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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01704 LG1 20066276 20068566 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 20066498 missense_variant p.Ala592Val
A/T 20066516 missense_variant p.Met586Lys
T/A 20067024 intron_variant
T/C 20067187 intron_variant
A/T 20067302 missense_variant p.Leu422Gln
C/T 20067309 missense_variant p.Glu420Lys
A/T 20067451 missense_variant p.Asp372Glu
T/A 20067633 stop_gained p.Lys312*
T/A 20067644 missense_variant p.Lys308Ile
G/T 20067824 missense_variant p.Thr248Asn
C/A 20067834 missense_variant p.Gly245Cys
G/T 20067885 missense_variant p.Leu228Ile
A/G 20067946 synonymous_variant p.Ala207Ala
G/T 20068440 missense_variant p.Gln43Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01704.1
MRMRLLEMVTTFVLLLLLRPPFLKTVESLNFNITNFNDPESAQNMAYIGDGKASNGSVELNIVDYLFRVGRALYAKPLHLWDQASNVLTDFTTHFTFSIDRAKNGTYADGFAFYIAPHGYPIPPNSGGGTFALFNTTSNTFIRHNHVLAVEFDTFNGTIDPPMQHVGIDDNSLVSVTSAKFDIDKNLGKKCNVLITYTSSSKTLFVAWSFNGTATSHSNSSLSYTIDLMEILPEWVDVGFSASTGEFTEHNVIYTWDFSSTLNSDASDNSSGGGNGKRNVWVIAVATSSAVLVAVVVSVAVWAMMRKKRRDKVDKSNDGEGGANLVKFDLDRATIPRRFDYRELLAATNGFADDRKLGRGASGQVFKGVLSDLGRVVAVKRIFAKFANSERVFINEVRVISRLIHRNLVQFVGWCHEQGEFLLLFEYMPNGSLDTHLFGDKKPLTWDVRYKVALGVASAVRYLHEDAEQCVLHRDIKSANVLLDTDFSTKLGDFGMAKFVDPGLRTQMTGVVGTFGYLAPEYINGRKASKESDIYSFGVVALEIACGRRTYHDGEFHVPLMNWVWQEYVKGNVMDVVDERLNKEFNVDEMRSLIIVGLWCTNPNDKERPKAAQVIKVLELEAPLPELPLDMHDRLPPSLVKYSEQPNFQSVQTLPFTDSFISVGR*


CDS Sequence:
>Vu_01704.1
ATGAGAATGAGGTTGCTAGAGATGGTGACAACTTTTGTTCTTCTGCTGCTTCTTCGTCCTCCCTTTCTTAAAACTGTAGAATCACTAAATTTCAACATAACAAACTTCAACGACCCTGAGAGTGCACAAAACATGGCATACATAGGTGATGGCAAAGCCAGCAACGGCAGCGTAGAACTCAACATTGTGGACTATCTTTTCCGCGTTGGAAGAGCCTTGTACGCAAAACCTCTGCACCTGTGGGATCAAGCATCGAATGTTCTCACAGACTTCACCACACACTTCACTTTCTCCATTGACAGAGCCAAAAACGGCACCTATGCCGACGGTTTCGCCTTCTACATCGCCCCTCATGGCTACCCGATTCCTCCCAACTCAGGTGGTGGCACTTTTGCCCTTTTCAACACCACCTCCAACACCTTTATTCGCCACAACCACGTCCTCGCGGTTGAATTTGACACTTTCAATGGCACCATTGACCCTCCCATGCAGCACGTTGGCATAGACGATAACTCTCTCGTCTCCGTGACTTCTGCCAAATTTGACATTGACAAAAACCTGGGAAAGAAATGTAACGTTTTGATAACCTACACTTCTTCCAGCAAGACCCTCTTTGTGGCTTGGTCCTTCAACGGAACAGCAACGTCACACTCCAATTCTTCACTTTCTTACACGATTGACCTCATGGAAATTCTACCAGAGTGGGTGGATGTGGGGTTCTCCGCTTCAACAGGCGAATTCACCGAACACAATGTTATTTACACCTGGGACTTTAGTTCAACGTTGAATTCGGATGCTTCGGATAATTCCTCCGGTGGCGGGAACGGAAAACGAAACGTTTGGGTGATTGCTGTGGCGACTTCTTCGGCGGTCTTGGTGGCCGTGGTTGTGAGTGTTGCAGTCTGGGCAATGATGAGGAAGAAAAGAAGGGATAAGGTTGATAAGAGTAATGATGGTGAAGGTGGAGCCAACTTGGTTAAGTTTGATTTGGATAGAGCAACTATACCAAGAAGATTTGATTACAGAGAACTACTTGCAGCCACCAACGGATTCGCAGATGATAGAAAGCTTGGACGAGGAGCTTCGGGACAGGTTTTCAAAGGGGTTCTGAGTGATTTGGGGAGGGTTGTTGCGGTGAAAAGGATTTTCGCTAAGTTTGCAAATTCAGAGAGAGTTTTCATCAATGAGGTTAGGGTCATAAGCCGTCTTATACACAGAAACTTGGTGCAGTTCGTAGGGTGGTGCCACGAGCAAGGTGAGTTTCTGTTGCTTTTTGAGTACATGCCTAATGGAAGCCTCGACACTCATCTCTTTGGGGACAAAAAACCTTTGACCTGGGATGTTAGGTACAAGGTAGCATTAGGAGTGGCTTCAGCAGTTCGTTATCTTCATGAAGATGCGGAGCAGTGTGTTCTTCACAGGGATATTAAGTCAGCAAATGTGTTGTTGGACACAGATTTTAGCACCAAGCTTGGAGATTTTGGAATGGCAAAGTTTGTGGATCCAGGGTTGAGGACTCAAATGACAGGGGTGGTGGGGACTTTCGGGTACCTTGCCCCAGAATACATCAACGGACGTAAGGCTAGCAAGGAATCAGACATTTACAGTTTTGGGGTTGTGGCTCTTGAGATCGCATGTGGAAGGAGGACTTACCATGATGGAGAGTTTCATGTGCCTCTGATGAACTGGGTGTGGCAAGAGTATGTGAAAGGGAATGTGATGGATGTTGTTGATGAGAGACTGAACAAAGAGTTTAATGTGGATGAAATGAGAAGCTTGATCATTGTGGGATTGTGGTGTACTAACCCTAACGACAAGGAAAGGCCAAAGGCTGCACAAGTGATAAAAGTTCTTGAGTTAGAAGCACCATTGCCAGAGCTTCCACTTGATATGCATGACCGTCTTCCTCCTTCTCTAGTTAAATATTCAGAACAACCTAATTTTCAGTCCGTTCAGACACTACCTTTCACCGACAGCTTTATAAGTGTTGGACGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_01704::LG1:20068566-20070566(-)
TTAGTTTTGTTTTAATTTGATCTATGTTCAGTGACATTATTAACTATGTGATATTATTAAGAATTGTGATCAATTTTAAGTATGTCAAGTAATATTATTAAGATTAATCATCATAAATTTTAGATATTTTTTTAAAGATTGAAACTCAATCATAATTTTATCTTCAAAAACTAAAATAGGAATAAATTCAATTATAATAAATAAATATCATGTAAATTATTTATATATATTTTTATAAAGTGCACGTCTTTATGGATGATGATATTCTAATTAAGATATTTCTATCTCAAAATCATATGCATATAACCTATGGAGAGAGGCAGTAGAATAGTCAAAGAATGACATACTTTATTTCACAACTTAAAAAAATATAAGCTAAACATCAAATAATTGAAGTCAATGTAATTATCTCTACTAAATTATTTTCTAGCCGGAAGTTTCTTTCTTATTGGTTCCTTGATTGTGGAAGTCTTCTTCAACAATTAAATTAATTGGCGCCGTATGTCCAATTAACACTTTTGTTCAAGGGAATTTTTTTAACTACTGAATGAAGACTTTTGTTTCAATTATAATAAATAAATATCATGTGAATTATTTTTATATTATTTTATAAAGTGACATGTTTTTATGGATTATGATATTCTAATTAAGATATTTCCATCTCTACATCATTTGCATCATGTCAAAAATATTATTAAAGATAAAAATAAATAAATAACATTACATAAGAACATTCATTATCATAAAAATCAAGAAAAACATTTATAGTTAGATAAGCCATTCCAACTTCTAGAAAAACTTGACCAAAGGAAATTTGGTATAAGATAACATCAAATCATATATGGCCAAAACATGAGCACTCACGCTTTTCTTTAAGAAATCACAAAAAAATTTGTAATTTCAAAACGACAACTTTCTTACTTTTTCTTCAAATTTATCTGCTCATCTTCATTTGAAAACTTGAATTTTTAACTAAATTAACCTTATACTACACCTAAAACTTTTAATTAACCTTATACTACACCCAATGATTGAAATACTATTTAGTCGTGGCATTAAGCTGATTCAAAAACTAGATTTACTATTAGATCTTACACTACGGGATCATAAAATATGCAAGCATGAATACTAATATCACGTAACAATAAGCTAAAATTCTAAACACTTTTCCAGTTGCCAAAATGTAATGGATATCAACGGCCACTTACCTTCCAATACAACAACATTATTAAACCAATTCCAAATATTCAAAACCTTGAAGTTTTCAATGCATATATTGTCTCATAAACTACAAATCAGAACGACAACACATAAGTAGACTCTCATCAATAAGCATACGTTGACGAAGAACATGCCATAAACTAAATGACGTAGAAGTGAACCAATACCTTTTCAAACCAAACCAATTGCAAAACACTTATACCAGGATTGTTTAGATGACTGATACAATCTTTCCAATTAAGCAAATTGTCCCTTTTTGTTTTTGTCTGACTTGTCTAAGTAGAAATAAGACATGTTATATTTTAAAAGAATATATTCAATATTATTCAATAGACATTTCAAGACAACAAAAAATAAAAATATGTTAATAACTTTTTTTTTTTATACTTTTTTACAAACATGATAGTTTTTCGTTCGTTTCAAATATCCAAACCAATAAACTAATGAAGTATAGTTATTAAAAGAAATTGTTAACGTAGGATAACGGTAAAAAAAATGATAAAAAAAAATTAACGACGAAGTTATTACAACATGTAATGCATACACTGCTCTGGTTGAATTTGGATATTTTATTTATGGTCGAGTTTTAATCTTACGAATGCAGAAGAAACAAAAGAAGTTGATTGAAAGGGAGAAATTGTTAATCATGTGGTACTTTGTATCTATCTATATATATCTTTAAACAAGAAGCTCCATTCATCAATTCCAGCTACAGCTGTTCTTCCCCTTGTCTTTCAAAATTGATATAATATAGGGGAGAAAAAGAACAGCCACTGAGA


Gene Sequence:
>Vu_01704(-)
ATGAGAATGAGGTTGCTAGAGATGGTGACAACTTTTGTTCTTCTGCTGCTTCTTCGTCCTCCCTTTCTTAAAACTGTAGAATCACTAAATTTCAACATAACAAACTTCAACGACCCTGAGAGTGCACAAAACATGGCATACATAGGTGATGGCAAAGCCAGCAACGGCAGCGTAGAACTCAACATTGTGGACTATCTTTTCCGCGTTGGAAGAGCCTTGTACGCAAAACCTCTGCACCTGTGGGATCAAGCATCGAATGTTCTCACAGACTTCACCACACACTTCACTTTCTCCATTGACAGAGCCAAAAACGGCACCTATGCCGACGGTTTCGCCTTCTACATCGCCCCTCATGGCTACCCGATTCCTCCCAACTCAGGTGGTGGCACTTTTGCCCTTTTCAACACCACCTCCAACACCTTTATTCGCCACAACCACGTCCTCGCGGTTGAATTTGACACTTTCAATGGCACCATTGACCCTCCCATGCAGCACGTTGGCATAGACGATAACTCTCTCGTCTCCGTGACTTCTGCCAAATTTGACATTGACAAAAACCTGGGAAAGAAATGTAACGTTTTGATAACCTACACTTCTTCCAGCAAGACCCTCTTTGTGGCTTGGTCCTTCAACGGAACAGCAACGTCACACTCCAATTCTTCACTTTCTTACACGATTGACCTCATGGAAATTCTACCAGAGTGGGTGGATGTGGGGTTCTCCGCTTCAACAGGCGAATTCACCGAACACAATGTTATTTACACCTGGGACTTTAGTTCAACGTTGAATTCGGATGCTTCGGATAATTCCTCCGGTGGCGGGAACGGAAAACGAAACGTTTGGGTGATTGCTGTGGCGACTTCTTCGGCGGTCTTGGTGGCCGTGGTTGTGAGTGTTGCAGTCTGGGCAATGATGAGGAAGAAAAGAAGGGATAAGGTTGATAAGAGTAATGATGGTGAAGGTGGAGCCAACTTGGTTAAGTTTGATTTGGATAGAGCAACTATACCAAGAAGATTTGATTACAGAGAACTACTTGCAGCCACCAACGGATTCGCAGATGATAGAAAGCTTGGACGAGGAGCTTCGGGACAGGTTTTCAAAGGGGTTCTGAGTGATTTGGGGAGGGTTGTTGCGGTGAAAAGGATTTTCGCTAAGTTTGCAAATTCAGAGAGAGTTTTCATCAATGAGGTTAGGGTCATAAGCCGTCTTATACACAGAAACTTGGTGCAGTTCGTAGGGTGGTGCCACGAGCAAGGTGAGTTTCTGTTGCTTTTTGAGTACATGCCTAATGGAAGCCTCGACACTCATCTCTTTGGGGACAAAAAACCTTTGACCTGGGATGTTAGGTGAGTTCGATAACATAGATGCTATTTTCTTCAATATATTTTATTACCTTGCTGTTCGGAATATAATATATTTCAAGCTAAAATATATTACCTGTTTGGAACATTTCAAATAATTACCATGTGTGTTTTGCATCACATCTGACACCACTTAAAAGAATAAATTCTCCATCTTTTGTTATGAACATGAAAATAAGAAAATATATAATTAAATAAACATAGGCAAACAAGCATTGATTTTCTTGCATTACAAGTACATGCTTCTTTCTCTCGTTTAATCCCAATTCTCCCGACAGGTACAAGGTAGCATTAGGAGTGGCTTCAGCAGTTCGTTATCTTCATGAAGATGCGGAGCAGTGTGTTCTTCACAGGGATATTAAGTCAGCAAATGTGTTGTTGGACACAGATTTTAGCACCAAGCTTGGAGATTTTGGAATGGCAAAGTTTGTGGATCCAGGGTTGAGGACTCAAATGACAGGGGTGGTGGGGACTTTCGGGTACCTTGCCCCAGAATACATCAACGGACGTAAGGCTAGCAAGGAATCAGACATTTACAGTTTTGGGGTTGTGGCTCTTGAGATCGCATGTGGAAGGAGGACTTACCATGATGGAGAGTTTCATGTGCCTCTGATGAACTGGGTGTGGCAAGAGTATGTGAAAGGGAATGTGATGGATGTTGTTGATGAGAGACTGAACAAAGAGTTTAATGTGGATGAAATGAGAAGCTTGATCATTGTGGGATTGTGGTGTACTAACCCTAACGACAAGGAAAGGCCAAAGGCTGCACAAGTGATAAAAGTTCTTGAGTTAGAAGCACCATTGCCAGAGCTTCCACTTGATATGCATGACCGTCTTCCTCCTTCTCTAGTTAAATATTCAGAACAACCTAATTTTCAGTCCGTTCAGACACTACCTTTCACCGACAGCTTTATAAGTGTTGGACGTTAA

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