Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00784 LG1 11179766 11184191 leucine-rich repeat protein 1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 11180082 splice_acceptor_variant&intron_variant
C/A 11180710 missense_variant p.Asp177Tyr
T/A 11180869 missense_variant p.Ile158Phe
G/C 11180994 intron_variant
C/T 11181507 intron_variant
T/C 11181638 intron_variant
A/C 11181739 intron_variant
G/A 11181760 intron_variant
A/G 11181765 intron_variant
G/T 11181889 missense_variant p.Ser122Arg
G/A 11181979 intron_variant
C/T 11182597 intron_variant
C/T 11182657 intron_variant
T/G 11182659 intron_variant
C/A 11182662 intron_variant
A/G 11182664 intron_variant
T/G 11182959 intron_variant
C/A 11183346 intron_variant
G/A 11184112 5_prime_UTR_variant
A/G 11184149 5_prime_UTR_variant
A/G 11184151 5_prime_UTR_variant
A/C 11184175 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00784.1
MAAATCTSMRFLLSVSLTLTLLRLGASNSEGDALYTLKRSLSDPDNVLQSWDPTLVSPCTWFHVTCNQDNRVTRVDLGNSNLSGHLVPELGKLEHLQYLELYKNNIQGTIPPELGNLKSLVSLDLYNNNISGTIPSSLGKLKNLVFLRLNDNRLTGPIPKDLAAVSSLKVVDVSNNDLCGTIPTSGPFEHIPLNNFENNPRLEGPELLGLVSYDTNCS*


CDS Sequence:
>Vu_00784.1
ATGGCAGCAGCAACCTGCACTTCCATGCGGTTCCTACTCTCAGTTTCCCTAACCCTAACTCTGCTCCGCCTCGGCGCCTCCAATTCCGAAGGCGATGCGCTGTACACGCTCAAACGGAGCCTGTCGGACCCGGACAACGTCCTTCAGAGTTGGGATCCCACGCTCGTGAGTCCGTGTACTTGGTTCCACGTCACCTGCAACCAGGACAACCGAGTCACTCGAGTGGATCTTGGTAACTCTAACCTATCTGGACATTTGGTTCCGGAACTTGGGAAGCTGGAGCATCTGCAGTATCTTGAGTTGTACAAAAACAACATTCAAGGAACTATTCCTCCAGAACTTGGAAACCTAAAGAGTCTAGTTAGCTTGGACCTGTACAACAACAACATATCAGGCACCATTCCGTCTTCATTGGGGAAATTGAAGAATCTTGTCTTTTTACGACTAAATGACAACCGACTTACTGGCCCTATCCCCAAGGATCTTGCTGCTGTTTCAAGCCTTAAAGTAGTGGATGTCTCCAACAATGATTTATGCGGTACAATTCCTACCTCTGGGCCATTCGAGCATATTCCATTGAATAACTTTGAGAATAACCCTCGTTTGGAAGGTCCAGAGTTGTTGGGTCTTGTAAGTTACGATACAAACTGCTCGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_00784::LG1:11184191-11186191(-)
