Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00964 LG1 12798479 12804045 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase HT1 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   cytoplasm
Cellular Component   located in   nucleus, chloroplast, nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   protein kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, ATP binding, ATP binding, protein kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 12798600 3_prime_UTR_variant
G/A 12798652 missense_variant p.Arg449Cys
T/A 12798756 intron_variant
A/C 12798761 intron_variant
G/A 12798805 intron_variant
C/T 12798810 intron_variant
A/G 12799016 intron_variant
G/A 12799042 intron_variant
A/G 12799195 intron_variant
A/T 12799357 intron_variant
A/G 12799826 intron_variant
T/C 12800028 intron_variant
A/G 12800032 intron_variant
A/T 12800112 intron_variant
G/T 12800617 intron_variant
A/C 12800836 intron_variant
A/G 12800879 intron_variant
T/A 12800953 intron_variant
C/A 12800954 intron_variant
G/T 12801118 synonymous_variant p.Val303Val
C/G 12801190 missense_variant p.Leu279Phe
A/G 12801192 synonymous_variant p.Leu279Leu
T/C 12801195 missense_variant p.Ile278Val
G/A 12801205 splice_region_variant&intron_variant
G/T 12801216 intron_variant
A/G 12801224 intron_variant
A/T 12801454 intron_variant
G/A 12801551 intron_variant
G/A 12801649 synonymous_variant p.Ala233Ala
G/A 12801708 intron_variant
C/T 12801771 intron_variant
A/T 12801812 intron_variant
A/G 12802069 intron_variant
T/C 12802080 intron_variant
G/C 12802173 intron_variant
A/G 12802272 intron_variant
G/A,* 12802643 intron_variant
C/T 12802658 intron_variant
G/A 12802677 intron_variant
C/T 12802907 intron_variant
T/C 12802958 intron_variant
T/A 12803061 intron_variant
A/G 12803623 upstream_gene_variant
G/A 12803628 upstream_gene_variant
G/C 12803887 synonymous_variant p.Gly24Gly
G/A 12803908 synonymous_variant p.Ser17Ser
C/G,T 12804000 5_prime_UTR_variant
T/C 12804017 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00964.1
METKKLQLRFSLGRQSSLAPERGGAGDLSEALDPTVRLMYLANEGDLDGIEELLDAGSDVNFTDIDGRTALHVAACQGRTDVVDLLLRRGAEVDPRDRWGSTPLADAMYYKNHDIVKLLEKHGAKPPITPMHVENAREVPEYEIDPSELDFTNSVCITKGTFRIALWRGTQVAVKTLGEEVFADDDKVKAFHDELTLLEKIRHPNVVQFLGAVTQSTPMIIVTEFLPQGDLRAYMKRKCALKPVTAVKFALDIARGMNYLHEHKPEAIIHRDLEPSNILRDDSGHLKVADFGVSKLLKVAKTVKEDKPVTSLDTSWRYVAPEVYRNEEYDTKVDVFSFALILQEMIEGCPPFYEKPENEVPKAYVENERPPFRALPKLYAYGLKALIEECWDEKPQRRPTFRQVIRRLEDINGHLVQKRRWKTGGSGCIQHLEALFRGNRTSPSSRSSRSTAR*


