Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_01424 LG1 16745275 16749031 putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase isoform C
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   embryo development ending in seed dormancy, protein phosphorylation, protein phosphorylation, embryo development ending in seed dormancy, embryo development ending in seed dormancy, protein phosphorylation, negative regulation of cellular process, embryo development ending in seed dormancy, protein phosphorylation, regulation of cellular component organization, protein phosphorylation, developmental growth, unidimensional cell growth, macromolecule modification, protein phosphorylation, unidimensional cell growth, unidimensional cell growth, regulation of developmental process, regulation of cellular component organization, embryo development ending in seed dormancy
Cellular Component   located in   plasmodesma, plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane, plant-type cell wall
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein tyrosine kinase activity, protein binding, ATP binding, protein serine/threonine kinase activity, ATP binding, protein tyrosine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein tyrosine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 16746097 missense_variant p.Ile275Leu
A/G 16746381 synonymous_variant p.Leu369Leu
A/G 16746861 synonymous_variant p.Leu529Leu
C/A 16746955 upstream_gene_variant
C/A 16747087 upstream_gene_variant
T/C 16747318 upstream_gene_variant
T/G 16747374 upstream_gene_variant
A/T 16747792 upstream_gene_variant
T/C 16747862 upstream_gene_variant
G/T 16748110 upstream_gene_variant
A/G 16748314 upstream_gene_variant
G/T 16748326 upstream_gene_variant
G/A 16748465 missense_variant p.Arg585His
G/T 16748491 stop_gained p.Gly594*
A/T 16748498 missense_variant p.His596Leu
A/T 16748515 missense_variant p.Ser602Cys
A/T 16748559 missense_variant p.Glu616Asp
A/G 16748886 synonymous_variant p.Gln725Gln
G/T 16748892 missense_variant p.Glu727Asp
T/A 16749029 missense_variant&splice_region_variant p.Ile773Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_01424.1
