Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01550 LG1 18049785 18050949 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 18049806 5_prime_UTR_variant
G/A 18050119 stop_gained p.Trp86*
T/A 18050144 missense_variant p.Asn94Lys
C/A 18050147 synonymous_variant p.Gly95Gly
T/A 18050234 synonymous_variant p.Pro124Pro
G/C 18050438 missense_variant p.Glu192Asp
A/G 18050458 missense_variant p.Tyr199Cys
C/T 18050503 missense_variant p.Pro214Leu
G/T 18050637 missense_variant p.Gly259Trp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01550.1
MATGSRDIDRIKGPWSPEEDEALQRLVQALGPRNWTMISKSIPGRSGKSCRLRWCNQLSPEVEHRTFTPEEDDAIIRAHSRFGNKWATIARLLNGRTDNAVKNHWNSTLKRKCSALGLDATDRPPLKRSASVSAGYLNPSSPSGSDLSDPGKPALSTPSASAFCRPNLMETASSLSDPATSLSLCLPGLNSEPIQRSLYLPGLSSEPEQRPPSPAQPSPPPPPSAVSTVEERRKQLFNPEFLRVMQEMIRKEVRNYMSGMEVKNGLRIQTEVIGKAVVKRMGISNIK*


CDS Sequence:
>Vu_01550.1
ATGGCAACTGGAAGCAGAGACATCGATCGGATCAAGGGCCCATGGAGCCCGGAGGAGGACGAGGCGCTGCAGAGGCTCGTGCAGGCTCTTGGGCCGAGAAACTGGACGATGATAAGCAAGTCTATTCCCGGTCGATCCGGCAAATCGTGCCGGCTACGCTGGTGCAACCAGCTCTCGCCGGAAGTAGAGCATCGCACTTTTACGCCGGAAGAGGACGATGCTATTATCAGGGCACACAGTAGGTTCGGTAATAAGTGGGCCACCATAGCACGTCTACTCAATGGCCGCACCGATAACGCCGTCAAAAATCACTGGAACTCCACTCTCAAGAGAAAATGTTCCGCCCTTGGTCTCGATGCAACGGATCGTCCTCCCCTAAAAAGATCTGCCAGTGTCAGCGCGGGTTATTTAAACCCGAGCAGTCCATCTGGGTCCGATTTAAGCGATCCGGGCAAGCCGGCTCTGTCGACTCCTTCTGCATCGGCCTTCTGCAGGCCCAATCTCATGGAAACCGCTTCTTCACTCTCCGATCCAGCCACGTCACTGAGTTTATGTCTTCCTGGGTTAAACTCGGAGCCTATACAGAGGAGTTTATATCTTCCTGGGTTAAGCTCGGAGCCTGAACAGCGGCCACCATCCCCGGCACAGCCTTCTCCACCTCCTCCTCCTTCAGCGGTGTCCACGGTGGAAGAGCGTAGAAAGCAATTGTTCAATCCGGAGTTTTTGAGGGTGATGCAAGAAATGATAAGGAAGGAAGTGAGGAATTACATGTCAGGGATGGAGGTGAAGAATGGTTTGAGAATACAAACGGAAGTCATTGGAAAAGCGGTGGTGAAGCGCATGGGAATCAGCAACATCAAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_01550::LG1:18047785-18049785(+)
GTTTATTCATCCAAAGATTGGAGTGTTTGGTTTAAAAAAAATTAAGTTTAAAATATATTTAAGATACAATTATATTAACATATTATATGAGTAAGAAGTTAACAAGACCATGAACAAATATAACAATTCAAATTATTGATTCAAGTAAAAAATAATTTCCTATCAAATGTTTTACTCTTTTTCTTTCTTATTTTATCTCTATATGTTTTGTAACCGAAAGATGTTTTTAATATATGTTCGGTAGTTGAAAAGATCAACATCAATTATATTAAAAAAAATAGTGAAAATAATTAATGATTTAATTTGATAAAATTGTAGTTTTTTTCTTTCTTTCTGAACCGTGTAAACCATGTTATATATGGGAAAAAAATGTGTAATTGAGATTATAGGTAGTATTTTAAAGATTATTGTGAGCTTGATTATATGGTAAGAAATTAACAAACAGAAAATATTATGTAACTAAAAAAAGTAATACCGGATATTTAGTAAATAATAATTTTTTCAATAATACTTAATAAAACTTGACATGACAAAATAACATATATTTATATTTTCATATTTGTTTTTGTATTTGATTTATAAAACTGAATATTACTTATAGTTAATATAAAAAATTAATGTTTTAAACATGTTGTTTAATTAACATTGAAGCATAAATATATTAAATGGTGCATGTTAACATGAAATACTCTATAAATATCAACTAAATAAATTAATTGAAAAATGAATTCTGTTTTTAAAATTCGAATTGGTTGATAGTTATACGAATTCTAGGTCATTGTTATAACCGTTATGGTTTTATTAGTTATCAATATTTTTTAATATCAGTTAAATTCCTGTTTATGAGTCCAATTCTCGAAAGATAAAGATAATAGAATATAAATTTGAGATGATAATAAATAGGTTTAGGATCTCAGATCCAATACTTCTGTAACTTAGTCTACATTCGCAAGGTACCATTATTATTCACCATAAATGTGTAAAATATTTTAAAGTAAAGTAAATATTAAATATAAATAAAATGAATAATATTAATATTCTTTTAAAAATTCAAGTGGTAAATATATACAACTATACTCATATTTTTAAGCACATACTTTTATTGTTCACCTCAAATTTTATATATATAAAAAAAACAAGACTCTTCAAATAAAAAGTTAGGCTTATCTAATTTAATCAACCTAGATAAATTTACAGTTAATTTTAAACCACTAAAATTAATTAAAAAATGCATTAAATAATAACTATTTCTTAAAAAAATTTGAACTTCTAATTAAAATAAACAGTCCATAAATATTATTTTATCGACACAAAACAACTCTAATTTGCAGTCAATCATGGTTTAATTTTAGATTTGGAAGACAATATCCGTAACGGTCAGTAGTTATATTTGAGCGAAAGCCGTTAGGTTTAAAGAATTAAATATATAATCTGATTCCCGAAAATAATTTGTAGATTTACCTTAATTTAAAAAATTCAGCTAAACAGTATTTTTAAAATTTAAAATAAATACATATCATATTTTATTAATTAATAATGATTAATTCAAGCCACTAATAATGTTTTACAACCAAAAATGGTTCAGTTGGAATTCGAGATTACCGTTTTGGTCAGAGCGAATTTAGAATGCGCAACTGTTCAACCGTCTTAGTCAATAAGACGATTTATTCTGGAATGAATGAGTTGATTTTTTTAATTGTAATTAAAATTATAATTAATTTAATAATTAAAATATCTAATTGAGATTGAGTGTAGAAAGGAAGAAGGAAGATTAGTTTAGTTAATTAGTTAATAATTTTACAGAAAACACCAGCCAGCACCGATAGCGTGATCATACGTGTAACCGTGAAGAGGCTCCAACTCCCACGCGTGTTAGTTTGCCAGCTGTAAGTAACTGCTTTGCCAACCGCCCCAACCGGTCACATCAACCGGCCCAACCGGTCATCCTTATCCCTTTTGCATTTTCTATTTCTCCCCCAAACCCCACCCTTCTTCTCACA


Gene Sequence:
>Vu_01550(+)
AAACCACACAACACATCTCTCATAAATTTTAATTTTGATATTTTCTTTATTTTGTTTTTATGATTAAACTCTGCTAGCATGGCAACTGGAAGCAGAGACATCGATCGGATCAAGGGCCCATGGAGCCCGGAGGAGGACGAGGCGCTGCAGAGGCTCGTGCAGGCTCTTGGGCCGAGAAACTGGACGATGATAAGCAAGTCTATTCCCGGTCGATCCGGCAAATCGTGCCGGCTACGCTGGTGCAACCAGCTCTCGCCGGAAGTAGAGCATCGCACTTTTACGCCGGAAGAGGACGATGCTATTATCAGGGCACACAGTAGGTTCGGTAATAAGTGGGCCACCATAGCACGTCTACTCAATGGCCGCACCGATAACGCCGTCAAAAATCACTGGAACTCCACTCTCAAGAGAAAATGTTCCGCCCTTGGTCTCGATGCAACGGATCGTCCTCCCCTAAAAAGATCTGCCAGTGTCAGCGCGGGTTATTTAAACCCGAGCAGTCCATCTGGGTCCGATTTAAGCGATCCGGGCAAGCCGGCTCTGTCGACTCCTTCTGCATCGGCCTTCTGCAGGCCCAATCTCATGGAAACCGCTTCTTCACTCTCCGATCCAGCCACGTCACTGAGTTTATGTCTTCCTGGGTTAAACTCGGAGCCTATACAGAGGAGTTTATATCTTCCTGGGTTAAGCTCGGAGCCTGAACAGCGGCCACCATCCCCGGCACAGCCTTCTCCACCTCCTCCTCCTTCAGCGGTGTCCACGGTGGAAGAGCGTAGAAAGCAATTGTTCAATCCGGAGTTTTTGAGGGTGATGCAAGAAATGATAAGGAAGGAAGTGAGGAATTACATGTCAGGGATGGAGGTGAAGAATGGTTTGAGAATACAAACGGAAGTCATTGGAAAAGCGGTGGTGAAGCGCATGGGAATCAGCAACATCAAGTGAAGGAAAGGAAAGAAACTGTGTCGTTTGAATTATCAGAACAGGCCAGAGGACATGAACTGTGAATCACAGGGTAGAGAAAAGTGAGTGAAAAAGAGAATTTTATTTTATTTTGTAGTTGAAGTAAATTCTAGTTTCCCTTTGCTTAAGGGTAAAAATTAGTAATAATTTCGGCACTGTACAGAACTTAAAAAGAAAAAATAAAATGAAAGAGTGCTTTTCTGAT