CDS Sequence:
>Vu_00964.1
ATGGAAACCAAGAAGCTTCAGCTTCGCTTCTCGCTCGGCCGGCAATCCTCCCTAGCGCCGGAGCGCGGCGGCGCGGGCGACCTGTCGGAGGCGCTGGATCCGACGGTTCGGTTGATGTATCTGGCCAACGAAGGAGACTTGGACGGGATCGAGGAACTTCTGGACGCGGGGAGCGACGTCAATTTCACCGACATTGACGGCCGCACCGCGCTCCACGTCGCCGCCTGCCAGGGACGCACCGACGTTGTTGACTTGCTGCTCCGACGAGGCGCTGAAGTTGATCCGCGAGACCGCTGGGGCAGCACCCCTCTAGCTGATGCAATGTACTACAAAAACCACGACATCGTGAAGCTTTTGGAGAAACACGGTGCAAAACCTCCAATAACTCCCATGCATGTGGAGAATGCTCGAGAAGTCCCAGAGTATGAGATTGATCCTTCTGAACTCGATTTTACTAATAGTGTTTGCATAACAAAGGGAACTTTCCGGATTGCATTATGGCGTGGAACTCAGGTTGCTGTCAAGACACTTGGGGAGGAAGTGTTCGCTGATGATGATAAAGTAAAAGCATTTCATGATGAGCTTACATTGCTTGAGAAAATAAGGCATCCAAATGTAGTTCAGTTTTTGGGTGCTGTAACCCAAAGCACCCCAATGATTATCGTCACAGAATTTCTACCCCAGGGGGATCTTCGTGCCTACATGAAGCGGAAATGTGCATTAAAACCAGTAACAGCTGTAAAATTTGCACTTGATATTGCTAGGGGTATGAACTATTTGCACGAACATAAACCTGAAGCCATTATACACCGAGATCTTGAGCCTTCAAATATTTTGCGGGATGATTCTGGGCATCTGAAAGTTGCAGACTTTGGAGTTAGCAAGTTGCTTAAAGTCGCTAAAACAGTCAAGGAAGACAAACCCGTGACAAGCCTGGATACATCATGGCGATACGTTGCACCAGAAGTCTATAGAAATGAGGAATACGACACAAAAGTGGATGTGTTTTCTTTTGCTCTGATATTACAGGAGATGATTGAAGGTTGTCCACCGTTCTATGAAAAACCAGAAAACGAAGTTCCTAAAGCGTATGTTGAAAATGAGCGCCCACCATTTAGAGCGTTGCCAAAGCTTTATGCTTATGGACTAAAAGCGTTAATTGAGGAATGCTGGGATGAAAAACCACAGAGAAGGCCAACATTTAGGCAAGTAATTAGGAGATTGGAAGACATCAACGGCCATCTTGTACAAAAGAGGCGCTGGAAGACTGGAGGTTCTGGATGCATCCAGCACCTGGAGGCCCTATTTAGGGGTAATCGCACAAGTCCAAGTAGCCGATCATCTCGCTCCACGGCCAGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_00964::LG1:12804045-12806045(-)
AAATGTATTATTTGAAAAATAATTATTGACAAAGTATATATTTTAAGTAATAAAAAATATGTAAGCAAGAAAAAATATTAACAAAATTAATATTCATAAATTTTGAAGTAATTTGTTTTTTTATCACTCAATTTGTTGCATGCGACATTAATGATCTTGTAGTATAAATTAAGTGGATTGAGTTATAATTGAAGTATGTTATTTGGAATTGTACACTCTTAAGTAAAAATAAAAACAATTATGCCCTAAATTTTTGATCCAATAATTTTTCAGAGAAAAAAAACATAAAATATTAAATATTAATGAAAAATGCTTGCATAATTTGAATAATTAATTTGTAAATAATAAATATAATAATTAAAATATTTATAAATGTAATACTCATTTTTGTATATAATTATTAAAATATAAACAACACTATTATCTACTTTTTCTAATGTACATTGTTATTATTATTTTAATAATTATGCATGTAACTATATATAATTTTTGAAATTAGGTAGATAAAAGAATAGAAAACTGACATGAAATATATTTGTTTTTATATTTTACATTTATTAAGAAAGGAGGAAAGGAAAAAGGATGATGGTAACAAGAGCAACTATAAGAGTAATTATTGCATCAACATCTCATTTTAAATTAATTTTAATTTCATCAATTCTTAATTTATATTACATTTAATCACAATAACAAACATGTAATCTTTTAATTTTATTTTTTATAACCTTTTTATCTATTACATCAAACAAAATTTTTACAAATTTTTCTTTTAAATTTATTTATTTTCATTTCAATCCTTAAAATAGACAATACCATAATTCATTTTAACGAAAGTTTGTCAAAGAATTTATACTATATTTGTTTTAGGGCCCGATTTGTACAAATTTACTGTTAAAAAAGAAAGTGACAAAAAAAACAAAAATTTCACAAATATATATTTTTTTAACTTTCTCTTCATATAGAAGAGATTTGCAACCAAAGTAAAAAAATTTCACTTTTAAATAAAGTTAATTTTGAATACAAATAATAATAATAAACCTAAATAATACTAATTTTTCATTTTTTTAATTAATTATTTTAATCCATCAACTCAATCATATTATTAATTTGATTTTTTCCATAAATTTTTACATCAAATTCTTTCATTTTTTATTAATCCAAATAACTTCATTTTCATATTATTTTTCCCTCAAATCCATTATCTTGAATCTATCTTCAAATTCAAACAACTTTAATATCATTTTTCTTTATTCAAGTGCATTAATATTTAAATGCTGAAGTGAACATATCCATGGTCTATGTTAAAAGTAGATTTAAAATTTTGTAAGGTGAGCTCATAAACTTTATTACTAATTTGGTACTCTATCCCATTGATTGTGAAAGCAGGTTTGAAACAAAAGGTACTAAAGGAACTGCGTTATCGATAATAAATACTCAAAATAATTGCTGTCGTAACTGCATATAAAAAATCTCACAGTTATCTAAACTCGTATTTTCATGAATTCATTAACCATGAATCAGTCAGAAGCTTACTTTATGAAGGTCCAGATCCAGCAAGTCTTTAATGTTATAAATAAATTTAATTAGAAAGTCAACTTCAAAATTAAAAATATCTTCTTAGAAAGTCAACTTTACCACGCAAGCTGTTATGGATTACCTCAGAAATAGCGGTTCAAAGCAATCCTAAAAGATACGGTCAATGACTACTTTTTTAAAATATTAAAATCCAGGCTTACTTTCTCACTAATTATTACCTAAAATTATCTATGAATTAGTTACTATATATTTTTATTATTTTCTTTTTAAGGATAAACCTTGTGGAGATTATCACAGAAACCGACGCTGTTTATTCCCACGGTCGCTTGCTGGAGTGTGTAGAAATGCAGTGACGTCAAGATTTGAATTACGAAGAATCCGATCCAATAGCAATCCTCTCTTCAAAAATATCAAAACCCGAATCAATCATATTTATTCACATTTCCTTTATCATTCATATTCTC


Gene Sequence:
>Vu_00964(-)
ATTCTTATTCTTCTCGACTTTGAATCCAACACATTCACACAGCACGATTACATTTTCTCTCTCTCTCCCAAAACCCTCGCCGCCGCAATGGAAACCAAGAAGCTTCAGCTTCGCTTCTCGCTCGGCCGGCAATCCTCCCTAGCGCCGGAGCGCGGCGGCGCGGGCGACCTGTCGGAGGCGCTGGATCCGACGGTTCGGTTGATGTATCTGGCCAACGAAGGAGACTTGGACGGGATCGAGGAACTTCTGGACGCGGGGAGCGACGTCAATTTCACCGACATTGACGGCCGCACCGCGCTCCACGTCGCCGCCTGCCAGGGACGCACCGACGTTGTTGACTTGCTGCTCCGACGAGGCGCTGAAGTTGATCCGCGAGACCGCTGGGGCAGCACCGTAATTTCACTTCCCTCCTCTTTTCGTTATTCTTACACTAGCTGTCACTGATTTTTGGATTGGATTGTTTAACAGCCTCTAGCTGATGCAATGTACTACAAAAACCACGACATCGTGAAGCTTTTGGAGAAACACGGTGCAAAACCTCCAGTTAGTCTCTTGTTTTCCTTTCCTTCTTGATATTAGATGAAAAATCGTTTGTTATTCGTCTTGAGAGTTTTAGTTGACACGTACTTTTACTGGAAATATTATCTTCGGATAGACTTTTAAGATTTTATTGTAAAAGTGAAACATAGTTAACATGCATAGCCGGGTTGGTGATTGGATAACAATGTAAGAGTTTAAACTGCCTCAGCATGGATTTGGACACTTCCATGTGACATTCCTGTTCTGTGAAATCCGAATCTTTAATTAAAAAAACAAGAGCATATTGAGAGAATTTAAATTGTGAAATGTGGATATCGGGTTTTGACAGTGGAGATTTTCGTCGGAGAGAATATCAGTGAAAATCCCACTCTCTGAGGATTCATTCCTCGTCTGATTATATTTAATTCAGCTCCAAGGGTCTTGCAGTCAAGCTTTTTCAAGAGAAATCAGTTTATGCACTGGCATTGTATAACCTCCTAAATATTATTTGGTTGGCTTCTACTATAAATAAATACTTTAAAGGTTTATATTGATTTCTTATTGCTTGACAGCGTAAGTTTTACTATGCTGATAGTACACAGATGCTAAACTCCTTTCAGAATAGTTGGTTTATGACATTACATTGCAATTACAAACTTCTTTTTGTTTGTAGATAACTCCCATGCATGTGGAGAATGCTCGAGAAGTCCCAGAGTATGAGATTGATCCTTCTGAACTCGATTTTACTAATAGTGTTTGCATAACAAAGGTGAGGTTTCAAATTTCCTTCTCTCTATAGTTAATAGTGTTTTGTAACCGGATTTATCCTTCTGCCTTTTGATGTAATTTCGTAAGTCAATATACCTTGGCTGATTTTATGTTTCATAATTTATATTGAATATTTCAGGGAACTTTCCGGATTGCATTATGGCGTGGAACTCAGGTTGCTGTCAAGACACTTGGGGAGGAAGTGTTCGCTGATGATGATAAAGTGTGGGTTTGTCTACTCATTCACGTCAGTTGATTATTCAGTTATCACTTTTTAATCTCAGTTGTTTTTTATTTGTTGGTGTATGTTTATCAGAAAAGCATTTCATGATGAGCTTACATTGCTTGAGAAAATAAGGCATCCAAATGTAGTTCAGTTTTTGGGTGCTGTAACCCAAAGCACCCCAATGATTATCGTCACAGAATTTCTACCCCAGGTTAGTTTTTGAAAAATTAATTTACTAGTTGACTACTGGTTATCTTATATATCGGTGAGCTGAATACGATGTGGTTAGAAATTTGTCATTTTAAAGTGACAACGTAGTTTCAATGGGGCTAGTCAAAATTCAATATTGTGTAGGAGTGCACAAATCATCAATAATAATTGAGAACTCAATGTAATAAACATTTACTCTGGGACTGATTAATTGTTGATGCATGGGTTGTTTGCAGTGGCCAAACAGGATTTGTCCCTCTAAAGTAAGGAGATGTGTAAAATGTAAAAGTTATGCATTTTCTACCATATATTAAAAGTCAATGTAATTCAAGTTGATGATGGATAGATTCTCACTTTTTTACTTATCTTCTCACTATAGAGAACTAAATCCAGACTGACAAATATGTTCCTGTTGTATCTAGAAGTAATAAATATCTATGCTGAAATAATTTAATGAAATGATAAAGGGTACCTGTTTTAACCCAGCATTGCTGTTGGTTTGGATTTTCGTTTCTCTTTATTTGAGGATTCCACTTCAGTTTAGTGAAACAGTGAAAAATACGAAGTGTATATATCTTCTCCCATACTTATGTGCGTGCTGACCTGTATTTTTACAAATGTAACATCTAACAATTTGGAATGAACTATCTTCTATTCAGGGGGATCTTCGTGCCTACATGAAGCGGAAATGTGCATTAAAACCAGTAACAGCTGTAAAATTTGCACTTGATATTGCTAGGTTAGTTAAGAGCTTTCTTATCATGCATGCATCACTTGCTTTCAATTGGTTCTCAAGGAAACAAGCTCTCTTGATTATTTTATTTTTGAAGAGTTGAATATTGCAAAATTTTCTCCTATATTAACAATTTGCATTTAAATAATACGTCTGTATTTTCAGGGGTATGAACTATTTGCACGAACATAAACCTGAAGCCATTATACACCGAGATCTTGAGCCTTCGTATGTTTTACACACTCCTACCCTGTCTAGTTGATTTTATCATTCTTCCTCCACGTGTGTGAAGTGTCATGGATTTTTCAGTTGAAACATGCATTTTTCATTCATTCTTTGAATGGTTGAAACTGTTTAAAGTTTCTTCATTGTACTTGAGTAAGACAACAGAAATATTTTGCGGGATGATTCTGGGCATCTGAAAGTTGCAGACTTTGGAGTTAGCAAGTTGCTTAAAGTCGCTAAAACAGTCAAGGAAGACAAACCCGTGACAAGCCTGGATACATCATGTAGGTTTTGTTCTACAGCACAGAGCCTTGTAATATTTATCGTTAATCATGTTCTGCATAAAAGCAATATTGCAAACTTATATTTCATAAAGGTTGTAATGTGCAATACGTTGCATACGCTATAAGGAAAAATAAAAAAGAAATGCTGTCTACTAAGTGACTAATAAAGACCTGGGGCTCAATTTTACTAATTTGAATTTATTAATTAATTTTTTAAGTATTGCCATCTTTTTATATTTATAAGTCAATTCGTTTTTATCCTATTCTGAGTGGTTCTGTAACAGGGCGATACGTTGCACCAGAAGTCTATAGAAATGAGGAATACGACACAAAAGTGGATGTGTTTTCTTTTGCTCTGATATTACAGGAGGTAAAATCATTACTGCTTACCTTTGGATGCAGTTTTTTTTTACTTTTTTCATATTTTAGAGATTTTTATTGACTTTTAAGTTAATTATTTACCCTTATTATGCGAATGGTTGTCTCCTCTCTTGTCTTGAAACAAGACTTTTAAACCCTGAAATTGCAAATTAATCAATACATATAAAACCTGTTTGATGAATTAATGCTTGATGAATAATGTTGTGGTAATTGACCAAATAATACATGTTAATTCAATACTCTCTGTCCTTGGTGGTGATTCCTTTTCATATCAGCACATATAACTTTTAGAACGCTGATAATTGATTTTGCTTTCTGAAAGCAGGAAGTCAGAACAGGAATTTATTGTATGTTTTCGATTGCTTTTTATGTTGTTTTATTTTTTGAGCATTTAAAAGCATTTATTGTTACGGAATCCTCTACATATCGTCATATCCTTTACGTATATAATTCTGTTATTTCCTTTAGTAAAAAAAAAGTCAAGTCCTAGAAAATAATGCTTTTAGAGGTGTATCATTTTGCTGTTGTGCATCCTTTGTTGCTTTCATCATTCAAATTCCTTCAGTGTTATTACAGCATATTGAATTTTAAAATAGTTGGTGGTATATTTTACGCATAAGACCTCTTCCGCTTATCAAGTATACTATAGGATTTTTTTATCAATGTATACTATGGGGTGAGTCTATGGACAGGTCAAGCACTCGTGACTCTTGAGCTCTGCCTACTTGGCACTCATATCTTCCTCGAGATATGTATATAATACATAACCGTTATATGCAAAATTGCATATTTTAAGGTTGATCTAACGGACAAGTTCTAGGGATTTGAGCTATCCACAATTGACAGGTCGAAATATAAAAATTTATGTATATGTTTTATATATTCATGATCATCTTGGTACGATGCCATGCCTAATAGTTTGCTGTGGTACCAATATGCTTGGTTCTTGTACTTTTTATGTGAATGCTAAATGTTCATTTTCTCCAACTGTTTTGCTGATAAACTTAGTTATTTTATTTGTGGATCATGGGCTATTTGTAATCTAGAATATTAATGACAACGAACAGTGGATTGTTTTGTAGAGATGCCCAGCAAAATACTGACGGAACTTGTATGGTTTTCTGTTCCTGTAGATGATTGAAGGTTGTCCACCGTTCTATGAAAAACCAGAAAACGAAGTTCCTAAAGCGTATGTTGAAAATGAGCGCCCACCATTTAGAGCGTTGCCAAAGCTTTATGCTTATGGACTAAAAGCGTGAGGATTTTAAATAAATTTTATTGGCAGTAGATTTGAAAGTTTTGTAGGAGGATAGAAGAATAAGTTTTTTACATTCAGGAAATCTGATTTGTCCATAGGTTAATTGAGGAATGCTGGGATGAAAAACCACAGAGAAGGCCAACATTTAGGCAAGTAATTAGGAGATTGGAAGACATCAACGGCCATCTTGTACAAAAGAGGCGCTGGAAGGTACCCCTTTTTTGTGCATACATTTATTTGATCAACTTTAGACCTAGTTGTGATAGTGTAATTTTGACATAATAGTAATTTGTGACACCAAACTAGATTACGAATTTTAAAGTAAATTTAGATGGTTTTTCTTTTTTAATTTTTGTTGATTGAAAAAGAGTAGTGCAAGAGCTTTATAGCTCTATGCCACGTCCATCTTCATTCATGAGTTAATTTCACAATAATTCAAAAGATGACTAATAGTATTCGGCTGCTCCTTTCCTTTTTCCATCCTAAGGGATATCCATTCTGGAGAATTTATTTTTGGTCCATAATCTTTGGAGTTGGTTTCCATCGTATGATTCCAATAGTCCACGGTCTCTGACTATTTTTTACCCATCTCACTAGTGGAATACCCTCATCAAAAGTGAGGATATTGTTCGATATCGTTATTTAACACGATAACTCTGTCATTCTTTATTTTCAGAGGTTTGATATATTTCTTTTTGTTCTGATACACAGACTGGAGGTTCTGGATGCATCCAGCACCTGGAGGCCCTATTTAGGGGTAATCGCACAAGTCCAAGTAGCCGATCATCTCGCTCCACGGCCAGATAAATATTTCCTATCGAGAACCAACAATTATTTTGATCAGTTTCAAGAAAAAAAAAGTTGATTGTATTGTCTTATACTTGCATTGCATGTCATATATAACCTTCTGTAAATAACTTGCGCTCGACGTTCGGTTGAATAAAAATGAAGAATGTGACATAT