AAAGCAACACTTGTCAAAGTCGGCCACATTAAAAAAGAAGTCCGCCTAAAGTTAGTCGTGTCAAAACATAGCTCTCTTAAAGTCGACCATATCAAAAGAGAAGCTCGCATAAAATTGGCCGCGTCAAAACGAAGTTTGCCTAAAATCAATAGCATTTAAGCACTGTTTAAGGCTAGCAACACTAAGCAAAGACTGTCTAAAGTCGACAACACCTAACAAAACCTACTTAATTAGTCGGTAAAAACCCTACTAAGAGATAACATGCAATCACATACACCAAATTAAACTCTCGTAAAGGGACTTATGTTCCTATTTGACTTAATAGGCATATTAAGGAGCATGACCCAATAAGACTCTTCAAACCTCTTCATTATGAAACAACCTAAACCTATATGTAATTGGGTTATATTCACTAAATATCGACAAATTGGTATGTTGATTATTATTTACCATTATATTATTATTTATTAGACTATTATTATACTTTTCAAGTTAGTATTATTTCAATTGGAACATATGTTCATTGTCTATGCTAATTTTATAAATACAATTAGTATTGGAAACACTTATACTCATTTTACACATCAAAATTCTAATTTTCGTAATGACATTAACGTTAAATAGTTTTTGGTAAGTGAATCTCTTTTCTTTTAATAATAAGAGATTCAATTAACAACCATCAAGAACAATCATGCCACCGTTAGAACATCACTACTACCTATAACCAAATCGCGTTCAAATTCCAGTGAAACCAAATATAAAATTTAATTTTTTTAATAACTAAAGTTTACAAGTTAGTAATTAACAAGTGGAGTAAAAAAACAATTTTCTTTGTATATTTCTAATGCAATAAACACTTCTACCCATTATTTTATCTATTTATACAATTTTAACCTATATATTTGAGAAATAAAAATGGCAGTTGGAGAATATTAGAAGATGACGATCCTTGTAACAAAAATAGTGAATTGATCCGTTGACGAAAGTCACGATGTGCAGCACCACAGCCATAAATTATCAAACCAATCTGGATCCTCCCAACCACTTTAGGTGGTGTCAATAATGGTGGTTGCACAGACTTGGCATTATCACACAGAATACGCCACTCACCAATACACCACTTACCATTTCATTTTTCACCACTTTCTTTTTTCTACAACCATCGACTTCTTCTTTCAGACATTCTTAGAGGAATTTATTCATCTGCATTGTAAATATTTCCAGCTTAACTAAATATTTATGGTAATTAAATAAAGAAGAAAATTTACGTTTTAATGTATAAAATTAAGAGTATTTCGTTTTCTTTTTATCGTTTCGTTATGTGTTCTTAGAGAAACCATTATTGTTTCCCTCCCTTCGGTGCGTGACATCCGCTAATGACTAAGTACCGAAAATTGTCCATAAAGGGAACATCGAAAGTCAACAAAGAAACAGAAGAAAAAACGAAAGATAGTGTGAAAATAGAGAGCAAAAGAAAATAAACTTTAATTAAAATAGTAATCTTTTTACACCACCAGTTAATTATATACATAAAAAATTATACAAGTAAGTGGCAAAACAACGGTACCTTTATTACGAGTTGTTGGTAAATTTATTGTTTATATAATAAAAAAAATGTTATTATTTTATTCTTCAAACAGGAGGAAAAGTAGAATAAGGAATTTCAATTATTAAGGAGGGAATTCTTATTAATAATTCTTAATGTTTCAAAAAACCATATTTAACTTAATAAGAAGTATATCAAGAATTTAAATTTTTTACTAATTTTTTTAATATATCAAAAATAATATATTTTAAAGGTACAGCAAAGGAAAACACCAGAGTTCATCAAAAAAACAAGACCAGTAAAACACTGGCTTTAAATCTCATAGAAAAAAAACAAGGAAAAAATAAAAATAAAAATAAAAATTAAAACATATTTAAAACAAATTAAATTTGTAATACATTAAACTGATTTGAAAAACTAAAACTATATAGTATATTATAAAATCGAAGCTCGC


Gene Sequence:
>Vu_00784(-)
