Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00944 LG1 12633979 12637318 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At2g42960
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 12635723 downstream_gene_variant
T/A 12636061 stop_gained p.Leu327*
A/G 12636380 synonymous_variant p.Gln396Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00944.1
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CDS Sequence:
>Vu_00944.1
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Promoter Sequence:
>Vu_00944::LG1:12631979-12633979(+)
GTATAGAAAATCTGTTGACTGTGAATTTGGACTTCATGAAGTAAGATCATGCAAATGTGGATACAAAATAATACTTTAACAACAGTTTGAACCGATAGTAATTTAAAACTCGTAATAACACACAATACAAAATGGTAATTATTATTTTGAAAAGGTGTGGAAAAGTGCAAAGGTTTTGTCTGGATTATCTTTAATAATAAAAAAAATATGCTTGGAATCAAAGTATCCATTTCTTTCTCCATTGGTGGCTTTTTTCAACCCTCAAAACCCATAATCTTACTAAGAAAGAAAATGCTTAATATTTTAGTGGAGCTTGTGATTTTCTCTCATTGAAAAAATCACTTCTCTCATATTCACCCAAATTTTAGATGGGTGGTAAGGAATTCACCTTTTCATCATAATGCTTTATGATATGAGAGAATTATAAAAAAGAAAAATATTTATTAAAAATTCTAGGGATATGTCCAAAAACCAAAACCCAAAGCAAATTGAATTAGCATGAGAAGGGGAAGCATGGTAGAATGGTGCCAAGCCAAGTTTCAAAATTTGCGTAAGATTTTTCCTTTTCACACAAATAGGACAGTTTGGTGAGCAGACATGACATCAGAGGAAGCCTAGATTTGGTGCTTAGCTTAGCTCCCTCTGTTATGTTGGATTGAGGTTGTTGGTCCTTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCACTCTCCCTCTTCACTTTACTTTACCTTTCTTCCTTACTCATTACAGTTTTTATTTTCTTATTTTCTTTCTAAGCTAAAATCTTTTTTTTCTTTACTTTTTATAAAAGTAATTTTATTTTTTAAAATGTTTAAATTTAACAGAAATCTAACAAAGGAATAATGTAATTAAATATTTTTAAAAATTAAAAAACTAAATAGAATTTTTATAGAATTAGAGGAAAAAGAGATTTTAACCTTCTTTCTACCAGCCATCCATAAACAGTGTATCATACACATACCTATTCATTTCACATTTGCTTTCCCTTTACTGTTCTCTCTCCCCCTCTGCTTTCCTTCATTGCAAACCAAGCTTCCTTTCCAGCTTGTTCTGGTCCTGCCCTCAGACACAACACCCACCAACCATTTCACTGCATTTACTCTTTCTCCTCTCCAAAATTAGTAGTGACAGTTGCCCACTCTCTCAAACTCTGTATTTTTCCTATCAAAATAAGATTTTTGTCTGCCATTCCCTTCCGGTTTCTCTTCTTAATATCTTACCGCTGAGTCCTTTTTTTTTTTTTGAAATATGGCCCCACTTTTTACCTATTAGTGTGCCACTTCATCTTTTGCTGCATCTGGATTCTGCTGTAGGGTATGTGTGTTGCTCAGCCTCAGGCATTTTTTGCACATTGAGTCTCTTGTCGGTTCAAAATGAGGTGTGAAACCTGTTGCTTCTTTGGGTAGAAGATTCAGGAGTTTAGCTACCTTGGATCACTACAAAGGTAAATGCTTTGTCTTTGTTAACCACTTTTTGGATAATATACATTTCACTTTCTCTTTTGTTTGCTTGGATCATAAGTGATTCTTTCCTGGTTTCCTTTTCTTTTCATTAGAAATTGTGTTCATAATCAACATTCAACCGGTTATTTTGCTTTCCAAATGAACTATGAAATTACTCAATATGTCCTTCTAATATTGGTTTTGAAACTGCTGAATTATGTATGATTCTGTTTATTTTGTATGCCATTGCTAATGAAGCCTGAGATAGTTTACGGGAAACTTTGTAGTTCGAGATTATCTTAAATCGTGATAAACATTGCATTAGTGATTTGTTGAAACTCTGGCTTTTTGTTCATGGCACTGTTTAAGACCTGAAATGTTGGTTGTAAATTGGAATGTTCAGATGTGTGTTTCAAAGCCTCGAGTAAGGGGAATGGAGTACTTAACTTGAATCCTGTACTTGGGTGGGAATGTCTTGGTTCTACCAGCTGAAGAATTTGTGGGGACGCTATTGATTGACTTGGTGCAACCAATTA


Gene Sequence:
>Vu_00944(+)
ATGTCATCCAACAGTTCTTTGAAAGGGGAATTGACAAAGAAGACTCCATTTTTGGGGTTGAGACGATGGGTTTTGATTGGAGTAGGTGTTGGTGCATTTATAGTGCTTATTCTTTGTATATTGTCAATATGGGTGATGTTTCGGAGAAAGTCTAAGAGATCTTTGGACAAGTATTCTGTATCCCAAATACCAAATGTCTCAAAAGATATCGACGTTGACAAGGTTGGAGTGCAGAGTTCTCATGTCCAACCAGAAAATGTGCTTATGCCTGTTCATAACATGACAAGTGATAAAAATTCAGATAATATATCAGTTCATTTGGGTAACAGCAAATCTGGGGATCCTGATAATATCAGTCAGTGCAGCTCAATTTATCATCATGAGAGAGGATTTAGTTCAATGTCAGCTGAAGAAGGAAGCTCTGGGAATGTTAAGAAACAATCCACATTGTCACATGGAGGGTTGGCTACTGCCTCTCCATTAGTTGGCTTGCCTGAATTTTCTCATCTTGGGTGGGGCCACTGGTTTACACTCAGAGATCTGGAAATGGCAACCAAACGATTCTCAGCTGAGAACATTATTGGTGAGGGTGGATATGGGGTTGTTTACAAGGGAATACTGATTAATGGAATTGAGGTGGCAGTGAAGAAACTTCTTAACAACTTGTAAGGATATTTATTGATCATTGATGTACTCTTTAATTTTTCCTGACACTTCATGTACTTGTGTAATTATTTCTACATTGAATTCATAGGGGACAGGCTGAGAAAGAATTCAGAGTTGAAGTGGAGGCTATAGGACATGTTAGACATAAGCATCTCGTACGCCTTCTCGGATATTGTGTAGAGGGAGTTCATAGGTAATTTTTTTCTTGGATTTGTGACAGTTATGTTCTCCTTGGTTCAAAATTTGAACCGAAGCTTTTCTCAATGTTATGTCTCTTTGTGTTATAATGAATGTACTTCCCAAATGAAATTCAGGCTGCTTGTGTATGAATATGTGAACAATGGTAACTTAGAACAGTGGTTACATGGAGACATGCACCAACATGGGACACTTACTTGGGAGGCCCGCTTGAAAGTTATACTTGGCACAGCCAAAGCGTAAGTTCAGTGTGCAATTTGTACAGTCTTTGCGAACTCATCTGAGTGATTATCATAAGTCTCTCATCTGTGAGATTTGATTGTAAAATGCTGTGTGTGTACCTTTAATTAATGCTATTACTATTTGTATTTTGAGAATGTCAAAATATATTTAATGGTCTGTTTATCTGTTTCTTGATAGTATTATGCTATTGACTTTATATTTTCATATAGTTTGCAGCATGTTGAAATATCTAAGCCCATTAGGTTTTTAGATTAAACAACAATAAGAGCTCGCTGCCCATGGGACCACTGAGTAAACTCTCTAATCTTTGGCTATATTTGGATATCTATTGATATTTGGAACAGAGTGAGATGAAATAGAATGAAATACCATTGCATTGTTAGAATCTTTTCTGAGGAAATGATATTGAATTAGAAAAACTGGTTTCACACTCCCATATTGGGGGAGGAGATAAGGAGAAGTTTTGGATGGAATGGATTTCATTCCTTCAATCAGTTCAAACATAGTCTTAGTTATTATCTGACCTACTTTAGTTTTAACATTTTACTTAGTTACAGATTTATGTTTGTGGAAGTTTCAACAGTGGACCTTGTCATGCTGATGAACCCCTCTATTATACTGTTACTGGTGGCAGGCTTGCTTATTTACATGAAGCAATAGAACCAAAGGTTATTCATCGGGACATAAAGTCTAGCAACATATTGATTGATGATGAATTCAATGCAAAGGTTTCTGATTTTGGCTTGGCCAAACTTTTGGATTCGGGAGAAAGTTACATAACCACAAGAGTAATGGGAACGTTTGGGTATATACAGAAAATTTCATTATCCCTTATTTAACACTTAAGGATCCATACTACTGGAAACTCACTTCTGTTGTGGATTACAGTTATGTGGCCCCAGAATACGCGAACAGTGGTTTGTTAAATGAGAAGAGTGACATTTACAGCTTTGGTGTCCTCTTGCTGGAAGCAGTTACTGGAAGGGACCCTGTAGACTATGCTCGTCCTGCCAATGAGGTTCCTAATCCTTATGAACTCTGCTAGCTTGCTAGTTCTAACCATGCTTTCTACTGGAAGGTGATGATCCTTAATAGTGATTAGATATTGTTCATCCTCATTATGGCAGGTTAATCTAGTTGAATGGCTCAAAATGATGGTAGGAACAAGAAGGGCTGAAGAAGTAGTGGACTCAAACCTTGAAGTTAAACCACCTTTGCGTGCTTTGAAGCGCACTCTTCTGGTTGCACTTAGATGTATTGATCCTGATGCTGACAAGAGGCCCAAAATGAGTCAAGTTGTGAGAATGCTCGAAGCTGATGAATATCCATACCGAGAGGTTCCCTTCTATACTCTGTCATTTCATACAAGTTCTGTTGTTTAATTGATGCTGAGTTTGAGTCTCATTGTTTTTTTATCACATTTTGCAACCTTTTAACCTTGTGGGCATCCTTAACATTATTTCCTTCAAGCATGTGTTGGCTATTCTTCCATCAACTAAAAGAAATACAATATTGAATGAAAACTCTTGGGGGAAATTAGGGGTAAAATATGTTTTTGGTCACTTTTTTGACAAATTTTGGTTTTGGCCCTTGTAAAAAATTTATTTATGATTCCTGTAAATTTAATTTTTTTCAGAAGGTCTACATTATCTTGTATTTGTGATGGGCATAAGCATCATGTTAATGATCATTCTAGGTTGACATGTAATATGACATTTAGATGCACGTTTCATCATCAATAACTGCTGATAAGGACAACTTTCAAAGTTTTTAAAAATTTACAAGTAATAAATCTGATATTTTTTCTCTGGAGGACTATATCAAAGTTTGTCAATTTCGCAAGGACTAAAAACACATAAAACCCAAATTTTTTTTGGTATTCTTCAGCCTACATACTTCCTCAAGTTTTACTTCATTAGCTAAAAGACAACAAAAGAAAGCATGATTTATGCCATAAATTGGGAAGATACCATTCTACATACATGGAATTGTGATGCATTGTAGTATATAAAGAGCCAGGTCCTCATTTTAAAGCAAGTTTTTTGGTGCTTATATCTGGAATATTAAGTATATATGTTGAAAAAACATCAAAATGTAAGATTGATATAATCACTTTCAGGATAGAAGAAACAGAAAGAGTGGCACTGTCAACATGGAAATTGAAACTGTGAAGGATATTTCGGGTCCATCTGATGCTGAAAGGATGGGGCATACTGAAACAACTCAAGGATAG