Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00392 LG1 6788241 6792164 PREDICTED: receptor protein kinase TMK1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 6788463 missense_variant p.Phe19Ile
C/A 6788504 synonymous_variant p.Ser32Ser
G/A 6788604 missense_variant p.Glu66Lys
C/A 6788794 missense_variant p.Ala129Asp
C/T 6788801 synonymous_variant p.Pro131Pro
A/T 6789344 synonymous_variant p.Val312Val
A/G 6789354 missense_variant p.Lys316Glu
A/T 6789544 missense_variant p.Lys379Met
G/A 6789905 synonymous_variant p.Ala499Ala
T/A 6791058 intron_variant
G/T 6791067 intron_variant
G/T 6791502 missense_variant p.Lys821Asn
T/A 6791995 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00392.1
MVSSTTTTTTTYFPNPLPFFIFLTMMTFFANSQDDVSVMLALKNSLNPPGWTGPVPCKWDHVRCSEDKRVTRIQIGRLNLQGTLPATIQNLTQLEQLELQYNNISGPIPSLNGLTNLRVFIASNNRFSAVPADFFAGMSQLQAVEIDNNPFEPWEIPQTLRNASVLQNFSANSANVRGTLPDFFSSDVFPGLTVLHLAINNLEGALPLSFSGSQIQSLWLNGQKSVNRLGGSVAVLQNMTFLTEVWLHSNAFTGPLPDLSGLKSLKLLSLRDNRFTGPVPPSLVGLKTLEVVNLTNNLFQGPMPVFGNGVEVDNDKDSNSFCLPGPGDCDSRVQVLLSVVGLMGYPQRFAEGWKGNDPCADWIGIACGDGNITVVNFQKMQLSGEISPDFSKIKSLQRIVLADNNLTGSIPVELTTLPRLSLLNVANNQLYGKVPSFRSNVVVSTNGNVDIGKDKSSQSPQGSVSPTAPNSKGENGGGSGNGGKKSSHVGVIVFSVIGAVFVVSMIGFLIFCLFRMKQKKLSRVQSPNALVIHPRHSGSDNESVKITVAGSNVSVGGVSETRTIPGSEAGDIQMVEAGNMVISIQVLRNVTGNFSEKNILGQGGFGTVYRGELHDGTRIAVKRMECGAITGKGAAEFKSEIAVLTKVRHRHLVALLGYCLDGNEKLLVYEYMHQGTLSRHLFNWPEEGLEPLEWNRRLTIALDVARGVEYLHGLAHQSFIHRDLKPSNILLGDDMRAKVADFGLVRLAPEGKASIETRIAGTFGYLAPEYAVTGRVTTKVDVFSFGVILMELITGRKALDETQPEDSMHLVTWFRRMSINKDSFRKAIDSAIDLNEETLASIHTVAELAGHCCAREPYQRPDMGHTVNVLSSLVELWKPSDQNSEDIYGIDLDMSLPQALKKWQAYEGKSQMESSSSSSLLPSLDNTQTSIPTRPYGFADSFTSADGR*


CDS Sequence:
>Vu_00392.1
ATGGTGAGCAGTACCACCACCACCACCACCACCTACTTTCCAAATCCTCTACCCTTCTTCATTTTCTTAACCATGATGACCTTTTTCGCCAACTCCCAGGACGATGTTTCAGTAATGCTGGCTCTCAAGAACAGCCTCAACCCGCCGGGATGGACCGGCCCGGTCCCATGCAAGTGGGACCACGTCAGGTGCTCCGAAGATAAACGGGTCACACGGATCCAAATCGGCCGCCTCAATCTCCAGGGTACTCTCCCTGCAACTATTCAGAACTTGACCCAGTTGGAACAGTTGGAGCTCCAATACAACAACATCTCGGGTCCCATTCCCTCGCTTAACGGCTTGACCAACCTCCGTGTCTTCATTGCCAGCAACAACCGCTTCTCCGCCGTCCCCGCCGACTTCTTCGCCGGCATGTCGCAGCTCCAGGCGGTGGAGATCGACAACAACCCCTTTGAGCCCTGGGAGATCCCTCAGACTCTCCGAAACGCTTCTGTGCTTCAGAACTTCTCCGCCAACTCTGCCAATGTCAGAGGCACTTTGCCGGATTTCTTCAGCTCCGACGTGTTTCCTGGTTTGACGGTTTTGCACTTGGCCATCAATAACCTCGAGGGGGCGTTGCCTTTGAGCTTTTCTGGCTCTCAGATTCAGTCTTTGTGGTTGAATGGGCAGAAGAGCGTTAACAGGCTCGGTGGCAGTGTTGCTGTTTTGCAGAACATGACTTTCTTGACGGAGGTTTGGTTGCACTCCAATGCTTTTACGGGTCCGTTGCCTGATTTGTCCGGGTTGAAGAGTTTGAAGCTTTTGAGTTTGAGGGATAACAGGTTTACAGGTCCTGTTCCGCCTTCGTTGGTGGGTCTCAAGACACTTGAAGTTGTGAACTTGACTAATAACTTGTTTCAGGGTCCTATGCCGGTGTTTGGCAATGGAGTTGAGGTAGATAACGATAAGGATTCCAACAGTTTTTGTTTGCCAGGACCTGGTGATTGTGATTCCAGGGTGCAGGTTCTTCTTTCTGTTGTTGGGCTTATGGGGTATCCTCAAAGGTTTGCCGAGGGTTGGAAGGGGAATGATCCTTGTGCTGATTGGATTGGAATTGCTTGTGGAGATGGGAATATAACTGTTGTTAATTTTCAGAAGATGCAACTTAGTGGTGAGATATCCCCGGATTTTTCAAAGATTAAATCTTTGCAAAGAATAGTACTTGCGGATAACAATCTCACTGGTTCAATTCCAGTAGAGCTTACTACTTTGCCTCGGCTTAGTCTATTGAATGTTGCGAACAATCAGCTTTATGGGAAGGTGCCGAGTTTTAGGAGTAATGTAGTTGTGAGTACTAATGGTAATGTTGATATAGGGAAGGATAAGAGTAGCCAGTCCCCTCAGGGTTCAGTGTCTCCAACGGCTCCCAATTCAAAGGGAGAAAACGGTGGGGGTTCTGGAAATGGTGGCAAAAAGTCTTCCCATGTGGGAGTGATCGTGTTTTCAGTGATTGGGGCGGTTTTTGTGGTTTCTATGATTGGTTTCCTGATTTTCTGCCTGTTTAGGATGAAGCAAAAGAAGTTGAGCAGGGTCCAGAGCCCAAATGCTCTAGTTATTCATCCTAGGCATTCTGGGTCGGATAACGAGAGTGTGAAGATAACCGTTGCAGGTTCAAATGTCAGTGTTGGTGGTGTCAGTGAAACGCGAACCATACCTGGCAGTGAGGCAGGAGATATCCAAATGGTTGAAGCTGGAAACATGGTCATTTCCATACAAGTTCTGAGAAATGTCACAGGCAACTTCAGTGAGAAGAACATATTGGGACAAGGAGGTTTTGGAACGGTTTATAGAGGTGAACTCCATGATGGTACAAGAATAGCAGTGAAAAGAATGGAGTGTGGAGCAATAACAGGGAAGGGTGCAGCAGAATTCAAGTCGGAAATTGCTGTTTTGACAAAAGTTCGCCACCGGCATCTTGTGGCTCTTCTAGGTTACTGCTTGGACGGGAATGAGAAGCTGCTTGTGTACGAGTACATGCATCAAGGAACATTGAGCAGGCATCTTTTCAACTGGCCAGAGGAAGGACTGGAACCACTGGAGTGGAACAGAAGATTGACGATTGCCTTGGATGTGGCAAGGGGTGTCGAGTACCTCCATGGCTTGGCCCATCAAAGCTTCATACACAGGGACTTAAAACCTTCAAACATTCTCCTTGGAGATGATATGAGGGCAAAGGTTGCTGATTTTGGTCTTGTGCGTCTTGCTCCGGAAGGAAAAGCCTCTATAGAGACAAGAATTGCAGGCACTTTTGGATACTTGGCACCTGAGTATGCAGTGACTGGCCGTGTGACAACTAAAGTTGACGTGTTCAGCTTTGGGGTAATATTGATGGAGCTGATAACAGGAAGAAAAGCACTTGATGAGACTCAACCCGAGGATAGCATGCACCTTGTAACATGGTTCCGCAGAATGTCCATAAATAAGGACTCATTCCGCAAGGCCATTGACTCCGCAATTGATCTCAACGAGGAAACTCTTGCCAGTATTCACACTGTTGCAGAGTTAGCTGGCCACTGCTGTGCCAGGGAGCCATATCAAAGGCCTGACATGGGTCATACTGTTAACGTGCTTTCTTCTCTCGTTGAACTCTGGAAACCATCTGATCAGAATTCTGAAGATATATATGGCATTGACCTTGACATGTCCTTGCCACAAGCACTTAAGAAGTGGCAGGCTTATGAAGGTAAAAGTCAAATGGAGTCCTCTTCTTCATCTTCGCTTCTACCAAGCTTGGATAACACACAGACAAGTATACCTACTCGCCCATATGGATTTGCTGATTCTTTCACATCAGCAGATGGTAGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_00392::LG1:6786241-6788241(+)
GCCTTAAACTGCTTTGATTTGAGTTAACTCTTGTATGTTATGTGCTTGATATGATGCATGCTTTTATATAATTAACTCACCCTTGCTTGTTTGTGTGCTTGTTGTATGTGTTTTCTTTTGCAATGATCATCCACTTGGATGTGAGCAAAGGAAGATGAGGTTTCTTTGGAGGCAACATTGGAGAGAAATGAAGATGATGCTGTAGCTTAGACTCACTAGGAATTCTTAGTTCTCTTATGTCATTTTGAAGAACCTTGTTATGTTTTAAGTTTCAAATTCTGGGCATATTTTGAAATACTCTAGTGCTTGAAGTTTTAATTTCTTAAAAAATTCTGGAAGACTGTAATCCTATAATACTTTAAGTACATCTCTTAACTGCTTTCTAATATTATAAATTTGTGATGTCTTTTTATATATATATATATATATTATATTTGGGATGCCACTGTAGTTTTTTTTATATAAAGATTTAGAGGTGACACCTGGAGCAACATGTCAAAACTATATCTATATAAAAAAAATTAGAGTGTGAGAACGAATATTTGCTAATAAGAATGAACTTTATTTCATTTTTATAATCTGTTTATTATTGTATGTCTCTGGTCTATGTTGGAGAGGAAAGAAACAAAAGAAACTAAGGAAGGAAAACAGAGGAAGAAAATGAAAAATGATAAATAATGGTTTGGTGAAAGAAACCGATAACAAAAATGAATAAAAATAAAATAAAACAATTATTATCACTATTTATTATTTTATTTTTATTCTTATTATAACAAATAAAAATAAAAAACTGTAAAAATACGAGAAGAACTCAATGCTTCTAAATGCAGGTTTTTTATTTGAAAAGAAATTATTACATAGAATTAATTTCATATATATATGACTTTAACTTCGCAAATTACTAAATATTTTGGATAGAGAATACATAAAACTTACAAATTTACAAATCAATAAATTTTCATAAGTTATTCCTTTGTTAAAGGAGTTGTTACATTTTTTAAATTTAAGCTTAAGTTTAACTCGAATGATATGCACTTGATTTTTTCTTCAATACAATTTCGACATATATAAGAAAATGTTTGAAATGAACCCTCTGGTTATAAGTAATATAAACATAAATTGTGTTAGAAAACGTAAATGTAAAGATGAAAATTAAAATATGGGTGAGAGGTGGTACCTATCTACCTATGGTTGACATCTCTAACAAGGACATTAAAAAAAGTTTGCTTGTGCCATTATTAGTTACTAAAAAAAGATTAAAAATCATTTAAAGTCCCTCTTCCCTCATTAGCAAGGGTTATTAATATATATACCCTCCAGCTAAGACATCCAGAACACAACACAACAATCATAAACTCAAAACTTTATGATCTGCTGCTTCCGCTCTTATTTTATTTCTCCATTCCCATCACTTTTTTGTTTGTGGGGTTATGAACAACCTATGTCTTTCTCAGCCTTACCTGTTATAATTATGCTCTTCAAATATATATAACAAATAAACACTCTTTTGTTTTCATTTGGACCATTAACATGAATCTCAAAACAACAAACTTCAAATTTTTAATAGATGAAATAAAATAAAAGTATAATTAAACCATAAATGAGAAAAATATTTGTTTTTAACAAATAAGAGATGAAATTGAAAAGGAAATGAGTTTATAGGAGAACAGACATGTCTGAAAACCTGGGAGAACAGCTGGACCTGGTTTTGCCCTTGCCAACCATTAAGACATTATTAGCCCATATTTGCATGTGATTGCTTTACCATAGAGCCGAACTTTTCCTTTTTTTAATGTATAAAAAAATGGAACTTCATTATTTTAAATAAAAAAAATGTATAATTTATTTGTAATAAAAACTGTAATCATTAATATTAAGATTAGTATTAGTAAAATAATAAAATGCAGATGATGATGATGATGATGGGCCATGCATGAGAGCTTCACTCGCTGAGTCTCTCACTCACTCACTCAGCAATGGTCACGACAGCCAGATACCTG


