Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00630 LG1 9503769 9504472 PREDICTED: LOB domain-containing protein 12-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 9503936 intron_variant
C/T 9503976 intron_variant
A/T 9504015 intron_variant
G/C 9504017 intron_variant
T/A 9504092 intron_variant
G/A 9504097 intron_variant
A/T,* 9504126 intron_variant
G/A 9504143 intron_variant
C/T 9504144 intron_variant
G/T 9504199 synonymous_variant p.Val67Val
A/G 9504205 synonymous_variant p.Glu69Glu
G/A 9504210 missense_variant p.Ser71Asn
G/A 9504224 missense_variant p.Asp76Asn
T/C 9504243 missense_variant p.Val82Ala
G/A 9504245 missense_variant p.Gly83Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00630.1
MGGNSPCASCKLLRRRCTKDCIFAPYFPSEEPQKFAIVHKVFGASNVSKMLQELPVQQRTDAVSSLVYEASARVRDPVYGCVGAISYLQNQVADLQMQLAVAQAEILCLQMENESLIPISETDLHQKSYLLQNNFSQLLDFNTSNSVVQYSPNHLTQ*


CDS Sequence:
>Vu_00630.1
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Promoter Sequence:
>Vu_00630::LG1:9501769-9503769(+)
CTCAACTTCTAAGTGATCTATTAGGTGTGGTAATTACTAAAAGAGTAAGATAAATTGCTGGACTTTTAAATTTTCCTACAAATATTTGGGTATTTAAATCTACTGATGTTTTGAAAACAATAAATGTTTATTCAATTTATGTAATCTTTAATGTAACTTAAAATTTAAACCTTTTTAATATTATTTATATATTTAATTATAATGTTTGTGTAATAAAAACATTAATGTACCATTTTGTTTTATTTTGTTATTGTAATCTTAATGTTACATTTATATTTTATGGGAGCATATGCTGGAAAAAAAATTACTAGAAAAATAATTAAGTTTAAATATTTAATCAGGCATTAAAGAAATGTATTCATATGATTTAATTATTTTTTTTTCTATTTTGTGATTATAAAATTTGATGGATTTATGGATATACAGAAGGAACGGATAATAAATAATAAATTGTGAAATAAAATAATGATAACTATGAAACCTCTTATCCTCTCATTACTCTCCACCACAGCATTTTCATTTTGATACCAATTATGGATTAGTCTTTTTTTCTTTTTTTTTCAAAGACCTAGTATTAATATATAATATCAGACCAAAATTTGAAATTTTGCATCAAATCCACACTTTGGTTATTTTACATGTGTAACTATAAAAATATTTTCTTGCTCAATAATCATATTTATTAGGAATTAAGAACTCTAATAATTATGATTCTTACAATTATTAAAATTTTGTACTTGATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATATTTCTGAAAATTAGTGAGTAAATTGTTATTTAATCTGTTATTAGATAACATGATTAAAAAGAGTAATATAATATTCTTTTCATAAAAAATATTTAAATTTTAAAAAATTAGATTGACATATCTTTAAGAAATTTTTTATGAATAATTTGATAAAATGTATTTTTAGAAGATATTAGTTTCTAAAGAATATATATTTTACTCTTAAATTCTCTCATATTCGTTTATTCCTTCTCTTTCCAATTCTTCTACTTAATAGCCTGGGATAATAAAACTCATATTTTTGATAAATTACAATTTGTTCATGGATAAGGTAAAGACAATTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGATTGGTCACTTTTAACTGGCTGGCACAACATTTCCATGATAAGACAACTTTTTTTCTTCCAATTAACTTCAATCAATCTTAAGTAAAAAAATAAGTTTCAAATCAGAAAATTATATATTAGCTGTATTTTAATAGTATAATTTAAACAAAATAATGCAGTTCATTGTAAAAAATTGTTTAGATAAATCTATCCATCAACACTTTAGAAATAAAAAAGATAAAAACATCTCGTTATAAATTATCATCACTACTTTATGTATAAATTAATTTATAAATTGTGAAAAATTATTTCATATTTTATATAAATTCTTACTATAAAAAAAAATCTATACCAAATTGAAATATATTATCACACACGCTTCCTAAATTTCAAAATATGAATTCTTCTCAGAATATTGACAAATTTGTCCGGGTATGAAATCAACTAAAACAAAAAGATAGAAGCGAAAAAGTTTCTGGTTATATGTTTCTTTTAATACGAGTGTGTCATATATTTATTTGAATGTCTAAATTGACAATTGTTTTTTATTTAAAAATTTTAAAATTTGGTGAATCACTTACTCTTTATTTAAATATAAAATAAAAAAATTTAGTAATTGATTGCAATTGATACTTTATATAATTATATAATACTTAACTGATTTTGTAGCAGGTTCCTTGCTAACCTCAACCCCTGTATCCATTATAAATACACCAATGTTTTCAATCTCAGTCTCATTATATGCAACTTTTTTATCTGTGCTCCGTTGTCTTCCTCTGTCTTCAGTTCATTCCTTTCTTTCCTTATTGTTCAAACACAATTAATTCCCTTTTTTCTTAGTCTTTTTTAAAAAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_00630(+)
ATGGGTGGAAATTCTCCTTGTGCCTCATGCAAACTGTTGAGACGCAGGTGCACGAAAGATTGCATCTTTGCTCCTTATTTTCCTTCTGAAGAACCTCAAAAGTTTGCCATAGTTCACAAAGTTTTTGGTGCTAGCAATGTTAGCAAAATGTTGCAGGTATTTCTTTCTTACTCTTCTTTTTGCATTCCTTTAAAAAACCCTTTTTTGCTACCTAATCAATTCATTTCAGAATAAAGAAGTTTGAATATGGGAGATTCAAGTACTATTTGCTAATACAACTTAAAAAAATATGATCTTTATCTGTTCTTTGGAGTTGTCTGTGGTGAAAGGTTTTTCAGAAGATTCACAGAGTGTTCTAAATGGTTGGTTCTTATGCAATGTTTCAGGAACTTCCAGTTCAGCAGAGAACAGATGCAGTGAGTAGTTTAGTGTATGAAGCAAGTGCAAGAGTGAGAGATCCTGTGTATGGTTGTGTTGGAGCCATATCTTATTTGCAAAATCAAGTTGCTGATCTTCAAATGCAACTTGCAGTTGCTCAAGCAGAGATACTCTGTCTTCAGATGGAAAATGAATCACTGATACCAATCTCAGAAACTGATCTACACCAGAAGTCTTATCTTCTTCAGAATAATTTCTCTCAGTTACTTGACTTTAACACTTCCAACAGTGTAGTTCAATATTCCCCTAATCATCTTACACAATGA