Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01707 LG1 20094787 20096949 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
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SNP Position Effect Amino acid change
G/A 20095054 missense_variant p.Thr601Met
C/A 20095366 missense_variant p.Gly497Val
G/A 20095473 downstream_gene_variant
G/T 20095596 missense_variant p.Pro452Thr
C/T 20095597 missense_variant p.Met451Ile
G/A 20095600 synonymous_variant p.Tyr450Tyr
G/A 20095768 synonymous_variant p.Ser394Ser
G/A 20095773 synonymous_variant p.Leu393Leu
A/G 20095774 synonymous_variant p.Val392Val
C/G 20095941 missense_variant p.Asp337His
C/T 20096750 missense_variant p.Arg67Lys
A/T 20096848 synonymous_variant p.Pro34Pro
C/T 20096925 missense_variant p.Val9Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01707.1
MNFLALAKVETKELPLRMRFLNMVTIFVLLLAFPSPFLKTVESLNFNITNFDDPESAKNMAYMGDGRTRNGSVDLNIVSYFFRVGRALSAQPLHLWDSSSRVVTDFTTRFTFSIEKGNDQTGSYADGFAFYIAPQGYQIPPNGAGGTFGLFNGTFNSLLPQNRILAVEFDTFNGSIDPPMQHVGIDDNSLKSATYGKFDIDENLGKKCNALVTYTASNKTLFVAWSFNETATRLSKPSLSYPIDLLGILPEWVDVGFSASTGELTERNFIHSWEFSSTLNSSTASKDNPSGGNEKSGKALSMAMVVVVVACSMILVAVAANVAAWIVIMKKRRVKGDCGYDDSGKGRSARFDLDRESIPRRFDYTELVEATKGFADETRLGRGGSGQVYKGVLSYLGRVVAVKRIFTNFENSERVFINEVKIISRLIHRNLVQFVGWCHEQGEFLLVFEYMPNGSLDTHLFGDKKTLTWDIRYKVALGVALALRYLHEDAEQSVLHRDIKSANVLLDTDFSTKLGDFGMAKLMDPRLKTQRTGVVGTYGYLAPEYLNGGRASKESDMYSFGVVALELACGRRTYPDGEFHVPLMNWVWQQYVEGNVMEVVDERLEKEFDVDKMRSLIIVGLWCTNPNDKERPKAAQVIKVLELEAPLPELPLDMHDRPPLSLSTYTHAQPNCNSLQSLPFTNSFVSTGR*


CDS Sequence:
>Vu_01707.1
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Promoter Sequence:
>Vu_01707::LG1:20096949-20098949(-)
TTGGTTTACACTCCTAAATTAATTGCATCGATCGTTGGCTTATTCTATGCTAACTTCATTCAATTATAATCAAAACCAAATTATCTTACTTATCTATTGTGAAACTTCCTCTGCATTACGTTGCCTCATTTAATTCAGTCAATAACGTTTGAAACCAAAATACTTTATAGGTTGAGAAGAAGACATAAATTAGGTGCCGTGCTATACAAATTTCAATATATAGAATAATAATATTTTAACTTTACCATTATGTATCAATACATAAAATAAAATATGTCTCACTAAACACTAATAGAATTTCTAAATATAATATTTAACTTTATTTTATTTATGATTACATCAACATATTTTTTTATTAAATAATGATAGAATTGTGAAATAAATATTTATTACAAATATTAACAGAAGCTTAATAAAATAAATTTGCTTATTATTATAACTTAAAAATAATGATGATTTATTTGTTAATATCGTATAAAAAAATTAATCTTAGGTAATTTTTCTTTGAATTCAAATATAAGCAAATTCTGACCCTCTCAACCCAATTTATGTTCATTTGAACTTAAGCCTCATCTCAATAGATATATATAGTTCTAGTTATTTAATGAACTTAAGTGTCATAATTACTATTTTTCATTCTAAAGAAATTAACTTTTGATTTATATTTAAATTGGGTGGTTGCAGCTATCAGAATATTAGTTATTTTTAAATCGTGATAATAGATAATAAATAATATAATTATAAAAAACTATCTATAACATGTTAGAATGAAATGATAAAATAAAGATTCATTTAAATTTTAAGAAATTAATTTATTTTTCCAATAAGAAAAATATATTTATTATACACATTTTTTCCATGGGTGATGATATACAAACACCATATTTTCTAGTCTACACACCCATCTAACACTAATAAAAGAGTATTTTTTTTTCTTAAAATATAAAATAAATTAAGATAAATCAAATAGAAAAATAAAAATATTTGTTTTTTTAGTAGATATTGGGAAAGGTGTAGAAAAATTGAAAAGTGTATGTTTATAATTTTCACTTTAACTTCTGTAATTAAATAAATAAACAGTATGTTTTCCGAAAGAAAAAAAAAATCTGATATAAAAGTTGTCTGTAGTGCAAGGGAAAATAAATCAACAAAATGATATCGCATGTTGTTACATTGTACTTTTTTTACAATATATGACATAAAGAGATTGATACCTATATTTGAAACAAATACTTATCAATAAAATTCTATAATATTATAAATAAAATTGTAATTTTTTTCAGAGATTTGCATATATAAAAATATATTTGCTGATAAAAAGAAACCTATTTGTCAAACAAATCTCGCTAATCTAATTATTAAAAATTACAACTCTTCTTAGGATGAACACGTGTAATTATAAATGTTACTAATTAGATTATTTTGATTTGAATACTAAAATATTTTTTAACAACTTTTTTATAACATAATGATTTGTAATTAATTGGTTTCAAAAAAAATTTTAAAAATAAATTTAAACAAATCAATAAAATAACCAACATATCAGAGTGTCTAAATTAAATCACGCTGTCTCACTCCGAACTTTCCCCTTCTTTACGCTTGACTACCAAGTGAACACAAAAATTGAAAATTGAAAGAAGAGTGCAGTACACGACATTCGTAGTATCTGGGATGCAACCTAGGAAGACCAGTCACACACAAAAATGTTTAGACTCAGTCAGTAAAACGTTTTTATCTGATCTTCCTCTTTAGTTTAATCTCTAATAATAAGTACTTATTATTATTATTTTTATATTTTTGTTTTTAGAATTTTAGACTCTGACGATTTTTTCCTTAAAGAAAAAAGAAGTATTTAACCATTGTTAGACTTCCTTCTGACATTACTGTTGTTAAAAAGAAAAATTACTATGTTGAGTTAAACTTTATTTAAGCAGCAACCTGCGTGAACAAATTCAGAACACACTTACTCAACATATCCACTTCGGTTCTTTGGTTTCCAG


Gene Sequence:
>Vu_01707(-)
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