Gene Sequence:
>Vu_00392(+)
GGGGCCCACTGCCATGTGCGTTTCTCCTTCTTCCCCGTTCCCTTCTCATTTCAACTCCCAAACCCAAACTCAACAAACAAAACACTTTCTTTTCTAATTTCTATACTTTCCCTCACATCACATCACATTACCTTCTCCCACACGGCTAACGGACAGAACCACAACAGCATGGTGAGCAGTACCACCACCACCACCACCACCTACTTTCCAAATCCTCTACCCTTCTTCATTTTCTTAACCATGATGACCTTTTTCGCCAACTCCCAGGACGATGTTTCAGTAATGCTGGCTCTCAAGAACAGCCTCAACCCGCCGGGATGGACCGGCCCGGTCCCATGCAAGTGGGACCACGTCAGGTGCTCCGAAGATAAACGGGTCACACGGATCCAAATCGGCCGCCTCAATCTCCAGGGTACTCTCCCTGCAACTATTCAGAACTTGACCCAGTTGGAACAGTTGGAGCTCCAATACAACAACATCTCGGGTCCCATTCCCTCGCTTAACGGCTTGACCAACCTCCGTGTCTTCATTGCCAGCAACAACCGCTTCTCCGCCGTCCCCGCCGACTTCTTCGCCGGCATGTCGCAGCTCCAGGCGGTGGAGATCGACAACAACCCCTTTGAGCCCTGGGAGATCCCTCAGACTCTCCGAAACGCTTCTGTGCTTCAGAACTTCTCCGCCAACTCTGCCAATGTCAGAGGCACTTTGCCGGATTTCTTCAGCTCCGACGTGTTTCCTGGTTTGACGGTTTTGCACTTGGCCATCAATAACCTCGAGGGGGCGTTGCCTTTGAGCTTTTCTGGCTCTCAGATTCAGTCTTTGTGGTTGAATGGGCAGAAGAGCGTTAACAGGCTCGGTGGCAGTGTTGCTGTTTTGCAGAACATGACTTTCTTGACGGAGGTTTGGTTGCACTCCAATGCTTTTACGGGTCCGTTGCCTGATTTGTCCGGGTTGAAGAGTTTGAAGCTTTTGAGTTTGAGGGATAACAGGTTTACAGGTCCTGTTCCGCCTTCGTTGGTGGGTCTCAAGACACTTGAAGTTGTGAACTTGACTAATAACTTGTTTCAGGGTCCTATGCCGGTGTTTGGCAATGGAGTTGAGGTAGATAACGATAAGGATTCCAACAGTTTTTGTTTGCCAGGACCTGGTGATTGTGATTCCAGGGTGCAGGTTCTTCTTTCTGTTGTTGGGCTTATGGGGTATCCTCAAAGGTTTGCCGAGGGTTGGAAGGGGAATGATCCTTGTGCTGATTGGATTGGAATTGCTTGTGGAGATGGGAATATAACTGTTGTTAATTTTCAGAAGATGCAACTTAGTGGTGAGATATCCCCGGATTTTTCAAAGATTAAATCTTTGCAAAGAATAGTACTTGCGGATAACAATCTCACTGGTTCAATTCCAGTAGAGCTTACTACTTTGCCTCGGCTTAGTCTATTGAATGTTGCGAACAATCAGCTTTATGGGAAGGTGCCGAGTTTTAGGAGTAATGTAGTTGTGAGTACTAATGGTAATGTTGATATAGGGAAGGATAAGAGTAGCCAGTCCCCTCAGGGTTCAGTGTCTCCAACGGCTCCCAATTCAAAGGGAGAAAACGGTGGGGGTTCTGGAAATGGTGGCAAAAAGTCTTCCCATGTGGGAGTGATCGTGTTTTCAGTGATTGGGGCGGTTTTTGTGGTTTCTATGATTGGTTTCCTGATTTTCTGCCTGTTTAGGATGAAGCAAAAGAAGTTGAGCAGGGTCCAGAGCCCAAATGCTCTAGTTATTCATCCTAGGCATTCTGGGTCGGATAACGAGAGTGTGAAGATAACCGTTGCAGGTTCAAATGTCAGTGTTGGTGGTGTCAGTGAAACGCGAACCATACCTGGCAGTGAGGCAGGAGATATCCAAATGGTTGAAGCTGGAAACATGGTCATTTCCATACAAGTTCTGAGAAATGTCACAGGCAACTTCAGTGAGAAGAACATATTGGGACAAGGAGGTTTTGGAACGGTTTATAGAGGTGAACTCCATGATGGTACAAGAATAGCAGTGAAAAGAATGGAGTGTGGAGCAATAACAGGGAAGGGTGCAGCAGAATTCAAGTCGGAAATTGCTGTTTTGACAAAAGTTCGCCACCGGCATCTTGTGGCTCTTCTAGGTTACTGCTTGGACGGGAATGAGAAGCTGCTTGTGTACGAGTACATGCATCAAGGAACATTGAGCAGGCATCTTTTCAACTGGCCAGAGGAAGGACTGGAACCACTGGAGTGGAACAGAAGATTGACGATTGCCTTGGATGTGGCAAGGGGTGTCGAGTACCTCCATGGCTTGGCCCATCAAAGCTTCATACACAGGGACTTAAAACCTTCAAACATTCTCCTTGGAGATGATATGAGGGCAAAGGTTGCTGATTTTGGTCTTGTGCGTCTTGCTCCGGAAGGAAAAGCCTCTATAGAGACAAGAATTGCAGGCACTTTTGGATACTTGGCACCTGAGTATGCAGGTATCACTTAGTTTTATAACTTCCCTTCACCACACCATGTCTTTGTGAGCAATGCCGTATTGAGTCAGTTTCTCAAATAAACAGTTGGAATAGAGTAGGCAATAAATATATTTCAAGTATTATGGTATTCCTGGGAATAGTATACCTTAGAAAAATCTAGTTTGATTAATTAGCATATTTTTTTCCTGGTAGGATCCATGATGCTTTAAGAGCTACTGGTGACATTTCATTTCTTCGTAGGAAGCTAATATGACATTCTTCTTGTCACCACTATCTAACCAACTTCTATACTTACTAGGAAGTTAGTTGAAGTAACCATTCAATCATTACACCAATTCACTGAAGTAAATACTCTCTACTCAGGACTCAAGAATGAAGCCTCTACATCCATGTTATTCATGTTCAATGCATACGAATTGACATGACTATTTTCCTTCCAAGGCATTAGTTTTTAAATGTTCATTCAAAATGTAAATTTCCCATTGGATTTATCTTGTCTTCAGAAGATATGGTTTATTTGGATCAATTAGATGTTTGCTATCTGACTTGGTTGCTTGGTGGTATAAATGTTCATTGATTTTTAGCCATATGCATCTCTAACACCGCCATGCAAATGACTATCTGATTGCAGTGACTGGCCGTGTGACAACTAAAGTTGACGTGTTCAGCTTTGGGGTAATATTGATGGAGCTGATAACAGGAAGAAAAGCACTTGATGAGACTCAACCCGAGGATAGCATGCACCTTGTAACATGGTTCCGCAGAATGTCCATAAATAAGGACTCATTCCGCAAGGCCATTGACTCCGCAATTGATCTCAACGAGGAAACTCTTGCCAGTATTCACACTGTTGCAGAGTTAGCTGGCCACTGCTGTGCCAGGGAGCCATATCAAAGGCCTGACATGGGTCATACTGTTAACGTGCTTTCTTCTCTCGTTGAACTCTGGAAACCATCTGATCAGAATTCTGAAGATATATATGGCATTGACCTTGACATGTCCTTGCCACAAGCACTTAAGAAGTGGCAGGCTTATGAAGGTAAAAGTCAAATGGAGTCCTCTTCTTCATCTTCGCTTCTACCAAGCTTGGATAACACACAGACAAGTATACCTACTCGCCCATATGGATTTGCTGATTCTTTCACATCAGCAGATGGTAGGTGATCATGCGTAGGTGATCATGCTCGGTTGTAAATATTTGTTTTAGTGTGTTTGTTCATTCTCCGGTCCTTGTTTCATGTACTGGCGATTCTTTGTGAACTTGTTTATCTTTTCTCATTGTGTAGATTAGTTCTACACCATCTTAGCCCTTGTTAAGAACTTTTACTGACAAACTTGGAAGAGATTCTGAGCCGATAATGTACTTTTCATCATCTCACATTCACGTTTTCCCCCTTCTGAGATGTGTAAATCAAATATCACTGTTGAACTTGTTGATTAGC