Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00563 LG1 8707874 8709664 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 8707899 5_prime_UTR_variant
G/T 8708023 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/A 8708255 5_prime_UTR_variant
C/T 8708264 5_prime_UTR_variant
G/C 8708405 missense_variant p.Asp14His
G/A 8708588 missense_variant p.Asp75Asn
T/C 8709254 synonymous_variant p.Ser251Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00563.1
MELETLYPPCFMPDSNWFVEESQSTEWSREDNKKFESALAIYDKDTPDRWFKVAAMIPGKTVLDVIKQYRELEEDVSEIEAGRVPIPGYLASSFTFELVHNHNYDGSRRRPAAVRGSDQERKKGVPWTEEEHRRFLMGLLKYGKGDWRNISRNFVVTKTPTQVASHAQKYYIRQKVSGGKDKRRPSIHDITTVNLTETAASDKIKSPFMITPQQKLNSMSKVQLDWTSHCNDGSLMVFNPNRDNLFVSSSSDIMALKMQGQDLYDCALHEAYAKVKVPGFGMAPRDFNNEAIFGIHAL*


CDS Sequence:
>Vu_00563.1
ATGGAATTGGAAACCCTGTACCCTCCTTGTTTTATGCCAGATTCAAATTGGTTCGTGGAAGAGAGCCAAAGCACAGAATGGAGTAGGGAGGATAACAAGAAGTTTGAAAGTGCCCTTGCTATATATGACAAGGACACCCCAGATAGATGGTTCAAGGTGGCAGCCATGATCCCTGGGAAGACTGTGTTGGATGTGATCAAGCAATATAGGGAACTGGAAGAAGATGTGAGCGAAATTGAAGCAGGGCGTGTTCCAATTCCTGGTTATCTTGCCTCTTCTTTCACCTTTGAGCTTGTTCACAACCACAACTATGATGGAAGCAGAAGAAGACCTGCAGCTGTCAGAGGTTCTGATCAAGAGAGAAAGAAAGGGGTTCCCTGGACTGAAGAGGAACACAGACGTTTTCTGATGGGACTTCTCAAGTATGGTAAAGGGGACTGGAGAAATATTTCTCGGAATTTCGTGGTGACAAAGACTCCCACCCAAGTTGCTAGCCATGCACAGAAGTACTACATAAGGCAAAAGGTTTCTGGAGGAAAAGATAAAAGGAGACCCAGCATCCATGATATAACCACTGTTAATCTTACAGAAACTGCTGCATCGGATAAGATAAAGTCTCCGTTCATGATTACACCGCAGCAGAAGCTGAATAGTATGTCAAAAGTGCAGTTGGACTGGACCAGCCACTGCAATGATGGATCACTCATGGTTTTCAACCCAAACAGAGACAACTTGTTTGTGTCGTCTTCATCTGATATCATGGCCCTGAAAATGCAAGGCCAGGATCTCTATGACTGTGCTTTACACGAGGCTTATGCCAAGGTAAAAGTTCCAGGTTTCGGCATGGCTCCCAGAGACTTCAATAATGAAGCTATTTTCGGTATTCATGCACTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_00563::LG1:8705874-8707874(+)
CTTTGCCATAACCGTTGGCCTTAATCCATGCGACACGTGTCTCACCGGGAGCAGGCTTGTCTCTGCTATTAACAACATCACCTTTTTGTTGCCGACAACATCACTTCTTGAAGCACATTACTACAACGTCAGGGGTGTTTTCACAGATGATTTCCCTGCATACCCTCCTATTGTTTTCAATTATACTGGTACTCAACCGGTTAATATTCAGACCAACAATGGCACAAGACTGTACAGATTGAATTTCAATTCAACTATTGAAATTATTCTCCAGGGCACTGCAATGATAGCTCCAGAAAATCACCCCTTTCATTTGCATGGCTACAATTTCTTTGTTGTAGGGCAGGGACTAGGGAACTTTGATCCAGAGAAGGATCCGTTAGCCTTTAATCTTGTTGACCCAGTTGAGAGAAACACCATTGGGGTACCCAATGGTGGATGGGCAGCAATCAGATTCAGGGCAAATAACCCAGGTATAGTTACTAATCACTTTCTATGTGAGTTTGTTTGTGCTTCAAAATTTTCCCATGCAATTATTATGCATAATTTATCTACAGTGAGTTTGCTGATATTTGTAAAATCTATTACAATTACCGTACGTGAAAATTAAACTTTATGATCAACATGTAGTTCATGTTGACTAAATTGATGTTTATAATGTGTGAACTGTGAAGGTGTTTGGTTCCTGCATTGCCACTTAGAAGTACACACCACATGGGGACTTAAGATGGCATTCATAGTAGACAATGGCAACGGTCCCAACGAGTCCCCGTTTCCACCTCCCAACGACCTTCCAAAGTGCTAAAGTTTATCACGTAAAAGGAACGAAATTTGGAATCTGAGAGACAACAAGAGTGTACATTATTACACTGGAGAGGTGATGTTACCACCCAAGGGGAACACATCAAGTTCTTTATGGCTGTTTCTGAAGTTGGATTTGTAGCAGAGATCAATAAAATACTTGCTGTAGATAATTCAGAGCTTTTTGTTTTTCTATTGTCAGTTTGGGGTTCATAAAATGTGATGAATGTGCTTTGATGAAACTTCAAATTGTTCAAATGGCTTTTCTAGAATTTTCATATTAATTTTTTCTTATGTTCAGCAGCACCATCTTTTTCTTCAACAGTGCTAGGCTTGCCATCGTTGATATTTTGGTAGTTATGTTGGCAGCTTCTGCTTTGATAGCATAAAAAGACAACAAAAGATAAAACATCGCGCCAGGTAGGGGTCGAACCTACGACCTTCTGCTTAGGAAACAGACGCTCTATCCACTGAGCTACAAGCGCAACTTTGAAATTACCCAGCATATCTTATTATATAATTGTTCTTTTGATCATAAGCAAGCAATGGCTATGTATGTCATAGTAGAATTCTCATCATCTATATTTTCAGAGTAGATTGAAAAAGTTATAGTCTTATGCTTCTATAGATTTTGTTCTTATTTGATAAATTAAATTATAAATTAATTTGACATGCTTACACGAACAAAATGGTTTGATTCTTAAATTTTATACTTTATATGAATGTTTTAACATATATCTGAAAATCGTACATAATTTAAAGTCAAAAGTAGTTTATTAACAATATGACAAAAATATTAAATGTCAAAATAGAAAATATTATTTTTATCTAGAGGGAATTGTACCTTTCCGCTAAAAAAAGTTTGTCTATTTTATTATTTTTACACTTAATTATATGTAAACCCTTTTGAGTATGTAATTAGAATGAAAATAAGAAGTAGCACGTGTGACACTTAATCCCAATGTTAACAAAAACCCTTAAAATTCTTTCCATTCTCTGCTTTAAAATCACTACACAACCGCTAAGAAATCCAAATCTTATTCCTTATCTCGTTGGATACCCTGATTCCTACTCTCTAAGTAGCATCAGTTTCCACTGTATATATGTACATGTATGTGTTTGATACATGCATTAGGTTTTAAAGTTTGCTTGGTCACCAAGAAACGACAAAGAGAACCTGTTTCCAACTTTTCCATTGT


Gene Sequence:
>Vu_00563(+)
TTGATCGTAAATAGTCTCTCTTTTCTTTATTGGATCGTAGCTTTATGCACCCTCTTCCTCTTAGGTTCTCAAACTTTTCTCTCTTACCGTGGACCTCACCTTTGTAGGATCACCTTAGAAAAACCTCATTTTCTTTGGTGGGGGTGAGAGGTTCTACCTTATTCCTGGTTTCATCCACAAGACAGCAACATCTATGTTGTTTTAGTTTCAGAATTCGTCAGACTCTCACACCAAAATTCTGGTACAGCATGATTTTTCCAAGATTTTGTACGAATCTAAAAGGTATGGCTTTTGTAGATTCTCAACTTTATCTTGATCATACGCGCAAAAGATTCTGAAATCTGTGCGCCTAGTGATTCAAAGCTCTATAATTTCTTCTTGTTTGTGTTTCTCTCCTGTGTTTTACGAGCACCCCTTTCGAGTTCCTCTCCTTTTCCATCTCTTTAGGGACTTAATTGAACTAAAGCTTTTTGTATGCTTGTGGTTTGAGGTATGGAATTGGAAACCCTGTACCCTCCTTGTTTTATGCCAGATTCAAATTGGTTCGTGGAAGAGAGCCAAAGCACAGAATGGAGTAGGGAGGATAACAAGAAGTTTGAAAGTGCCCTTGCTATATATGACAAGGACACCCCAGATAGATGGTTCAAGGTGGCAGCCATGATCCCTGGGAAGACTGTGTTGGATGTGATCAAGCAATATAGGGAACTGGAAGAAGATGTGAGCGAAATTGAAGCAGGGCGTGTTCCAATTCCTGGTTATCTTGCCTCTTCTTTCACCTTTGAGCTTGTTCACAACCACAACTATGATGGAAGCAGAAGAAGACCTGCAGCTGTCAGAGGTTCTGATCAAGAGAGAAAGAAAGGGGTTCCCTGGACTGAAGAGGAACACAGGTGAGTTTCCCCAATTTAAACATCATAATCTTGAGTTGGTCTACTTGTTTCTTGTATACACTTGTTATTGATTGAAATCTTCTGCTGTGATGCTACTTTTTGAGGTATTTCAATCTCTGTCGTTTTTGAATTGCAGACGTTTTCTGATGGGACTTCTCAAGTATGGTAAAGGGGACTGGAGAAATATTTCTCGGAATTTCGTGGTGACAAAGACTCCCACCCAAGTTGCTAGCCATGCACAGAAGTACTACATAAGGCAAAAGGTTTCTGGAGGAAAAGATAAAAGGAGACCCAGCATCCATGATATAACCACTGTTAATCTTACAGAAACTGCTGCATCGGATAAGATAAAGTCTCCGTTCATGATTACACCGCAGCAGAAGCTGAATAGTATGTCAAAAGTGCAGTTGGACTGGACCAGCCACTGCAATGATGGATCACTCATGGTTTTCAACCCAAACAGAGACAACTTGTTTGTGTCGTCTTCATCTGATATCATGGCCCTGAAAATGCAAGGCCAGGATCTCTATGACTGTGCTTTACACGAGGCTTATGCCAAGGTAAAAGTTCCAGGTTTCGGCATGGCTCCCAGAGACTTCAATAATGAAGCTATTTTCGGTATTCATGCACTGTAGTCACAGACAACCCTGATGAGAAAAATTCCACTGCATTAGATCATTGTTCTGTAGGATTAATGTAGATGACCTGAAGCTCGCTACCTACTTAGTTCATGGTTATTGAACATCCTAAAAGAAAAACTGCAATCTTCTGAAGTTTTCCTCTTTATCTTTTTAGTCACAGTGATCGTGTCTATTTCTTTGGAGACCCAATCATATGATGTACCATTCAGGCATGCTATGTCTCAAAAGCAACATGACGAACATCACAAATAATTGAATCC