CATGTTTTACTGCTCCTTGTTATTCCCAAAGCCGATACTTTCTTTTCAAGTCTTTTCTCTTTCTCTCTCACAAGATTCTCCCCTCTTCCTTCCTCTCTCTCTAGAACTTCGTCCTTTGCTTTCGTTCTTCTCTGCGCGGTCGTTGCGAACCGACGAATAAGAGCGATAACCCTAACACGGCAGTAGAGGTGTACGGTTGAAGCTCAGATCAGCCATGGCAGCAGCAACCTGCACTTCCATGCGGTTCCTACTCTCAGTTTCCCTAACCCTAACTCTGCTCCGCCTCGGCGCCTCCAATTCCGAAGGCGATGCGCTGTACACGCTCAAACGGAGCCTGTCGGACCCGGACAACGTCCTTCAGAGTTGGGATCCCACGCTCGTGAGTCCGTGTACTTGGTTCCACGTCACCTGCAACCAGGACAACCGAGTCACTCGAGTGTATTCTCTCTCTATCCCTCTCTGTTTTGTTTGTTTCTGCGATGTTAAGATTTTTTAGTTTCGTTTCGGTGCTCGATTCTGCTTAATAGTTGGCATTTGTTGCGTTAATCAACACTTCTGCTGCTTCCTGTTTTATCACGCGGTGTTGATTTTTTATTTTTGTTCTTTAGTTAATTGTTTTATAAAATTGAAGGATCCCCCGTGAGGTTGCAGGATTCACTGTTTGCGGTTGGATTCGTTTGTTTTTATATTCAATGAAACAAACAAAGCCGCGTTTTCGTCAAATTACTTCCTGTTGATAGTTAGATTTCCATATTTACTTACCTGTTTCTTGTGGTGTTTATGTGGTTGGAATTCTTTTTATGTAGTTTAATTAGATGCTTTTCTTTGCTGTTTTACATTTTGGGGGCGGGATTATTGTTGCCCATGTTGCATAAATATTATATATAATGCATGTATAAGTTCGTAGTTGAATAAATAATCCATGTATTGACTGTTAAATTTGGCGTCGACCAATAGCAAATGGAAAAGTTTGTTAACTATTATAATAATTAGCTTAAAAGGTTATATTAGCGATGATTTGTGATTGAATATGGTGTTGACTTATAACATACGTAAAGTGCGCATTTAGATGTGAACAAATTCATAAAACTTAATAAATATGTATTGCAATTCATGCTTCTATGTATCGTATGTAGCTGTATTAAATTAAACTTTATTTACCCTTCTTCTTTCACTTATACGAATTAGTAAAGTATTGATATGTATTGGATAAGATACGAGAATAAAAGGAAAACATTGTTCTTAATAGATGGTTGCTATTATAACTGGTAATATGGGAAATCCAACTAAAATGTGTTGGTTTGACTGAATCTGTTGATATTTTGTCCACATTTATGGTGATAATTATGTTGCTTTCTACAGGGATCTTGGTAACTCTAACCTATCTGGACATTTGGTTCCGGAACTTGGGAAGCTGGAGCATCTGCAGTATCTGTATGTTTTCTAAATTTTGGCTAATATTTTTTACCTAGTGTCACTTAAGTCGTTTAGATGTGATCGTATGATGGATAAATACAATATATGTATTAGATATGATACATATTTGATATTAGATTCGGTGATATAATTATTCTAAAAAGTATTGGCCATGCATGTGAGATACTTGTCAACAACATAAATGTAATGAATTATTGTCATCATAAATCGTGTTCTATTGTCAAATGGGAAAAGGAGAGGACTTTAAGTCTATTTAATGTGCTCTTATGATGCATGGATACAATAAATGTATCAGATATATTTATAAAAGGCATCCTATAATACTAATATTCTATAAATGTATCTAGTATGTCTGACACATATCTAGATATGTATAAAAAAAATAAAAATAATAATAAATATATTATTGCAATTATGCAAATCCAAATTAAGAAAACTTCTAGGACATTACTATGAACAAAATAAAAAAGAAATTATTGTAATCATAAATTATTTCCTTTTATCTTCAAGTAGGAAGGATCATCTATAAAGTGCACGATTTCCATTTTTTGGTTCACTAAGGAACAATATATGACATGTAGCTATAAAAGTCACAAAAAGTATCATACATTGTTCATATATATGATATGTGGCTATATTAGATTTTCATAACTTTTATAAAAGGCTTGTGTGCTTCATAGATATATTTCATATTGTACTCATATTATTACTACAATGATTGATCTATTGGCATTTGTTGTGAACTATAGCACCTCATATTTGTGTGTTTCATGTGCTTTTTCTTAATTGGATGCAGTGAGTTGTACAAAAACAACATTCAAGGAACTATTCCTCCAGAACTTGGAAACCTAAAGAGTCTAGTTAGCTTGGACCTGTACAACAACAACATATCAGGCACCATTCCGTCTTCATTGGGGAAATTGAAGAATCTTGTCTTTTTGTAAGTCTGCAATAGCATATTAAGCATGATTGGACTGATCTGTGGCCTTTGCTTCCGCTATCCTTTCATTTGAATTTCTCACAAGAGTTTGAATGATGCAGGAGAATTGCAAGAACATTTGGATAGCTACTCATGGACTTTGGTGTTTTTCAATTATACATTTTATGAGTTTGGACAATTGTGGGCTTTGTGGTTGATGTTACGATGTTGAGCAGTAGTGCATATATTTGATGTTAAGACATCTGAAATATGACAGTATATATGAAATGAATTGCTTCCAAAATTCACATGCTCATATCCAAACTTAGACCTCACTCATGGGAGAAATATTAACTGAGTGTTTAGTTCAAAGGAAGGGATGGAAGGGAAAATAAAATATTTTACTATCTTATCCTTAGAATAGACAAATAAAGCCATCAAGTAAGCATACTTGAGTTTAATCAGTGTTAAGAAACAAAATCTCCCCCTTTAAAAAGAAGGGTAAGAGACTCTAGTATGACTAATTCTGATTAGATTGAGATGATTTCACTCCCAACATTCAGTGGTGTGATTCAATCTATAAACAATCTAAGCAACTTAAAGGATTCCTATGTAGTATGAAAGTGTTCAATCTATAAATTTTGATGGACCCTGTCTGGGCAACATCAGAATCCTTCATAAGTCAAACTACTTGTAGTGAATGGATGACCTATTGAAAATTGCTTGCTTTCAACCAACATCAGGAAGCTAAGTTCAAATCTAAAATAAGTAGCAATCGTAGTTAGTAGTTCCATTTTTGAAGTGTTGGAAGCTGTTAGTCTTTAAATATGAAATAGTTTAACTTACCGGATTCTTAACTGGTAAAGCCTTTGATTATTATTTTGTGGAATAAAATATTCCGTACTCGCATGTTTCTCATATATGTTTTCTTTCAGACGACTAAATGACAACCGACTTACTGGCCCTATCCCCAAGGATCTTGCTGCTGTTTCAAGCCTTAAAGTAGTGTAAGTAAAAATGTTGTCTTTATAAGATGATCATGATAGGATTATTTGGTATATGATGAAGACGTGGGCTTTTGGAGAGACTAAACATTAGCTTATTTTCAGGGATGTCTCCAACAATGATTTATGCGGTACAATTCCTACCTCTGGGCCATTCGAGCATATTCCATTGAATAAGTAGGTCCCACTAAATCTCTCCTGAATTTTGTAATTTTTTTTAATTTTTATTTTTATGTTGGGGTGAGGGAAGGGGAGCAACAATGAGAAACCTAGTAACCTTTCTGCCATGCACTGCTATATTTATCGCTTGCAATTTTTTCTGCTTTATGAGTATGATGTTAAAGATGTCTTGTTCACATTCTGTTCACGAAGGTCCTTTTAAACTGTTATTCACATTCTATTTATCGAACTGTTAAACTGTGATGGTAATATTCAGTTGTTATTTATTGTTGTTTGTGATAATGATATTCTCCAATCGTTTAATGAGATATTATGCATGCAAAATTTTGATTAACTAAATCCGCTGCCCTGTACCAATGCATTTGGGAATAGTGATTGCGGTGAATCTGATTGCATCTTATCTGTCCTATACAGTTAATTATAATCAGTCTTCCTGCATTTTTCTGGTGCACTGATTCTGAAATCATTCAAAAGTTTGAACTCTAGATTATTAGCTGTAGAACATGTTTTCTGCTATCTGGTTATCATTCCTGTTACCTGTTGAATAAACATTTTTTTTTCAATGCTGTAGCTTTGAGAATAACCCTCGTTTGGAAGGTCCAGAGTTGTTGGGTCTTGTAAGTTACGATACAAACTGCTCGTGAATAAGGTGATGTGGTAGGATCTCTCTCTCTATATATATATATTCTAAAATTCAAGTGTATTACCTCATAGTGTAATGGGCAGTGGTAAATGTAATCTCTGGTATATGTAAATTTACATACTGAAGAGCATTGGCATTTGTAACAATATTATGATCTGACAATGATGTTGAGACTTGAATATCATCTATTTTATGTAATACTAGAAAAATTCGACTTGGTTACTCTGAAATTATTTGAAACTC