Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01465 LG1 17229797 17232946 PREDICTED: B3 domain-containing protein REM16-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   biological_process
Cellular Component   located in   cytoplasm, plant-type vacuole, cytoplasm
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
T/C,* 17229885 3_prime_UTR_variant
T/C 17229964 3_prime_UTR_variant
C/T 17230456 intron_variant
T/A 17230564 missense_variant p.Lys320Met
A/G 17230568 missense_variant p.Tyr319His
T/A 17230667 missense_variant p.Arg286Trp
T/A 17230766 intron_variant
A/T 17230767 intron_variant
C/A 17230970 intron_variant
T/A 17231004 intron_variant
C/T 17231036 intron_variant
C/T 17231045 intron_variant
T/C 17231115 intron_variant
G/A 17231224 intron_variant
A/T 17231479 intron_variant
G/A 17231931 synonymous_variant p.Thr133Thr
A/T 17231977 stop_gained p.Leu118*
A/T 17232242 intron_variant
A/C 17232277 intron_variant
C/A 17232614 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01465.1
MGVQSCNGCRSWEEDIYWSHFQFLHFVQFLRTGYDQHLALPKTFSDNLKKKPPANVTLKGPSGVAWNVGIITSGDTLYFARGWEQFVKDQCLKENDFLVFKYNGESQFDVLVFDGGSLCEKASSYFVRKCGHTEAEDVGGSLNKKRDNAEDPMKEGHIPLKAGVQCASPGKSVHANGTKEPINVPFETPTPSEEAFNADVESAGAEQITSDGVPLSAVPKETVNGKRIRKLASVVKHVQTKRRGRGRPAKVSTVIERALDWVSGLDAEPVSAVRSAAQEAFISNRRPVTDDEIKNALALAQAGRTDDSLVVVMRPSHVYKRFFVSMPNKWIGEHIPPMSQDVILRMDKGEWVARYSYHNIRHTGGLTGGWKHFVLDNNLEEYDVCVFKPAGQMNDNLVLDMSIFRVVEEIVPLSVMSPTGKRGRKPAAQNAILTET*


CDS Sequence:
>Vu_01465.1
ATGGGGGTTCAAAGTTGTAATGGTTGCAGATCCTGGGAGGAGGACATTTACTGGTCTCATTTTCAATTCCTCCATTTCGTGCAGTTTCTCCGAACGGGTTATGATCAACATCTTGCACTTCCGAAGACATTTTCAGACAACTTAAAGAAGAAGCCGCCTGCAAATGTGACCCTAAAGGGTCCTAGTGGTGTTGCGTGGAACGTGGGGATAATTACTAGTGGAGATACCTTGTACTTTGCACGTGGTTGGGAGCAGTTTGTGAAAGATCAGTGTTTGAAGGAGAATGATTTCCTAGTCTTTAAGTATAATGGTGAATCTCAGTTTGATGTTTTAGTGTTTGATGGGGGGAGCTTGTGTGAGAAGGCATCTTCTTATTTTGTTCGCAAATGTGGGCACACCGAAGCTGAAGATGTGGGTGGAAGTCTCAACAAGAAAAGGGACAATGCAGAAGATCCTATGAAAGAAGGTCACATCCCTTTAAAAGCTGGTGTGCAATGTGCTTCACCTGGGAAATCTGTGCATGCTAATGGTACCAAGGAGCCAATTAATGTACCTTTTGAAACTCCTACTCCCAGTGAAGAGGCTTTCAATGCAGATGTTGAATCTGCTGGTGCTGAGCAAATTACATCGGATGGAGTCCCTCTGTCAGCTGTTCCCAAAGAAACTGTTAATGGAAAAAGGATCAGGAAGCTTGCTTCAGTTGTTAAACATGTGCAGACCAAACGGAGGGGCAGGGGCAGACCAGCTAAAGTGTCTACTGTTATAGAGAGAGCACTTGACTGGGTGTCTGGACTAGATGCTGAACCTGTTTCTGCTGTTAGAAGTGCTGCACAAGAGGCATTTATATCAAATAGAAGGCCTGTCACAGATGATGAGATTAAAAATGCCTTAGCATTGGCCCAGGCAGGACGCACTGATGACAGTTTGGTTGTAGTCATGCGACCCTCTCACGTGTACAAGAGATTCTTTGTGTCAATGCCCAACAAGTGGATAGGAGAACACATCCCTCCAATGTCTCAAGATGTGATCTTGCGCATGGACAAGGGTGAATGGGTTGCTAGATACAGCTACCATAATATTCGTCATACTGGTGGACTTACTGGTGGGTGGAAACACTTTGTCTTGGACAACAACCTAGAAGAGTATGATGTTTGTGTGTTTAAACCAGCTGGCCAAATGAACGACAACTTGGTCCTTGATATGAGCATTTTCAGAGTTGTTGAGGAAATTGTTCCTCTTTCTGTTATGTCTCCAACAGGAAAAAGAGGAAGAAAACCAGCAGCACAGAATGCTATTCTGACTGAAACATAA


Promoter Sequence:
>Vu_01465::LG1:17232946-17234946(-)
AATATATCAAAATAGTTTTGTCTATTAAAACCCGGTATACATTACTAAAATGTACCATCTAAAAAAAGAGTTTATGGGTGTTAACAAACCCCCTTCACCACACACATGCGCACGCGCACACTCATAAGATATTAAATTATAGTTATATTTAATTTTTTGTTAATTATAACACACTTATATTAAATGATAATTTGATAAGAAATTATAAAAAGCTTAAACATCAATTTTGATGTATTTAAACTATAGTGATTTGAATTTAAATAACAAATATTTTTCTATACGTGGCTAACTAAATTTGTTTATACTTTAAACTTTTCTTTCAAATGAGGCTAGCTCTCTCTCTATATATATATTATAATTATAGTAGATGTGATTAAAATACTACAAAGGAATCTCCTTTTAAATATTATTATTTGGAATAAAAAGTCAATCAATTTAATTTCTTAATTAATAACTCTTAGGGTGTGTTCGCATGAACGAAATTTACTGTTCATGTGAATCACAGAGCGAGGAATTGAAATTTATCTGTGTTCGTATGAGAGGATTAATGAGGATAAGCGAAAATGGATTTGCGAGATGGATGCAGTTTTGGTTACCCGAGGAAGTGAGAAGATTTGCTCTGATTTAATACACAAATACTCATATGCCCTGTACGGATATGAAGACACACAAACGTGGAAGCAGCGAAGAAGTGATAACCGGTTACAGCAGAGTGTAACTGGTTACAGAGTGTAACACAGAAGAGTGGCGTAACCGGTTACAGAAGAGTGTAACCGGTTATAGAAAAATGAAGTTTTGGTGGCAAACGCGTAACCGGTTACAGGTTATATATTTTTCAGTTTTTTTTATAATTATTTTAATATTATAATTTAAAAAATCTACATCTTAATAAAATTAGGTATATTATATTTTCTAATTTATTAAAAATAAGTTGATTATTTAATTTTTATAATTTTTAAACATTAATTTTATAAATTATTCATAATTTTTTTTCTTTATAAACATTTTTACAATTAAATATAGCATTTATAAATAACATTTTATATTACTTTTATAACTAGGGGTATTTTAGTAATCTTTAATTTCTATCAATTAAACAAATTTTTAAAATCTATCACATCAATCAAATCCTACACTAATTCTCACAAACTTTACTTCTAAATCCACTCCCAATTACCCACAAATTCACTAAAAAAAACAACAACAAAAATATCCTCAAATCTATTCAAATCATCTCCCCAAATCATCTCTCCCAAATCACTCTAAACGAATAAAGCCTTAAAGCAAGACTTGTGCTTAAAAAAATTGTTAAATGTGTATGTATGAACTTTTACATTGAATTTTCTTCTAAAAAATGTTACTGTAATAAACTTCCAAATTTGAATTTTAAAAAAAAAACTATGAAAAAAATTAATTGAATAATTTAAATACATTTATGAATGTAAACTGGTAACCGCTAATAGCATCATCTGGGTCCGTTTCAGTAACTAGTCACTCTACCCTTAATTACATCTCCTTAATTAAAAAGATTAACATTATAAATTTAAGAATTAAGTTATAATAGAACTGTTAGAATATGTTAAGGTTAAAAGTAAAAAACAAATTTTAATTTTAATATAATAATGAAATTAATTTCTTGAATATATTAAAAATTATAAATTATAAGTCTTACAAAAGATTTATATTAAAACAAAATTAAAAAAGTTTTAAAATTAATGTAATAAAGTAAAAAATTTATATTTTAAAAAAAATTAAATAAAGCTTTAGATTTTGAAATAGAAAAATATTTATAATATTAATATGATAATTAAATTAATTTTAAAATGTAAAAAGTAATTTAAAAAAGTTATAAAATATTTATATACTGAAGTAATTTTTTTAAAAAATAATATAAGAAATTGGTCGTAAGAGTTAGAGCGATAAGATTCTTCTTGTGTCGGAAATTAGTGTCATCACATTTTGTTTTTAATTTTTCTTACTTTTTTTACGTTGTAAGAAGT


Gene Sequence:
>Vu_01465(-)
GTTCTAACTATGAGTGGGTTTGGTCTGTGTTTTGTCATTCCAGTTTATACTCGTTGGGCCGTGTGCCTTTGCTCTCAACTCATACCCTTTCACCGTCTCTTGGACTCAAATCACTAAAGATTGAAACTTTTTTCATCTTTGACTGTTGCTGTTCAAATGGGGGTTCAAAGTTGTAATGGTTGCAGATCCTGGGAGGAGGACATTTACTGGTCTCATTTTCAATTCCTCCATTTCGTGCAGTTTCTCCGAACGGGTTATGATCAACATCTTGTTAGTATTCCATCCCACCTCTTACTTTTCTGTTGTGAATCATGATAAATCTGGCAAGGAATGGAACATGGGTTGAATTGAGCTCATGAACTTCATTCTATGTCCACAATTTTTTTACCCCCTTTGTTTCATTCTATCATCTCTTTTGTATCGATTTTTTTGGTAAAAAAATTTGCATGCACCCTGATATGTTTAAGGATATGGGCGAAGGGCAAATAGAAAAAAGAGAAAAAAACGAATGAGCTAAATAGTTTGTGTCTTGTGATTTGGTTGTTGTTGTCTTTGTTGTTCTGCTCCTTGCTTGCAAACACTATCTACTTTGCATGCTTGATATGGAAATAGTTGGTTATCAACCAAGTTGTTGTTGTTGTTGCTCTTTGATGTGTATCCTATTCTAACTGCATGTTTTTGCTGCTAATTGTATGTCGTTCTCATTGATGAAATTTGAAGCTTGTTTGTAGGCACTTCCGAAGACATTTTCAGACAACTTAAAGAAGAAGCCGCCTGCAAATGTGACCCTAAAGGGTCCTAGTGGTGTTGCGTGGAACGTGGGGATAATTACTAGTGGAGATACCTTGTACTTTGCACGTGGTTGGGAGCAGTTTGTGAAAGATCAGTGTTTGAAGGAGAATGATTTCCTAGTCTTTAAGTATAATGGTGAATCTCAGTTTGATGTTTTAGTGTTTGATGGGGGGAGCTTGTGTGAGAAGGCATCTTCTTATTTTGTTCGCAAATGTGGGCACACCGAAGCTGAAGATGTGGGTGGAAGTCTCAACAAGAAAAGGGACAATGCAGAAGATCCTATGAAAGAAGGTCACATCCCTTTAAAAGCTGGTGTGCAATGTGCTTCACCTGGGAAATCTGTGCATGCTAATGGTACCAAGGAGCCAATTAATGTACCTTTTGAAACTCCTACTCCCAGTGAAGAGGCTTTCAATGCAGATGTTGAATCTGCTGGTGCTGAGCAAATTACATCGGATGGAGTCCCTCTGTCAGCTGTTCCCAAAGAAACTGTTAATGGAAAAAGGATCAGGAAGCTTGCTTCAGTTGTTAAACATGTGCAGACCAAACGGAGGGGCAGGGGCAGACCAGCTAAAGTGTCTACTGTTATAGAGAGAGCACTTGACTGGGTGTCTGGTAACATGTTTGCTTGTCAAAAACTGAAAGGAAATGATATTACTACTGTTTAATGAACTTTTTTTTTTCTTATGAAGATCAAATTTGAGAATTTTTTATTTACTGACCAGTTTTTTATTCTTCAAAACCACAATGTTTTCTTAGGCTTTGAACTTCAAATACATATAGCTGATATGAAATAATGGAAGCCGAATGTAGGCTTCCGACATTACCTTTGTTTTCCCTAATCATATACTGAAATTTGGCTCTCTTTTATTATGTAACGAAGCATATGAATTGGCTAATGAGAAAGTATGGTTGCTCATACCTTTGATTCAAAGCAAATTACGTTTGTGAGATGTCTTAATTCAAGTGAAGGTTAAATCCATCATTTCTTTCTGACAATGAGAAAAAGTTATGTGAGTAATAGCATAAGGCAAGACTTACTTTTGCATAGATGTGCCCTGAACTCTACAACAGATACCAACTGATTGCTTTGATGATAGTTGGCTGTTGTTGCTTGTGTAGGCTTCTTGTTTGCGTGTTTTAAACTCAAATGTTATGTGATTATCTTGAAACAACTAGTTGATGATTTGCATGTAGAAAACATGCGTGGTTGAGATTGATTATGGAGAAAATAATCGCTGGTTTTATATTCAAAATCTCAGGGAGTTGACACATTTAAGTGGTTCTTTCTTGAAAATAAGTTGGACTAGCACATGCTTCTCAGTTTGTAAAATTGATTAAAAGTAAAAATAGAAAAAAAAAACCTGGTCTGTTTTTACATTGACCTTATAACACTGCTGCTTCTGTTTGAATCAATATCAGGACTAGATGCTGAACCTGTTTCTGCTGTTAGAAGTGCTGCACAAGAGGCATTTATATCAAATAGAAGGCCTGTCACAGATGATGAGATTAAAAATGCCTTAGCATTGGCCCAGGCAGGACGCACTGATGACAGTTTGGTTGTAGTCATGCGACCCTCTCACGTGTACAAGAGATTCTTTGTGGTAAACATTTGCCTCACACAATCTTTCATTATTTGATCTGTCATACATAAGCTAAAATCATCTCAGGTTATGGAGAAACTCAATACATTTTACCGTGTTGTCTTTTCTTTAAGTAAGTGTTTGTTATTCATTGTAATCCTTTTCTGTGACTAGTCAATGCCCAACAAGTGGATAGGAGAACACATCCCTCCAATGTCTCAAGATGTGATCTTGCGCATGGACAAGGGTGAATGGGTTGCTAGATACAGCTACCATAATATTCGTCATACTGGTGGACTTACTGGTGGGTGGAAACACTTTGTCTTGGACAACAACCTAGAAGAGTATGATGTTTGTGTGTTTAAACCAGCTGGCCAAATGAACGACAACTTGGTCCTTGATATGAGCATTTTCAGAGTTGTTGAGGAAATTGTTCCTCTTTCTGTTATGTCTCCAACAGGAAAAAGAGGAAGAAAACCAGCAGCACAGAATGCTATTCTGACTGAAACATAATTTGCATCATCATGAGGGTGAATGAAAGCATTGCAATGTAAGTTGATAATTTATCATAGGACTGCAGACCAAGTTCTTTAGTTGTGTTGTGTGTATTTTGGATATTGAGTTAGATTGTTTAGCCTTATTATCAGTCTTCTAAGGGGGCGCAGTGTAGTTATATATATATATGTATGTACTTCTTATTGGTCCTGTTAGACCTAGCTGGTTTAAATATGAACTGATATCTGCAGAGTTTTTAGATATTGAGTTTGACTAGAAC