intron_variant
G/T 20102282 missense_variant p.Gly383Val
A/G 20102283 synonymous_variant p.Gly383Gly
A/G 20102312 missense_variant p.Lys393Arg
A/G 20102368 missense_variant p.Ile412Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01708.1
MKSFHNFKTCLLFYIFLVLPITVAQPLSFNVTNFNDTQTASLVGYAGVAKSENRSIVLNSLIDNGIGRAIYGLPLRFKNSSNRHVTDFSTRFSFTIDVSSKTDYGDGFAFYVAPLAYPIPSDSGGGGLGLYGANQDSIIAVEFDTFPNANVDPQMRHVGINNNSMVSLNSSFFDIESNIGNMGHALITYNSSAKLLAVSWFFEGTSSGFMPNTSLSYQIDLGEILPEWVTVGFSGATGASNEENVIHSWEFTSTLNSTPLNNKEKDGNNDIIVKYKFSVQVVAVAVSCSVLFMLVVAAVSCFIIIKKRRSEDGFGFNGAAMPRRFGYKELVAATNGFADDRRLGEGGTGQVYKGFLRRASKESDMYGFGVVALEIGCGRRTYQDGEYNHVPLTNWVWKKYVDGDILDAVDEGLKGDYDVEEMRCLLTVGIWCTHPDHRQRPKAEQVINALKQETPLPMLSL*


CDS Sequence:
>Vu_01708.1
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Promoter Sequence:
>Vu_01708::LG1:20098668-20100668(+)
TGAGACATATTTTATTTTATGTATTGATACATAATGGTAAAGTTAAAATATTATTATTCTATATATTGAAATTTGTATAGCACGGCACCTAATTTATGTCTTCTTCTCAACCTATAAAGTATTTTGGTTTCAAACGTTATTGACTGAATTAAATGAGGCAACGTAATGCAGAGGAAGTTTCACAATAGATAAGTAAGATAATTTGGTTTTGATTATAATTGAATGAAGTTAGCATAGAATAAGCCAACGATCGATGCAATTAATTTAGGAGTGTAAACCAAACTCGCTTGACGAGAAATGGAGATAGTAGTTGGGGCCCACGCTAGGGTTTTCTTTTTTCAAGCTATGAAAGTTTCCACTAACCTACTATATACTAATCTCGCTTAAATTTATTTGTTTTGTAAGTCATAGTTGTAATTTTTAATGTTTTAGGAACTATGCTTTCGACAATATGCAAAATAATTCCAACTAAGACATTTTTCTAAAGATAATTAATTGAATTATGGTTCATGTTATTATATACTTCCAAGCAAAATATTTCCTATTTTTCTTTCGAATATTTTAAAGAATAATGATATTTTGACAACATTTTTTTTATAACTTGTTAACATAATTTACGTGTTATTATGTGATTGGTCCAAAATTACTGCACAATCAATAGTAATAATCATAAACACCAATATAAACCAATCACATAATGACATATAGTGATATTAAAATGTTGTTAAAAAAATATTGTCAAAGTATCATTATCCTATTCTAAATAAGGTGAAATAAATTTATCCATGTATGAGTACATCTTGGTCCTCAAATGAAGATATATTCAACCTAAACATTTTCTATCATAACAAAATCATATCAATCCACACCATTAACTTTCATAAAATATGTTTAAATTAATAAAAAGACTAAAACGCAACCACATGACTAGGTCCATCTAGATAAAAGGACTCATAACTATAATATAAGTAGTACAGTACACAAAATAAATTAATTATATTTATTTATTATTTTATTTATTATCATCTAAGCACACTTGACTTAATTGAGTATTGCCGGCACACCCCTCATTCAACTTGGAGATGATAAATATTCAGACATCCCAGTCTAAAAATATGAAGTTAGAGCTATGAGTGTTGGAGTTGATTTGACCAAAACTTAATTTTTTAAAACAAAAAGATTTAAAAAAATTCAAATTAATTTTTAATTGTTTTCATCAAATAAATATTATATTAACATTGGTGTAGTTAATAAAATATAAAATATTTAAAAAAAATAAAACTAACATTAGCTTAACAGCCACTAATTAAAATAAATATAAATAATATATAAGTTAGCATCGACTCACGACCACTAGTAAAATAAATAAGTTAGCGTAGGTTTAAAACCACTGACTAAAATAAATAAGTTATAATCAACTTAGTAGACACTAACTAAAATAAGTTTTCATCTCCTTTATTAATATTTTCGTTCATATTTATTTTCTTCGTCTATTCTCGTTTCTTTTATCTACACTCACATCCTTTATCCATTATAATTTTCTTTTTCTATTCTTTCATTTATATTTTTTTGAACATTGTACGTTTTTTTATTATTATTATTATTATTGTTAATGTCAATTAAACCAATACACATTATATCAACATTAAAAGTAGATTTTATTGGTCAATTTATTATGAAAATTTGCCAATTTATATATTCATAATTTATTATGAATTTTTTTTTTCATGAGTATACTCATTCTCCAAACCCATATGTATTGATTTTTTTTTTATTTAGCTTTCTAAATTAATTATATAACTCCTAGGGTAGGTGTAAACTTTTTGGATTGTGCTCGACGTTCAAAAATAAATTCTTATGAACCATTCCAAGTCAAGACCATTTCAAAACGTTTGGTTAGCAGTCCATAAATCATCCTATCGAATGCAAACAAATATATAAGACAAGAGAATTGCGAAATATAGCTTTCTCAGACATAGAATCTGTCGTGTTGCCTACCA


Gene Sequence:
>Vu_01708(+)
ATGAAAAGTTTCCACAACTTCAAAACTTGTCTTCTTTTCTACATCTTCCTCGTTCTTCCAATAACCGTAGCTCAACCACTCTCCTTCAACGTAACTAACTTCAACGATACTCAAACTGCAAGCCTTGTTGGATACGCTGGTGTGGCCAAGAGTGAAAACAGAAGCATAGTGCTAAATTCTCTCATCGACAATGGAATTGGAAGAGCCATCTATGGCCTCCCTCTACGCTTCAAAAACTCTTCTAACCGACATGTCACTGATTTTTCTACTCGTTTTTCATTCACTATCGATGTGTCCTCCAAAACCGACTACGGTGACGGTTTTGCCTTCTACGTCGCACCCCTTGCCTACCCGATTCCGTCGGATTCAGGTGGCGGCGGCCTCGGCCTTTACGGTGCCAACCAGGATAGCATCATTGCTGTTGAATTTGACACTTTCCCAAATGCTAATGTTGATCCACAAATGAGGCATGTGGGGATAAACAATAATTCTATGGTGTCTCTCAATTCTTCCTTTTTTGATATTGAGAGCAACATAGGGAACATGGGGCATGCGTTGATAACTTACAATTCTTCTGCCAAACTCCTTGCTGTTTCATGGTTCTTTGAGGGAACCAGTTCTGGTTTTATGCCTAACACTTCTCTTTCGTACCAGATTGACCTGGGGGAAATTCTCCCGGAGTGGGTCACTGTTGGGTTTTCGGGTGCAACCGGGGCGTCTAATGAGGAGAATGTTATTCATTCTTGGGAATTCACGTCAACTCTGAATTCCACACCGTTAAACAATAAAGAAAAAGATGGCAATAATGACATCATAGTTAAATACAAGTTTTCAGTCCAAGTAGTAGCTGTTGCAGTGAGTTGTTCTGTTTTGTTTATGCTCGTGGTTGCTGCAGTTTCTTGTTTTATCATCATCAAGAAGAGAAGAAGCGAAGATGGTTTTGGTTTCAATGGAGCAGCTATGCCCAGAAGGTTTGGTTATAAAGAGTTAGTTGCAGCCACCAACGGGTTTGCAGATGATAGAAGGCTGGGAGAAGGAGGCACTGGACAAGTTTACAAAGGGTTTCTGAGTGATCTAGGGAGTGTGGTTGCAGTGAAAAGGATATTTTCTGATGTTGAAGATTCGGAGAGAATATTCACAAACGAGGTGAAGATTATAAGTCGTCTTGTGCATAAAAACCTGGTGCAATTGATGGGGTGGTGCAATGAGGAAGGAGAGTTGTTACTGGTTTTTGAGTACATGAGTAATGGAAGCCTTGACACTCATATATTTGGCAACAGGAGAACCTTGACATGGAGTGTGAGATACAATATAGCGTTAGGTGTGGCTAGGGCACTGTGTTATCTTCATGAAGAGGTGGAGCAGTGTGTTCTTCATAGAGACATAAAGTCAAGTAATGTTTTGTTAGACACAGATTTCAACACTAAGGTTAGTGACTTTGGGATAGCAAAGCTGGTGGATCCAAGGTTGAGGACTCAGAAGACAAGGGTGGTGGGGACATATGGGTACCTTGCACCTGAATATGTGAATGAAGGAAGGGCTAGCAAGGAGTCTGACATGTATGGTTTTGGGGTTGTGGCTTTGGAGATAGGTTGTGGAAGGAGGACTTACCAGGATGGAGAGTATAACCATGTGCCATTGACAAATTGGGTGTGGAAAAAGTATGTGGATGGAGATATTTTGGATGCTGTGGATGAGGGATTGAAGGGAGATTATGATGTGGAAGAAATGAGATGTTTGCTCACTGTTGGAATATGGTGTACTCACCCAGATCACAGGCAAAGGCCAAAGGCAGAACAGGTTATTAATGCTCTAAAGCAAGAGACGCCATTGCCAATGCTTTCACTATAA