MGMGEIAVSVVSMLLLMVGLTMGMRLSSTTEWNALRELRSSLGIRAKYWPIKAEPCGNWTGVHCRNGRVVGINVSGLRRTRWGRLNPSFEVGSLVNLTLLESFNASGFVLNGSIPEWLGESMKVLDVLDLRLCSIMGSIPNSIGELSRLKVLVLSGNFLTGKMPTTFENLTRLTVLDLSNNSLSGYMPASVTQLGNLTRLDLSNNYLSGSVPLKLGALSSLQNLNLSGNSFTGSVPSQLGNLSELVEVDLSKNFLSGSFFGDLSFSRLSALEVLILSENLFDGALPHNFSSTPRLTFLDVSCNNLTGTLPNFTSWNGSSAGVVFNLSNNMFYGLLNTSLYEFKTIDLSSNYLEGEVQGGGNVILDRNCLQMTPNQRNLDECRAFYAARNLPFSFPESKSSRRVVFILVGIFGGLGFIAVLTLVLVLVLKQCHNHRSSEVQRGTKEEGPVQEGESPIPPKDADFVPGVGEAFSSQQIIRLTDNFAEANVIKNGHSGVLFLGVLEGGATVVVKRIDLNLFKRESYVVELRLLTSSILLDDKFEVRLGSLSQVTAQGDVQQGVISRVFNKPPSTSEGDPGKSSVTCTYDVYCFGKILLELITGNIEVSKSDDGTTKEWLEKTLPYITLYDKERVTKIIDPQLIVDEDLLEEVWAMAIVAHACLNPKPSKRPPMRHVLKALENPLKIVREDNSSSARLRSNSSRKSWSTAFFGSWRHSSSDSVVATTHANKESSSDTKKSRVGSQSSGNDHSSSNKRSSNEIFPEPLEVQDVEAGEAG*


CDS Sequence:
>Vu_01424.1
ATGGGAATGGGGGAAATTGCAGTGAGTGTGGTTTCAATGTTGTTGTTGATGGTTGGGTTAACAATGGGAATGCGTTTGAGTTCGACAACGGAATGGAACGCGTTAAGGGAGCTTCGATCGTCGTTGGGGATTAGGGCAAAGTATTGGCCCATAAAAGCAGAACCGTGCGGGAACTGGACCGGAGTTCATTGCCGGAATGGTCGAGTTGTGGGTATAAACGTGTCCGGTTTGAGGAGAACCCGGTGGGGTCGCCTTAACCCAAGTTTTGAAGTGGGTTCTCTTGTGAATTTGACACTGTTGGAATCGTTTAATGCTTCTGGGTTCGTGCTTAATGGGTCTATTCCTGAGTGGTTGGGTGAGAGCATGAAGGTGTTGGATGTACTTGACCTTAGGCTTTGTTCTATTATGGGTTCGATTCCTAATTCAATTGGAGAGTTGAGTAGGTTGAAGGTTTTGGTGCTTTCAGGGAATTTTCTCACTGGTAAAATGCCTACAACGTTTGAGAATCTCACAAGACTGACTGTTCTTGATCTCTCTAATAACTCTCTTTCAGGGTATATGCCTGCTTCTGTGACTCAACTTGGGAATCTCACAAGGCTTGATCTTTCTAACAACTACTTGAGTGGGTCTGTTCCACTCAAACTGGGTGCCCTTTCTAGTTTGCAAAATTTGAACCTTTCTGGGAATTCTTTCACTGGGTCGGTTCCCTCTCAACTCGGTAACCTTTCTGAGTTGGTTGAGGTTGATCTTAGCAAAAATTTTCTGTCGGGTTCATTTTTTGGTGATTTATCTTTTTCACGGCTCTCGGCCCTCGAGGTTCTCATTCTCAGCGAGAATTTGTTTGATGGTGCTCTGCCTCATAATTTTAGCTCAACGCCCAGGTTGACCTTTCTTGATGTGTCTTGTAACAATCTCACTGGGACACTGCCGAATTTCACAAGTTGGAATGGTAGCTCTGCTGGTGTTGTGTTCAATCTGTCAAATAATATGTTCTATGGACTTCTGAACACTTCACTGTACGAGTTTAAAACTATTGATTTGTCAAGTAATTATTTGGAAGGTGAGGTGCAAGGTGGTGGTAATGTTATTCTAGACAGAAATTGCCTACAGATGACTCCAAACCAGAGGAATTTGGACGAGTGTAGAGCTTTTTATGCTGCAAGAAACTTACCCTTTTCATTCCCAGAATCTAAGTCCAGCAGAAGGGTGGTATTCATACTGGTAGGAATATTTGGTGGGCTTGGCTTTATTGCGGTGCTGACATTGGTCCTTGTGCTGGTTCTAAAACAATGTCACAATCATAGAAGCTCGGAAGTTCAAAGGGGGACCAAAGAAGAGGGACCTGTTCAGGAAGGGGAAAGCCCTATACCTCCTAAGGATGCTGATTTTGTGCCTGGCGTGGGAGAAGCATTTAGTTCTCAGCAAATTATTCGTCTAACTGACAATTTTGCTGAAGCAAATGTCATAAAGAATGGCCATTCCGGGGTCCTCTTCTTAGGAGTCTTGGAAGGTGGAGCAACTGTGGTTGTCAAAAGGATAGATTTGAATTTATTTAAGAGAGAATCATATGTCGTGGAATTGAGACTATTAACTAGCAGTATACTTCTTGATGATAAATTTGAAGTGCGACTTGGAAGTTTGAGCCAGGTTACCGCCCAAGGAGATGTTCAACAGGGAGTCATCTCAAGGGTTTTCAACAAGCCACCATCTACTAGTGAAGGCGATCCTGGTAAATCATCAGTGACATGCACCTACGACGTGTACTGTTTCGGGAAGATTTTACTGGAACTCATTACAGGTAACATTGAAGTGAGCAAGTCAGATGATGGCACTACAAAAGAGTGGTTAGAGAAAACCTTGCCTTACATCACTCTGTACGATAAAGAACGTGTGACTAAGATTATTGACCCACAATTGATAGTGGATGAGGACCTATTGGAAGAGGTATGGGCTATGGCAATTGTGGCTCATGCATGCTTGAATCCAAAGCCTTCCAAACGTCCTCCAATGAGACATGTCCTGAAAGCATTGGAGAATCCATTGAAGATTGTGAGAGAAGATAATAGCAGCTCAGCGAGGTTGAGATCAAACTCTTCTAGGAAATCTTGGAGCACTGCTTTCTTTGGTAGCTGGAGACACAGTTCATCAGACAGTGTTGTTGCCACAACACATGCAAACAAAGAGAGTAGCAGTGACACTAAAAAATCAAGAGTAGGCTCTCAAAGTAGTGGAAATGATCACTCATCTTCCAACAAAAGGTCATCCAATGAAATTTTCCCTGAACCATTGGAAGTGCAAGATGTGGAGGCTGGAGAGGCAGGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_01424::LG1:16743275-16745275(+)
ATTCTTCGTGTGAAGACATTGCAACAACTGCAACTTGTTCCTACTGTTCTCTATAACATTTTTTCTTCTTCTTATTATTCTTAATATTAAAACTATAAAAATTTTGTTGACTATGCTGAGATTTCCAAATAATGGCCTTCTGGATTTTTTAATATCACTTGAAAGATTTATTTAGAGAAAATATCAGCTCAATTATTTGTGAATAAACTTATATAACATGTTATTTCTAAAAACAAACTTTAAAGTATACCATCGTCTATCGAGAGGAGGTTCGGTAGTATGGTGTTCTACTTTTCTTTTTTACTTAATAAAACTCAGATTTACACTTGAAATTTTAACACCGTCTTATTTTAAAATTTTAAAAAATAAATATTAAGGTTTTCTTTAATTATATATGTTTTTCTTTCTAAATTATTACAACTTTTATAAACAAAATTTGAGTGATGTTTTCAAATTAAATTATAAAATATTTAATCTTTGAATTTTATAACAAGTAAAACATCTTTTTAACAAAATTATATGTTGTTTTTATCTATTCCAATAAATATACTAACGAATACGACTAATCACACTCATTAAATCTTTTCATTTTAAAATAGTTTAAATCTATAAACAACATTCAAATATTATAATTTATCTTGATAATTTAATGTTATGATTATTATTAACTATTATATAATTATATACTAGTTACATGTGAAAGGGATTTTTATGTGATAAATCAAATACATGGAGATATTTGATGGAAAGAATATTTTATTTTATTTTACTTTTACAAAAAAAAAAAATTATAATTTAATTTAGAAATAAAATATAATTTAAAGGAAAACATGTTTATTCCTTAAAAAAATGACACCTGTAATTCAAAACTTTGATAGAGACAGTTTTTCCATGTAAAATGGGATAGCAAATTAAAAATTACAAATGTACTTTTACATAATTAAAGTGTTTGCATTATCATCAATGAGTGAAAACAATGAAATATGCGAAAGAAACTTGGATAATAAAATTTGTAAGATAGTAGAATATGAAAAAAAGAAGTCTTCCATGTCATCATTTATCAGTGGATGGCGATTTCAGGGGTCTTATATTTTTCATGTTTCCAGCAGAAATCAGAAAAGAAAAATCAACTCAGAAAAAAAGGCCATGCAATTCCACGAAACTTCTAACAACAAATTGACAATCATTTTCTTTTTTTCAACTCCTTGATTTGTTGCTGTAATGTATTGTATTATCCAATGAAATCTTCTTACAAAGCCAACCTCCATAACCACACACCATGTTCACTTCCCATAACTACCATTAAAACAGTCCAACTTTTTTCAGAAGAAACTCACACACTCTCTTTCTCTCTCTCAAATCTTCATTAATATCTTCGGTGAGTTAGAAACAAACCAAGACTTGTGGCCGTTGGGGGCACCATTAATGCACTATCCATTTTCTTCGCACCCATTTAATGTTTTGTTGCAAAAGCTTCATCTTTGTTCCGAATCCATCACCCCTTTTGGTCATGTAAAACACACCACAACATTATACAAACATACAACCTTAAACATGCCAAAGCCTTGTTTCATGCACTTTCCTGCGAGGGAATAAAAAAGCAGAGACATTTTTCCCGATTGAAACATTGATGGATCCGTTTCGTGGGTTGTGTCGGAGTTCAGAAGAGACGGCGGAACAGAATCGTGTGCAGGTAAACAAAAGTGAAAAAGTAAATAGAATTATGGGTTGTGTGTAAAATTTGCTGAATTGAACTAAACTGGTGCATGCATGATGCAGATGAAGTCGAGTTCAGTTTAACACTCGGCGCATGGATCAACGGGTACAGGTTAAGTAGCGGTCTCAAATTCAAGTCCTGGTATGCCACTGTGTTTCGACCCAGAAGGAGAACTTTTGCAGTGATAGTGGTTCTACTCGAGTGGAGCAGAATTTTTGCTGTAGAGGATATTTGTGAAATAAAGAAGTGAAGTTGAGTTTGTGAGAGTGAGTTTTAGGATTCA


Gene Sequence:
>Vu_01424(+)
ATGGGAATGGGGGAAATTGCAGTGAGTGTGGTTTCAATGTTGTTGTTGATGGTTGGGTTAACAATGGGAATGCGTTTGAGTTCGACAACGGAATGGAACGCGTTAAGGGAGCTTCGATCGTCGTTGGGGATTAGGGCAAAGTATTGGCCCATAAAAGCAGAACCGTGCGGGAACTGGACCGGAGTTCATTGCCGGAATGGTCGAGTTGTGGGTATAAACGTGTCCGGTTTGAGGAGAACCCGGTGGGGTCGCCTTAACCCAAGTTTTGAAGTGGGTTCTCTTGTGAATTTGACACTGTTGGAATCGTTTAATGCTTCTGGGTTCGTGCTTAATGGGTCTATTCCTGAGTGGTTGGGTGAGAGCATGAAGGTGTTGGATGTACTTGACCTTAGGCTTTGTTCTATTATGGGTTCGATTCCTAATTCAATTGGAGAGTTGAGTAGGTTGAAGGTTTTGGTGCTTTCAGGGAATTTTCTCACTGGTAAAATGCCTACAACGTTTGAGAATCTCACAAGACTGACTGTTCTTGATCTCTCTAATAACTCTCTTTCAGGGTATATGCCTGCTTCTGTGACTCAACTTGGGAATCTCACAAGGCTTGATCTTTCTAACAACTACTTGAGTGGGTCTGTTCCACTCAAACTGGGTGCCCTTTCTAGTTTGCAAAATTTGAACCTTTCTGGGAATTCTTTCACTGGGTCGGTTCCCTCTCAACTCGGTAACCTTTCTGAGTTGGTTGAGGTTGATCTTAGCAAAAATTTTCTGTCGGGTTCATTTTTTGGTGATTTATCTTTTTCACGGCTCTCGGCCCTCGAGGTTCTCATTCTCAGCGAGAATTTGTTTGATGGTGCTCTGCCTCATAATTTTAGCTCAACGCCCAGGTTGACCTTTCTTGATGTGTCTTGTAACAATCTCACTGGGACACTGCCGAATTTCACAAGTTGGAATGGTAGCTCTGCTGGTGTTGTGTTCAATCTGTCAAATAATATGTTCTATGGACTTCTGAACACTTCACTGTACGAGTTTAAAACTATTGATTTGTCAAGTAATTATTTGGAAGGTGAGGTGCAAGGTGGTGGTAATGTTATTCTAGACAGAAATTGCCTACAGATGACTCCAAACCAGAGGAATTTGGACGAGTGTAGAGCTTTTTATGCTGCAAGAAACTTACCCTTTTCATTCCCAGAATCTAAGTCCAGCAGAAGGGTGGTATTCATACTGGTAGGAATATTTGGTGGGCTTGGCTTTATTGCGGTGCTGACATTGGTCCTTGTGCTGGTTCTAAAACAATGTCACAATCATAGAAGCTCGGAAGTTCAAAGGGGGACCAAAGAAGAGGGACCTGTTCAGGAAGGGGAAAGCCCTATACCTCCTAAGGATGCTGATTTTGTGCCTGGCGTGGGAGAAGCATTTAGTTCTCAGCAAATTATTCGTCTAACTGACAATTTTGCTGAAGCAAATGTCATAAAGAATGGCCATTCCGGGGTCCTCTTCTTAGGAGTCTTGGAAGGTGGAGCAACTGTGGTTGTCAAAAGGATAGATTTGAATTTATTTAAGAGAGAATCATATGTCGTGGAATTGAGACTATTAAGTAAGGTTTCACATGCAAGATTGGTCCCAATCCTGGGCCACTGCTTGGACAATGAGAATGAGAAATGTATAGTTTACAAATACATGCCACATAGAGATTTGGCTACTTCTTTGCACAGAGCCAATGAGCCAGATGGTAAATTACAGTCCCTGGATTGGATCACGAGATTGAAAATTGCAATAGGAGCTGCTGAAGGCCTAGCCTACCTACATGAGTGCAGCCCTCCCCTTGTCCACAGGTAATACCAAATGCAGTATAGATTGTTACGGTTCTCTCAATATGATCACGCCACAAAAATTGAATTTGTCTGCAAAATTTGATTGAATTTATGTTGTCAAAATAAGACATGCTGGATTCTCATTTCTTTAGCATGATGCCTTTTCTATGTTAGAATGATTGCTAGAAATGTCTTTTATCTCTATGTAGTTATATTTTACATTACAATCTTGTTGTATTAAATTGTTATCATTGTCACAGTTAACAATGTGTGAAGTTAGGAGGTGTGAAATAACTTTTGTAGTTCTGCAAATTACTAAAATTACACTCTTGATTTTTGAAGGGATGTCCAAGCTAGCAGTATACTTCTTGATGATAAATTTGAAGTGCGACTTGGAAGTTTGAGCCAGGTTACCGCCCAAGGAGATGTTCAACAGGGAGTCATCTCAAGGGTTTTCAACAAGCCACCGTAAGTTTTTGAATTAATAAAGCATAACTGTTTTGCAATGAATGAATGAAAATCAAAGAGATATTGTTAGAGCAGAAGTGAATCAATTCCTATGGATAAAAAAATCAAAGAGATGCTGTGATGATTTATAAACATACTGAAGCTTTTAATGGTTGCAACATAATGGCCAGACAAATGATTTGATCGTATCTATGATTAGTATATTTGTTGCTTTGTCTTAGACATTTGACCTATTTAATTTAATTTTGCATATGTTCCTAAGTCACTGAAAATTGATGTGTAAAAAGGATCGCATTCTATTGCTAAGAGTGTTTCTTGTAATCAAGGCACACAGCACAAGCAAGCTTACAGAGTTATCACTGCATGCTGATTTTGTTTATATTCTCTTGTTTATTTTTGTATCCAGAAAAGGTTGTAACAAACTGTTTATTTTCTTGTGATTTTGCAGATCTACTAGTGAAGGCGATCCTGGTGAGTAGAATTGGTTTAGCAATGTCTATTTAGTTTTTTATCAGATTGTTGATCCATTCATATTAAGCCAGAAACTTTGTCATTTTTTGAAATAACTGTAAAAAGTACATTATTTCAACAATTGACGGAACACAAACTGTTGAAAGATAATCACAAAATCACATTTTTAGATTCATAAAATCAGTTTTTATGATCAAAATAACTCCTTACAAATTTGAGCGATTGTTTCAAACATGTGGCTGGAATTGTAAACAACTTTTTATCATCAAAACAACTCAAATCTTGAAAAAAAAGACTTTTTTTTGTGTGTACAGAGTAACATATTGGCTTTAAGATTCATGGCCCTTTTGTTGTTTAAAACTGTAACAAGAGAAATCCTAAACATTTTTCCTTTCATGGTGTGCAAATGAACAGGTAAATCATCAGTGACATGCACCTACGACGTGTACTGTTTCGGGAAGATTTTACTGGAACTCATTACAGGTAACATTGAAGTGAGCAAGTCAGATGATGGCACTACAAAAGAGTGGTTAGAGAAAACCTTGCCTTACATCACTCTGTACGATAAAGAACGTGTGACTAAGATTATTGACCCACAATTGATAGTGGATGAGGACCTATTGGAAGAGGTATGGGCTATGGCAATTGTGGCTCATGCATGCTTGAATCCAAAGCCTTCCAAACGTCCTCCAATGAGACATGTCCTGAAAGCATTGGAGAATCCATTGAAGATTGTGAGAGAAGATAATAGCAGCTCAGCGAGGTTGAGATCAAACTCTTCTAGGAAATCTTGGAGCACTGCTTTCTTTGGTAGCTGGAGACACAGTTCATCAGACAGTGTTGTTGCCACAACACATGCAAACAAAGAGAGTAGCAGTGACACTAAAAAATCAAGAGTAGGCTCTCAAAGTAGTGGAAATGATCACTCATCTTCCAACAAAAGGTCATCCAATGAAATTTTCCCTGAACCATTGGAAGTGCAAGATGTGGAGGCTGGAGAGGCAGGATAA