Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01705 LG1 20084946 20086901 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 20085409 missense_variant p.Gln155Leu
A/G 20085457 missense_variant p.Glu171Gly
A/T 20085458 missense_variant p.Glu171Asp
A/T 20085462 missense_variant p.Ile173Leu
A/G 20085687 missense_variant p.Asn248Asp
T/A 20085693 missense_variant p.Tyr250Asn
G/A 20086017 missense_variant p.Gly358Ser
G/C 20086187 missense_variant p.Glu414Asp
T/A 20086264 stop_gained p.Leu440*
T/C 20086267 missense_variant p.Ile441Thr
C/G 20086454 missense_variant p.Ser503Arg
C/T 20086712 synonymous_variant p.Asp589Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01705.1
MQVSRESSSSVSSLEPAKTYKTNLNLHPRTQYTVSEKTMLATSQNSHHSTTFLLLILPIVIVQPFSFSITNFEDSESAALVGYAGVAKIENGSILLNPLTYSGVGRAIYGQPLHLKNSSNERVTDVSTRFSFTIQSPNSLYGDGFAFYVAPLSYQIPETDKTGYGLGLYGENISIVAVEFDTFINDLDPPIQHVGINNGSVVSLNYTKFDIENNRGNMGHALITYNASAKLLAVSWFFDINSSSSTPNAYLSHQIDLAELLPEWVALGFSGSTGSSIEENVIHYWEFSSSLDLTISPPNEENVITTKYKGRGKVVVVAVICSIIFATVVVSITCWMIKKRRKEGEFGFDREATPRRFGYNELVAATNGFADDRRVGEGGHGEVYKGFMSDLGRVVAVKRICSDVEDSERTFRNEVKIISRLIHKNLVQLIGWCEEEGELLIVMEYLDNGSLETHLFGNRRSLKWDVRYCIALGVVRAIRYLHEDTEQCVVHRNIKPGNVLLDSDFNAKLSDFGMAKLVDPRLRSQKTRVVGTYGYLAPEYVNEGRASKESDMYGFGVLALEIACGRRSYRDEEYNHVPLMNWVWKLYVDGKILNAADEKLKSDFDVSEMRCLLTVGIWCTLQDHKERPTAEQVINVLKQKVSLPVLSTKHA*


CDS Sequence:
>Vu_01705.1
ATGCAAGTTTCGCGTGAATCATCTTCTTCCGTGTCTTCCCTGGAACCTGCAAAGACATATAAGACAAACCTGAACTTGCATCCTCGTACCCAGTATACTGTGTCAGAGAAAACCATGTTAGCTACCTCACAAAATTCCCACCACTCGACAACTTTTCTTCTGCTTATCCTTCCAATAGTCATAGTTCAACCATTCTCCTTCAGTATAACTAACTTTGAAGACTCTGAAAGTGCAGCCCTAGTTGGATACGCAGGCGTAGCTAAGATTGAGAACGGAAGCATACTACTCAACCCACTCACCTACAGTGGAGTTGGAAGAGCAATCTATGGCCAACCTCTACACCTCAAAAACTCTTCTAACGAACGAGTCACCGATGTTTCAACTCGTTTTTCATTCACTATCCAATCCCCTAATTCCCTTTACGGTGACGGCTTTGCCTTCTACGTCGCACCTCTTTCCTACCAGATTCCGGAAACCGACAAAACTGGTTACGGTCTCGGCTTATACGGTGAAAACATATCCATAGTTGCTGTCGAATTTGACACTTTTATAAACGACTTAGACCCACCAATTCAGCACGTAGGGATCAACAATGGCTCTGTGGTATCTCTCAATTATACCAAGTTTGATATTGAGAACAACAGAGGGAACATGGGGCATGCGTTGATAACGTACAACGCTTCTGCCAAACTCCTTGCTGTTTCGTGGTTCTTTGATATAAATAGTTCCTCTTCTACGCCTAACGCTTATCTTTCCCACCAGATCGACCTAGCGGAGCTTCTACCAGAGTGGGTCGCTCTTGGTTTTTCAGGATCAACCGGATCGTCCATTGAGGAAAACGTTATCCATTACTGGGAATTCAGTTCTAGTCTGGATCTAACAATTTCCCCACCAAACGAAGAAAATGTCATCACAACAAAATACAAGGGTCGGGGAAAAGTAGTGGTTGTTGCAGTGATTTGCTCTATTATTTTTGCGACGGTGGTTGTTAGTATTACGTGTTGGATGATCAAGAAGAGAAGAAAGGAGGGTGAATTTGGTTTTGACAGAGAAGCTACGCCTAGAAGGTTTGGTTACAACGAGTTAGTTGCAGCCACGAACGGGTTTGCAGATGATAGAAGAGTTGGAGAAGGTGGGCATGGAGAAGTTTACAAAGGGTTTATGAGTGATTTAGGGCGTGTGGTGGCGGTGAAAAGGATTTGTTCAGACGTGGAAGATTCGGAGAGAACATTCAGAAACGAGGTGAAGATTATAAGCCGGCTTATACATAAAAACCTAGTGCAGTTGATTGGGTGGTGCGAGGAGGAAGGGGAGTTATTGATAGTTATGGAGTACTTAGATAATGGAAGCCTTGAGACTCATCTGTTTGGGAACAGAAGGAGTTTGAAATGGGATGTGAGGTACTGCATAGCATTAGGTGTGGTGAGAGCAATTCGTTATCTTCATGAAGACACGGAGCAGTGTGTTGTTCATAGGAATATTAAGCCTGGTAATGTGTTGTTAGACAGCGATTTCAATGCTAAGCTTAGTGATTTTGGAATGGCGAAGTTGGTGGATCCGAGATTGAGGAGTCAGAAGACAAGGGTGGTGGGGACATATGGATATCTTGCTCCTGAATATGTGAATGAAGGAAGGGCTAGCAAGGAATCAGACATGTACGGTTTTGGGGTGTTGGCTTTGGAAATAGCATGTGGAAGGAGGAGTTACAGGGATGAGGAGTATAATCATGTGCCTTTGATGAATTGGGTGTGGAAACTTTATGTTGACGGGAAGATTTTGAATGCTGCTGATGAGAAATTGAAGAGCGATTTTGATGTGAGTGAAATGAGATGCTTGCTCACTGTGGGGATATGGTGTACCCTACAAGACCATAAGGAAAGACCAACAGCAGAACAGGTTATTAATGTTCTTAAACAAAAAGTGTCGTTGCCAGTGCTTTCTACTAAACATGCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_01705::LG1:20082946-20084946(+)
CCTAGCTTCATATTTAGAATATTTTGAATTCGATTTTTCTTCGTAGCCTGCTCTTAGAGTAATCCCTTAGGTCTACAAATCTTCTCTCAAACATTCGGGTACTCACAAATATAATAATCCAACCGTGGAAAAAAAAATAATGCTAAAATACTAGTATAGTTTTTATTTTTAAAATCGCATTAGATGCTTTAGTTACAGAGTAAAACATATAAATATATTGTAATTTTGAAAATTTTATGAATTTATAAATTTCAGTTTTTGAAAAATTGAAATCTATCAACTTTTATGTTTGATTCTTAAAATCTAAGATCTAAAGGTTCTTAAAATTTCAAAAAAAAAAATAACTATTTTATCTGAGAAAAGATATATAAGTATTTAAATAGAAGATGAAGACTTTTAAGCTTTCAGTTCTAAATAACAAAGACTAAAAAATTCACCAAAATTTTGAGTTTGTTACTGAGGATCGAGTTTTAGGTCTTAATTATTTTTATAACTAAAACCAATTGCCTTTTATGTGTCAATTTTATTAATAATTGAGGTTTAAAAATTTTTTCTACTCTTAATATTCGTTAAAGTTGTACTGTAGTCTTCATTTTTTCTTTGTGAAAACATTGCATTTTATTCTTGCCATTTCATCTACATTATTATCTTCTTCTTCTTTTTCATCCTTCCCATTTAATACTTGTTGCTAATTCTGGTACTAAGTTAACTGACCCTGATCAATACCAAAACATAGAACACTATTATATTTTACCACATCAAGACCTAACATATGTTTCTCTGTACAAACTTTATCAATTTATTTATAACTCTCGTACTTATCATATGAATATTATTAATACTTCATTAAGAAATGAACTTTAAATTTAATAAAGTAAAATTTAAACCCACTTATATATTATAAATTGATATAAAACATACTTAAATACCGGACAATATATTTTAATACTAGACTTCATGCTCACCAGTGATATCTGTCCTGATATCAAGAAATCTATTACGGGATTCTGCAGATTTTTGGGCAATTCTTTAACTTTCTGGGAATAAAAAATAAAAAAGGCAGAACATTATCAATATATAAATCTTCTACTGATGTTGAATACGAGCTCTGGCAGCTGTTTGAAATAACTTGTCTGAAGAATCTTACTTTACTTCCATATCACTAATACTTTTGCTTTAAGTTTAATGTGATAATAAACTATCATTGAGATTGCTTTAAATCCTATTTATCATGAGAAAACTAAACATTTGGAGATCTACAATTCTATTTACCAAAACAATTCTTAAGTTCATTCAACCAGAAATTTTCATCAACTTGTGGATATTTTTATTTTTACCAAAATCTTGCCAGAGACATCCTTCATCAAACATATTTTCAAGATGACTAATAATAAATATTTTTCTGCCATTTAATTTAGTTATTTCAATCTAGTTTGTTTAGTTTAATTAATATGGTCAATATCAACTTGTTTTTACTTCTGGCTTTATTTTATATATAGACACAAATTTCTATAAAAATGGCGTTTATTCTGAAACTCACGTTTCATTATTTCAAGTATTCTGAGTGATATTTTCGCATACATAAATTCTTTACATTTATTTGATGTTATTTTTTTTTTTACTTTATTTTTTTATAAGAAAATTATAAAAATTCATTATTTTATCCTTGGTACGTGACAAATAAATGTAAATATATGTCATTCTATTTCCAAAATTCTCTTTTATTTATTTATTTTTTATGGCCAATTTGTGAAAATAATATCAATCCTCGGTTACATTACCTGGAATTCTTTTCTGAAACTCAAGTCAGTAGCTGAACTATTTCTTCAAATCTAGTAGTATTGATAAATTATTTTAAAATTTAATTACATTATAACATCTTAATATTTTATCCACAAATATTTTAGGAAGTTTTCGTTTTGAAATAAAATTCTCAAGAATCATTCCAAAAAATCATGACCATTTCAAAACGTGTGGTTAGGGGGTGACTACGTGATTTA


Gene Sequence:
>Vu_01705(+)
ATGCAAGTTTCGCGTGAATCATCTTCTTCCGTGTCTTCCCTGGAACCTGCAAAGACATATAAGACAAACCTGAACTTGCATCCTCGTACCCAGTATACTGTGTCAGAGAAAACCATGTTAGCTACCTCACAAAATTCCCACCACTCGACAACTTTTCTTCTGCTTATCCTTCCAATAGTCATAGTTCAACCATTCTCCTTCAGTATAACTAACTTTGAAGACTCTGAAAGTGCAGCCCTAGTTGGATACGCAGGCGTAGCTAAGATTGAGAACGGAAGCATACTACTCAACCCACTCACCTACAGTGGAGTTGGAAGAGCAATCTATGGCCAACCTCTACACCTCAAAAACTCTTCTAACGAACGAGTCACCGATGTTTCAACTCGTTTTTCATTCACTATCCAATCCCCTAATTCCCTTTACGGTGACGGCTTTGCCTTCTACGTCGCACCTCTTTCCTACCAGATTCCGGAAACCGACAAAACTGGTTACGGTCTCGGCTTATACGGTGAAAACATATCCATAGTTGCTGTCGAATTTGACACTTTTATAAACGACTTAGACCCACCAATTCAGCACGTAGGGATCAACAATGGCTCTGTGGTATCTCTCAATTATACCAAGTTTGATATTGAGAACAACAGAGGGAACATGGGGCATGCGTTGATAACGTACAACGCTTCTGCCAAACTCCTTGCTGTTTCGTGGTTCTTTGATATAAATAGTTCCTCTTCTACGCCTAACGCTTATCTTTCCCACCAGATCGACCTAGCGGAGCTTCTACCAGAGTGGGTCGCTCTTGGTTTTTCAGGATCAACCGGATCGTCCATTGAGGAAAACGTTATCCATTACTGGGAATTCAGTTCTAGTCTGGATCTAACAATTTCCCCACCAAACGAAGAAAATGTCATCACAACAAAATACAAGGGTCGGGGAAAAGTAGTGGTTGTTGCAGTGATTTGCTCTATTATTTTTGCGACGGTGGTTGTTAGTATTACGTGTTGGATGATCAAGAAGAGAAGAAAGGAGGGTGAATTTGGTTTTGACAGAGAAGCTACGCCTAGAAGGTTTGGTTACAACGAGTTAGTTGCAGCCACGAACGGGTTTGCAGATGATAGAAGAGTTGGAGAAGGTGGGCATGGAGAAGTTTACAAAGGGTTTATGAGTGATTTAGGGCGTGTGGTGGCGGTGAAAAGGATTTGTTCAGACGTGGAAGATTCGGAGAGAACATTCAGAAACGAGGTGAAGATTATAAGCCGGCTTATACATAAAAACCTAGTGCAGTTGATTGGGTGGTGCGAGGAGGAAGGGGAGTTATTGATAGTTATGGAGTACTTAGATAATGGAAGCCTTGAGACTCATCTGTTTGGGAACAGAAGGAGTTTGAAATGGGATGTGAGGTACTGCATAGCATTAGGTGTGGTGAGAGCAATTCGTTATCTTCATGAAGACACGGAGCAGTGTGTTGTTCATAGGAATATTAAGCCTGGTAATGTGTTGTTAGACAGCGATTTCAATGCTAAGCTTAGTGATTTTGGAATGGCGAAGTTGGTGGATCCGAGATTGAGGAGTCAGAAGACAAGGGTGGTGGGGACATATGGATATCTTGCTCCTGAATATGTGAATGAAGGAAGGGCTAGCAAGGAATCAGACATGTACGGTTTTGGGGTGTTGGCTTTGGAAATAGCATGTGGAAGGAGGAGTTACAGGGATGAGGAGTATAATCATGTGCCTTTGATGAATTGGGTGTGGAAACTTTATGTTGACGGGAAGATTTTGAATGCTGCTGATGAGAAATTGAAGAGCGATTTTGATGTGAGTGAAATGAGATGCTTGCTCACTGTGGGGATATGGTGTACCCTACAAGACCATAAGGAAAGACCAACAGCAGAACAGGTTATTAATGTTCTTAAACAAAAAGTGTCGTTGCCAGTGCTTTCTACTAAACATGCATGA