Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01462 LG1 17185957 17199939 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase DDB_G0281745
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 17186058 3_prime_UTR_variant
T/C 17186059 3_prime_UTR_variant
G/C 17186121 3_prime_UTR_variant
T/A 17186208 3_prime_UTR_variant
G/T 17186249 3_prime_UTR_variant
A/T 17186250 3_prime_UTR_variant
T/C 17186871 downstream_gene_variant
C/T 17186959 synonymous_variant p.Ala551Ala
A/G 17186983 downstream_gene_variant
A/G 17186992 downstream_gene_variant
T/A 17187005 downstream_gene_variant
A/*,T 17187009 downstream_gene_variant
T/A 17187436 missense_variant p.Ile485Leu
A/G 17187439 missense_variant p.Tyr484His
C/A 17187563 synonymous_variant p.Gly442Gly
G/T 17187779 synonymous_variant p.Gly370Gly
G/A 17187995 synonymous_variant p.Thr298Thr
C/T 17188009 missense_variant p.Gly294Ser
G/T 17188048 missense_variant p.Pro281Thr
A/T 17188560 intron_variant
T/C 17188624 intron_variant
T/C 17188861 intron_variant
T/A 17188886 intron_variant
C/G 17188911 intron_variant
T/C 17189259 intron_variant
T/G 17189287 intron_variant
A/T 17189339 intron_variant
A/G 17189342 intron_variant
T/C 17189350 intron_variant
G/A 17189354 intron_variant
C/A 17189359 intron_variant
G/T 17189361 intron_variant
C/A 17189370 intron_variant
T/A 17189371 intron_variant
G/T 17189421 intron_variant
G/A 17189437 intron_variant
C/G 17189443 intron_variant
A/T 17189462 intron_variant
A/G 17189471 intron_variant
T/C 17189507 intron_variant
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G/A 17190366 intron_variant
A/G 17190379 intron_variant
G/T 17190556 intron_variant
C/T 17190575 intron_variant
G/C 17190593 intron_variant
C/T 17190595 intron_variant
T/A 17190646 intron_variant
G/A 17191034 intron_variant
T/A 17191420 intron_variant
T/C 17191440 intron_variant
T/C 17192028 intron_variant
G/A 17195308 intron_variant
C/G 17195450 intron_variant
C/T 17195735 intron_variant
G/T 17195756 intron_variant
A/G 17195814 intron_variant
A/G 17195845 intron_variant
G/T 17196105 intron_variant
C/T 17197372 intron_variant
T/C 17197436 intron_variant
T/C 17197457 intron_variant
G/T 17197478 intron_variant
G/A 17197495 intron_variant
A/T,* 17197527 intron_variant
C/T 17197542 intron_variant
C/T 17197543 intron_variant
C/G 17197578 intron_variant
G/T 17197595 intron_variant
G/T 17197602 intron_variant
C/T 17197660 intron_variant
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C/A 17198804 intron_variant
C/T 17199010 intron_variant
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C/T 17199020 intron_variant
C/T 17199126 intron_variant
C/T 17199721 synonymous_variant p.Lys33Lys
