Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00925 LG1 12497411 12500750 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At2g42960
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein autophosphorylation, protein autophosphorylation, protein autophosphorylation
Cellular Component   located in   plasma membrane, plasmodesma, cytosol
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 12497618 missense_variant p.Ile70Val
T/A 12497619 missense_variant p.Ile70Asn
G/T 12499228 downstream_gene_variant
A/G 12499341 downstream_gene_variant
G/A 12499392 downstream_gene_variant
A/C 12500504 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00925.1
MSSNSSLKGELTKKTPFLGLRRWVLIGVGVGAFIVLILCILSIWVMFRRKSKRSLDKYSVSQIPNVSKDIDVDKVGVQSSHVQPENVLMPVHNMTSDKNSDNISVHLGNSKSGDPDNISQCSSIYHHERGFSSMSAEEGSSGNVKKQSTLSHGGLATASPLVGLPEFSHLGWGHWFTLRDLEMATKRFSAENIIGEGGYGVVYKGILINGIEVAVKKLLNNLGQAEKEFRVEVEAIGHVRHKHLVRLLGYCVEGVHRLLVYEYVNNGNLEQWLHGDMHQHGTLTWEARLKVILGTAKAYVAPEYANSGLLNEKSDIYSFGVLLLEAVTGRDPVDYARPANEVNLVEWLKMMVGTRRAEEVVDSNLEVKPPLCALKRTLLVALRCIDPDADKRPKMSQVVRMLEADEYPYREDRRNRKSGTVNMEIETVKDISGPSDAERMGHTETTQG*


CDS Sequence:
>Vu_00925.1
ATGTCATCCAACAGTTCTTTGAAAGGGGAATTGACAAAGAAGACTCCATTTTTGGGGTTGAGACGATGGGTTTTGATTGGAGTAGGTGTTGGTGCATTTATAGTGCTTATTCTTTGTATATTGTCAATATGGGTGATGTTTCGGAGAAAGTCTAAGAGATCTTTGGACAAGTATTCTGTATCCCAAATACCAAATGTCTCAAAAGATATCGACGTTGACAAGGTTGGGGTGCAGAGTTCTCATGTCCAACCAGAAAATGTGCTTATGCCTGTTCATAACATGACAAGTGATAAAAATTCAGATAATATATCAGTTCATTTGGGTAACAGCAAATCTGGGGATCCTGATAATATCAGTCAGTGCAGCTCAATTTATCATCATGAGAGAGGATTTAGTTCAATGTCAGCTGAAGAAGGAAGCTCTGGGAATGTTAAGAAACAATCCACATTGTCACATGGAGGGTTGGCTACTGCCTCTCCATTAGTTGGCTTGCCTGAATTTTCTCATCTTGGGTGGGGCCACTGGTTTACACTCAGAGATCTGGAAATGGCAACCAAACGATTCTCAGCTGAGAACATTATTGGTGAGGGTGGATATGGGGTTGTTTACAAGGGAATACTGATTAATGGAATTGAGGTGGCAGTGAAGAAACTTCTTAACAACTTGGGACAGGCTGAGAAAGAATTCAGAGTTGAAGTGGAGGCTATAGGACATGTTAGACATAAGCATCTCGTACGCCTTCTCGGATATTGTGTAGAGGGAGTTCATAGGCTGCTTGTGTATGAATATGTGAACAATGGTAACTTAGAACAGTGGTTACATGGAGACATGCACCAACATGGGACACTTACTTGGGAGGCCCGCTTGAAAGTTATACTTGGCACAGCCAAAGCTTATGTGGCCCCAGAATACGCGAACAGTGGTTTGTTAAACGAGAAGAGTGACATTTACAGCTTTGGTGTCCTCTTGCTGGAAGCAGTTACTGGAAGGGACCCTGTAGACTATGCTCGTCCTGCCAATGAGGTTAATCTAGTTGAATGGCTCAAAATGATGGTAGGAACAAGAAGGGCTGAAGAAGTAGTGGACTCAAACCTTGAAGTTAAACCACCTTTGTGTGCTTTGAAGCGCACTCTTCTGGTTGCACTTAGATGTATTGATCCTGATGCTGACAAGAGGCCCAAAATGAGTCAAGTTGTGAGAATGCTCGAAGCTGATGAATATCCATACCGAGAGGATAGAAGAAACAGAAAGAGTGGCACTGTCAACATGGAAATTGAAACTGTGAAGGATATTTCGGGTCCATCTGATGCTGAAAGGATGGGGCATACTGAAACAACTCAAGGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_00925::LG1:12495411-12497411(+)
GTATAGAAAATCTGTTGACTGTGAATTTGGACTTCATGAAGTAAGATCATGCAAATGTGGATACAAAATAATACTTTAACAACAGTTTGAACCGATAGTAATTTAAAACTCGTAATAACACACAATACAAAATGGTAATTATTATTTTGAAAAGGTGTGGAAAAGTGCAAAGGTTTTGTCTGGATTATCTTTAATAATAAAAAAAATATGCTTGGAATCAAAGTATCCATTTCTTTCTCCATTGGTGGCTTTTTTCAACCCTCAAAACCCATAATCTTACTAAGAAAGAAAATGCTTAATATTTTAGTGGAGCTTGTGATTTTCTCTCATTGAAAAAATCACTTCTCTCATATTCACCCAAATTTTAGATGGGTGGTAAGGAATTCACCTTTTCATCATAATGCTTTATGATATGAGAGAATTATAAAAAAGAAAAATATTTATTAAAAATTCTAGGGATATGTCCAAAAACCAAAACCCAAAGCAAATTGAATTAGCATGAGAAGGGGAAGCATGGTAGAATGGTGCCAAGCCAAGTTTCAAAATTTGCGTAAGATTTTTCCTTTTCACACAAATAGGACAGTTTGGTGAGCAGACATGACATCAGAGGAAGCCTAGATTTGGTGCTTAGCTTAGCTCCCTCTGTTATGTTGGATTGAGGTTGTTGGTCCTTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCACTCTCCCTCTTCACTTTACTTTACCTTTCTTCCTTACTCATTACAGTTTTTATTTTCTTATTTTCTTTCTAAGCTAAAATCTTTTTTTTTCTTTACTTTTTATAAAAGTAATTTTATTTTTTTAAAATGTTTAAATTTAACAGAAATCTAACAAAGGAATAATGTAATTAAATATTTTTAAAAATTAAAAAACTAAATAGAATTTTTATAGAATTAGAGGAAAAAGAGATTTTAACCTTCTTTCTACCAGCCATCCATAAACAGTGTATCATACACATACCTATTCATTTCACATTTGCTTTCCCTTTACTGTTCTCTCTCCCCCTCTGCTTTCCTTCATTGCAAACCAAGCTTCCTTTCCAGCTTGTTCTGGTCCTGCCCTCAGACACAACACCCACCAACCATTTCACTGCATTTACTCTTTCTCCTCTCCAAAATTAGTAGTGACAGTTGCCCACTCTCTCAAACTCTGTATTTTTCCTATCAAAATAAGATTTTTGTCTGCCATTCCCTTCCGGTTTCTCTTCTTAATATCTTACCGCTGAGTCCTTTTTTTTTTTGAAATATGGCCCCACTTTTTACCTATTAGTGTGCCACTTCATCTTTTGCTGCATCTGGATTCTGCTGTAGGGTATGTGTGTTGCTCAGCCTCAGGCATTTTTTGCACATTGAGTCTCTTGTCGGTTCAAAATGAGGTGTGAAACCTGTTGCTTCTTTGGGTAGAAGATTCAGGAGTTTAGCTACCTTGGATCACTACAAAGGTAAATGCTTTGTCTTTGTTAACCACTTTTTGGATAATATACATTTCACTTTCTCTCTTGTTTGCTTGGATCATAAGTGATTCTTTCCTGGTTTCCTTTTCTTTTCATTAGAAATTGTGTTCATAATCAACATTCAACCGGTTATTTTGCTTTCCAAATGAACTATGAAATCACTCAATATGTCCTTCTAATATTGGTTTTGAAACTGCTGAATTATGTATGATTCTGTTTATTTTGTATGCCATTGCTAATGAAGCCTGAGATAGTTTACGGGAAACTTTGTAGTTCGAGATTATCTTAAATCGTGATAAACATTGCATTAGTGATTTGTTGAAACTCTGGCTTTTTGTTTATGGCACTGTGTAAGACCTGAAATGTTGGTTGTAAATTGGAATGTTCAGATGTGTGTTTCAAAGCCTCGAGTAAGGGGAATGGAGTACTTAACTTGAATCCTGTACTTGGGTGGGAATGTCTTGGTTCTACCAGCTGAAGAATTTGTGGGGACGCTATTGATTGACTTGGTGCAACCAATTA


Gene Sequence:
>Vu_00925(+)
ATGTCATCCAACAGTTCTTTGAAAGGGGAATTGACAAAGAAGACTCCATTTTTGGGGTTGAGACGATGGGTTTTGATTGGAGTAGGTGTTGGTGCATTTATAGTGCTTATTCTTTGTATATTGTCAATATGGGTGATGTTTCGGAGAAAGTCTAAGAGATCTTTGGACAAGTATTCTGTATCCCAAATACCAAATGTCTCAAAAGATATCGACGTTGACAAGGTTGGGGTGCAGAGTTCTCATGTCCAACCAGAAAATGTGCTTATGCCTGTTCATAACATGACAAGTGATAAAAATTCAGATAATATATCAGTTCATTTGGGTAACAGCAAATCTGGGGATCCTGATAATATCAGTCAGTGCAGCTCAATTTATCATCATGAGAGAGGATTTAGTTCAATGTCAGCTGAAGAAGGAAGCTCTGGGAATGTTAAGAAACAATCCACATTGTCACATGGAGGGTTGGCTACTGCCTCTCCATTAGTTGGCTTGCCTGAATTTTCTCATCTTGGGTGGGGCCACTGGTTTACACTCAGAGATCTGGAAATGGCAACCAAACGATTCTCAGCTGAGAACATTATTGGTGAGGGTGGATATGGGGTTGTTTACAAGGGAATACTGATTAATGGAATTGAGGTGGCAGTGAAGAAACTTCTTAACAACTTGTAAGGATATTTATTGATCATTGATGTACTCTTTAATTTTTCCTGACACTTCATGTACTTGTGTAATTATTTCTACATTGAATTCATAGGGGACAGGCTGAGAAAGAATTCAGAGTTGAAGTGGAGGCTATAGGACATGTTAGACATAAGCATCTCGTACGCCTTCTCGGATATTGTGTAGAGGGAGTTCATAGGTAATTTTTTTCTTGGATTTGTGACAGTTATGTTCTCCTTGGTTCAAAATTTGAACCGAAGCTTTTCTCAATGTTATGTCTCTTTGTGTTATAATGAATGTACTTCCCAAATGAAATTCAGGCTGCTTGTGTATGAATATGTGAACAATGGTAACTTAGAACAGTGGTTACATGGAGACATGCACCAACATGGGACACTTACTTGGGAGGCCCGCTTGAAAGTTATACTTGGCACAGCCAAAGCGTAAGTTCAGTGTGCAATTTGTACAGTCTTTGCGAACTCATCTGAGTGATTATCATAAGTCTCTCATCTGTGAGATTTGATTGTAAAATGCTGTGTGTGTACCTTTAATTAATGCTATTACTATTTGTATTTTGAGAATGTCAAAATATATTTAATGGTCTGTTTATCTGTTTCTTGATAGTATTATGCTATTGACTTTATATTTTCATATAGTTTGCAGCATGTTGAAATATCTAAGCCCATTAGGTTTTTAGATTAAACAACAATAAGAGCTCGCTGCCCATGGGACCACTGAGTAAACTCTCTAATCTTTGGCTATATTTGGATATCTATTGATATTTGGAACAGAGTGAGATGAAATAGAATGAAATACCATTGCATTGTTAGAATCTTTTCTGAGGAAATGATATTGAATTAGAAAAACTGGTTTCACACTCCCATATTGGGGGAGGAGATAAGGAGAAGTTTTGGATGGAATGGATTTCATTCCTTCAATCAGTTCAAACATAGTCTTAGTTATTATCTGACCTACTTTAGTTTTAACATTTTACTTAGTTACAGATTTATATTTGTGGAAGTTTCAACAGTGGACCTTGTCATGCTGATGAACCCCTCTATTATACTGTTACTGGTGGCAGGCTTGCTTATTTACATGAAGCAATAGAACCAAAGGTTATTCATCGGGACATAAAGTCTAGCAACATATTGATTGATGATGAATTCAATGCAAAGGTTTCTGATTTTGGCCTGGCCAAACTTTTGGATTCGGGAGAAAGTTACATAACCACAAGAGTAATGGGAACGTTTGGGTATATACAGAAAATTTCATTATCCCTTATTTAACACTTAAGGATTCATACTACTGGAAACTCACTTCTGTTGTGGATTACAGTTATGTGGCCCCAGAATACGCGAACAGTGGTTTGTTAAACGAGAAGAGTGACATTTACAGCTTTGGTGTCCTCTTGCTGGAAGCAGTTACTGGAAGGGACCCTGTAGACTATGCTCGTCCTGCCAATGAGGTTCCTAATCCTTATGAACTCTGCTAGCTTGCTAGTTCTAACCATGCTTTCTACTGGAAGGTGATGATCCTTAATAGTGATTAGATATTGTTCATCCTCATTATGACAGGTTAATCTAGTTGAATGGCTCAAAATGATGGTAGGAACAAGAAGGGCTGAAGAAGTAGTGGACTCAAACCTTGAAGTTAAACCACCTTTGTGTGCTTTGAAGCGCACTCTTCTGGTTGCACTTAGATGTATTGATCCTGATGCTGACAAGAGGCCCAAAATGAGTCAAGTTGTGAGAATGCTCGAAGCTGATGAATATCCATACCGAGAGGTTCCCTTCTATACTCTGTCATTTCATACAAGTTCTGTTGTTTAATTGATGCTGAGTTTGAGTCTCATTGTTTTTTTATCACATTTTGCAACCTTTTAACCTTGTGGGCATCCTTAACATTATTTCCTTCAAGCATGTGTTGGCTATTCTTCCATCAACTAAAAGAAATACAATATTGAATGAAAACTCTTGGGGGAAATTAAGGGTAAAATATGTTTTTGGTCACTTTTTTGACAAATTTTGGTTTTGGCCCTTGTAAAAAATTTATTTATGATTCCTGTAAATTTAATTTTTTTCAGAAGGTCTACATTATCTTGTATTTGTGATGGGCATAAGCATCATGTTAACGATCATTCTAGGATGACATGTAATATGACATTTAGATGCACGTTTCATCATCAATAACTGCTGATAAGGACAACTTTCAAAGTTTTTAAAAATTTACAAGTAATAAATCTGATATTTTTTCTCTGGAGGACTATATCAAAGTTTGTCAATTTCGCAAGGACTAAAAACACATAAAACCCAAATTTTTTTTGGTATTCTTCAGCCTACATACTTCCTCAAGTTTTACTTCATTAGCTAAAAGACAACAAAAGAAAGCATGATTTATGCCATAAATTGGGAAGATACCATTCTACATACATGGAATTGTGATGCATTGTAGTATATAAAGAGCCAGGTCCTCATTTTAAAGCAAGTTTTTTGGTGCTTATATCTGGAATATTAAGTATATATGTTGAAAAAACATCAAAATGTAAGATTGATATAATCACTTTCAGGATAGAAGAAACAGAAAGAGTGGCACTGTCAACATGGAAATTGAAACTGTGAAGGATATTTCGGGTCCATCTGATGCTGAAAGGATGGGGCATACTGAAACAACTCAAGGATAG