G/A 17199728 missense_variant p.Ala31Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01462.1
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>Vu_01462.2
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CDS Sequence:
>Vu_01462.1
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>Vu_01462.2
ATGCTAAGAGAGGAAACGGTGGGTTCCAGAAGTGCCAGGCACACCGCCGCCTCCGCCACCGTCTCCAACAAGGTTCTCGTCGCCGTCAAGGCGGAGAAGGTGATCTCCAACACCGCATTAGCCTGGGCTCTCACTCATGTCGTTCACTCCAGCGACTCCATCACGCTCCTTGCCGTTTACTCTGCTCAAAAAACCGGCAGAAGATTCTGGCATTTTTCGAGAATTGCTGGAGACTGTACGACCGGACCGGCGGCGAAGTTGCCGGAGCGAATTTCAGATATCTCCGAGTCTTGTGCGCAGATGGTGCTTCAGTTGCACAATCAAGTTGAGGTAAGGGTAAAGATTAAGGTGGTCACGGGTACTCCCAGTGGTGCTGTGGCGGCCGAGGCTAGATGGAGCGGTTCCCATTGGGTCATACTGGACAAGAAATTAAAGCAAGAGGTAAATCATTGCATGGATGAACTCAACTGTAGCATTGTGGTGATGAATGGGTCACAGGCAAAAATCCTCAGACTTAACTTAGGGTGTTCCGATGAACTCCAAACCCCTTTTTTCTCGGCTACTTCTTCACCAGGCATAGAAATTGCAAAGCTAAAAGGCGGAAGATTGATGCATTCTACCCCAGTGGGTAGCCCTGAAGAAGCAGGTACTTCTGTTATAAGAAATATAGGAGTAAATTCAGGGTCAAGTTCGGACTCGATGACTTCTCCTTTCCTTGTCTATGAACAAAACCCTCTGTACGAGGGTCAGGGCCCAGGAAAAAACATACACAAAGCAATCAACGAACAGATAGATTTCAATGTCCAGCCACCATTATACTTTGACATTGAAAGAGATCGCCCTCCCCCGCTATGGCCGCGTCCAACAGCATCCGTGGCTGGTGAAAACAAGACCGTATTTTGGATTCCTCAAAACCACATTGTAGACGAGAAGTTTCAGAAAACTAAAAACAACAGTACTATCCAAAGAACTAAATCTCCATCTTCGAAAACTTTACTTGAGAATTTTAAGCGTTGTGATCAAGAGATGAGAAGAAATGAATACGGGTTTGACCAAGCTCAAAGTAGAAGATACGACACGGGCAACAGAGATAATTCCATACCTTTGGGCAGAACTACCTCAATACCTCCTCCCTTGTGCTCACAGTGTCAGAATAAAGCACCAGTATTTGGAAAGCCTCCAAAACGGTTTTCTTACAAAGAGCTAGAGGAAGCTACTGATATGTTCTCAGATGTGAATTTTTTGGCTGAAGGTGGATTCGGTGTGGTCCACAAGGGAATCCTCAAAGATGGCCAGGTTGTTGCGGTGAAACAGTTAAAGTGTGGGGGTTCTCAAGCAGATCTTGACTTCTGCAGGGAAGTTCGGGTTTTGAGCTGTGCACAACACAGAAATGTTGTGCTGTTGATAGGGTTTTGTACAGAGAGCAATTTGAGGATATTAGTTTATGAGTACATATGCAACGGATCCTTAGACCTCTACTTATATGGAGATGAGAGTATGCCTCTCGATTGGAACTCACGCTTAAAGATTGCAATTGGAACTGCACGAGGCTTGCGCTACCTTCATGAAGACTGTAGAGTTGGTTGTATAGTGCACAGAGACTTTCGACCCAAAAATATCCTCTTAACCCATGACTTTGAACCTCTGGTGGCGGATTTTGGGCTTGCTAGATGGTACTCAGAATGGAATATAGATACAGAAGATCGAGTTCTAGGAACTTCAGGGTATCTTGCACCGGAGTATCTTGACGCCGGAAATCTTACATATAAAGTAGATGTATATGCATTTGGAATTGTATTAGTAGAGTTAATAACAGGTAGAAGAATTAGCGAGTTGGAACAGTTCAACGGATTCTCGTATCTTCCTGAATGGATTCACCCTCTACGCATGTTAGAGCCCAGTCATATCTTACAAAACGTCAGTTCTCCCAAACCATTGGAATTTAATCTTCAATGGCAAGCTATGGCTCGAGCTGCTTCGTTGTGTCTCCGTGTGGATCCCGATGCCAGACCCCCAATGTCAAAGATCCTGAGAGTGCTGGAAGGGGGTGATCCAGTTCGTCCTATGGGTTTAGACATAAACTCAATTGGTAACACAAGTGGGCATTTAAGCGGTTTGAAGTCGCTCACTCCACCAGAAGCTACAATAACTCATTCTCGTACACTATCACATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_01462::LG1:17199939-17201939(-)
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Gene Sequence:
>Vu_01462(-)
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